<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL670757.5	1	TATTATGTTACTAGGCCATCATCTTGTCCCTGAAGATAGACAATTGCGTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	174184	TATTATGTTACTAGGCCATCATCTTGTCCCTGAAGATAGACAATTGCGTG	174233

AL670757.5	51	TTCCCCAAAGTAGCCTAGGAATTGCCCGGAGAAAGCAATCTCTCTGGTTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	174234	TTCCCCAAAGTAGCCTAGGAATTGCCCGGAGAAAGCAATCTCTCTGGTTT	174283

AL670757.5	101	ATTTGACAGTAACTGAGGATATGTCTGTCCTCTTTCTAGTAGGCTTCTCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	174284	ATTTGACAGTAACTGAGGATATGTCTGTCCTCTTTCTAGTAGGCTTCTCT	174333

AL670757.5	151	TTTTATTTTCTGGAATCAAAGCCTAGAAATGTAGATCTCCTTGTTTTTGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	174334	TTTTATTTTCTGGAATCAAAGCCTAGAAATGTAGATCTCCTTGTTTTTGG	174383

AL670757.5	201	AGAATGGTCTCACCTTGTGTGCTGATACAAATGATGGAGGGGAAAACAGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	174384	AGAATGGTCTCACCTTGTGTGCTGATACAAATGATGGAGGGGAAAACAGA	174433

AL670757.5	251	AAGTCCTGGCAATACATCATCAAGTCCAGAGGGTTGCTATGGAGCCTCTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	174434	AAGTCCTGGCAATACATCATCAAGTCCAGAGGGTTGCTATGGAGCCTCTG	174483

AL670757.5	301	TGATCCACCGGAGTCGGCAGGAAGCACACTTATTTTAACAGTGGTACTGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	174484	TGATCCACCGGAGTCGGCAGGAAGCACACTTATTTTAACAGTGGTACTGG	174533

AL670757.5	351	ATCATCAGAACCACTCCCATCAAGATTTCTATGGTGAAATAACAAAAATG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	174534	ATCATCAGAACCACTCCCATCAAGATTTCTATGGTGAAATAACAAAAATG	174583

AL670757.5	401	CCAACTAATGCGCATGGTGAGGGGAGCAGCAGGGGCCACTCGTAGTTTTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	174584	CCAACTAATGCGCATGGTGAGGGGAGCAGCAGGGGCCACTCGTAGTTTTC	174633

AL670757.5	451	CAATAAGGTGCTTGGAAACAATTAGACACAGAGGCAGGTACTTTAATGCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	174634	CAATAAGGTGCTTGGAAACAATTAGACACAGAGGCAGGTACTTTAATGCA	174683

AL670757.5	501	TACTGAGGTGATTGGTCAGATTGATCTTGGTCACGGGACAGGCTGACAGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	174684	TACTGAGGTGATTGGTCAGATTGATCTTGGTCACGGGACAGGCTGACAGC	174733

AL670757.5	551	AGAGAAGGGCAGACTGTAGCTTCCTTTTTCACTGTGGTGGCTATGTTAGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	174734	AGAGAAGGGCAGACTGTAGCTTCCTTTTTCACTGTGGTGGCTATGTTAGA	174783

AL670757.5	601	GAACACACCAGCTTGCATCTACAGCTCATTCAATCCCCTGACAGTACAAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	174784	GAACACACCAGCTTGCATCTACAGCTCATTCAATCCCCTGACAGTACAAG	174833

AL670757.5	651	CATCTGAATAATTATTCTAGGAATTGAGTTTGTTGGGTATGGGCTTTTTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	174834	CATCTGAATAATTATTCTAGGAATTGAGTTTGTTGGGTATGGGCTTTTTG	174883

AL670757.5	701	GCTTATAGGGAGAAAATGTAGGGGGATCTAGAGGACTCAATACAGCATAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	174884	GCTTATAGGGAGAAAATGTAGGGGGATCTAGAGGACTCAATACAGCATAG	174933

AL670757.5	751	AAGATCCATTTATATTGATACCAGGGACTCAGACCATGGAAAAATTCTTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	174934	AAGATCCATTTATATTGATACCAGGGACTCAGACCATGGAAAAATTCTTT	174983

AL670757.5	801	CAAATGACATAGAGCAGAAGGCCTTCTTTATAATTTTACTTTTTTTGAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	174984	CAAATGACATAGAGCAGAAGGCCTTCTTTATAATTTTACTTTTTTTGAAA	175033

AL670757.5	851	TCCTTCCCAAAGTCTTGCCTCTTGGTCTCTTGAACTCTGAATTTGATTCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175034	TCCTTCCCAAAGTCTTGCCTCTTGGTCTCTTGAACTCTGAATTTGATTCA	175083

AL670757.5	901	TAGAATAACCTTTAGGAGATGATGTTTCCCAGCTCCTGTTTTCTTACCTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175084	TAGAATAACCTTTAGGAGATGATGTTTCCCAGCTCCTGTTTTCTTACCTG	175133

AL670757.5	951	TGGGGTGGGGGAGGGGGTGTCCGTCTATCTCCCAGCTTCTTCTCGCTGGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175134	TGGGGTGGGGGAGGGGGTGTCCGTCTATCTCCCAGCTTCTTCTCGCTGGG	175183

AL670757.5	1001	AATGATACTGTGGAAAAGCATTTTGATTCTTACTGGGAAAGATGTTATAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175184	AATGATACTGTGGAAAAGCATTTTGATTCTTACTGGGAAAGATGTTATAT	175233

AL670757.5	1051	GGCTGCATAGAATTATACCAGATTCTGCAACATCCACAGGTTCAATCTCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175234	GGCTGCATAGAATTATACCAGATTCTGCAACATCCACAGGTTCAATCTCT	175283

AL670757.5	1101	ATGCCTGAGTGTACACAAGTGTTTCTCTGGGTGTTGTAGGTAGTAACAAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175284	ATGCCTGAGTGTACACAAGTGTTTCTCTGGGTGTTGTAGGTAGTAACAAC	175333

AL670757.5	1151	CAGGAGGGGGCTATTGTTTAACTTTCTATATTTTCAGTATCTAGTTTTTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175334	CAGGAGGGGGCTATTGTTTAACTTTCTATATTTTCAGTATCTAGTTTTTT	175383

AL670757.5	1201	TTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTGTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175384	TTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTGTG	175433

AL670757.5	1251	CTGGGATTAAAGGTGTGCGCCACCATGCCCGGCTCTAGTGTTTTTATAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175434	CTGGGATTAAAGGTGTGCGCCACCATGCCCGGCTCTAGTGTTTTTATAAA	175483

AL670757.5	1301	CACCTTTATTTCACTAAAACAAGGCTTTTCAACCTTGGTATTTTGTCTGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175484	CACCTTTATTTCACTAAAACAAGGCTTTTCAACCTTGGTATTTTGTCTGT	175533

AL670757.5	1351	TGAAGTGGTCACATGTGGGTTGCCTAAGGTGGTGTAGAGGACTTACTAGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175534	TGAAGTGGTCACATGTGGGTTGCCTAAGGTGGTGTAGAGGACTTACTAGA	175583

AL670757.5	1401	AAAGCTCTTCCTACCTAGTCCAAGTTTTGAAAGTGAAAATATCACAGATA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175584	AAAGCTCTTCCTACCTAGTCCAAGTTTTGAAAGTGAAAATATCACAGATA	175633

AL670757.5	1451	TTGCCAACTATTTGAGAATGAAAAAAAAAATCACTTCTAGTTGGGGAATG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175634	TTGCCAACTATTTGAGAATGAAAAAAAAAATCACTTCTAGTTGGGGAATG	175683

AL670757.5	1501	CTAATTTGTGCTCTGACCATCTCCCATCCCTTCAGATAGAGGCTGTGCGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175684	CTAATTTGTGCTCTGACCATCTCCCATCCCTTCAGATAGAGGCTGTGCGA	175733

AL670757.5	1551	TAATAGAATCGGCTTGGACTGCATCTAAACTACTTAAGGTCTGCGTCACG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175734	TAATAGAATCGGCTTGGACTGCATCTAAACTACTTAAGGTCTGCGTCACG	175783

AL670757.5	1601	GTCGGTCTTAATTGCCAACTTTATTGGGTTCAGACACATCTCTGGGTGTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175784	GTCGGTCTTAATTGCCAACTTTATTGGGTTCAGACACATCTCTGGGTGTT	175833

AL670757.5	1651	TCTGGGAGCCTTTCTAGAGAGGATTAATTGAGGTAGAAGACTACCTCTTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175834	TCTGGGAGCCTTTCTAGAGAGGATTAATTGAGGTAGAAGACTACCTCTTA	175883

AL670757.5	1701	ACATGGTTTGCTTCTTTCTCAGGGCCATACAGATAGAAAGAGGTGGTAGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175884	ACATGGTTTGCTTCTTTCTCAGGGCCATACAGATAGAAAGAGGTGGTAGG	175933

AL670757.5	1751	AAAACAATGTGCTAGTCTCCGCTGGTGTTTCTGAGTGCATCTGTTCCTGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175934	AAAACAATGTGCTAGTCTCCGCTGGTGTTTCTGAGTGCATCTGTTCCTGC	175983

AL670757.5	1801	CAATATCAGACTCCAGCTCTTTTACCTTTCAATGCAGCAAATACCCAGGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	175984	CAATATCAGACTCCAGCTCTTTTACCTTTCAATGCAGCAAATACCCAGGG	176033

AL670757.5	1851	CTTTCCTGGTGCTTTTAGCACCACACTGGGACTGCTGGTGTCCAGCTTCC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	176034	CTTTCCTGGTGCTTTTAGCACCACACTGGGACTGCTGGTGTCCAGCTTCC	176083

AL670757.5	1901	TAAACTTAGCATCTGCCAAATTCTCTTCTCCATCATCCAGTAGATATTAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	176084	TAAACTTAGCATCTGCCAAATTCTCTTCTCCATCATCCAGTAGATATTAC	176133

AL670757.5	1951	TGGACTACTTATCCCCTATCACATACACCATACACCAGTCCAAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589766.17	176134	TGGACTACTTATCCCCTATCACATACACCATACACCAGTCCAAAGAATTC	176183

Overview

Query
AL670757.5 - 92103 bps
Hit
AL589766.17 - 176183 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link