<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL589699.4	1	GAATTCATTTTTGTCAATTCTTTACAGCCTACTCTAGACAGAGAGCTCCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	78461	GAATTCATTTTTGTCAATTCTTTACAGCCTACTCTAGACAGAGAGCTCCA	78510

AL589699.4	51	GGCATGGCACTTTGTCACTTGGTAGCAGAGACTGGTTCTGGTTAAGAGTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	78511	GGCATGGCACTTTGTCACTTGGTAGCAGAGACTGGTTCTGGTTAAGAGTC	78560

AL589699.4	101	AGCAGTGACTCCGTGGCTTTTAAAATTTGTCTGCTGGGTTGGTTTGAAGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	78561	AGCAGTGACTCCGTGGCTTTTAAAATTTGTCTGCTGGGTTGGTTTGAAGA	78610

AL589699.4	151	AGAATTTTTTTCTAAGAGTCTCATATTCACTAGGCTGGTCTTGAATGCAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	78611	AGAATTTTTTTCTAAGAGTCTCATATTCACTAGGCTGGTCTTGAATGCAT	78660

AL589699.4	201	GAGATCAAATGGAGCTCTCAGCTCAACCTTCTGCGTGCCTGGGACTGCTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	78661	GAGATCAAATGGAGCTCTCAGCTCAACCTTCTGCGTGCCTGGGACTGCTA	78710

AL589699.4	251	AGTGCTGTGGTACCCAGCTTGCTCATTCTGTTTGATTTGGTGGTGAGCAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	78711	AGTGCTGTGGTACCCAGCTTGCTCATTCTGTTTGATTTGGTGGTGAGCAC	78760

AL589699.4	301	TACACCAAAGGAACATGTCACTTCTGTTTCCCAAGACTTTCAGGTTGTCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	78761	TACACCAAAGGAACATGTCACTTCTGTTTCCCAAGACTTTCAGGTTGTCA	78810

AL589699.4	351	TTTTTTTAAGTTGTTTTATAGTCATTTCAGGGTGTCAATTTTTTATAGTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	78811	TTTTTTTAAGTTGTTTTATAGTCATTTCAGGGTGTCAATTTTTTATAGTA	78860

AL589699.4	401	ATGCAACTTCAAACAGAGGTAGATCTGTCAATCTGCCAAAACCCCCAGTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	78861	ATGCAACTTCAAACAGAGGTAGATCTGTCAATCTGCCAAAACCCCCAGTG	78910

AL589699.4	451	ATACCCAGTGACTCTCAGTGACCCCCCCCCCCAGTGACCGACTTAACCTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	78911	ATACCCAGTGACTCTCAGTGACCCCCCCCCCCAGTGACCGACTTAACCTC	78960

AL589699.4	501	CAGTCCTGTATCTTCTATCCTTCCTTCTCAATTCTGTTAGAACAATTTAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	78961	CAGTCCTGTATCTTCTATCCTTCCTTCTCAATTCTGTTAGAACAATTTAC	79010

AL589699.4	551	AAATGTTGTGCCATTGTTTCTGTGGTTGTAATTCTTTTGTCTCAAGATGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79011	AAATGTTGTGCCATTGTTTCTGTGGTTGTAATTCTTTTGTCTCAAGATGA	79060

AL589699.4	601	AAACTAAACGCCAATGAAAAATAAAACCTTGGAAAACTGTAAGAAAGTGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79061	AAACTAAACGCCAATGAAAAATAAAACCTTGGAAAACTGTAAGAAAGTGT	79110

AL589699.4	651	CACGTTTCCCACGGGTGCCATGAGTCCTGCCAGTGCCCCTGGTGTGTTGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79111	CACGTTTCCCACGGGTGCCATGAGTCCTGCCAGTGCCCCTGGTGTGTTGA	79160

AL589699.4	701	TTGGTCTCCTTGGTACCTTCTGCCTTTGCAGTGCAAGCCGGCTGGCAGCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79161	TTGGTCTCCTTGGTACCTTCTGCCTTTGCAGTGCAAGCCGGCTGGCAGCC	79210

AL589699.4	751	GCAGCAGGTCTTCCAGCCTAAGTCTGACGGTTGAGAGTGCTTTAGAAAGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79211	GCAGCAGGTCTTCCAGCCTAAGTCTGACGGTTGAGAGTGCTTTAGAAAGC	79260

AL589699.4	801	TTTGATTTCCTCAACACCTCTGACTTTGACGAAGAGGAAGAGGATGGCGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79261	TTTGATTTCCTCAACACCTCTGACTTTGACGAAGAGGAAGAGGATGGCGA	79310

AL589699.4	851	TGACGTCTGCCACGTTGGAGGAGGCGCAGACTCCGTGTTTTCAGATACTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79311	TGACGTCTGCCACGTTGGAGGAGGCGCAGACTCCGTGTTTTCAGATACTG	79360

AL589699.4	901	AGACTGAGAAGAGTGGGTAAGTGTGAAGGCAGCGTGTGCTTGTGTTCCTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79361	AGACTGAGAAGAGTGGGTAAGTGTGAAGGCAGCGTGTGCTTGTGTTCCTG	79410

AL589699.4	951	CCCACCCCCCATCACAGTTGGTATGGTCACCCTTTGCTACTGGCAGGGCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79411	CCCACCCCCCATCACAGTTGGTATGGTCACCCTTTGCTACTGGCAGGGCC	79460

AL589699.4	1001	AGCCCAGTGCACATCTGCAAGAGGGTGCAATCCTTGTCATGTCCAACCGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79461	AGCCCAGTGCACATCTGCAAGAGGGTGCAATCCTTGTCATGTCCAACCGC	79510

AL589699.4	1051	ATATGGCCCAAGACAGCCATGAGTGCTGCCCAACACCAAATCATAAACTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79511	ATATGGCCCAAGACAGCCATGAGTGCTGCCCAACACCAAATCATAAACTT	79560

AL589699.4	1101	ACTTAAGACACTGCAGCATGCTTTGTGGGGTTTGTTGGTGTCAAGATTTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79561	ACTTAAGACACTGCAGCATGCTTTGTGGGGTTTGTTGGTGTCAAGATTTC	79610

AL589699.4	1151	GTGGTTCTTGGGCATGGACTTTGTAGGGTACAATATCGAGCCAAAACTGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79611	GTGGTTCTTGGGCATGGACTTTGTAGGGTACAATATCGAGCCAAAACTGT	79660

AL589699.4	1201	CAAAAGGTTGAGCGCACCTGCGGATGACTTGATATGCAGTTCCTTCTAGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79661	CAAAAGGTTGAGCGCACCTGCGGATGACTTGATATGCAGTTCCTTCTAGT	79710

AL589699.4	1251	GGTTAAGTACAGCTTCTAATTATCGGTGACCTACTGGAGGTTACGTAGGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79711	GGTTAAGTACAGCTTCTAATTATCGGTGACCTACTGGAGGTTACGTAGGG	79760

AL589699.4	1301	AACACCAATATCTCTTGTTTCCGAGAAGCATCTGTGTGATTCGTGTACAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79761	AACACCAATATCTCTTGTTTCCGAGAAGCATCTGTGTGATTCGTGTACAC	79810

AL589699.4	1351	AGGCATGTGTGGTGTGGGTGAAGGGTCTACACAGCAGGTGGCCCGGACTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79811	AGGCATGTGTGGTGTGGGTGAAGGGTCTACACAGCAGGTGGCCCGGACTT	79860

AL589699.4	1401	TAATACCCTGCCCCTGCTGTGTACTTCCTGTACTTCCAAAGCCCTTAGTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79861	TAATACCCTGCCCCTGCTGTGTACTTCCTGTACTTCCAAAGCCCTTAGTT	79910

AL589699.4	1451	TGCTGAGCTCTGTTTTCCCAGCATCCTTCCCTCTTTCATTACAACTCATC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79911	TGCTGAGCTCTGTTTTCCCAGCATCCTTCCCTCTTTCATTACAACTCATC	79960

AL589699.4	1501	TCTGCATGAGGCTGAAATCATTGGTGCACATCCCAAAGCCAAGCTTACGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	79961	TCTGCATGAGGCTGAAATCATTGGTGCACATCCCAAAGCCAAGCTTACGT	80010

AL589699.4	1551	TTCCCTATAATGTAAGATGGAGGCTTGGCACTCCTTTTGACCTATGTCTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	80011	TTCCCTATAATGTAAGATGGAGGCTTGGCACTCCTTTTGACCTATGTCTC	80060

AL589699.4	1601	TCCAGGTAGAAAAATGTGTCACCTTCTCCATAAGGTGTCTCTTGCAGCCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	80061	TCCAGGTAGAAAAATGTGTCACCTTCTCCATAAGGTGTCTCTTGCAGCCA	80110

AL589699.4	1651	AGCCAACGTTCTTTTTTGTTTTTGCTTTTTGCTTTTTTTTTTTGTATTTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	80111	AGCCAACGTTCTTTTTTGTTTTTGCTTTTTGCTTTTTTTTTTTGTATTTT	80160

AL589699.4	1701	TGTTTGTTTGTTTGTTTTTCCCTCTGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	80161	TGTTTGTTTGTTTGTTTTTCCCTCTGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCC	80210

AL589699.4	1751	TGGCTGTCCTAGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	80211	TGGCTGTCCTAGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAA	80260

AL589699.4	1801	ATCCGCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCGCCACC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	80261	ATCCGCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCGCCACC	80310

AL589699.4	1851	ACTGCCCAGCCAAGCCAACGTTTTTAGAGCCAGATCCTGAGCCCTCTTTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	80311	ACTGCCCAGCCAAGCCAACGTTTTTAGAGCCAGATCCTGAGCCCTCTTTG	80360

AL589699.4	1901	TGATTTCAAATGAAACAAAAGCAGCTTGGTGGCCAGTGCCCACCTTCTAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	80361	TGATTTCAAATGAAACAAAAGCAGCTTGGTGGCCAGTGCCCACCTTCTAA	80410

AL589699.4	1951	GAATCCTCTGCCTTTACCTTTGCTACAACAGAAGCGACGTACGCAGGTTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL513014.9	80411	GAATCCTCTGCCTTTACCTTTGCTACAACAGAAGCGACGTACGCAGGTTT	80460

Overview

Query
AL589699.4 - 256608 bps
Hit
AL513014.9 - 80460 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link