<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL591851.12	1	ACAAAGAGTCCACTTGAAGCCAAACATGCAGACTTTAATTCTTACTTGGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	214801	ACAAAGAGTCCACTTGAAGCCAAACATGCAGACTTTAATTCTTACTTGGG	214850

AL591851.12	51	CTGTTCTCATAGCCAAGGTCTACAGGCTCACATGAACTTCCCAAACCTCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	214851	CTGTTCTCATAGCCAAGGTCTACAGGCTCACATGAACTTCCCAAACCTCA	214900

AL591851.12	101	AAAGCCCTCCTGTCATTTTATGCTCTCAGCACAGGTGTTGTCTTAGCACT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	214901	AAAGCCCTCCTGTCATTTTATGCTCTCAGCACAGGTGTTGTCTTAGCACT	214950

AL591851.12	151	TACATGATAGCATTCCCACAGAACAACCAAGCAAAGCACCACTAAGAGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	214951	TACATGATAGCATTCCCACAGAACAACCAAGCAAAGCACCACTAAGAGAA	215000

AL591851.12	201	CTCATTGTGCCCGTAAAATGGGAAGTCCAAAGAGGCAAAGTCCCAGCCCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215001	CTCATTGTGCCCGTAAAATGGGAAGTCCAAAGAGGCAAAGTCCCAGCCCT	215050

AL591851.12	251	CAGCCTCCAGCCCTGGAGCTGGCTGCCCTTGGGTGTGGCAGAAGGAAACC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215051	CAGCCTCCAGCCCTGGAGCTGGCTGCCCTTGGGTGTGGCAGAAGGAAACC	215100

AL591851.12	301	TGATCTGAGGGCGAGATGACCTTGACCATCATCAGCAGAAGGACAGCAAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215101	TGATCTGAGGGCGAGATGACCTTGACCATCATCAGCAGAAGGACAGCAAG	215150

AL591851.12	351	AACATCTTGCAAGTGGAGGTTTTAGTTTACTGCTTTGTTGCCTGTACTTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215151	AACATCTTGCAAGTGGAGGTTTTAGTTTACTGCTTTGTTGCCTGTACTTA	215200

AL591851.12	401	AAATTATAGGTTGTGTGTGGCCGGGAAAGGCCTTCCAGAAGAGATAAGTA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215201	AAATTATAGGTTGTGTGTGGCCGGGAAAGGCCTTCCAGAAGAGATAAGTA	215250

AL591851.12	451	ACAAGCTATTTTAGGATGACTCTTCCCATGACATAAATTATGGTTTGGAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215251	ACAAGCTATTTTAGGATGACTCTTCCCATGACATAAATTATGGTTTGGAG	215300

AL591851.12	501	AGGAGAGAGTTTGGAGGTACCAGAGGCTAATTAGAAAGAGACAGCCCAGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215301	AGGAGAGAGTTTGGAGGTACCAGAGGCTAATTAGAAAGAGACAGCCCAGT	215350

AL591851.12	551	CTGCATGGAGGCCAGGGAGAGAGGGAACAAGAAGCCACAGACCGGAGAGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215351	CTGCATGGAGGCCAGGGAGAGAGGGAACAAGAAGCCACAGACCGGAGAGA	215400

AL591851.12	601	CCAACTCCTTTCAAACATATAATATCACCGTCTAGCCTGGCATTCAGGGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215401	CCAACTCCTTTCAAACATATAATATCACCGTCTAGCCTGGCATTCAGGGC	215450

AL591851.12	651	CGTGGACCGAAGAGTTTTCATGGTTAAAGGTAATATTCACAATTTGGGAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215451	CGTGGACCGAAGAGTTTTCATGGTTAAAGGTAATATTCACAATTTGGGAG	215500

AL591851.12	701	AAGTGGGAGAAAAGAAGTGTTTCAACTGTTTGCTAGGATAGGTTCTGAGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215501	AAGTGGGAGAAAAGAAGTGTTTCAACTGTTTGCTAGGATAGGTTCTGAGC	215550

AL591851.12	751	AGGTAAGGAGCTGAGGGCCCAGCCCAGGGAAACACACTTCCTTTGTGTGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215551	AGGTAAGGAGCTGAGGGCCCAGCCCAGGGAAACACACTTCCTTTGTGTGT	215600

AL591851.12	801	AGGAAGCCCTCAGTTCCACCCAACTTCTGCAAAACAGGGGTTTGAGGGGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215601	AGGAAGCCCTCAGTTCCACCCAACTTCTGCAAAACAGGGGTTTGAGGGGG	215650

AL591851.12	851	CTTGCTAAAATGGGTTCTATAACTGCAGCTCTGGAGTAAAAACCTTGGCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215651	CTTGCTAAAATGGGTTCTATAACTGCAGCTCTGGAGTAAAAACCTTGGCT	215700

AL591851.12	901	CCAGCTCTCTCACCAGGTAAGGCTTGTCCAGCCATCCCAACAGCCAATTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215701	CCAGCTCTCTCACCAGGTAAGGCTTGTCCAGCCATCCCAACAGCCAATTA	215750

AL591851.12	951	AAGAGACAAGGAATGGAGACAAGTGGAGATCAGGTGACATTGGGAAGAAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215751	AAGAGACAAGGAATGGAGACAAGTGGAGATCAGGTGACATTGGGAAGAAC	215800

AL591851.12	1001	AGAAAGGGGCAGTCACTCAAGTCCATCTCTGGGTACAGAACAGGGGAGAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215801	AGAAAGGGGCAGTCACTCAAGTCCATCTCTGGGTACAGAACAGGGGAGAG	215850

AL591851.12	1051	TGGGGAGTAGAGGTCTAGTCAATCACCCAGCCCCGCTCGAGGTCTCCTCG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215851	TGGGGAGTAGAGGTCTAGTCAATCACCCAGCCCCGCTCGAGGTCTCCTCG	215900

AL591851.12	1101	TTGTCTCAGTTCTGCGTCTGAAGAGTGGTCCAAAGAAGTTCGTATTGCTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215901	TTGTCTCAGTTCTGCGTCTGAAGAGTGGTCCAAAGAAGTTCGTATTGCTT	215950

AL591851.12	1151	GAGGGGGACAAGCAGGGTCTCAGGAGGTGGTCACTTCTTGCGGTTGTGGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	215951	GAGGGGGACAAGCAGGGTCTCAGGAGGTGGTCACTTCTTGCGGTTGTGGA	216000

AL591851.12	1201	TAACCGCTCTCACCTGGGGCAGGGGGAAGGCTGAGGGCTGTGTTCTGTCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	216001	TAACCGCTCTCACCTGGGGCAGGGGGAAGGCTGAGGGCTGTGTTCTGTCC	216050

AL591851.12	1251	TGACTTTGTTCTTCCTTGAATCCAAGGTGATTTTAAGCGATTTAATCTCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	216051	TGACTTTGTTCTTCCTTGAATCCAAGGTGATTTTAAGCGATTTAATCTCA	216100

AL591851.12	1301	ATAACTTCATCCTTGAAGCGGCACTGAGCTAGCTTTGGCAGACATACACG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	216101	ATAACTTCATCCTTGAAGCGGCACTGAGCTAGCTTTGGCAGACATACACG	216150

AL591851.12	1351	TGTTAGTGATTCTCATGCCTATGTGTGTGTGCGCGTGGGGCGCGGGGGGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	216151	TGTTAGTGATTCTCATGCCTATGTGTGTGTGCGCGTGGGGCGCGGGGGGA	216200

AL591851.12	1401	GGGGTGTCAATCAAAAGCCTGAACCAAGGTTAAGGGATGGACACAGAATG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	216201	GGGGTGTCAATCAAAAGCCTGAACCAAGGTTAAGGGATGGACACAGAATG	216250

AL591851.12	1451	AAGGCATAGGTGACAGGCTTTTAGTGACACTGTGGGTGAGCAAAACCAGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	216251	AAGGCATAGGTGACAGGCTTTTAGTGACACTGTGGGTGAGCAAAACCAGC	216300

AL591851.12	1501	TGCTGAGTGCCTGTTACTGCACCATATGGTCAAGACAGGAGATTATGAGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	216301	TGCTGAGTGCCTGTTACTGCACCATATGGTCAAGACAGGAGATTATGAGC	216350

AL591851.12	1551	AGGCAGATGTAAAAGGGTGATGTCACTCTTCCTGGCCATGTGAGTGTTGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	216351	AGGCAGATGTAAAAGGGTGATGTCACTCTTCCTGGCCATGTGAGTGTTGT	216400

AL591851.12	1601	GAGAACCTAGTGCTGTGGAGAGGGGTGCCAAAGGTTTAGGGAGCCTGAAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	216401	GAGAACCTAGTGCTGTGGAGAGGGGTGCCAAAGGTTTAGGGAGCCTGAAG	216450

AL591851.12	1651	TTGCACTTGGCTAGACGTTTTCACTTGGAGTCTGAAGAATGAAAGAGGAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	216451	TTGCACTTGGCTAGACGTTTTCACTTGGAGTCTGAAGAATGAAAGAGGAA	216500

AL591851.12	1701	AGACCTCCATCAGTCTTGCTCTGGTGGAGGCAGACTGGGAGACCTGGAGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	216501	AGACCTCCATCAGTCTTGCTCTGGTGGAGGCAGACTGGGAGACCTGGAGC	216550

AL591851.12	1751	TCCCAAGCCCCACTGGGCAGGCTTCTCCTCGACTCCTGCCTTGCAGCCAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	216551	TCCCAAGCCCCACTGGGCAGGCTTCTCCTCGACTCCTGCCTTGCAGCCAT	216600

AL591851.12	1801	CCTTTGGTTGCCATGGTGACCACAGCAGACAGTGTGCAGATTCTCTCCAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	216601	CCTTTGGTTGCCATGGTGACCACAGCAGACAGTGTGCAGATTCTCTCCAG	216650

AL591851.12	1851	TTCTCAAACCCCTCCCACAGACTACCATGTGTAGCCAATATGCCTCATGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	216651	TTCTCAAACCCCTCCCACAGACTACCATGTGTAGCCAATATGCCTCATGT	216700

AL591851.12	1901	AGCAATTAAAAGGAAAGATGATACCCACGCCTTCTCTAAAACGGTGGTAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	216701	AGCAATTAAAAGGAAAGATGATACCCACGCCTTCTCTAAAACGGTGGTAG	216750

AL591851.12	1951	TCTCAACTCTCCAGATAACAACCAAGTGGGCTGAGATAAACACAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589744.18	216751	TCTCAACTCTCCAGATAACAACCAAGTGGGCTGAGATAAACACAGAATTC	216800

Overview

Query
AL591851.12 - 53867 bps
Hit
AL589744.18 - 216800 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link