<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645799.5	1	ACTCCTTATATATTGCTTTCTCAATTTATTTCCCTGGATAAAACTTCTAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	200856	ACTCCTTATATATTGCTTTCTCAATTTATTTCCCTGGATAAAACTTCTAG	200905

AL645799.5	51	TGCTAGGTTGTGGAAGCATTGTCTTATGTCTGATGTTAGGATGGGAGCAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	200906	TGCTAGGTTGTGGAAGCATTGTCTTATGTCTGATGTTAGGATGGGAGCAT	200955

AL645799.5	101	GCAGCTTTTCTTTATTCAGTATACTGTGAACTAAAGGATTCATGTAGATT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	200956	GCAGCTTTTCTTTATTCAGTATACTGTGAACTAAAGGATTCATGTAGATT	201005

AL645799.5	151	TCCTTTACTGACTTGAAGAAGTTCTCTGGACTGGAAAGATGGCTCAGCAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201006	TCCTTTACTGACTTGAAGAAGTTCTCTGGACTGGAAAGATGGCTCAGCAG	201055

AL645799.5	201	TTAACAGCACTGTATGCTCTTCAAGGGCATACATATGGTGGTTCATAACC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201056	TTAACAGCACTGTATGCTCTTCAAGGGCATACATATGGTGGTTCATAACC	201105

AL645799.5	251	AGTGTACCTGCAAGTTCTAGGGGATCCAACACCCTTTTCTGGCCTTTGAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201106	AGTGTACCTGCAAGTTCTAGGGGATCCAACACCCTTTTCTGGCCTTTGAG	201155

AL645799.5	301	AACACCAAACATACATATGGTACATAGATATACATGCAGGCAAACACCTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201156	AACACCAAACATACATATGGTACATAGATATACATGCAGGCAAACACCTA	201205

AL645799.5	351	ATCTCTAACTAACTTGATTATGTATTTTTAACACGTGTTGTTGGCATATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201206	ATCTCTAACTAACTTGATTATGTATTTTTAACACGTGTTGTTGGCATATT	201255

AL645799.5	401	TTTAGGCTACTTTATTGAGTTCTTATACCTCTACCTCCCTTCCAACCCTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201256	TTTAGGCTACTTTATTGAGTTCTTATACCTCTACCTCCCTTCCAACCCTT	201305

AL645799.5	451	TTCTACCCTAATCCCTTCCAAACCCCAGTAACAATCCATGCTGGCACATC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201306	TTCTACCCTAATCCCTTCCAAACCCCAGTAACAATCCATGCTGGCACATC	201355

AL645799.5	501	AAGTCTCACTAGGACTAAATGCAACCTATACCACTGAGGCCAAACAAAAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201356	AAGTCTCACTAGGACTAAATGCAACCTATACCACTGAGGCCAAACAAAAC	201405

AL645799.5	551	AGCATAGCTAGGGGGAAGCGTCCAAGTAAGAGACAGCATCCCAAGCTCCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201406	AGCATAGCTAGGGGGAAGCGTCCAAGTAAGAGACAGCATCCCAAGCTCCA	201455

AL645799.5	601	ATTTTGGGGGGACCCACATGGAGACCAAGATTCAAATCAGCTACATATGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201456	ATTTTGGGGGGACCCACATGGAGACCAAGATTCAAATCAGCTACATATGT	201505

AL645799.5	651	GTAGGGGGCCTAGGTACAGTCCCTGCATGCTCTTTGACTGGTGATTCAGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201506	GTAGGGGGCCTAGGTACAGTCCCTGCATGCTCTTTGACTGGTGATTCAGA	201555

AL645799.5	701	GTCTGTGAGCCCTCATGGGAAAGACATTCATGGTATGTGTTCATTGATAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201556	GTCTGTGAGCCCTCATGGGAAAGACATTCATGGTATGTGTTCATTGATAA	201605

AL645799.5	751	GTGGATATTAGCCATTCCTTCAATTGCTGCTCCATTTTTAACCTTGTACA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201606	GTGGATATTAGCCATTCCTTCAATTGCTGCTCCATTTTTAACCTTGTACA	201655

AL645799.5	801	TCTTGAAGGCAGGACAAATTTGGGGTGGAAAGTTTTGTGGGAGGGTTGCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201656	TCTTGAAGGCAGGACAAATTTGGGGTGGAAAGTTTTGTGGGAGGGTTGCT	201705

AL645799.5	851	ATCCTTTCCATCCACTGGAAGTGTTGTCTCGATACAGGAGGTGGCCACTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201706	ATCCTTTCCATCCACTGGAAGTGTTGTCTCGATACAGGAGGTGGCCACTT	201755

AL645799.5	901	CAGGCTCCATATCTCCTGCTGGGCCAACCAATCTGAGACCCACCCCAAGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201756	CAGGCTCCATATCTCCTGCTGGGCCAACCAATCTGAGACCCACCCCAAGG	201805

AL645799.5	951	GAGAGAACCAACCCCTGACACTATTAAAGATACTCTGCTATGCTTACAGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201806	GAGAGAACCAACCCCTGACACTATTAAAGATACTCTGCTATGCTTACAGA	201855

AL645799.5	1001	CAGGAGTCTAGAATAAACTGTCTCCTGAGAGGTTTCATCCAACAGCAAAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201856	CAGGAGTCTAGAATAAACTGTCTCCTGAGAGGTTTCATCCAACAGCAAAT	201905

AL645799.5	1051	GGAAATAGATGCAGAATCCCACAGCCAATCATCAGGTGAAGCATGGGAAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201906	GGAAATAGATGCAGAATCCCACAGCCAATCATCAGGTGAAGCATGGGAAG	201955

AL645799.5	1101	TCCTGTAGAAAGATTAAGGAAACTGGAGGGGGTCAAGGACACTGTAAGAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	201956	TCCTGTAGAAAGATTAAGGAAACTGGAGGGGGTCAAGGACACTGTAAGAC	202005

AL645799.5	1151	GATCTACAGAGGCAAATCCAGTCTTCATCAGCATAATATCCAGCAGTCCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	202006	GATCTACAGAGGCAAATCCAGTCTTCATCAGCATAATATCCAGCAGTCCA	202055

AL645799.5	1201	GCAAACCAGCAAACCAGTAATCCATCAGTGCGAATGCAGCAGCAGAAACT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	202056	GCAAACCAGCAAACCAGTAATCCATCAGTGCGAATGCAGCAGCAGAAACT	202105

AL645799.5	1251	AACAGGAAGCTGAAGCAGGGGGAGGTGCAGCAGGGAGAGTAGCAACCCTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	202106	AACAGGAAGCTGAAGCAGGGGGAGGTGCAGCAGGGAGAGTAGCAACCCTC	202155

AL645799.5	1301	TTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	202156	TTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCCT	202205

AL645799.5	1351	CCTCCTCCTCCTCTTTCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	202206	CCTCCTCCTCCTCTTTCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC	202255

AL645799.5	1401	TCCCCCCTCCCCCCGCTTCTTCTCACACGTACTAGTGTAAGAGGTAAATC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	202256	TCCCCCCTCCCCCCGCTTCTTCTCACACGTACTAGTGTAAGAGGTAAATC	202305

AL645799.5	1451	ATAATCACCTGCTGTGAATCAGCCTCTTCTCCCACACCTGGGATTTTAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	202306	ATAATCACCTGCTGTGAATCAGCCTCTTCTCCCACACCTGGGATTTTAAA	202355

AL645799.5	1501	AAATCCAAATCCACTTAACATAATTGGATTTTTAAAGAAACCCAAATTCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	202356	AAATCCAAATCCACTTAACATAATTGGATTTTTAAAGAAACCCAAATTCT	202405

AL645799.5	1551	CACTACAGTGTGTTACTATGGTATGTCATATTGATTCATTTTTTTGAATA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	202406	CACTACAGTGTGTTACTATGGTATGTCATATTGATTCATTTTTTTGAATA	202455

AL645799.5	1601	GGTAATAATATAAATCTTATTTGATCTTGATGAATATTTTAACGTGTCAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	202456	GGTAATAATATAAATCTTATTTGATCTTGATGAATATTTTAACGTGTCAC	202505

AL645799.5	1651	CAAGCTTTACTTGCTAATATTTAGTAATAAGTATTTACTAATAAATTTGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	202506	CAAGCTTTACTTGCTAATATTTAGTAATAAGTATTTACTAATAAATTTGT	202555

AL645799.5	1701	ATCTATATGGTCTTGTATTTTATTTTATTTTGCTTGTTTAATCTTTGCTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	202556	ATCTATATGGTCTTGTATTTTATTTTATTTTGCTTGTTTAATCTTTGCTT	202605

AL645799.5	1751	ATCTCATCCTAATTTTGTGATCCGAGTAATATTACCTTTATAAAACTACT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	202606	ATCTCATCCTAATTTTGTGATCCGAGTAATATTACCTTTATAAAACTACT	202655

AL645799.5	1801	TGTGACGGGGGTATATGGGGTGGTATGTGGACGTAGCTGGGCGGTAGAAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	202656	TGTGACGGGGGTATATGGGGTGGTATGTGGACGTAGCTGGGCGGTAGAAT	202705

AL645799.5	1851	CCATGCCTATCATATACAAGAGCTGGGCCACACCCAGCCACCTATTAGAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	202706	CCATGCCTATCATATACAAGAGCTGGGCCACACCCAGCCACCTATTAGAT	202755

AL645799.5	1901	AAATTAAATATATGACATAATTGGGAAAGTTTCTTTCATTTATATTTTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	202756	AAATTAAATATATGACATAATTGGGAAAGTTTCTTTCATTTATATTTTTT	202805

AL645799.5	1951	GGAAAGGGCTGCATAGAATTAGTGTCAACCCTGTGTACATGTAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589737.11	202806	GGAAAGGGCTGCATAGAATTAGTGTCAACCCTGTGTACATGTAGGAATTC	202855

Overview

Query
AL645799.5 - 63170 bps
Hit
AL589737.11 - 202855 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link