<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662813.7	1	GTTTTGTATTTCAGTGTCTGTCTTATTTTGCCTAATTTCCAATTTCTCCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	205738	GTTTTGTATTTCAGTGTCTGTCTTATTTTGCCTAATTTCCAATTTCTCCC	205787

AL662813.7	51	AGCTTGTAAAGAAATGGCAATATTTTTTGAATCAAATAATATCCCTATTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	205788	AGCTTGTAAAGAAATGGCAATATTTTTTGAATCAAATAATATCCCTATTT	205837

AL662813.7	101	ATGTGTGTGTACCTTTATCATCTTTGTTTTGTTTATCTGTCAGTTAATGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	205838	ATGTGTGTGTACCTTTATCATCTTTGTTTTGTTTATCTGTCAGTTAATGG	205887

AL662813.7	151	CTCAGTTGATTCCATATCTTAACTGCTGTATATGATGCTAAAATAAAGAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	205888	CTCAGTTGATTCCATATCTTAACTGCTGTATATGATGCTAAAATAAAGAC	205937

AL662813.7	201	TGTCCTTTTTGGGGGCACACTTCTTCAGTGTTTTATAGAAAAAAAAAAGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	205938	TGTCCTTTTTGGGGGCACACTTCTTCAGTGTTTTATAGAAAAAAAAAAGA	205987

AL662813.7	251	TGGAAAGAAAGCTAAAACATCTGAGGTTGTTCACTTTCTAGTACACTTCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	205988	TGGAAAGAAAGCTAAAACATCTGAGGTTGTTCACTTTCTAGTACACTTCT	206037

AL662813.7	301	ATCTTGATGCATACAGAAATTCATTTACACACATGACTATGCATACACCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206038	ATCTTGATGCATACAGAAATTCATTTACACACATGACTATGCATACACCC	206087

AL662813.7	351	ACAAACACAAATAATCATATAAACCAAACATACACACAAAATTTTTTAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206088	ACAAACACAAATAATCATATAAACCAAACATACACACAAAATTTTTTAAA	206137

AL662813.7	401	AATGCACACTAATTATATTAATAATTTTCATGTATAATGCATTTATTCAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206138	AATGCACACTAATTATATTAATAATTTTCATGTATAATGCATTTATTCAT	206187

AL662813.7	451	TTCCAAATTAAGATAACTGAGTCCTTTTCATCAGTTATAGGATGCACAGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206188	TTCCAAATTAAGATAACTGAGTCCTTTTCATCAGTTATAGGATGCACAGT	206237

AL662813.7	501	ACAAGCCAGGCAGGTGATACCTTGATGGATCCCAAAGCAGTTGCCACATA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206238	ACAAGCCAGGCAGGTGATACCTTGATGGATCCCAAAGCAGTTGCCACATA	206287

AL662813.7	551	TGCACCTTTGCTTTTCTGCTAACTGAAGAGTAAACTGAACAGATCCAAGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206288	TGCACCTTTGCTTTTCTGCTAACTGAAGAGTAAACTGAACAGATCCAAGT	206337

AL662813.7	601	GGATCTTCAGCTTCTGCTTTAACCTAAAGAACTAAGCAGGTCACTAGCTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206338	GGATCTTCAGCTTCTGCTTTAACCTAAAGAACTAAGCAGGTCACTAGCTA	206387

AL662813.7	651	TGTTTTGAAGCTGCACATTGTGGGTGTAATCACACATGCAGAAGACTGGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206388	TGTTTTGAAGCTGCACATTGTGGGTGTAATCACACATGCAGAAGACTGGA	206437

AL662813.7	701	GAATAGGAGAACAGTCCAGGAACAATCTGCATTGTAGAACTGTAGACTGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206438	GAATAGGAGAACAGTCCAGGAACAATCTGCATTGTAGAACTGTAGACTGT	206487

AL662813.7	751	AAGTAAAATTAAAAGCTAAGTAATATTAGCAGATCTATAAACATTTTATC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206488	AAGTAAAATTAAAAGCTAAGTAATATTAGCAGATCTATAAACATTTTATC	206537

AL662813.7	801	AAGAGAACCTATTTTCTCAATGACCATAGCTGGGGTTGTGTTTATAATTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206538	AAGAGAACCTATTTTCTCAATGACCATAGCTGGGGTTGTGTTTATAATTA	206587

AL662813.7	851	TGTAGCATACTTTGAACTGAATTGCATGCATACTTAAATATAGTCTTGTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206588	TGTAGCATACTTTGAACTGAATTGCATGCATACTTAAATATAGTCTTGTG	206637

AL662813.7	901	TATATAGAGGAAATGAAAACATAGTTTCATTTAATACACATCATGAATGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206638	TATATAGAGGAAATGAAAACATAGTTTCATTTAATACACATCATGAATGG	206687

AL662813.7	951	CTCCTGTGTTTGCAGCTTTGCATATTACTGATCATCAAGGTATCTGTTGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206688	CTCCTGTGTTTGCAGCTTTGCATATTACTGATCATCAAGGTATCTGTTGA	206737

AL662813.7	1001	CTTTCAGGACCTTCCTTGATCTACTTTTGTTTCTAACGTGTAGATAACAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206738	CTTTCAGGACCTTCCTTGATCTACTTTTGTTTCTAACGTGTAGATAACAT	206787

AL662813.7	1051	GTGCCATCTACAAAATTATTTCACTAACATACACATGTCTTGTTCAGCTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206788	GTGCCATCTACAAAATTATTTCACTAACATACACATGTCTTGTTCAGCTC	206837

AL662813.7	1101	TTGAGCAAATGCCACATGAACTATGAACATTGCTGTTTTTTTTTAAGAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206838	TTGAGCAAATGCCACATGAACTATGAACATTGCTGTTTTTTTTTAAGAAA	206887

AL662813.7	1151	TGTTAATACAATTGTTAAACTGTCATTGTGTAGGGTGCTGTTCATCTGCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206888	TGTTAATACAATTGTTAAACTGTCATTGTGTAGGGTGCTGTTCATCTGCA	206937

AL662813.7	1201	AGAGATACTCACTATGTTGGCAGCTTGGAAAGACTCCCTGAAGCACAGTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206938	AGAGATACTCACTATGTTGGCAGCTTGGAAAGACTCCCTGAAGCACAGTG	206987

AL662813.7	1251	ATGGAGCTCAGTGGTATGAAAGAACCTCCTACTGCATTTATACCAAGAAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	206988	ATGGAGCTCAGTGGTATGAAAGAACCTCCTACTGCATTTATACCAAGAAC	207037

AL662813.7	1301	AAACATTGCTGGCATAATGGTGAATGGACTTCAAGGTGTTCAGAGAACAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	207038	AAACATTGCTGGCATAATGGTGAATGGACTTCAAGGTGTTCAGAGAACAC	207087

AL662813.7	1351	TCACTAAGCTTTGTAGTCTTCTTATGTTTCTTTGTTTTTCTTGTTCATCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	207088	TCACTAAGCTTTGTAGTCTTCTTATGTTTCTTTGTTTTTCTTGTTCATCA	207137

AL662813.7	1401	GAGTTGATGAACCCCATAAAAGAAATTCAATATATCAAAATAGAGTCATC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	207138	GAGTTGATGAACCCCATAAAAGAAATTCAATATATCAAAATAGAGTCATC	207187

AL662813.7	1451	TAGTCTTTTAAAAATCTTGCTTCTAAAGATTTATGGGAATCCACAACTTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	207188	TAGTCTTTTAAAAATCTTGCTTCTAAAGATTTATGGGAATCCACAACTTT	207237

AL662813.7	1501	TCTAAGATCAATTATTCCATATTTCAGGAATACCAATTCAAAGTAGATGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	207238	TCTAAGATCAATTATTCCATATTTCAGGAATACCAATTCAAAGTAGATGT	207287

AL662813.7	1551	TCCTCACAGTTCTTTGAATAATGACCTTTCTGTAGTGGTAGGAAAATCTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	207288	TCCTCACAGTTCTTTGAATAATGACCTTTCTGTAGTGGTAGGAAAATCTC	207337

AL662813.7	1601	CTGACACCATCACTAGGTCTTATTACAGCAATCATTGGATTATTTGCACC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	207338	CTGACACCATCACTAGGTCTTATTACAGCAATCATTGGATTATTTGCACC	207387

AL662813.7	1651	TGGAAGCATCAGGTAAATTCCTCACCAAATCTGAGATTCCATGTACTATG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	207388	TGGAAGCATCAGGTAAATTCCTCACCAAATCTGAGATTCCATGTACTATG	207437

AL662813.7	1701	TGGTCAATAGATTTAGTTGAAAACTAGAATTGGGCAACAGTTCCCTTTTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	207438	TGGTCAATAGATTTAGTTGAAAACTAGAATTGGGCAACAGTTCCCTTTTA	207487

AL662813.7	1751	GCACCAGGACCGTATACTCCAGGCCAATAATGAGGACATGTTTAAGTTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	207488	GCACCAGGACCGTATACTCCAGGCCAATAATGAGGACATGTTTAAGTTTT	207537

AL662813.7	1801	CTCATGAGAGAATTGCTACTAGCTCCTGAATTATCCCTGGTAAAATCCAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	207538	CTCATGAGAGAATTGCTACTAGCTCCTGAATTATCCCTGGTAAAATCCAT	207587

AL662813.7	1851	GTCTACAGGCAGGGAGCCCCTTCTTTCTTATATATGAACACATCCTTAAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	207588	GTCTACAGGCAGGGAGCCCCTTCTTTCTTATATATGAACACATCCTTAAT	207637

AL662813.7	1901	ATTCCATCTACTCTATGCACAAAATATCTCTAAGGATCTATCATTTAGAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	207638	ATTCCATCTACTCTATGCACAAAATATCTCTAAGGATCTATCATTTAGAA	207687

AL662813.7	1951	TTTTTGTGACTGATGCATTAACACTAGTCTAATGTGTCTATATTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589679.14	207688	TTTTTGTGACTGATGCATTAACACTAGTCTAATGTGTCTATATTGAATTC	207737

Overview

Query
AL662813.7 - 6042 bps
Hit
AL589679.14 - 207737 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link