<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX664725.10	1	CCTTAATAAGCTGTATCTGTTTCATATGCTTTTAATTTTAAAGGAATAAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	185506	CCTTAATAAGCTGTATCTGTTTCATATGCTTTTAATTTTAAAGGAATAAC	185555

BX664725.10	51	AAAACTGTCTGGCTCAACTGCAAGTTTCCCTCCCCTCTGTGACCGAGACT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	185556	AAAACTGTCTGGCTCAACTGCAAGTTTCCCTCCCCTCTGTGACCGAGACT	185605

BX664725.10	101	AAGTCTAGCACACAGCACTTGGGCCAGCAAATCCTGGAAGGCAGACAAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	185606	AAGTCTAGCACACAGCACTTGGGCCAGCAAATCCTGGAAGGCAGACAAAA	185655

BX664725.10	151	ATGAGAACCTGAAGCAATGCTTACAGTAGATGTCTCACACAGAACAATAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	185656	ATGAGAACCTGAAGCAATGCTTACAGTAGATGTCTCACACAGAACAATAC	185705

BX664725.10	201	AAACATGTAAAAAATCTTTCACCACATATTCTTGCCAATTAATTGGATCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	185706	AAACATGTAAAAAATCTTTCACCACATATTCTTGCCAATTAATTGGATCA	185755

BX664725.10	251	TATAAGTAAAATCATTACAAATATAAGTATTTACAGGATTTAAAAGTTAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	185756	TATAAGTAAAATCATTACAAATATAAGTATTTACAGGATTTAAAAGTTAG	185805

BX664725.10	301	AATATATTTGAATGCATAGGTAGAAAAGTATCATATTTTAAAACTATGTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	185806	AATATATTTGAATGCATAGGTAGAAAAGTATCATATTTTAAAACTATGTA	185855

BX664725.10	351	TATTTAAATTTAGTAATTTTCTAATCTCTAGAAATCTCTGCTGTTCAAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	185856	TATTTAAATTTAGTAATTTTCTAATCTCTAGAAATCTCTGCTGTTCAAAA	185905

BX664725.10	401	GGTGGCAGCACTGAAAGTTGTTTTCCTGTTAGATGGCAAGAGCACAATGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	185906	GGTGGCAGCACTGAAAGTTGTTTTCCTGTTAGATGGCAAGAGCACAATGC	185955

BX664725.10	451	CCAAAACAGAAGATACAGTTAGGAATAAGGGGCCTTGAATGTCATGAAGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	185956	CCAAAACAGAAGATACAGTTAGGAATAAGGGGCCTTGAATGTCATGAAGG	186005

BX664725.10	501	CTTGAGGTCAGCTTACAGATAACAGGATTATTAAAAAGATGAATTTCCAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186006	CTTGAGGTCAGCTTACAGATAACAGGATTATTAAAAAGATGAATTTCCAC	186055

BX664725.10	551	TTCCAAAGTCTTTCATTGGCAGATCTTGGTAGCACTTTATATGTTCACCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186056	TTCCAAAGTCTTTCATTGGCAGATCTTGGTAGCACTTTATATGTTCACCA	186105

BX664725.10	601	ATGGGAGGTCAACATTTATCTAATTTAAAAGCTATGCTAACCATTGTGGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186106	ATGGGAGGTCAACATTTATCTAATTTAAAAGCTATGCTAACCATTGTGGT	186155

BX664725.10	651	TTTAATTTCAAAATATTTGTCATTCAAGTCCCTTTACATAAATAGTATTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186156	TTTAATTTCAAAATATTTGTCATTCAAGTCCCTTTACATAAATAGTATTT	186205

BX664725.10	701	GGTAATACATTTATAGATGAGGCTTATATGAAAAGGCTAGGTCAACAAAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186206	GGTAATACATTTATAGATGAGGCTTATATGAAAAGGCTAGGTCAACAAAC	186255

BX664725.10	751	CAATAGATTCATTTAATTTTCCTGTGGTTGACCTATACGACCAGGATGTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186256	CAATAGATTCATTTAATTTTCCTGTGGTTGACCTATACGACCAGGATGTA	186305

BX664725.10	801	GAAAACTAGAAAGAACTGCCCTTCCTCAGATATACTCTTGGGAGAGAGCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186306	GAAAACTAGAAAGAACTGCCCTTCCTCAGATATACTCTTGGGAGAGAGCA	186355

BX664725.10	851	TGAATGGTATTCTGAACTATCACCTGATTCAAGGACTTTGTTAGCTAGGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186356	TGAATGGTATTCTGAACTATCACCTGATTCAAGGACTTTGTTAGCTAGGT	186405

BX664725.10	901	TTTGAGGTCAGGCTTCAGTAACTGTAGTCTTGTGAGCATATTGAGGGCAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186406	TTTGAGGTCAGGCTTCAGTAACTGTAGTCTTGTGAGCATATTGAGGGCAG	186455

BX664725.10	951	AGGAGGACTTAGTTTTTCATATGTGTTTCCTTAGTGCCTAGCAGACTATC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186456	AGGAGGACTTAGTTTTTCATATGTGTTTCCTTAGTGCCTAGCAGACTATC	186505

BX664725.10	1001	TGTTCATAATCAGTTTTCAGTGTGAATTCACTGAATGTTTATAGACAAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186506	TGTTCATAATCAGTTTTCAGTGTGAATTCACTGAATGTTTATAGACAAAA	186555

BX664725.10	1051	GAAAATACATAATAAAACTAATCTTCATTTTAAAAGGGTAAAACATGACT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186556	GAAAATACATAATAAAACTAATCTTCATTTTAAAAGGGTAAAACATGACT	186605

BX664725.10	1101	ACACAGAAATTTAAATAGAAATAGTGTATATACATATAAAATACAAGCTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186606	ACACAGAAATTTAAATAGAAATAGTGTATATACATATAAAATACAAGCTA	186655

BX664725.10	1151	TGTTAGGACCAAATCTCTTTGTCTATGGAGTTATACTTCCATCAAATTAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186656	TGTTAGGACCAAATCTCTTTGTCTATGGAGTTATACTTCCATCAAATTAC	186705

BX664725.10	1201	ATAGCAATGCTGAATTAGGCAAAACCAATATTTAGTGGTAAATCCATTCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186706	ATAGCAATGCTGAATTAGGCAAAACCAATATTTAGTGGTAAATCCATTCC	186755

BX664725.10	1251	TGGTAGTATAAGTCACCTAAAAAAGACTTCCAGAAATATGTACTTTAATT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186756	TGGTAGTATAAGTCACCTAAAAAAGACTTCCAGAAATATGTACTTTAATT	186805

BX664725.10	1301	ATTAGTTTTTCTCCTATTTTAAAATTTATTATGCAAATTTTAGAAAATAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186806	ATTAGTTTTTCTCCTATTTTAAAATTTATTATGCAAATTTTAGAAAATAA	186855

BX664725.10	1351	AATTTGCTCCAGTTACACCCACTTAGAATTCCAGAATCTTAAAACTGTAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186856	AATTTGCTCCAGTTACACCCACTTAGAATTCCAGAATCTTAAAACTGTAA	186905

BX664725.10	1401	GGGGCCTCCATCCCTCTTACTCATTTGTAGTCTAGGAAATCGAGATTTTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186906	GGGGCCTCCATCCCTCTTACTCATTTGTAGTCTAGGAAATCGAGATTTTG	186955

BX664725.10	1451	ATACACCTAAGGTCAAGCAGCTGAGTAGATATACAACTGTCACAAGAGTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	186956	ATACACCTAAGGTCAAGCAGCTGAGTAGATATACAACTGTCACAAGAGTC	187005

BX664725.10	1501	TAGATCAGTTGGCACATGCTTTCTATACTAGATTATTAGTATTATTAGCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	187006	TAGATCAGTTGGCACATGCTTTCTATACTAGATTATTAGTATTATTAGCT	187055

BX664725.10	1551	AATGGTCTTCTGCATTTTTTTGTTTTTTTATTTCTATTGAGATATAGCCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	187056	AATGGTCTTCTGCATTTTTTTGTTTTTTTATTTCTATTGAGATATAGCCT	187105

BX664725.10	1601	TTACATTTGTACACAAATGTGACTATGTCTTGGCAATGCACTTCATACAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	187106	TTACATTTGTACACAAATGTGACTATGTCTTGGCAATGCACTTCATACAC	187155

BX664725.10	1651	AATGACTAATCTATACTGTGATGATTTGACTCAAAAGGAGAAAAGAAATT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	187156	AATGACTAATCTATACTGTGATGATTTGACTCAAAAGGAGAAAAGAAATT	187205

BX664725.10	1701	ATGTAGTTTTCAATTCTGATTCCTATTCACCTTTTGTTTATGAATGGAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	187206	ATGTAGTTTTCAATTCTGATTCCTATTCACCTTTTGTTTATGAATGGAAA	187255

BX664725.10	1751	GCTTTGTGCAAAATATACATATAAGCAGAGTAAGCCTTTTAAAAATGTTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	187256	GCTTTGTGCAAAATATACATATAAGCAGAGTAAGCCTTTTAAAAATGTTC	187305

BX664725.10	1801	TTTGAAAGATAAAATTAAATACATGAGTTTCTAACAATTAGAAAGGAAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	187306	TTTGAAAGATAAAATTAAATACATGAGTTTCTAACAATTAGAAAGGAAAA	187355

BX664725.10	1851	AATTAAAATATGAAATGATAACAAAAGTAAACAAAAGATACTTTCAAAGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	187356	AATTAAAATATGAAATGATAACAAAAGTAAACAAAAGATACTTTCAAAGC	187405

BX664725.10	1901	AGTGAACAAAACATTTTGACATAAGCCATAATATAAATTATAATATAAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	187406	AGTGAACAAAACATTTTGACATAAGCCATAATATAAATTATAATATAAAA	187455

BX664725.10	1951	ATATAAAAACCATAGTATAAATTGTCAATCTTTGAGTTGGCTATGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590399.4	187456	ATATAAAAACCATAGTATAAATTGTCAATCTTTGAGTTGGCTATGAATTC	187505

Overview

Query
BX664725.10 - 61470 bps
Hit
AL590399.4 - 187505 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link