<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645587.9	1	AAATAAGTAAATAAAATAAAATAGAATAGAATGTGTTGTACCAATGAGCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	217201	AAATAAGTAAATAAAATAAAATAGAATAGAATGTGTTGTACCAATGAGCT	217250

AL645587.9	51	ACATCCCCAGCCAGTCCCTCTGCTTTTTCTAAGGCATGGGAGTGTTTCAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	217251	ACATCCCCAGCCAGTCCCTCTGCTTTTTCTAAGGCATGGGAGTGTTTCAT	217300

AL645587.9	101	TACTGTTCTGTGAGAGGCCTCTTCTGTGACAATAGGGAAAACAAGACACA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	217301	TACTGTTCTGTGAGAGGCCTCTTCTGTGACAATAGGGAAAACAAGACACA	217350

AL645587.9	151	CCTGTAAGTCCCAGGAAGACGTTACTCGTTAGTCTCTAGTAAGAGCTGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	217351	CCTGTAAGTCCCAGGAAGACGTTACTCGTTAGTCTCTAGTAAGAGCTGAA	217400

AL645587.9	201	AAATCACGAAGGTAAGCCTTCATACCACTGAGTGGCCTCTCCACAGGCTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	217401	AAATCACGAAGGTAAGCCTTCATACCACTGAGTGGCCTCTCCACAGGCTA	217450

AL645587.9	251	GGTGGACAGTATAAGCATTTCCTACAGGATGTGATGGCAGTACTGAGGGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	217451	GGTGGACAGTATAAGCATTTCCTACAGGATGTGATGGCAGTACTGAGGGC	217500

AL645587.9	301	AGAATTAGGGAGTTGATCAATCTAATCACCCTAACATAATGGTAGACATC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	217501	AGAATTAGGGAGTTGATCAATCTAATCACCCTAACATAATGGTAGACATC	217550

AL645587.9	351	AAATTCAGCAGATGTGCAATGTGCAGCTGATTCGAAAGCATTGAGGGCGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	217551	AAATTCAGCAGATGTGCAATGTGCAGCTGATTCGAAAGCATTGAGGGCGT	217600

AL645587.9	401	CAGTGGAACTCAAATAACAAGGCAAGTGTACTGGCCAACCACAGCGGCCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	217601	CAGTGGAACTCAAATAACAAGGCAAGTGTACTGGCCAACCACAGCGGCCC	217650

AL645587.9	451	TCAATGGGCAATAACTAGGGACACCTGCCCTGCGGGGAGATGGTGATATG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	217651	TCAATGGGCAATAACTAGGGACACCTGCCCTGCGGGGAGATGGTGATATG	217700

AL645587.9	501	TGGTGAAGTGAAAGGGAACAGCCATGCCTATGTACAGGCACACTATTTTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	217701	TGGTGAAGTGAAAGGGAACAGCCATGCCTATGTACAGGCACACTATTTTC	217750

AL645587.9	551	TAGAGAACATTTATTTGCAAGGAAAAGCCATTCTATGTCAACAAAGGCAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	217751	TAGAGAACATTTATTTGCAAGGAAAAGCCATTCTATGTCAACAAAGGCAT	217800

AL645587.9	601	GTTGGGCATAGAAGGAAAGACTCATTTTTGTCATAGTTGTTGCCCAAATG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	217801	GTTGGGCATAGAAGGAAAGACTCATTTTTGTCATAGTTGTTGCCCAAATG	217850

AL645587.9	651	AGTAGCCGTGACCAGCAATAGGACAAAGTCCTTGTATACTGAGTAGCAGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	217851	AGTAGCCGTGACCAGCAATAGGACAAAGTCCTTGTATACTGAGTAGCAGA	217900

AL645587.9	701	TTCTGTACAACGGTTCATTCAAACATCCTCTGTGTGGTCACTTCTGGGCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	217901	TTCTGTACAACGGTTCATTCAAACATCCTCTGTGTGGTCACTTCTGGGCA	217950

AL645587.9	751	CTGAGAATGAGCAAGAACACAGGGGGCTCTACTGAGCCACACAGTATTGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	217951	CTGAGAATGAGCAAGAACACAGGGGGCTCTACTGAGCCACACAGTATTGC	218000

AL645587.9	801	CAGTCTTCCCTCTGCCATCTTTGCTGGCGACCACAGAGTGGAAAGTCTGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218001	CAGTCTTCCCTCTGCCATCTTTGCTGGCGACCACAGAGTGGAAAGTCTGC	218050

AL645587.9	851	TCCTACTTACACGGTCATCTCACTGTGTCCTTTCCTCACTCTGTAAGTTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218051	TCCTACTTACACGGTCATCTCACTGTGTCCTTTCCTCACTCTGTAAGTTC	218100

AL645587.9	901	AAAGTCTCCCATTAAATGACCAGTGAGCCAAAATGGGCGGACACCTTTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218101	AAAGTCTCCCATTAAATGACCAGTGAGCCAAAATGGGCGGACACCTTTTT	218150

AL645587.9	951	TTTATAGTTAAGTTTGTCCTTATAGTTTCAAATGTTTTGGGCATCACACA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218151	TTTATAGTTAAGTTTGTCCTTATAGTTTCAAATGTTTTGGGCATCACACA	218200

AL645587.9	1001	AAATGTAACTTGTGTGTAGGAGACACTGGGATTCAGGTGGCTTTATTCCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218201	AAATGTAACTTGTGTGTAGGAGACACTGGGATTCAGGTGGCTTTATTCCC	218250

AL645587.9	1051	TCTGTAGGTAGTGCCTGACTCTCCTAACTCACATCTCCTTAATGCCACTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218251	TCTGTAGGTAGTGCCTGACTCTCCTAACTCACATCTCCTTAATGCCACTC	218300

AL645587.9	1101	CTGATGCCTGCAAGGGCCCCACTGCCATCTTCAGGTACTGGATTCATCCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218301	CTGATGCCTGCAAGGGCCCCACTGCCATCTTCAGGTACTGGATTCATCCC	218350

AL645587.9	1151	ACAAGTTTCGTTCAAAATAGTCTCTTCTGGGCTGGAGAGATGCTTCAGCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218351	ACAAGTTTCGTTCAAAATAGTCTCTTCTGGGCTGGAGAGATGCTTCAGCA	218400

AL645587.9	1201	ATTATGAGCTTCCCTTCTCCTTGTTTGATTCTCAGCACCCAGAGGGTGCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218401	ATTATGAGCTTCCCTTCTCCTTGTTTGATTCTCAGCACCCAGAGGGTGCT	218450

AL645587.9	1251	GTGGGTACCAGGCATGCATCTGGTACATACATATATGTGCAGGCAAATAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218451	GTGGGTACCAGGCATGCATCTGGTACATACATATATGTGCAGGCAAATAA	218500

AL645587.9	1301	TTAATTTTAAATCATCTTTTCCAAGCTGCCACTGTCCAACCCAACAGAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218501	TTAATTTTAAATCATCTTTTCCAAGCTGCCACTGTCCAACCCAACAGAAA	218550

AL645587.9	1351	CCCTCTCTGTACAGAGCTCCTTCCTAATTGCTGCCACCCTGTGTCAAGGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218551	CCCTCTCTGTACAGAGCTCCTTCCTAATTGCTGCCACCCTGTGTCAAGGC	218600

AL645587.9	1401	CTCTTTGAGGAAAAAGCTGTGATCTGGTCACTATGTACCATGCCTTCCCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218601	CTCTTTGAGGAAAAAGCTGTGATCTGGTCACTATGTACCATGCCTTCCCT	218650

AL645587.9	1451	AACACAACTATAAAAACTGCAATGAGGGGGATGTTCAGAAGGTCCACCCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218651	AACACAACTATAAAAACTGCAATGAGGGGGATGTTCAGAAGGTCCACCCA	218700

AL645587.9	1501	TTCTCTTCCCCAGCTCCTACAATGTTGCTTTACCTTTACTGAGCCTTCTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218701	TTCTCTTCCCCAGCTCCTACAATGTTGCTTTACCTTTACTGAGCCTTCTG	218750

AL645587.9	1551	GGTCCTCTAACTCCTTGGGCATCTTTTGTTCTAACACCTCAGCTTATGAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218751	GGTCCTCTAACTCCTTGGGCATCTTTTGTTCTAACACCTCAGCTTATGAC	218800

AL645587.9	1601	ACAGCAGTCCAGCCTGTTTCTGGTCAGTAACCTTCGATTCCCCATTCTTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218801	ACAGCAGTCCAGCCTGTTTCTGGTCAGTAACCTTCGATTCCCCATTCTTC	218850

AL645587.9	1651	TGTCCTTTATTCACTCTTAGAGTTGGATCAATCCCCCAACCGTATATCCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218851	TGTCCTTTATTCACTCTTAGAGTTGGATCAATCCCCCAACCGTATATCCC	218900

AL645587.9	1701	AATTCTTCAATGGAGCCTTCTACCCCATGGATGCTCTTCTCCCTTTCCTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218901	AATTCTTCAATGGAGCCTTCTACCCCATGGATGCTCTTCTCCCTTTCCTA	218950

AL645587.9	1751	CAAGCCTTCTGACCCACTGTCCTGCTTCCACCATTCCCTCCTCACATACC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	218951	CAAGCCTTCTGACCCACTGTCCTGCTTCCACCATTCCCTCCTCACATACC	219000

AL645587.9	1801	ATCTATTCTCTGAGCTCTGACTCCAATCATCCATTTTCTACATAACCACC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	219001	ATCTATTCTCTGAGCTCTGACTCCAATCATCCATTTTCTACATAACCACC	219050

AL645587.9	1851	ATTCTGCAGGCACCATACTAGTGCATCTGAAAGCAACATTATTGACTTAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	219051	ATTCTGCAGGCACCATACTAGTGCATCTGAAAGCAACATTATTGACTTAG	219100

AL645587.9	1901	CAGAGCTCATGAACTCACGAGGAGGAAAAGCCAAGCCTTGTGCATACCTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	219101	CAGAGCTCATGAACTCACGAGGAGGAAAAGCCAAGCCTTGTGCATACCTA	219150

AL645587.9	1951	ACCAGCAGCTAAGCACATAGTGAGTACAGACATGTTGGAAAAATGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589701.9	219151	ACCAGCAGCTAAGCACATAGTGAGTACAGACATGTTGGAAAAATGAATTC	219200

Overview

Query
AL645587.9 - 150986 bps
Hit
AL589701.9 - 219200 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link