<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2010 bps / non-identical: 50 bps

Full alignment

AL589651.8	1	GAATTCTATGAAAATCTGGGTGTGAAATGTGTTCTGATATTTAGGAGCAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	123566	GAATTCTATGAAAATCTGGGTGTGAAATGTGTTCTGATATTTAGGAGCAT	123615

AL589651.8	51	GGGATGCAATGTGCTCTGAATGCACAGGCTTGATGATTGTCTCTGCCAAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	123616	GGGATGCAATGTGCTCTGAATGCACAGGCTTGATGATTGTCTCTGCCAAC	123665

AL589651.8	101	GTGGGAAGATAGTAGAGAATGCTGGGTAAGTCTATGTAAGCCATGTCCGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	123666	GTGGGAAGATAGTAGAGAATGCTGGGTAAGTCTATGTAAGCCATGTCCGT	123715

AL589651.8	151	TTTCACTTAAGCCAAGGCTCATCCCAGGTGTGTTGAAAGACAACCTTAAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	123716	TTTCACTTAAGCCAAGGCTCATCCCAGGTGTGTTGAAAGACAACCTTAAG	123765

AL589651.8	201	AAAATTTTATATATGTTTAAACAGTTTTGTCTTTTATTATCTGCCTGATA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	123766	AAAATTTTATATATGTTTAAACAGTTTTGTCTTTTATTATCTGCCTGATA	123815

AL589651.8	251	ATACCAATACCAAAACACTCAGAGTTATTTTCATCATTATGGTTTTATTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	123816	ATACCAATACCAAAACACTCAGAGTTATTTTCATCATTATGGTTTTATTT	123865

AL589651.8	301	CTGATATTATTCTTGGGCAGTTGCTGGGCTTTAATGGGACATACCCTAGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	123866	CTGATATTATTCTTGGGCAGTTGCTGGGCTTTAATGGGACATACCCTAGC	123915

AL589651.8	351	ATGTTTGCGTGTAGTTGGTGGTCCTCTCCAAGAACCTGTGCCATCAAAGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	123916	ATGTTTGCGTGTAGTTGGTGGTCCTCTCCAAGAACCTGTGCCATCAAAGC	123965

AL589651.8	401	AGTTCCCTGTAGCCATTTTGTAAGGTTCCCATGGCCTCTAAATAGAGTAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	123966	AGTTCCCTGTAGCCATTTTGTAAGGTTCCCATGGCCTCTAAATAGAGTAG	124015

AL589651.8	451	GTAAGTTTTAGGCCTATAATCACCAACAGTAGAGAAATGGAAAAAAGATG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124016	GTAAGTTTTAGGCCTATAATCACCAACAGTAGAGAAATGGAAAAAAGATG	124065

AL589651.8	501	TATTTCAAGCTTCTGTTGTGCTGAGCATTGAACGCGCTTTTACAAGCCCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124066	TATTTCAAGCTTCTGTTGTGCTGAGCATTGAACGCGCTTTTACAAGCCCA	124115

AL589651.8	551	TCTCTTCTCTCTTCCTGCCAGAGCAACAAGTGAGAATGCTTTTGATCTCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124116	TCTCTTCTCTCTTCCTGCCAGAGCAACAAGTGAGAATGCTTTTGATCTCA	124165

AL589651.8	601	CTTATTACCCACCCCACTCCGGTGAGTAACCTCTGATTTAAAAAAAAAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124166	CTTATTACCCACCCCACTCCGGTGAGTAACCTCTGATTTAAAAAAAAAAA	124215

AL589651.8	651	TGTTTGCTTTTTCTATTGCAGTCATTTTCCCCCAACACCCTGTAATAGTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124216	TGTTTGCTTTTTCTATTGCAGTCATTTTCCCCCAACACCCTGTAATAGTA	124265

AL589651.8	701	TAGCTAACTGTAAGTATCTTTCCTACTTGTGCAGAATAGAAGAGAGTAGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124266	TAGCTAACTGTAAGTATCTTTCCTACTTGTGCAGAATAGAAGAGAGTAGC	124315

AL589651.8	751	ATCTAACAAAAGCAGAGAATGAGTGTCGAGCATGCACAACTGGCCTGATA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124316	ATCTAACAAAAGCAGAGAATGAGTGTCGAGCATGCACAACTGGCCTGATA	124365

AL589651.8	801	CCGAACACGGGAAGTAATATAACAAACAGGATGTGTGTGGTTGTGAGCCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124366	CCGAACACGGGAAGTAATATAACAAACAGGATGTGTGTGGTTGTGAGCCT	124415

AL589651.8	851	CTTCAGAGTGGCACTGAAAGGATAAGGAGTTACAGTGGAAAGTGTTTATA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124416	CTTCAGAGTGGCACTGAAAGGATAAGGAGTTACAGTGGAAAGTGTTTATA	124465

AL589651.8	901	TCATGTCAGCATAATGTATATAGACAGAGACATTACCTAAAAGCCAGGGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124466	TCATGTCAGCATAATGTATATAGACAGAGACATTACCTAAAAGCCAGGGG	124515

AL589651.8	951	TGGGGCATGTGTCCTTGGAAAAGGGGTAACGCAGATCAAAACTTTACCAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124516	TGGGGCATGTGTCCTTGGAAAAGGGGTAACGCAGATCAAAACTTTACCAG	124565

AL589651.8	1001	AAGAGGGGCCGAGGCAATAAAAAGCATGGGGGGTGGGTATTAACCCATGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124566	AAGAGGGGCCGAGGCAATAAAAAGCATGGGGGGTGGGTATTAACCCATGC	124615

AL589651.8	1051	TAGAAAAAGAACCCACAGCCAGGAACACTTCTCAGGTGTGAGAGGGAGGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124616	TAGAAAAAGAACCCACAGCCAGGAACACTTCTCAGGTGTGAGAGGGAGGG	124665

AL589651.8	1101	AGGGAGTGGGGCAGGTTGGCAGGTTTGTGTCTGGTCATTACACAGATGTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124666	AGGGAGTGGGGCAGGTTGGCAGGTTTGTGTCTGGTCATTACACAGATGTC	124715

AL589651.8	1151	AGATCAGATGTGTACATAGAAGGAAAAAGAGAAAATCCAACTTTGGGGTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124716	AGATCAGATGTGTACATAGAAGGAAAAAGAGAAAATCCAACTTTGGGGTA	124765

AL589651.8	1201	ATGATGAGGCTAATTTGGGGTTCCAGAAGAGTACAAAGTTTCATGAAGAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124766	ATGATGAGGCTAATTTGGGGTTCCAGAAGAGTACAAAGTTTCATGAAGAC	124815

AL589651.8	1251	TCTGTATTCTATTCTTATAGCATTTCTAACTTCTCTCTTTAAAAACGATT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124816	TCTGTATTCTATTCTTATAGCATTTCTAACTTCTCTCTTTAAAAACGATT	124865

AL589651.8	1301	TCGTCTTTTAATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124866	TCGTCTTTTAATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	124915

AL589651.8	1351	TGTATGTATGTATGTATGTGCGTGTGAAAGTGTTGGTGGAGTTCAGATCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124916	TGTATGTATGTATGTATGTGCGTGTGAAAGTGTTGGTGGAGTTCAGATCT	124965

AL589651.8	1401	CCTGAATCTGGAGTTATAGGCAATTATGAACTACCCCTTGTGGGAACAGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	124966	CCTGAATCTGGAGTTATAGGCAATTATGAACTACCCCTTGTGGGAACAGA	125015

AL589651.8	1451	ATTCAGGTCCCAAGTTAGAGTAACAAATACCCTTGGCCACTGAGCAATCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	125016	ATTCAGGTCCCAAGTTAGAGTAACAAATACCCTTGGCCACTGAGCAATCT	125065

AL589651.8	1501	CTGCAGGCCATCATCTTTCTGAGACAGGGTCTCACATAGTACCTCAGGCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	125066	CTGCAGGCCATCATCTTTCTGAGACAGGGTCTCACATAGTACCTCAGGCT	125115

AL589651.8	1551	AGTATGCAGCTTAACTAGGAACCTCATGTTAGCATTGAAACCATGGCAAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	125116	AGTATGCAGCTTAACTAGGAACCTCATGTTAGCATTGAAACCATGGCAAT	125165

AL589651.8	1601	CCTCCTACCTTTGCTTCCTAAGTGCTAGGATTTCAGGAGTAAGCTACCAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	125166	CCTCCTACCTTTGCTTCCTAAGTGCTAGGATTTCAGGAGTAAGCTACCAT	125215

AL589651.8	1651	GCCCAGGTCAATTCCAACTTTTTAAAACATTGATATTTAATATAATTTTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	125216	GCCCAGGTCAATTCCAACTTTTTAAAACATTGATATTTAATATAATTTTC	125265

AL589651.8	1701	TTGATATTTAAACTTGAAAGTTAGAGAATTTTAGTATAACTTGTGTTCCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	125266	TTGATATTTAAACTTGAAAGTTAGAGAATTTTAGTATAACTTGTGTTCCT	125315

AL589651.8	1751	GGAATCACCATCTATAGTTGATGGGTATGCAGAATTATTGTTTGTTTTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	125316	GGAATCACCATCTATAGTTGATGGGTATGCAGAATTATTGTTTGTTTTTT	125365

AL589651.8	1801	AAGTTAAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	1850
			|||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	125366	AAGTTAAATTT----------TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	125405

AL589651.8	1851	GTGTGTGTACACCTTATGTAACCCTGGCTGTATGTAGGCCAGGCTGATCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	125406	GTGTGTGTACACCTTATGTAACCCTGGCTGTATGTAGGCCAGGCTGATCT	125455

AL589651.8	1901	TGAACAGAGAGATGCACCCTAGGATTAGACTTAGGCAGTATGCTTTGTAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	125456	TGAACAGAGAGATGCACCCTAGGATTAGACTTAGGCAGTATGCTTTGTAG	125505

AL589651.8	1951	ACCTACTGTAAGGTATCCTTGGCTCTGAGCTTTAATGATGAGAGATTCCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	125506	ACCTACTGTAAGGTATCCTTGGCTCTGAGCTTTAATGATGAGAGATTCCT	125555

AL589651.8	2001	AAGCATGATT	2010
			||||||||||
AL589742.22	125556	AAGCATGATT	125565

Compact alignment

skip 1800 bps 100% identity alignment

AL589651.8	1801	AAGTTAAATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	1850
			|||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||
AL589742.22	125366	AAGTTAAATTT----------TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	125405

skip 160 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AL589651.8 - 222823 bps
Hit
AL589742.22 - 125565 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2010 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link