<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
AL606928.9 1 GAATTCATACCAACTGTGATTACCTGCCAGTTAACACTCTATTGTAGAAA 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 120920 GAATTCATACCAACTGTGATTACCTGCCAGTTAACACTCTATTGTAGAAA 120969 AL606928.9 51 GGAAAAGGGCTCACCCTTTCTTGAAGATTTATACATATACATATACATAT 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 120970 GGAAAAGGGCTCACCCTTTCTTGAAGATTTATACATATACATATACATAT 121019 AL606928.9 101 ACATATACATATACATATACATATACATATACATATACATATACATATAC 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121020 ACATATACATATACATATACATATACATATACATATACATATACATATAC 121069 AL606928.9 151 AGCTGATAAGTAAAGGAAAGCTATTTTCTTCAGTGATGTAGCCACTGGTA 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121070 AGCTGATAAGTAAAGGAAAGCTATTTTCTTCAGTGATGTAGCCACTGGTA 121119 AL606928.9 201 AGGGTCCCATATTCTTGTCATTTTTATATCTTAGCCTTGCTTCCCAAGAA 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121120 AGGGTCCCATATTCTTGTCATTTTTATATCTTAGCCTTGCTTCCCAAGAA 121169 AL606928.9 251 TTACTCCTGGTCCTAAAGAGTTTAATAATCAGTCAACTAGTGACAAGAGA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121170 TTACTCCTGGTCCTAAAGAGTTTAATAATCAGTCAACTAGTGACAAGAGA 121219 AL606928.9 301 TTTAGTTCAAAGATTTACAAGCAATAAGGCATCTTCTACTTTCTGTTGGA 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121220 TTTAGTTCAAAGATTTACAAGCAATAAGGCATCTTCTACTTTCTGTTGGA 121269 AL606928.9 351 TCTGTGTATAGGTTGTAGAGAGCAAAATTTGAGCACCTTTCAAGTCTGCC 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121270 TCTGTGTATAGGTTGTAGAGAGCAAAATTTGAGCACCTTTCAAGTCTGCC 121319 AL606928.9 401 ACAGCTTCTGCTTTCTTCCAGAAACCTTCCCATCTCCCTTTATGAACAAT 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121320 ACAGCTTCTGCTTTCTTCCAGAAACCTTCCCATCTCCCTTTATGAACAAT 121369 AL606928.9 451 CTGTTAGTCTAACAGAATGCCTTAACATATTACTCTTTGCTAAGTGTCTA 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121370 CTGTTAGTCTAACAGAATGCCTTAACATATTACTCTTTGCTAAGTGTCTA 121419 AL606928.9 501 CCTGCATGTCTACCCTGCCATTCATTCTACAAGGACTGGGTCTGCTACTT 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121420 CCTGCATGTCTACCCTGCCATTCATTCTACAAGGACTGGGTCTGCTACTT 121469 AL606928.9 551 AGGGCTAGCAGGATCCTGAACTGTCTTTGTTCTTTCCTATTGGTTTTGAC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121470 AGGGCTAGCAGGATCCTGAACTGTCTTTGTTCTTTCCTATTGGTTTTGAC 121519 AL606928.9 601 ACTTTTACCAATAATGTTTTCAAAAGAAAGAAAATAAAAAGCTCTGAGTT 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121520 ACTTTTACCAATAATGTTTTCAAAAGAAAGAAAATAAAAAGCTCTGAGTT 121569 AL606928.9 651 GGGAAAATATAAAAGCTGTGGGTTTGAAGACAATTCAACTGTGGTGACCC 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121570 GGGAAAATATAAAAGCTGTGGGTTTGAAGACAATTCAACTGTGGTGACCC 121619 AL606928.9 701 ACCTTGGCACTGAACTAGAGAAGATGTGGATATCAATACAAGGAAGTCTT 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121620 ACCTTGGCACTGAACTAGAGAAGATGTGGATATCAATACAAGGAAGTCTT 121669 AL606928.9 751 GATCTCCTACTGTTCTTACTGCAAGCCCAGTGGTGTTACAAGAATAGCCA 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121670 GATCTCCTACTGTTCTTACTGCAAGCCCAGTGGTGTTACAAGAATAGCCA 121719 AL606928.9 801 CCTCACAATTTGTTTATTGCCTTTGGTCAGCTTTAAGTGACATTAATAAA 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121720 CCTCACAATTTGTTTATTGCCTTTGGTCAGCTTTAAGTGACATTAATAAA 121769 AL606928.9 851 TACTGTGCCCAGCATTGTCCAGTGTTATACTGTTCATTTAAGGCAGGACT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121770 TACTGTGCCCAGCATTGTCCAGTGTTATACTGTTCATTTAAGGCAGGACT 121819 AL606928.9 901 TGCAGGTTCCTCATGCCCATTAGAGAGAAATTCTACCTTCATCTGTGTTT 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121820 TGCAGGTTCCTCATGCCCATTAGAGAGAAATTCTACCTTCATCTGTGTTT 121869 AL606928.9 951 TTCTTTTACCACATAATACTGGCTAGAACTGGTGCATAGGGGCTGTATAA 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121870 TTCTTTTACCACATAATACTGGCTAGAACTGGTGCATAGGGGCTGTATAA 121919 AL606928.9 1001 CCAATACTGACTCTTTGCCAAACTATAATGGAGTTACTTTTATTAAAAGT 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121920 CCAATACTGACTCTTTGCCAAACTATAATGGAGTTACTTTTATTAAAAGT 121969 AL606928.9 1051 TTGTGGTTACATCTTTGTGTCATTTATTCTGGATTTTTTGACTTTCAAGT 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 121970 TTGTGGTTACATCTTTGTGTCATTTATTCTGGATTTTTTGACTTTCAAGT 122019 AL606928.9 1101 TCATTTTAGATAGCTCATGATACCTTATGAACGTCTTCTGAGTCAGTACC 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 122020 TCATTTTAGATAGCTCATGATACCTTATGAACGTCTTCTGAGTCAGTACC 122069 AL606928.9 1151 CATATGTTATTCCTCTGCCCCCAGTGGCTATTCAGCTGTTTGGAGGATGC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 122070 CATATGTTATTCCTCTGCCCCCAGTGGCTATTCAGCTGTTTGGAGGATGC 122119 AL606928.9 1201 TTACCTCTTTCTCTTTCTCTCCTTATGTGCTTGCCCTTTCAGTCCTGTCT 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 122120 TTACCTCTTTCTCTTTCTCTCCTTATGTGCTTGCCCTTTCAGTCCTGTCT 122169 AL606928.9 1251 TCCCTATCTCTTCTATAGACATTTTCTCTTTGTTTGTCCTAGACTCCATA 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 122170 TCCCTATCTCTTCTATAGACATTTTCTCTTTGTTTGTCCTAGACTCCATA 122219 AL606928.9 1301 CCATATACTTCAATGTTTGTCCTAGAGTTGGTATTAGCTACCTAACCATT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 122220 CCATATACTTCAATGTTTGTCCTAGAGTTGGTATTAGCTACCTAACCATT 122269 AL606928.9 1351 TGTCCTAGAGTTGGTACCATGTGCCTTGCTAGCTATTTATCCTAGAGCTA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 122270 TGTCCTAGAGTTGGTACCATGTGCCTTGCTAGCTATTTATCCTAGAGCTA 122319 AL606928.9 1401 GGGTCCAGTACCACCTACCTCACTGTTTGTCCTGGAGTTTGTTCTATCTG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 122320 GGGTCCAGTACCACCTACCTCACTGTTTGTCCTGGAGTTTGTTCTATCTG 122369 AL606928.9 1451 CCTTGCTAACTCTAGTGAACTGAGGTTCAGCAGATCGGGAACAGTTCTTT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 122370 CCTTGCTAACTCTAGTGAACTGAGGTTCAGCAGATCGGGAACAGTTCTTT 122419 AL606928.9 1501 GCATGACTTTGCTTTGCAAACTTGGGAGGTCATTCTTCCCGAAACATAAA 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 122420 GCATGACTTTGCTTTGCAAACTTGGGAGGTCATTCTTCCCGAAACATAAA 122469 AL606928.9 1551 CAACCAGAACTTGGCTCTATCTAAAAAAGAACTGGGATAGTGATGCAGGA 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 122470 CAACCAGAACTTGGCTCTATCTAAAAAAGAACTGGGATAGTGATGCAGGA 122519 AL606928.9 1601 AGCTTTACCAAGAGTGTGTGGTCTTGAATGTATGGTTTGACCAGTGCACA 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 122520 AGCTTTACCAAGAGTGTGTGGTCTTGAATGTATGGTTTGACCAGTGCACA 122569 AL606928.9 1651 GAGCCTGAGAGGATGACACAATCTTTATCTAAACAAGGCTTGGCTTCTCT 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 122570 GAGCCTGAGAGGATGACACAATCTTTATCTAAACAAGGCTTGGCTTCTCT 122619 AL606928.9 1701 CTGTGGGGAAAGAGCACAGCTCCCCAGCGCCAGCTTGTCCTCTGATCCCG 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 122620 CTGTGGGGAAAGAGCACAGCTCCCCAGCGCCAGCTTGTCCTCTGATCCCG 122669 AL606928.9 1751 TACACATGCACTTCATTGTGCTAAAGCTGTAGAACGGTGCGGCAGTGATT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 122670 TACACATGCACTTCATTGTGCTAAAGCTGTAGAACGGTGCGGCAGTGATT 122719 AL606928.9 1801 TATGAGGCCCGTGTTTCTTTCCTGATCCAGGCTGCCACATTGCTGGAGGC 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 122720 TATGAGGCCCGTGTTTCTTTCCTGATCCAGGCTGCCACATTGCTGGAGGC 122769 AL606928.9 1851 TTGCTTTTATGTCCATGTCAGGGGCAACTGGCAACCAGCTGTTGGAAACT 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 122770 TTGCTTTTATGTCCATGTCAGGGGCAACTGGCAACCAGCTGTTGGAAACT 122819 AL606928.9 1901 GGTTTAAGAAAATAATAAAAGTAAAAATACGCATGGACTATCCTGTCATT 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 122820 GGTTTAAGAAAATAATAAAAGTAAAAATACGCATGGACTATCCTGTCATT 122869 AL606928.9 1951 GAAGGTTTCTGGTACCCACCACCAGGTTTGGATACAGTAAGAGAGATCCC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL583890.13 122870 GAAGGTTTCTGGTACCCACCACCAGGTTTGGATACAGTAAGAGAGATCCC 122919