<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL590625.16	1	GGCTGTGGATCTCTGCATCTGTTTCAGTCAGCTGCTGAGTGAAGCCTCTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	185710	GGCTGTGGATCTCTGCATCTGTTTCAGTCAGCTGCTGAGTGAAGCCTCTC	185759

AL590625.16	51	AGAGGACAGTTATGCTAGGTTCCTGTCCATAAGCAAAATAGAGTATCATT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	185760	AGAGGACAGTTATGCTAGGTTCCTGTCCATAAGCAAAATAGAGTATCATT	185809

AL590625.16	101	AATAGTGTCAGGATTGGTTCTTGCCCATGGATGGGTCTCAGTTTTAGCCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	185810	AATAGTGTCAGGATTGGTTCTTGCCCATGGATGGGTCTCAGTTTTAGCCA	185859

AL590625.16	151	GTTTTTGGTTGGCCATTCCTTCAGTTTTTGCTCTACCTTTGTCCCTGCAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	185860	GTTTTTGGTTGGCCATTCCTTCAGTTTTTGCTCTACCTTTGTCCCTGCAC	185909

AL590625.16	201	TTTCTTGTAGGCAGGACACATTCTGGTGTCCTTAACCCTCCATGGGGAGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	185910	TTTCTTGTAGGCAGGACACATTCTGGTGTCCTTAACCCTCCATGGGGAGT	185959

AL590625.16	251	CTTGTCTAGGGGAGGTGGGGGAAGGGCTAAGGGAGATGGGACTCAGGGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	185960	CTTGTCTAGGGGAGGTGGGGGAAGGGCTAAGGGAGATGGGACTCAGGGGA	186009

AL590625.16	301	GTTCAATCTAGATGTAAGGTGAATGAATAAATTAATTACAAAATAAATGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186010	GTTCAATCTAGATGTAAGGTGAATGAATAAATTAATTACAAAATAAATGA	186059

AL590625.16	351	AAGTATAAAATAATATATTAGATTTTTTGGAACACAGTTTCTAGACTGGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186060	AAGTATAAAATAATATATTAGATTTTTTGGAACACAGTTTCTAGACTGGA	186109

AL590625.16	401	GTGGGTTCTGTGTCCAACAAGGAAAAGCAGAAAGAATATGGATCCTTGCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186110	GTGGGTTCTGTGTCCAACAAGGAAAAGCAGAAAGAATATGGATCCTTGCT	186159

AL590625.16	451	GTCATCACTGACCTGTTAGCTCAGCATTCTCAGTGACATAAGCTGCATTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186160	GTCATCACTGACCTGTTAGCTCAGCATTCTCAGTGACATAAGCTGCATTC	186209

AL590625.16	501	CCATTGTTTATAGCATGAATCACATCCATGAAGATATCCTTGGGCTTTGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186210	CCATTGTTTATAGCATGAATCACATCCATGAAGATATCCTTGGGCTTTGT	186259

AL590625.16	551	TTCAATGGGAGTTGAAATTTGACATACCATTTTGATTTGAGAAGGTATGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186260	TTCAATGGGAGTTGAAATTTGACATACCATTTTGATTTGAGAAGGTATGA	186309

AL590625.16	601	CCTTATAATCTACTTAAGGCCACAATAAAATCCTACATTTTTGTGTGGCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186310	CCTTATAATCTACTTAAGGCCACAATAAAATCCTACATTTTTGTGTGGCA	186359

AL590625.16	651	TGGTCTCACTGGGTACCTCTGGGTAGCCTGGAACTCACTGTGTAGACCAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186360	TGGTCTCACTGGGTACCTCTGGGTAGCCTGGAACTCACTGTGTAGACCAG	186409

AL590625.16	701	GTTAACACCAAACTTGCAGCGACTCTACTTCCCAAGTCCTGGGTTTGAAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186410	GTTAACACCAAACTTGCAGCGACTCTACTTCCCAAGTCCTGGGTTTGAAG	186459

AL590625.16	751	ATATGTACCACCATGCCTAACCTACGATCTCTCTTTAGTCTTCAACACCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186460	ATATGTACCACCATGCCTAACCTACGATCTCTCTTTAGTCTTCAACACCC	186509

AL590625.16	801	TTGCTCTTCTTTCTCTTTAATCAGAGTTGTGAGCCTACTCCAGGCCTTCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186510	TTGCTCTTCTTTCTCTTTAATCAGAGTTGTGAGCCTACTCCAGGCCTTCC	186559

AL590625.16	851	GCAAATATCCTGAACCCCAAGGCTGGGTATAGAGATCAGCATAGTTTAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186560	GCAAATATCCTGAACCCCAAGGCTGGGTATAGAGATCAGCATAGTTTAAA	186609

AL590625.16	901	CAGTGCTGACCTCAAGGTCTTCATTGTACTAATCCTGAGGGTTGGCCTCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186610	CAGTGCTGACCTCAAGGTCTTCATTGTACTAATCCTGAGGGTTGGCCTCA	186659

AL590625.16	951	GTGCCTCCATAGTGTAGGAATGAAGTGAGTGCAACTGAATTAGAGAAGAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186660	GTGCCTCCATAGTGTAGGAATGAAGTGAGTGCAACTGAATTAGAGAAGAG	186709

AL590625.16	1001	CAATTCTCACACAACACATGCCTAAAAATGGGCTACCTCACACAAAAGAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186710	CAATTCTCACACAACACATGCCTAAAAATGGGCTACCTCACACAAAAGAC	186759

AL590625.16	1051	AATGGGAGAGTCACGTGATCATCCAAGGACTTTAACCTGCTCTGCCTGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186760	AATGGGAGAGTCACGTGATCATCCAAGGACTTTAACCTGCTCTGCCTGTG	186809

AL590625.16	1101	TTGAGGAAGTCAGTATCACATGCTTTTCATAGGGAGGCTGACTAAAGAGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186810	TTGAGGAAGTCAGTATCACATGCTTTTCATAGGGAGGCTGACTAAAGAGA	186859

AL590625.16	1151	AAAGGAGAAAAAAAAGCCCAGTCAGCCCCTCTCCTTGTTTATCAACATTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186860	AAAGGAGAAAAAAAAGCCCAGTCAGCCCCTCTCCTTGTTTATCAACATTT	186909

AL590625.16	1201	TCCAAAGGGCATCTAGAAAGGAGAAAGACAGCCCAGGCTCCCTCTCTCTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186910	TCCAAAGGGCATCTAGAAAGGAGAAAGACAGCCCAGGCTCCCTCTCTCTT	186959

AL590625.16	1251	GTGACATTTGAACAATCAACCCAAGGTCATTTGTTGGGACCTCTGGATAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	186960	GTGACATTTGAACAATCAACCCAAGGTCATTTGTTGGGACCTCTGGATAT	187009

AL590625.16	1301	TTTGGCTCCATTTGCACCATGTCTTCCCATAGCTGGGCCTCTTAGTCCTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	187010	TTTGGCTCCATTTGCACCATGTCTTCCCATAGCTGGGCCTCTTAGTCCTC	187059

AL590625.16	1351	CACCCTCTCCTCATATCAACATGACCTGAGAGCCAAGATGACTGTCAGCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	187060	CACCCTCTCCTCATATCAACATGACCTGAGAGCCAAGATGACTGTCAGCC	187109

AL590625.16	1401	TCTGTCTAGCATACAGCCCTCCTGTACCACCGCCATCGTACTTAACTTCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	187110	TCTGTCTAGCATACAGCCCTCCTGTACCACCGCCATCGTACTTAACTTCT	187159

AL590625.16	1451	GAGGTAGCCTCTGTTCTGGGGCCATTTTGTCTCTAAAAGGTTGTATAGAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	187160	GAGGTAGCCTCTGTTCTGGGGCCATTTTGTCTCTAAAAGGTTGTATAGAC	187209

AL590625.16	1501	TTCCTTGTGGACCCTCATCTTTCAAGTTTAAGCTTTGAAGACAGAGTCCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	187210	TTCCTTGTGGACCCTCATCTTTCAAGTTTAAGCTTTGAAGACAGAGTCCT	187259

AL590625.16	1551	TGACAACTCCCATGAGTATTTCTCCCACACCTAAAACTCTGCCTATCTCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	187260	TGACAACTCCCATGAGTATTTCTCCCACACCTAAAACTCTGCCTATCTCA	187309

AL590625.16	1601	GGACAGGCACTTAGAATGCATTTGTGGAACCAAAGAGCTGGTGATTAATG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	187310	GGACAGGCACTTAGAATGCATTTGTGGAACCAAAGAGCTGGTGATTAATG	187359

AL590625.16	1651	AGGATACACAATACACACACACACACACACACACACACACACAATTTGTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	187360	AGGATACACAATACACACACACACACACACACACACACACACAATTTGTG	187409

AL590625.16	1701	CACATGTACTGGCCTCATTCTTTTCTGTTACACAAGGCTTCCTACCTCTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	187410	CACATGTACTGGCCTCATTCTTTTCTGTTACACAAGGCTTCCTACCTCTG	187459

AL590625.16	1751	AAAAGCCAGAAAAGTCATATGATGACCAGCAAAAATACTCTTAATGCCTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	187460	AAAAGCCAGAAAAGTCATATGATGACCAGCAAAAATACTCTTAATGCCTG	187509

AL590625.16	1801	TGTTTCAGAAAAGAAAGGCGGAGGATGACCCTCCCCTACTGGCTTTGCTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	187510	TGTTTCAGAAAAGAAAGGCGGAGGATGACCCTCCCCTACTGGCTTTGCTA	187559

AL590625.16	1851	ATAAGCCCAGAAAATTCCTCTGGATGGTGAATGTCAATCTGTGTCTTTAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	187560	ATAAGCCCAGAAAATTCCTCTGGATGGTGAATGTCAATCTGTGTCTTTAC	187609

AL590625.16	1901	TTGACCAGCCACTAAAGTAGTAGTAGTAGTAAAGTCAGGGGTTACATGAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	187610	TTGACCAGCCACTAAAGTAGTAGTAGTAGTAAAGTCAGGGGTTACATGAC	187659

AL590625.16	1951	CACCTCCCATCTCATAGCTGGGTGATTACATGCAAAGCAGGATGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589738.6	187660	CACCTCCCATCTCATAGCTGGGTGATTACATGCAAAGCAGGATGGAATTC	187709

Overview

Query
AL590625.16 - 165745 bps
Hit
AL589738.6 - 187709 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link