<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL590626.9	1	GAATTCTTTGTATATATTGAATATTAGCCCTCCTAGGATAGCAAAAACTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	167548	GAATTCTTTGTATATATTGAATATTAGCCCTCCTAGGATAGCAAAAACTA	167597

AL590626.9	51	TTCTCAACAATAAAAGAATTTCCGGCCAAATCACCATCCCTGATCTTAAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	167598	TTCTCAACAATAAAAGAATTTCCGGCCAAATCACCATCCCTGATCTTAAG	167647

AL590626.9	101	CTGTACTACAGAGCAATTGTGATAAAAACTGCATGGTATTGGTACAGTGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	167648	CTGTACTACAGAGCAATTGTGATAAAAACTGCATGGTATTGGTACAGTGA	167697

AL590626.9	151	CAGGCAAGTAGATCAATGGAAAAAAATTGAAGACCCAGAAATGAACTGAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	167698	CAGGCAAGTAGATCAATGGAAAAAAATTGAAGACCCAGAAATGAACTGAC	167747

AL590626.9	201	ACAATGTTGTCACTTGATCTTTGACAAAGGAGCTAAAACCAACTAGTGGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	167748	ACAATGTTGTCACTTGATCTTTGACAAAGGAGCTAAAACCAACTAGTGGA	167797

AL590626.9	251	GGAAAGACAGCATTTTCAACAAATGGTGCTAGTTCAACTGGTGGTTAGCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	167798	GGAAAGACAGCATTTTCAACAAATGGTGCTAGTTCAACTGGTGGTTAGCA	167847

AL590626.9	301	TGCAGAAGAATGAAAATCAATCCATTCTTATATCCTTGTACAAAGCTTAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	167848	TGCAGAAGAATGAAAATCAATCCATTCTTATATCCTTGTACAAAGCTTAA	167897

AL590626.9	351	GTCCAAGGAGATCAAGGACCATTCCATAAAACCAGATACACTGAAACTAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	167898	GTCCAAGGAGATCAAGGACCATTCCATAAAACCAGATACACTGAAACTAA	167947

AL590626.9	401	CTGAAAAGAAAGTGGGGAAGAGCTTCAAGAACATGAGCACGGGGAAAATT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	167948	CTGAAAAGAAAGTGGGGAAGAGCTTCAAGAACATGAGCACGGGGAAAATT	167997

AL590626.9	451	CCCTGAACAGAACACTAATAGCTTATGTTCTACAATCAAGAATTGACAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	167998	CCCTGAACAGAACACTAATAGCTTATGTTCTACAATCAAGAATTGACAAA	168047

AL590626.9	501	TGGGACCTCATAAAATTACAAAGCTTCTATAAGGCAAAAGACAGTGTCAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168048	TGGGACCTCATAAAATTACAAAGCTTCTATAAGGCAAAAGACAGTGTCAA	168097

AL590626.9	551	TAAGACAAAACAGCAACCAACAGATTGGGAAAAGAACATTGCTCTTCTAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168098	TAAGACAAAACAGCAACCAACAGATTGGGAAAAGAACATTGCTCTTCTAT	168147

AL590626.9	601	ACTCTAGGAAGAAAGACATTAATGAAGCAAATAGCAACAATGAAATTTAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168148	ACTCTAGGAAGAAAGACATTAATGAAGCAAATAGCAACAATGAAATTTAG	168197

AL590626.9	651	GCAAGAAATGTAACTTTACATACATACCTAGGCTCTTATATTGCCAAGGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168198	GCAAGAAATGTAACTTTACATACATACCTAGGCTCTTATATTGCCAAGGT	168247

AL590626.9	701	CACAGGATCGTGTTGGCTAGTTCTGAGGTGATGTATGAGCAGTAGGCTGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168248	CACAGGATCGTGTTGGCTAGTTCTGAGGTGATGTATGAGCAGTAGGCTGA	168297

AL590626.9	751	GATAAAAGTGTTGTTGTGTACCTGAGGCTATAGGCCACTTTATATAGTTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168298	GATAAAAGTGTTGTTGTGTACCTGAGGCTATAGGCCACTTTATATAGTTT	168347

AL590626.9	801	ACACTCAAAGGTGATTTATGGGGAAATACCTGTTTTCTTATGCCTGAGAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168348	ACACTCAAAGGTGATTTATGGGGAAATACCTGTTTTCTTATGCCTGAGAC	168397

AL590626.9	851	ATTGGACCATCCTATACAAGTTTCATCTCTGGTCACTGCTGAATAGTTAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168398	ATTGGACCATCCTATACAAGTTTCATCTCTGGTCACTGCTGAATAGTTAA	168447

AL590626.9	901	TATGTTGTCTGTGTGTCTAGCCTCCAATAAAGTTGCTGGTCACCAAGGTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168448	TATGTTGTCTGTGTGTCTAGCCTCCAATAAAGTTGCTGGTCACCAAGGTT	168497

AL590626.9	951	CCTTGACATTCCTTGGTTTGTAACACTTTCAAGGCACAAATATTGCTAAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168498	CCTTGACATTCCTTGGTTTGTAACACTTTCAAGGCACAAATATTGCTAAG	168547

AL590626.9	1001	AAGGGAACAAAGGATGTCCTTGAGGTTGTACTGGGACTTGTAACTATAAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168548	AAGGGAACAAAGGATGTCCTTGAGGTTGTACTGGGACTTGTAACTATAAG	168597

AL590626.9	1051	TGTACTGGCTAGTTTTGTGTCAACTTGACACAGCTGGAGTTATCACAGAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168598	TGTACTGGCTAGTTTTGTGTCAACTTGACACAGCTGGAGTTATCACAGAG	168647

AL590626.9	1101	AAAGGAGTTTCAGTTGGGAAAATGTCTTCATAAGATCCAGCTGTGGATTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168648	AAAGGAGTTTCAGTTGGGAAAATGTCTTCATAAGATCCAGCTGTGGATTT	168697

AL590626.9	1151	TCAACAATTGGTGCTGGCACAACTGGTTGTTATTGTGTAGAAGAATGCGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168698	TCAACAATTGGTGCTGGCACAACTGGTTGTTATTGTGTAGAAGAATGCGA	168747

AL590626.9	1201	ATCGATCCATACTTATCTCCTTGTACTAAGGTCAAATCTAAGTGGATCAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168748	ATCGATCCATACTTATCTCCTTGTACTAAGGTCAAATCTAAGTGGATCAA	168797

AL590626.9	1251	GGAACTTCACATAAAACCAGAGACACTGAAACTTATAGAGGAGAAAGTGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168798	GGAACTTCACATAAAACCAGAGACACTGAAACTTATAGAGGAGAAAGTGG	168847

AL590626.9	1301	GGAAAAGCCTTGAAGATATGGGCACAGGGGAAAAATTCCTGAACAGAACA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168848	GGAAAAGCCTTGAAGATATGGGCACAGGGGAAAAATTCCTGAACAGAACA	168897

AL590626.9	1351	GCAATGGCTTGTGCTGTAAGATCGAGAATCGACAAATGGGACCTAATGAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168898	GCAATGGCTTGTGCTGTAAGATCGAGAATCGACAAATGGGACCTAATGAA	168947

AL590626.9	1401	ACTCCAAAGTTTCTGCAAGGCAAAAGACACCGTCAATAAGACAAAAAGAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168948	ACTCCAAAGTTTCTGCAAGGCAAAAGACACCGTCAATAAGACAAAAAGAC	168997

AL590626.9	1451	CACCAACAGATTGGGAAAGGATCTTTACCTATCCTAAATCAGATAGGGGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	168998	CACCAACAGATTGGGAAAGGATCTTTACCTATCCTAAATCAGATAGGGGA	169047

AL590626.9	1501	CTAATATCCAACATATATAAAGAACTCAAGAAGGTGGACTTCAGAAAATC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	169048	CTAATATCCAACATATATAAAGAACTCAAGAAGGTGGACTTCAGAAAATC	169097

AL590626.9	1551	AAATAACCCCATTAAAAAATGGGGCTCAGAACTGAACAAAGAATTCTCAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	169098	AAATAACCCCATTAAAAAATGGGGCTCAGAACTGAACAAAGAATTCTCAC	169147

AL590626.9	1601	CTGAGGAATACCGAATGGCAGAGAAGCACTTGAAAAAATGTTCAACATCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	169148	CTGAGGAATACCGAATGGCAGAGAAGCACTTGAAAAAATGTTCAACATCC	169197

AL590626.9	1651	TTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	169198	TTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCAC	169247

AL590626.9	1701	ACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	169248	ACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGC	169297

AL590626.9	1751	GTGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGAGTGCAGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	169298	GTGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGAGTGCAGG	169347

AL590626.9	1801	CTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	169348	CTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGA	169397

AL590626.9	1851	CATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	169398	CATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAG	169447

AL590626.9	1901	AAGATGCCCCAACAGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	169448	AAGATGCCCCAACAGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCA	169497

AL590626.9	1951	GCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCTAGATGCCCCTCAAC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590503.11	169498	GCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCTAGATGCCCCTCAAC	169547

Overview

Query
AL590626.9 - 179282 bps
Hit
AL590503.11 - 169547 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link