<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL606928.9	1	GAATTCATACCAACTGTGATTACCTGCCAGTTAACACTCTATTGTAGAAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	120920	GAATTCATACCAACTGTGATTACCTGCCAGTTAACACTCTATTGTAGAAA	120969

AL606928.9	51	GGAAAAGGGCTCACCCTTTCTTGAAGATTTATACATATACATATACATAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	120970	GGAAAAGGGCTCACCCTTTCTTGAAGATTTATACATATACATATACATAT	121019

AL606928.9	101	ACATATACATATACATATACATATACATATACATATACATATACATATAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121020	ACATATACATATACATATACATATACATATACATATACATATACATATAC	121069

AL606928.9	151	AGCTGATAAGTAAAGGAAAGCTATTTTCTTCAGTGATGTAGCCACTGGTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121070	AGCTGATAAGTAAAGGAAAGCTATTTTCTTCAGTGATGTAGCCACTGGTA	121119

AL606928.9	201	AGGGTCCCATATTCTTGTCATTTTTATATCTTAGCCTTGCTTCCCAAGAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121120	AGGGTCCCATATTCTTGTCATTTTTATATCTTAGCCTTGCTTCCCAAGAA	121169

AL606928.9	251	TTACTCCTGGTCCTAAAGAGTTTAATAATCAGTCAACTAGTGACAAGAGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121170	TTACTCCTGGTCCTAAAGAGTTTAATAATCAGTCAACTAGTGACAAGAGA	121219

AL606928.9	301	TTTAGTTCAAAGATTTACAAGCAATAAGGCATCTTCTACTTTCTGTTGGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121220	TTTAGTTCAAAGATTTACAAGCAATAAGGCATCTTCTACTTTCTGTTGGA	121269

AL606928.9	351	TCTGTGTATAGGTTGTAGAGAGCAAAATTTGAGCACCTTTCAAGTCTGCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121270	TCTGTGTATAGGTTGTAGAGAGCAAAATTTGAGCACCTTTCAAGTCTGCC	121319

AL606928.9	401	ACAGCTTCTGCTTTCTTCCAGAAACCTTCCCATCTCCCTTTATGAACAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121320	ACAGCTTCTGCTTTCTTCCAGAAACCTTCCCATCTCCCTTTATGAACAAT	121369

AL606928.9	451	CTGTTAGTCTAACAGAATGCCTTAACATATTACTCTTTGCTAAGTGTCTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121370	CTGTTAGTCTAACAGAATGCCTTAACATATTACTCTTTGCTAAGTGTCTA	121419

AL606928.9	501	CCTGCATGTCTACCCTGCCATTCATTCTACAAGGACTGGGTCTGCTACTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121420	CCTGCATGTCTACCCTGCCATTCATTCTACAAGGACTGGGTCTGCTACTT	121469

AL606928.9	551	AGGGCTAGCAGGATCCTGAACTGTCTTTGTTCTTTCCTATTGGTTTTGAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121470	AGGGCTAGCAGGATCCTGAACTGTCTTTGTTCTTTCCTATTGGTTTTGAC	121519

AL606928.9	601	ACTTTTACCAATAATGTTTTCAAAAGAAAGAAAATAAAAAGCTCTGAGTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121520	ACTTTTACCAATAATGTTTTCAAAAGAAAGAAAATAAAAAGCTCTGAGTT	121569

AL606928.9	651	GGGAAAATATAAAAGCTGTGGGTTTGAAGACAATTCAACTGTGGTGACCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121570	GGGAAAATATAAAAGCTGTGGGTTTGAAGACAATTCAACTGTGGTGACCC	121619

AL606928.9	701	ACCTTGGCACTGAACTAGAGAAGATGTGGATATCAATACAAGGAAGTCTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121620	ACCTTGGCACTGAACTAGAGAAGATGTGGATATCAATACAAGGAAGTCTT	121669

AL606928.9	751	GATCTCCTACTGTTCTTACTGCAAGCCCAGTGGTGTTACAAGAATAGCCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121670	GATCTCCTACTGTTCTTACTGCAAGCCCAGTGGTGTTACAAGAATAGCCA	121719

AL606928.9	801	CCTCACAATTTGTTTATTGCCTTTGGTCAGCTTTAAGTGACATTAATAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121720	CCTCACAATTTGTTTATTGCCTTTGGTCAGCTTTAAGTGACATTAATAAA	121769

AL606928.9	851	TACTGTGCCCAGCATTGTCCAGTGTTATACTGTTCATTTAAGGCAGGACT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121770	TACTGTGCCCAGCATTGTCCAGTGTTATACTGTTCATTTAAGGCAGGACT	121819

AL606928.9	901	TGCAGGTTCCTCATGCCCATTAGAGAGAAATTCTACCTTCATCTGTGTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121820	TGCAGGTTCCTCATGCCCATTAGAGAGAAATTCTACCTTCATCTGTGTTT	121869

AL606928.9	951	TTCTTTTACCACATAATACTGGCTAGAACTGGTGCATAGGGGCTGTATAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121870	TTCTTTTACCACATAATACTGGCTAGAACTGGTGCATAGGGGCTGTATAA	121919

AL606928.9	1001	CCAATACTGACTCTTTGCCAAACTATAATGGAGTTACTTTTATTAAAAGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121920	CCAATACTGACTCTTTGCCAAACTATAATGGAGTTACTTTTATTAAAAGT	121969

AL606928.9	1051	TTGTGGTTACATCTTTGTGTCATTTATTCTGGATTTTTTGACTTTCAAGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	121970	TTGTGGTTACATCTTTGTGTCATTTATTCTGGATTTTTTGACTTTCAAGT	122019

AL606928.9	1101	TCATTTTAGATAGCTCATGATACCTTATGAACGTCTTCTGAGTCAGTACC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	122020	TCATTTTAGATAGCTCATGATACCTTATGAACGTCTTCTGAGTCAGTACC	122069

AL606928.9	1151	CATATGTTATTCCTCTGCCCCCAGTGGCTATTCAGCTGTTTGGAGGATGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	122070	CATATGTTATTCCTCTGCCCCCAGTGGCTATTCAGCTGTTTGGAGGATGC	122119

AL606928.9	1201	TTACCTCTTTCTCTTTCTCTCCTTATGTGCTTGCCCTTTCAGTCCTGTCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	122120	TTACCTCTTTCTCTTTCTCTCCTTATGTGCTTGCCCTTTCAGTCCTGTCT	122169

AL606928.9	1251	TCCCTATCTCTTCTATAGACATTTTCTCTTTGTTTGTCCTAGACTCCATA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	122170	TCCCTATCTCTTCTATAGACATTTTCTCTTTGTTTGTCCTAGACTCCATA	122219

AL606928.9	1301	CCATATACTTCAATGTTTGTCCTAGAGTTGGTATTAGCTACCTAACCATT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	122220	CCATATACTTCAATGTTTGTCCTAGAGTTGGTATTAGCTACCTAACCATT	122269

AL606928.9	1351	TGTCCTAGAGTTGGTACCATGTGCCTTGCTAGCTATTTATCCTAGAGCTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	122270	TGTCCTAGAGTTGGTACCATGTGCCTTGCTAGCTATTTATCCTAGAGCTA	122319

AL606928.9	1401	GGGTCCAGTACCACCTACCTCACTGTTTGTCCTGGAGTTTGTTCTATCTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	122320	GGGTCCAGTACCACCTACCTCACTGTTTGTCCTGGAGTTTGTTCTATCTG	122369

AL606928.9	1451	CCTTGCTAACTCTAGTGAACTGAGGTTCAGCAGATCGGGAACAGTTCTTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	122370	CCTTGCTAACTCTAGTGAACTGAGGTTCAGCAGATCGGGAACAGTTCTTT	122419

AL606928.9	1501	GCATGACTTTGCTTTGCAAACTTGGGAGGTCATTCTTCCCGAAACATAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	122420	GCATGACTTTGCTTTGCAAACTTGGGAGGTCATTCTTCCCGAAACATAAA	122469

AL606928.9	1551	CAACCAGAACTTGGCTCTATCTAAAAAAGAACTGGGATAGTGATGCAGGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	122470	CAACCAGAACTTGGCTCTATCTAAAAAAGAACTGGGATAGTGATGCAGGA	122519

AL606928.9	1601	AGCTTTACCAAGAGTGTGTGGTCTTGAATGTATGGTTTGACCAGTGCACA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	122520	AGCTTTACCAAGAGTGTGTGGTCTTGAATGTATGGTTTGACCAGTGCACA	122569

AL606928.9	1651	GAGCCTGAGAGGATGACACAATCTTTATCTAAACAAGGCTTGGCTTCTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	122570	GAGCCTGAGAGGATGACACAATCTTTATCTAAACAAGGCTTGGCTTCTCT	122619

AL606928.9	1701	CTGTGGGGAAAGAGCACAGCTCCCCAGCGCCAGCTTGTCCTCTGATCCCG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	122620	CTGTGGGGAAAGAGCACAGCTCCCCAGCGCCAGCTTGTCCTCTGATCCCG	122669

AL606928.9	1751	TACACATGCACTTCATTGTGCTAAAGCTGTAGAACGGTGCGGCAGTGATT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	122670	TACACATGCACTTCATTGTGCTAAAGCTGTAGAACGGTGCGGCAGTGATT	122719

AL606928.9	1801	TATGAGGCCCGTGTTTCTTTCCTGATCCAGGCTGCCACATTGCTGGAGGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	122720	TATGAGGCCCGTGTTTCTTTCCTGATCCAGGCTGCCACATTGCTGGAGGC	122769

AL606928.9	1851	TTGCTTTTATGTCCATGTCAGGGGCAACTGGCAACCAGCTGTTGGAAACT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	122770	TTGCTTTTATGTCCATGTCAGGGGCAACTGGCAACCAGCTGTTGGAAACT	122819

AL606928.9	1901	GGTTTAAGAAAATAATAAAAGTAAAAATACGCATGGACTATCCTGTCATT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	122820	GGTTTAAGAAAATAATAAAAGTAAAAATACGCATGGACTATCCTGTCATT	122869

AL606928.9	1951	GAAGGTTTCTGGTACCCACCACCAGGTTTGGATACAGTAAGAGAGATCCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583890.13	122870	GAAGGTTTCTGGTACCCACCACCAGGTTTGGATACAGTAAGAGAGATCCC	122919

Overview

Query
AL606928.9 - 186605 bps
Hit
AL583890.13 - 122919 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link