<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1582 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  AL589766.17	1582	GAATTCCTTAGCACACAAAGTAGAAAATTAAAGGCTTACACAGAAAAAAA	1533
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	1	GAATTCCTTAGCACACAAAGTAGAAAATTAAAGGCTTACACAGAAAAAAA	50

C  AL589766.17	1532	CTTCTAATGTAATCATAAAAGGTCTACTGAAACTATGTCAATAGGAACTG	1483
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	51	CTTCTAATGTAATCATAAAAGGTCTACTGAAACTATGTCAATAGGAACTG	100

C  AL589766.17	1482	ACCTAGCAGAAATCATAGTACTTTATACTAATACTGAAATTATATAATTA	1433
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	101	ACCTAGCAGAAATCATAGTACTTTATACTAATACTGAAATTATATAATTA	150

C  AL589766.17	1432	TGAGTAATAAAGATTGGCAAAGAGCTTGTAGCAACTATTTGGGAGAAATT	1383
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	151	TGAGTAATAAAGATTGGCAAAGAGCTTGTAGCAACTATTTGGGAGAAATT	200

C  AL589766.17	1382	AACAGCAAATATCCTAAAAGCAAGCATCTTCAGTTTATAAAAAGAACGAA	1333
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	201	AACAGCAAATATCCTAAAAGCAAGCATCTTCAGTTTATAAAAAGAACGAA	250

C  AL589766.17	1332	TTGAATTCTCTCATATATTGTTAAAAACAAAAACAAAAACAACAAAAAAA	1283
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	251	TTGAATTCTCTCATATATTGTTAAAAACAAAAACAAAAACAACAAAAAAA	300

C  AL589766.17	1282	ATTTTTTTCTTTTTTTTTCCTTTCCATTTTTTATTAGGTATTTACCTCAT	1233
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	301	ATTTTTTTCTTTTTTTTTCCTTTCCATTTTTTATTAGGTATTTACCTCAT	350

C  AL589766.17	1232	TTACATTTCCAATGCTATACCAAAAGTCCCCCATAGCCACCCACTCCCAC	1183
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	351	TTACATTTCCAATGCTATACCAAAAGTCCCCCATAGCCACCCACTCCCAC	400

C  AL589766.17	1182	TCCCCTACCCACCCACTCACCCTTTTTGGCCCTGGCGTTCCCCTGTACTG	1133
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	401	TCCCCTACCCACCCACTCACCCTTTTTGGCCCTGGCGTTCCCCTGTACTG	450

C  AL589766.17	1132	GGGCATAAAAAGTTTGCGTGTCCAATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATGGCC	1083
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	451	GGGCATAAAAAGTTTGCGTGTCCAATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATGGCC	500

C  AL589766.17	1082	GACTAGGCCATCTTTTGATACATATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCCGGGG	1033
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	501	GACTAGGCCATCTTTTGATACATATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCCGGGG	550

C  AL589766.17	1032	TACTGGTTAGTTCATAATGTTGTTCCACCTATAGGGTTGCAGATCCCTTT	983
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	551	TACTGGTTAGTTCATAATGTTGTTCCACCTATAGGGTTGCAGATCCCTTT	600

C  AL589766.17	982	AGCTCCTTGGGTACTTTCTCGAGCTCCTCCATTGGGAGCCCTGTGATTCA	933
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	601	AGCTCCTTGGGTACTTTCTCGAGCTCCTCCATTGGGAGCCCTGTGATTCA	650

C  AL589766.17	932	TCCATTAGCTGACTGTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAGGCCCCGGCA	883
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	651	TCCATTAGCTGACTGTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAGGCCCCGGCA	700

C  AL589766.17	882	TAGTCTCACAAGAGACAGCTACATCTGGGTCCTTTCGATAAAATCTTCCT	833
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	701	TAGTCTCACAAGAGACAGCTACATCTGGGTCCTTTCGATAAAATCTTCCT	750

C  AL589766.17	832	AGTGTATGCAAAGGTGTCAGCGTTTGGATGCTGATTATGGGGTAGATCCC	783
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	751	AGTGTATGCAAAGGTGTCAGCGTTTGGATGCTGATTATGGGGTAGATCCC	800

C  AL589766.17	782	TGGATATGGCAGTCTCTACATGGTCCATCCTTTCATCTCAGCTCCAAACG	733
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	801	TGGATATGGCAGTCTCTACATGGTCCATCCTTTCATCTCAGCTCCAAACG	850

C  AL589766.17	732	TTGTCTCTGTAACTCCTTCCAAGGGTGTTTTGTTCCCACTTCTAAGGAGG	683
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	851	TTGTCTCTGTAACTCCTTCCAAGGGTGTTTTGTTCCCACTTCTAAGGAGG	900

C  AL589766.17	682	GGCATAGTGTCCACACTTCAGTCTTCATTTTTCTTGAGTTTCATGTGTTT	633
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	901	GGCATAGTGTCCACACTTCAGTCTTCATTTTTCTTGAGTTTCATGTGTTT	950

C  AL589766.17	632	AGGAAATTGTATCTTATATCTTGGGTATCCTAGGTTTTGGGCTAATATCC	583
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	951	AGGAAATTGTATCTTATATCTTGGGTATCCTAGGTTTTGGGCTAATATCC	1000

C  AL589766.17	582	ACTTATCAGTGAGTACATATTGTGTGAGTTCCTTTGTGAATGTGTTACCT	533
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	1001	ACTTATCAGTGAGTACATATTGTGTGAGTTCCTTTGTGAATGTGTTACCT	1050

C  AL589766.17	532	CACTCAGGATGATGCCCTCCAGGTCCATCCATTTGGCTAGGAATTTCATA	483
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	1051	CACTCAGGATGATGCCCTCCAGGTCCATCCATTTGGCTAGGAATTTCATA	1100

C  AL589766.17	482	AATTCATTGTTTTTAATAGCTGACTAGTACTCCATTGTGTAGATGTACCA	433
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	1101	AATTCATTGTTTTTAATAGCTGACTAGTACTCCATTGTGTAGATGTACCA	1150

C  AL589766.17	432	CATTTTCTGTATCCATTCCTCTGTTGAGGGGCATCTGAGTTCTTTCCAGC	383
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	1151	CATTTTCTGTATCCATTCCTCTGTTGAGGGGCATCTGAGTTCTTTCCAGC	1200

C  AL589766.17	382	TTCTGGCTATTATAAATAAGGCTGCTATGAACATAGTGGAGCATGTGTCC	333
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	1201	TTCTGGCTATTATAAATAAGGCTGCTATGAACATAGTGGAGCATGTGTCC	1250

C  AL589766.17	332	TTCTTACCGGTTGGGGCATCTTCTGGATATATGCCCAGGAGAGGTATTGC	283
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	1251	TTCTTACCGGTTGGGGCATCTTCTGGATATATGCCCAGGAGAGGTATTGC	1300

C  AL589766.17	282	TGGATCCTCCGGTAGTACTATGTCCAATTTTCTGAGGAACCTCCAGACTG	233
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	1301	TGGATCCTCCGGTAGTACTATGTCCAATTTTCTGAGGAACCTCCAGACTG	1350

C  AL589766.17	232	ATTTCCAGAGTGGTTGTACAAGCCTGCAATCCCACCAACATTGGAGGAGT	183
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	1351	ATTTCCAGAGTGGTTGTACAAGCCTGCAATCCCACCAACATTGGAGGAGT	1400

C  AL589766.17	182	GTTCCTCTTTCTCCACATCCACGCCAGCATCTGCTGTCACCTGAATTTTT	133
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	1401	GTTCCTCTTTCTCCACATCCACGCCAGCATCTGCTGTCACCTGAATTTTT	1450

C  AL589766.17	132	GATCTTAGCCATTCTAACTGGTGTGAGGAGGAATTTCAGGGTTGTTTTGA	83
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	1451	GATCTTAGCCATTCTAACTGGTGTGAGGAGGAATTTCAGGGTTGTTTTGA	1500

C  AL589766.17	82	TTTGCATTTCCCTGATGATTAAGGATGTTGAACATTTTTTCAGGTGCTTC	33
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	1501	TTTGCATTTCCCTGATGATTAAGGATGTTGAACATTTTTTCAGGTGCTTC	1550

C  AL589766.17	32	TCTGCCATTCGGTATTCCTCAGGTGAGAATTC	1
			||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL589735.12	1551	TCTGCCATTCGGTATTCCTCAGGTGAGAATTC	1582

Overview

Query
AL589766.17 - 176183 bps
Hit
AL589735.12 - 199957 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1582 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link