<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL606968.9	1	TTGTGTATTTGGAGCTCAGCGGACAGCTTATGGGAGTTAGCTCACTCCTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	180818	TTGTGTATTTGGAGCTCAGCGGACAGCTTATGGGAGTTAGCTCACTCCTT	180867

AL606968.9	51	CCACCAAGTGCATGCTCAGACTTGGCCATCTTGCTTGTCAATACTGTTTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	180868	CCACCAAGTGCATGCTCAGACTTGGCCATCTTGCTTGTCAATACTGTTTT	180917

AL606968.9	101	GAGAAAGTGCTTGGTTAGCTACTTGTTTTGTTTTGGGTGAAATGTAAGAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	180918	GAGAAAGTGCTTGGTTAGCTACTTGTTTTGTTTTGGGTGAAATGTAAGAT	180967

AL606968.9	151	TCTAGCTCATGGCCAGGCAGAGTTCTTTGATACTTTGGTCCACTGGCCAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	180968	TCTAGCTCATGGCCAGGCAGAGTTCTTTGATACTTTGGTCCACTGGCCAG	181017

AL606968.9	201	CATAGGGGTGTAGAGTGAAACTTTCTGTATCCCCCTAAGAAGTCAGTTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181018	CATAGGGGTGTAGAGTGAAACTTTCTGTATCCCCCTAAGAAGTCAGTTTT	181067

AL606968.9	251	ACCTTCAACTTCTATCAACTTGTTTAACACACTAATTCTGCAAGTGAATA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181068	ACCTTCAACTTCTATCAACTTGTTTAACACACTAATTCTGCAAGTGAATA	181117

AL606968.9	301	GAGGTTTGGTCGGGAAGAGGAGCTCCAAGTGTCTTCTAAATAGACCCTTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181118	GAGGTTTGGTCGGGAAGAGGAGCTCCAAGTGTCTTCTAAATAGACCCTTT	181167

AL606968.9	351	CCCGCCAGGGTGCAAGGTTACAAATCCTGACTTTATCCCCTGAAGGTATG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181168	CCCGCCAGGGTGCAAGGTTACAAATCCTGACTTTATCCCCTGAAGGTATG	181217

AL606968.9	401	ATGCTGGGTTTGGCCATGAGGAGGCTCTGATAGAACTCACAGACATTACC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181218	ATGCTGGGTTTGGCCATGAGGAGGCTCTGATAGAACTCACAGACATTACC	181267

AL606968.9	451	TCAGCTGGCTGCTGCCTTTCCCATTGACAAGTCACAATGCCCTATAGCCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181268	TCAGCTGGCTGCTGCCTTTCCCATTGACAAGTCACAATGCCCTATAGCCT	181317

AL606968.9	501	GCCTAAACAGTTCCATCTTCCTCTGGTCCTGTGCCCTCTCGAGCACACCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181318	GCCTAAACAGTTCCATCTTCCTCTGGTCCTGTGCCCTCTCGAGCACACCC	181367

AL606968.9	551	ACTCGTTCCCTCGTACGTTCACTCGTACGATGAAGGGATTCAAATCACCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181368	ACTCGTTCCCTCGTACGTTCACTCGTACGATGAAGGGATTCAAATCACCC	181417

AL606968.9	601	AGAGTCGCTTCCAGCTCAGAGTTTGGGGAACTGGGACGCGCACCAATGCG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181418	AGAGTCGCTTCCAGCTCAGAGTTTGGGGAACTGGGACGCGCACCAATGCG	181467

AL606968.9	651	CATCCAGGTCCAAGGCCGGGTCCTGCCTGGATGCTAGACACCGAGCCCCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181468	CATCCAGGTCCAAGGCCGGGTCCTGCCTGGATGCTAGACACCGAGCCCCC	181517

AL606968.9	701	ATGAGCTCTGCCAGTGTGGTGCTCAGACCGCAGATCCCAGAGCGGGCTGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181518	ATGAGCTCTGCCAGTGTGGTGCTCAGACCGCAGATCCCAGAGCGGGCTGA	181567

AL606968.9	751	CGTGGTTGCCGTGGCCCGCGTGTCGCCAGCTCCCCAGTTCCCTCGCGCTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181568	CGTGGTTGCCGTGGCCCGCGTGTCGCCAGCTCCCCAGTTCCCTCGCGCTT	181617

AL606968.9	801	TTCTGGCGCTCGTGGCCCAACCGTCACTCGAGCAGCGGATGCTTGGATTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181618	TTCTGGCGCTCGTGGCCCAACCGTCACTCGAGCAGCGGATGCTTGGATTC	181667

AL606968.9	851	GGCCGCCTCCGCCGAGGTTGAAACGGGGCTAGAAGTCACCGCCCGTCCGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181668	GGCCGCCTCCGCCGAGGTTGAAACGGGGCTAGAAGTCACCGCCCGTCCGC	181717

AL606968.9	901	GCCTCTCAGCATGGGCAGCTACCTGGGCAAAGCGGGGTCCTCGCCGCGGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181718	GCCTCTCAGCATGGGCAGCTACCTGGGCAAAGCGGGGTCCTCGCCGCGGT	181767

AL606968.9	951	CCCCAGCACAGGGGCGCGCAGACTCAGGGGAGAAGCCTGCGAGCCGCCGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181768	CCCCAGCACAGGGGCGCGCAGACTCAGGGGAGAAGCCTGCGAGCCGCCGA	181817

AL606968.9	1001	CCCGCTAGGCCCCTCTACCAGGTCCACCGGGTGCAGCATGTCCACCGCGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181818	CCCGCTAGGCCCCTCTACCAGGTCCACCGGGTGCAGCATGTCCACCGCGC	181867

AL606968.9	1051	CCAGCCCGCTCGGAGACACAGGCCGGCCCGGAGGCCGCCCAACTGGGATC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181868	CCAGCCCGCTCGGAGACACAGGCCGGCCCGGAGGCCGCCCAACTGGGATC	181917

AL606968.9	1101	CCGCCAACCCTACCGCTTTCGTCAGTGAGGCCTGGAGGCGCTTCCCCATG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181918	CCGCCAACCCTACCGCTTTCGTCAGTGAGGCCTGGAGGCGCTTCCCCATG	181967

AL606968.9	1151	AAGAGGCCACAGAACCCCATCATGGGCTCTCTTCCTTCAGACTGGTGGGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	181968	AAGAGGCCACAGAACCCCATCATGGGCTCTCTTCCTTCAGACTGGTGGGA	182017

AL606968.9	1201	AAGTTACCTGAAGCGTAATATTTGGTCCCTTCGTCACCCTCGGGCCACAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	182018	AAGTTACCTGAAGCGTAATATTTGGTCCCTTCGTCACCCTCGGGCCACAT	182067

AL606968.9	1251	GGAGTCCGGTGACAGTCAAGATCTCGCCTCCTGAGCGGAGACCACGGCCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	182068	GGAGTCCGGTGACAGTCAAGATCTCGCCTCCTGAGCGGAGACCACGGCCC	182117

AL606968.9	1301	TTGTTCCCGGTCTCAAGAGTGGTGAACTCCGCGGGACCTTCAGAGGAGCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	182118	TTGTTCCCGGTCTCAAGAGTGGTGAACTCCGCGGGACCTTCAGAGGAGCC	182167

AL606968.9	1351	ACCAGGGCCCTGTGGAAAGGACCCGGTGCTGAGGGCCCTCCTCCAGTGCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	182168	ACCAGGGCCCTGTGGAAAGGACCCGGTGCTGAGGGCCCTCCTCCAGTGCA	182217

AL606968.9	1401	GGAAGGGCAGAGCCAGGTGGGAAGAGCCACTGTTCCCGGACACCTCCGAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	182218	GGAAGGGCAGAGCCAGGTGGGAAGAGCCACTGTTCCCGGACACCTCCGAC	182267

AL606968.9	1451	AGCCAAAGGCATTCGGCCTCCGTATGGTCCGCCTTTAAGCCCCTGTTGAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	182268	AGCCAAAGGCATTCGGCCTCCGTATGGTCCGCCTTTAAGCCCCTGTTGAA	182317

AL606968.9	1501	AAGTGGGGCCACTGTTTCGTTTGTGGCCAGGCCTGGGTCTCTGAAAAGGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	182318	AAGTGGGGCCACTGTTTCGTTTGTGGCCAGGCCTGGGTCTCTGAAAAGGA	182367

AL606968.9	1551	GACCCCATGTCCAGAGCTCAGATGATAAATGTAAGAGATCCGGTTGCTTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	182368	GACCCCATGTCCAGAGCTCAGATGATAAATGTAAGAGATCCGGTTGCTTC	182417

AL606968.9	1601	TCTGGGGCCCTTGTGGCCAGCATACATACCCAAGGCCCCCCCAGCACAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	182418	TCTGGGGCCCTTGTGGCCAGCATACATACCCAAGGCCCCCCCAGCACAAA	182467

AL606968.9	1651	AAGAAATGCTATTACCAGTTCTTACAGTTCTTCTAGAGAGCTCTCAGGAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	182468	AAGAAATGCTATTACCAGTTCTTACAGTTCTTCTAGAGAGCTCTCAGGAT	182517

AL606968.9	1701	CTTGGAAGAGACATTTTCTCAGGACATTAGTCCAGACTCCAGAATGGCCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	182518	CTTGGAAGAGACATTTTCTCAGGACATTAGTCCAGACTCCAGAATGGCCA	182567

AL606968.9	1751	TTGAAAAAAGCAGGAGAGAGTCCTAATTCTCACCTCTCAGTCACACCCAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	182568	TTGAAAAAAGCAGGAGAGAGTCCTAATTCTCACCTCTCAGTCACACCCAG	182617

AL606968.9	1801	CAGCTCTGGACAGCTAAATGGAGAGATTCCTCTACTGCAGTCTGGCCCTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	182618	CAGCTCTGGACAGCTAAATGGAGAGATTCCTCTACTGCAGTCTGGCCCTA	182667

AL606968.9	1851	GGGACCTGCTAACTATACCTTGCCAGCAAGGTCCTGTTGTCACTGAAGAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	182668	GGGACCTGCTAACTATACCTTGCCAGCAAGGTCCTGTTGTCACTGAAGAG	182717

AL606968.9	1901	GACCCAACATTAGAGGGGCAAGCTGTGCCGAGCAACCAAACCACAGAAGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	182718	GACCCAACATTAGAGGGGCAAGCTGTGCCGAGCAACCAAACCACAGAAGC	182767

AL606968.9	1951	TACAACCGGGACAGCCGGAGACTCCATTCCAGAGATGAGGGCTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589879.21	182768	TACAACCGGGACAGCCGGAGACTCCATTCCAGAGATGAGGGCTGGAATTC	182817

Overview

Query
AL606968.9 - 3994 bps
Hit
AL589879.21 - 182817 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link