<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645704.9	1	ACTTTCTTCTCTCTCTCTCTTCCTTCTCTCTTTCCCCCTGCCTTTCTATA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	215644	ACTTTCTTCTCTCTCTCTCTTCCTTCTCTCTTTCCCCCTGCCTTTCTATA	215693

AL645704.9	51	ATAAAGCTATAAAACCATAGAATGTCTCTGCTGAAGGTTTGGAGGATGGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	215694	ATAAAGCTATAAAACCATAGAATGTCTCTGCTGAAGGTTTGGAGGATGGG	215743

AL645704.9	101	ACAGGCTTTTTCCTAATGAGCCGTTTCTAAACTCCCAATAGAAGGCCTTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	215744	ACAGGCTTTTTCCTAATGAGCCGTTTCTAAACTCCCAATAGAAGGCCTTC	215793

AL645704.9	151	CTGCGCTCCAGTCAAGATCCACTGCACTCACTCTCGCAGGTGTTGGGAAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	215794	CTGCGCTCCAGTCAAGATCCACTGCACTCACTCTCGCAGGTGTTGGGAAC	215843

AL645704.9	201	CTCTCTTCCCTCATTCCTCTATCCTAAAACTGTGCTGGCTTTAGCAAAGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	215844	CTCTCTTCCCTCATTCCTCTATCCTAAAACTGTGCTGGCTTTAGCAAAGT	215893

AL645704.9	251	AGCTCCGGGAATCCCAGGTAGGGCTGCTCCTTGGCCACCCCCTGAAGAGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	215894	AGCTCCGGGAATCCCAGGTAGGGCTGCTCCTTGGCCACCCCCTGAAGAGT	215943

AL645704.9	301	GGGTCAGAGGCTTGAATGCCCATCCAGGGATGAGTGGAAAGTGTATAGCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	215944	GGGTCAGAGGCTTGAATGCCCATCCAGGGATGAGTGGAAAGTGTATAGCT	215993

AL645704.9	351	GATCTCCCATGCCTGACTGACCAGAGTATAGGTGGAACTCTGGCGGGGAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	215994	GATCTCCCATGCCTGACTGACCAGAGTATAGGTGGAACTCTGGCGGGGAG	216043

AL645704.9	401	TGGGTCTTCCCTTCCCCAGGAGATCCTCTAGGTCCCCTTTTTGGTTCCCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216044	TGGGTCTTCCCTTCCCCAGGAGATCCTCTAGGTCCCCTTTTTGGTTCCCA	216093

AL645704.9	451	ACAAAGGAGCATATAGAATACCACTTACGTTGGACAAGAAAAGAAAATCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216094	ACAAAGGAGCATATAGAATACCACTTACGTTGGACAAGAAAAGAAAATCC	216143

AL645704.9	501	TCTCCCTGCATAGCAAGCAAAGCACAATATCTACAGAAAAAAGAAACACT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216144	TCTCCCTGCATAGCAAGCAAAGCACAATATCTACAGAAAAAAGAAACACT	216193

AL645704.9	551	ATTAAAGTCAGCAAGAATGTTTGGCAAAATCCAACACCCATTCATGATAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216194	ATTAAAGTCAGCAAGAATGTTTGGCAAAATCCAACACCCATTCATGATAA	216243

AL645704.9	601	AAGACTTAGAAAAATCAGGACTTCAAGGCCCATATCTAAATATAGTAAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216244	AAGACTTAGAAAAATCAGGACTTCAAGGCCCATATCTAAATATAGTAAAA	216293

AL645704.9	651	GCATATACAGCAAACCAATAGCCAACATCAAACTAACTGGAGAGAAACTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216294	GCATATACAGCAAACCAATAGCCAACATCAAACTAACTGGAGAGAAACTT	216343

AL645704.9	701	GAAGCAATTTCACTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216344	GAAGCAATTTCACTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTTC	216393

AL645704.9	751	CTACTTATTCAATGTAGTACTTGAAGTCCTAGCCAGAACAACTTGACAAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216394	CTACTTATTCAATGTAGTACTTGAAGTCCTAGCCAGAACAACTTGACAAC	216443

AL645704.9	801	AAAAGGAGATCAAGGGGTTATGAATTGGAAAGGAAGAAGTCAAAATATCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216444	AAAAGGAGATCAAGGGGTTATGAATTGGAAAGGAAGAAGTCAAAATATCA	216493

AL645704.9	851	CTCTTTGCAGATGATATGATAGTATATATAAGTGACCCTAAAAATTCCAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216494	CTCTTTGCAGATGATATGATAGTATATATAAGTGACCCTAAAAATTCCAC	216543

AL645704.9	901	CAGAGAACTCCTAAACCTGATAAACAGCTTCAGTACAGTAGCTGGATATA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216544	CAGAGAACTCCTAAACCTGATAAACAGCTTCAGTACAGTAGCTGGATATA	216593

AL645704.9	951	AAATTAACTCAAAAAAATCAGTGACCTTTCTCTACACAAAGTATAAACAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216594	AAATTAACTCAAAAAAATCAGTGACCTTTCTCTACACAAAGTATAAACAG	216643

AL645704.9	1001	GCTGAGAAAGAAATTAGGGAAACAACACCCTTCACAATAGTCACAAAAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216644	GCTGAGAAAGAAATTAGGGAAACAACACCCTTCACAATAGTCACAAAAAA	216693

AL645704.9	1051	TATGAAATACCTTGTTGTGACTCCAAGGAAGTGAAAATCTGTATGATAAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216694	TATGAAATACCTTGTTGTGACTCCAAGGAAGTGAAAATCTGTATGATAAG	216743

AL645704.9	1101	AACTTAAAGTCTCTGAAGAAAGAAATCAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216744	AACTTAAAGTCTCTGAAGAAAGAAATCAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAA	216793

AL645704.9	1151	AGAGCTCCCATGCTCATGGCTTGGTAACATTAATATAGTAAAAATTTGCC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216794	AGAGCTCCCATGCTCATGGCTTGGTAACATTAATATAGTAAAAATTTGCC	216843

AL645704.9	1201	AAAAGCAATCTACAGTTTCAATGCAATCCCCACCAAAATTCCAACTCAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216844	AAAAGCAATCTACAGTTTCAATGCAATCCCCACCAAAATTCCAACTCAAT	216893

AL645704.9	1251	TCTTCACTGAGTTAGAAAGGGCAATTTGCAAATTTATCTGGAATAACAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216894	TCTTCACTGAGTTAGAAAGGGCAATTTGCAAATTTATCTGGAATAACAAA	216943

AL645704.9	1301	AAACCTAGGGTAGCAAAAACTATTCTCAACAATATAAGAAACTCTGGTGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216944	AAACCTAGGGTAGCAAAAACTATTCTCAACAATATAAGAAACTCTGGTGG	216993

AL645704.9	1351	AATCACCATGCCTGACCTCAAGCTGGACTACGGAGCAATTGTGATAAAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	216994	AATCACCATGCCTGACCTCAAGCTGGACTACGGAGCAATTGTGATAAAAA	217043

AL645704.9	1401	CTGCATGGTACTGGTACAGCAACAGACAGGTAGATCAATGGAATAGAACT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	217044	CTGCATGGTACTGGTACAGCAACAGACAGGTAGATCAATGGAATAGAACT	217093

AL645704.9	1451	GAAGACCCCAAAATGTATCCACACACCTGTGGTCACTTGATCTTTGACAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	217094	GAAGACCCCAAAATGTATCCACACACCTGTGGTCACTTGATCTTTGACAA	217143

AL645704.9	1501	GAAAGCTAAAACCATCCAGTGGAAAAAAGACAACATTTTCAACAAGTGGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	217144	GAAAGCTAAAACCATCCAGTGGAAAAAAGACAACATTTTCAACAAGTGGT	217193

AL645704.9	1551	GCTGGTACAACTGGCAGTTATCATGTAGAAGAATGAGAATTGATCAATAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	217194	GCTGGTACAACTGGCAGTTATCATGTAGAAGAATGAGAATTGATCAATAC	217243

AL645704.9	1601	TTATCTCCTTGTATAAAGCTCAAGTCTAAGTGGATCATGGAACTCCACAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	217244	TTATCTCCTTGTATAAAGCTCAAGTCTAAGTGGATCATGGAACTCCACAT	217293

AL645704.9	1651	AAAACCAGAGACACTGAAACTTATAGGGGAGAAAGTGGGGAAAAGCCTCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	217294	AAAACCAGAGACACTGAAACTTATAGGGGAGAAAGTGGGGAAAAGCCTCA	217343

AL645704.9	1701	AAGATATGGGCACAGGGGACAAATTCCTGAACAGATCAGCAATGGCTTGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	217344	AAGATATGGGCACAGGGGACAAATTCCTGAACAGATCAGCAATGGCTTGT	217393

AL645704.9	1751	GCTGTAAGACCAAGATTCACCAAATGGGAACTTATAAATTTGCAAAGCTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	217394	GCTGTAAGACCAAGATTCACCAAATGGGAACTTATAAATTTGCAAAGCTT	217443

AL645704.9	1801	CTGTAAAGCAAAAGACAGTGTCAACAAGACAAAAAGGCCACCAACAGATT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	217444	CTGTAAAGCAAAAGACAGTGTCAACAAGACAAAAAGGCCACCAACAGATT	217493

AL645704.9	1851	GGGAAAGGATCTTTACAAATTCTAAATCTGTTAGGGAACTAATATCCAAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	217494	GGGAAAGGATCTTTACAAATTCTAAATCTGTTAGGGAACTAATATCCAAT	217543

AL645704.9	1901	ATATATAAAGAACTCAAGAAGCTGGACTACAGAAAATCAAATAAACCTAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	217544	ATATATAAAGAACTCAAGAAGCTGGACTACAGAAAATCAAATAAACCTAA	217593

AL645704.9	1951	TAAAAAAATGGGGTACAGAGCTAAACAAATAATTCTCAACTGAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589871.13	217594	TAAAAAAATGGGGTACAGAGCTAAACAAATAATTCTCAACTGAGGAATTC	217643

Overview

Query
AL645704.9 - 150424 bps
Hit
AL589871.13 - 217643 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link