<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL513025.13	1	AATGCTATTGATTTCAACATTGAGTCTTCTCTACTCTCAAAAGTAGATTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	197849	AATGCTATTGATTTCAACATTGAGTCTTCTCTACTCTCAAAAGTAGATTA	197898

AL513025.13	51	AGCTACATGGAAACAGTTTCTGTACTACCTTTCCTTATACTTAGGCATCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	197899	AGCTACATGGAAACAGTTTCTGTACTACCTTTCCTTATACTTAGGCATCA	197948

AL513025.13	101	CTCACAACTCTACCTTTCACAACTTCTCCCGTACATTGTCTTGGTAAAAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	197949	CTCACAACTCTACCTTTCACAACTTCTCCCGTACATTGTCTTGGTAAAAT	197998

AL513025.13	151	CACTGCACACCTCAACGCTAACAAGTTACAGAACCACAGTCTGTAAAGAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	197999	CACTGCACACCTCAACGCTAACAAGTTACAGAACCACAGTCTGTAAAGAG	198048

AL513025.13	201	GTCTCCCCTCATGTGAATTCAGGGAAAAGTTTCCTGGCACGCCACTAGAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198049	GTCTCCCCTCATGTGAATTCAGGGAAAAGTTTCCTGGCACGCCACTAGAC	198098

AL513025.13	251	AGTTAAAGGGCTAGCACAGTATTATCTTCTGATAATAACAGCTGCTTTGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198099	AGTTAAAGGGCTAGCACAGTATTATCTTCTGATAATAACAGCTGCTTTGT	198148

AL513025.13	301	AGGGAAAAGCCTTCCTAATGTTAGACCCAAGGGATTTTTCTCTGTAATTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198149	AGGGAAAAGCCTTCCTAATGTTAGACCCAAGGGATTTTTCTCTGTAATTT	198198

AL513025.13	351	GGATCTACAAAACAAATACTTTGCTATCATTTAAAACACACCTATTTTTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198199	GGATCTACAAAACAAATACTTTGCTATCATTTAAAACACACCTATTTTTA	198248

AL513025.13	401	AAGTAATATCTACAAGGATGAGAGTGAGTAATGGCACAATATCTATAATT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198249	AAGTAATATCTACAAGGATGAGAGTGAGTAATGGCACAATATCTATAATT	198298

AL513025.13	451	ACTTTAAAATCTTTCAACAGAGGGCTAAAGAAATAGTTCAATAGATAAAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198299	ACTTTAAAATCTTTCAACAGAGGGCTAAAGAAATAGTTCAATAGATAAAG	198348

AL513025.13	501	TGCTTTCTGGGCAAAGTAGACCTGAATTTTTTTAATCCCCAGAAACAAAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198349	TGCTTTCTGGGCAAAGTAGACCTGAATTTTTTTAATCCCCAGAAACAAAG	198398

AL513025.13	551	CTGGATGGAGTAGTCCACTCCTGTGGTCCCACTGACAGGCAGAAGCAGAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198399	CTGGATGGAGTAGTCCACTCCTGTGGTCCCACTGACAGGCAGAAGCAGAG	198448

AL513025.13	601	AGAGAACCCCTGCACACTGATGGGCCAGCTAGCCTGTCTCAAACAAGATA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198449	AGAGAACCCCTGCACACTGATGGGCCAGCTAGCCTGTCTCAAACAAGATA	198498

AL513025.13	651	AGGCATAATGACTGATACCACACAGATACTATAGCATACACAATCCCACA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198499	AGGCATAATGACTGATACCACACAGATACTATAGCATACACAATCCCACA	198548

AL513025.13	701	CTCACACACATGGACATCATACACATACATACATATTCTTCAACAAAAAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198549	CTCACACACATGGACATCATACACATACATACATATTCTTCAACAAAAAT	198598

AL513025.13	751	AAAAGTGACAAAGAGCCAGGGGTGGCAGAAGAGGCCTGTAATCCCACCTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198599	AAAAGTGACAAAGAGCCAGGGGTGGCAGAAGAGGCCTGTAATCCCACCTT	198648

AL513025.13	801	CCAGAGGAGACTCCAATAGTAAAATCAAAACAATGGCTAGAAGAAGGAAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198649	CCAGAGGAGACTCCAATAGTAAAATCAAAACAATGGCTAGAAGAAGGAAG	198698

AL513025.13	851	CCAGCGTTACTGACTGGATCTCCTCGAGTGGGGTGGGCTCTTGTGAACTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198699	CCAGCGTTACTGACTGGATCTCCTCGAGTGGGGTGGGCTCTTGTGAACTA	198748

AL513025.13	901	GTTCCTCAGCTTGTGAGAGACTAAACATTCTCATAATAAATTATCAGCTC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198749	GTTCCTCAGCTTGTGAGAGACTAAACATTCTCATAATAAATTATCAGCTC	198798

AL513025.13	951	TGAAAGATGAAAGAATACAAATATACTTAGAAATTTTGTGTATAATAATA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198799	TGAAAGATGAAAGAATACAAATATACTTAGAAATTTTGTGTATAATAATA	198848

AL513025.13	1001	GTGGCATTTCAAATTAGAGTTGAAAAGACAGATTACTTAATAAATGGTAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198849	GTGGCATTTCAAATTAGAGTTGAAAAGACAGATTACTTAATAAATGGTAT	198898

AL513025.13	1051	CAGGAAAAACGATTAGTCATCTGGGAGACTGAGAGCAGGTCTATCCATCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198899	CAGGAAAAACGATTAGTCATCTGGGAGACTGAGAGCAGGTCTATCCATCA	198948

AL513025.13	1101	CTTGTAAATCACAGACAGTTCCACATAACTGATTTAAATGTATGAAAATG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198949	CTTGTAAATCACAGACAGTTCCACATAACTGATTTAAATGTATGAAAATG	198998

AL513025.13	1151	AGAGTGTTAGCATAATAGCAGGAACAAGGCCGCGCAACTGCTGTCATCTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	198999	AGAGTGTTAGCATAATAGCAGGAACAAGGCCGCGCAACTGCTGTCATCTA	199048

AL513025.13	1201	GAACTTAAAAAAAAAAAAATCAACTGTTTAAAAAACAGTGTCTTCACAAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	199049	GAACTTAAAAAAAAAAAAATCAACTGTTTAAAAAACAGTGTCTTCACAAC	199098

AL513025.13	1251	AAAAGTAACCAAGAGTAACAAGTGTCCTCTGGCCAGCTAATGTCCCTGAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	199099	AAAAGTAACCAAGAGTAACAAGTGTCCTCTGGCCAGCTAATGTCCCTGAG	199148

AL513025.13	1301	AGAATACCTTCAAATTAGTAACCACCATCCAATAAAACAATAACAAAAGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	199149	AGAATACCTTCAAATTAGTAACCACCATCCAATAAAACAATAACAAAAGG	199198

AL513025.13	1351	CTATGAGTAGGTCACAGGAAAGGAAGTAAAATGATTCTTTTGAGAAATGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	199199	CTATGAGTAGGTCACAGGAAAGGAAGTAAAATGATTCTTTTGAGAAATGC	199248

AL513025.13	1401	AACTCACAAGACACTAAAATACTATTTTTCACTCATAAGATTAGTAAAGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	199249	AACTCACAAGACACTAAAATACTATTTTTCACTCATAAGATTAGTAAAGA	199298

AL513025.13	1451	CCAAAAAGGTTCATAATTTGGTATGCTAGCCAGACTCTGGGAAAATACCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	199299	CCAAAAAGGTTCATAATTTGGTATGCTAGCCAGACTCTGGGAAAATACCA	199348

AL513025.13	1501	AACTCATAAACTGTTGATAGGAACATAAATTAATACACTCTCTACAGAAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	199349	AACTCATAAACTGTTGATAGGAACATAAATTAATACACTCTCTACAGAAG	199398

AL513025.13	1551	GCAACACGTCCATAGTAAAATTATATATTTACACACATTTAACACAGATA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	199399	GCAACACGTCCATAGTAAAATTATATATTTACACACATTTAACACAGATA	199448

AL513025.13	1601	TTACACTTACAGATATTTACTCCAAAGATCAGTTACCTGTATGCAAAATG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	199449	TTACACTTACAGATATTTACTCCAAAGATCAGTTACCTGTATGCAAAATG	199498

AL513025.13	1651	ACACACACACACACACACACACACACACACATTATACCTACATACAAAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	199499	ACACACACACACACACACACACACACACACATTATACCTACATACAAAGA	199548

AL513025.13	1701	CATAGGAATCACTGTAGCATCACTGATAATAACAACAGATATGAAACAGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	199549	CATAGGAATCACTGTAGCATCACTGATAATAACAACAGATATGAAACAGG	199598

AL513025.13	1751	GACTCTTAGAAAGGATTGGAGCTGGAGAGATGGATCAGTGGTTAAGAGCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	199599	GACTCTTAGAAAGGATTGGAGCTGGAGAGATGGATCAGTGGTTAAGAGCA	199648

AL513025.13	1801	CATGCTCTTCCAGAGGTCGGGAGTTCAATTCCCAGCAACTACATGGTGGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	199649	CATGCTCTTCCAGAGGTCGGGAGTTCAATTCCCAGCAACTACATGGTGGC	199698

AL513025.13	1851	TCACAACCATCTGTAATTGGACCTAATGCCCTCCTCTTGTGTGTCAATGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	199699	TCACAACCATCTGTAATTGGACCTAATGCCCTCCTCTTGTGTGTCAATGA	199748

AL513025.13	1901	CAGTGTGCTCATCTACATAAAATGAATAAATAAGCCTTTTTTTAAAAATG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	199749	CAGTGTGCTCATCTACATAAAATGAATAAATAAGCCTTTTTTTAAAAATG	199798

AL513025.13	1951	AAGGAAGAAAGGATTGGGTAGGACTATGCTTCACTGATACAATGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL512647.14	199799	AAGGAAGAAAGGATTGGGTAGGACTATGCTTCACTGATACAATGGAATTC	199848

Overview

Query
AL513025.13 - 197940 bps
Hit
AL512647.14 - 199848 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link