<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL136158.25	1	GATCTTGAGATTACACTTTTTATGGAGCTATTTCTGATCCTTTATCAGCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	38801	GATCTTGAGATTACACTTTTTATGGAGCTATTTCTGATCCTTTATCAGCT	38850

AL136158.25	51	AATGATAGCTTGTGATTATCTACACAAGCAGCTATTAAAGGGGCCAACAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	38851	AATGATAGCTTGTGATTATCTACACAAGCAGCTATTAAAGGGGCCAACAG	38900

AL136158.25	101	ATTTTTGCTTGTAACAAAAAGTTAGCTTAAAATTGGTAATTCAAGGTTGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	38901	ATTTTTGCTTGTAACAAAAAGTTAGCTTAAAATTGGTAATTCAAGGTTGG	38950

AL136158.25	151	AGTCATTCTTGGCATGAACCAACCCAGGAAAACAGTTCCTTAAAGGTACT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	38951	AGTCATTCTTGGCATGAACCAACCCAGGAAAACAGTTCCTTAAAGGTACT	39000

AL136158.25	201	TCTAAATTGGGATAATATTTTATGTAATTATTATTCTAGAAACTAGACTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39001	TCTAAATTGGGATAATATTTTATGTAATTATTATTCTAGAAACTAGACTT	39050

AL136158.25	251	ATAAAGGATAGAATTTAAAACAATTCTCTTTAATGAGGTATTAAAGGCTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39051	ATAAAGGATAGAATTTAAAACAATTCTCTTTAATGAGGTATTAAAGGCTA	39100

AL136158.25	301	CACTGTCATACATTCATATACAAGAACTGGCAGCAAAACTTTGTAACGTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39101	CACTGTCATACATTCATATACAAGAACTGGCAGCAAAACTTTGTAACGTG	39150

AL136158.25	351	AAATTAATGCTCATGGTATTGATTTTTAAAGAGAATGGATTGTTGAAAAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39151	AAATTAATGCTCATGGTATTGATTTTTAAAGAGAATGGATTGTTGAAAAC	39200

AL136158.25	401	TAAGTTTTATTTTTCAAAATTATGGACATGCTCTAATATTGCAAAAGAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39201	TAAGTTTTATTTTTCAAAATTATGGACATGCTCTAATATTGCAAAAGAAA	39250

AL136158.25	451	CTTAAAAATATAGTTAAACTGCCAATATTCCATTAGCTGCCATTTACAAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39251	CTTAAAAATATAGTTAAACTGCCAATATTCCATTAGCTGCCATTTACAAT	39300

AL136158.25	501	TCAATCACAAGCTCAATATTTTAACTCATCCATATTTGCAATTAAGAAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39301	TCAATCACAAGCTCAATATTTTAACTCATCCATATTTGCAATTAAGAAAA	39350

AL136158.25	551	AAAATCAAGCAAGTGGAGGCATTCATAAAAGATATTATAAAAAAGTAGTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39351	AAAATCAAGCAAGTGGAGGCATTCATAAAAGATATTATAAAAAAGTAGTA	39400

AL136158.25	601	GATTTGAAAGATTGTTTCTTTACTATTCCTATGCATCCTCAGGATTGTGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39401	GATTTGAAAGATTGTTTCTTTACTATTCCTATGCATCCTCAGGATTGTGA	39450

AL136158.25	651	AAGATTTGCTTTCAGTGTTCTTTCTATTCATTTTAAAGAGCCAATGAAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39451	AAGATTTGCTTTCAGTGTTCTTTCTATTCATTTTAAAGAGCCAATGAAAA	39500

AL136158.25	701	GGTATCAATGGATAGTTCTTTCTCAAGGAATGGCTAACAGTCCTACAGTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39501	GGTATCAATGGATAGTTCTTTCTCAAGGAATGGCTAACAGTCCTACAGTA	39550

AL136158.25	751	TGTCAAAAATTTGTGACACAAGCCATTGAGCCCATAAGACAGCAATGGCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39551	TGTCAAAAATTTGTGACACAAGCCATTGAGCCCATAAGACAGCAATGGCC	39600

AL136158.25	801	AATAATATACATTATACATTATGTGGATGCTATCTTATTAGCAGGAAAAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39601	AATAATATACATTATACATTATGTGGATGCTATCTTATTAGCAGGAAAAG	39650

AL136158.25	851	GTCCGCAGGACTTGCTTCTATGTTATAGAGATTTACAACAGGCATTAGCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39651	GTCCGCAGGACTTGCTTCTATGTTATAGAGATTTACAACAGGCATTAGCT	39700

AL136158.25	901	GATAAAGGATCACAAATAGCTCCAGAAAAAGGGCAATCTCAAGATTATAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39701	GATAAAGGATCACAAATAGCTCCAGAAAAAGGGCAATCTCAAGATTATAA	39750

AL136158.25	951	TTATTTAGATTTTAGGCTTACAATCAAGCTGTTTTTCCTCAGAAAATAAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39751	TTATTTAGATTTTAGGCTTACAATCAAGCTGTTTTTCCTCAGAAAATAAT	39800

AL136158.25	1001	TATTCATAGGGACAATTTAAAAACGTTAAATGATTTTCAAAAGATGATAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39801	TATTCATAGGGACAATTTAAAAACGTTAAATGATTTTCAAAAGATGATAG	39850

AL136158.25	1051	GTGATATTACTTGGCTTCATTATTATTTAAAGCTTACTACAGGAGAATTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39851	GTGATATTACTTGGCTTCATTATTATTTAAAGCTTACTACAGGAGAATTG	39900

AL136158.25	1101	AAACCCTTATTTGATATTCTTAGGGAGAGTGATGATTCTACCTCTCTTCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39901	AAACCCTTATTTGATATTCTTAGGGAGAGTGATGATTCTACCTCTCTTCA	39950

AL136158.25	1151	AGTTTTAATTTCAGAAGGATTGTTGGCCTTACAACAAGTATAAAGAGCTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	39951	AGTTTTAATTTCAGAAGGATTGTTGGCCTTACAACAAGTATAAAGAGCTA	40000

AL136158.25	1201	CTGAAAAACAAATTTTTACTTCTATAGATTATTCTTTGCCTTTACATTTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	40001	CTGAAAAACAAATTTTTACTTCTATAGATTATTCTTTGCCTTTACATTTG	40050

AL136158.25	1251	TTGATTTTTAACATGACTCTTACACCTACAGGATTATTAAGGCAAAAAGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	40051	TTGATTTTTAACATGACTCTTACACCTACAGGATTATTAAGGCAAAAAGC	40100

AL136158.25	1301	TCCTCTTATGTGGATATACTCAAGGATATCTCCTCAACATAATATATTGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	40101	TCCTCTTATGTGGATATACTCAAGGATATCTCCTCAACATAATATATTGC	40150

AL136158.25	1351	CATATTATGAAGCAGTGGCTCATATGATGGTGCTTGGAAGAAAGCAGGCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	40151	CATATTATGAAGCAGTGGCTCATATGATGGTGCTTGGAAGAAAGCAGGCA	40200

AL136158.25	1401	CTGATTTGTTTTGACAAAGAACTATATATCATTATTCAGCTTTTTAATGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	40201	CTGATTTGTTTTGACAAAGAACTATATATCATTATTCAGCTTTTTAATGT	40250

AL136158.25	1451	GGATCAAAATAACAGCATAGTACAGATTAAAGCAGCATAGTACAGATTGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	40251	GGATCAAAATAACAGCATAGTACAGATTAAAGCAGCATAGTACAGATTGG	40300

AL136158.25	1501	TTACTTGCTCAAATAGGATTTGAAGTTTTTATAGATAATCATTATCCTCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	40301	TTACTTGCTCAAATAGGATTTGAAGTTTTTATAGATAATCATTATCCTCA	40350

AL136158.25	1551	AGATAGGATGATGATAAAATATTTAAATGTACATAAGGTTATTTTTCCTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	40351	AGATAGGATGATGATAAAATATTTAAATGTACATAAGGTTATTTTTCCTC	40400

AL136158.25	1601	ATATAACATCTTTATAACTTCTACATAATGCTCTTTTGATATTTACTGAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	40401	ATATAACATCTTTATAACTTCTACATAATGCTCTTTTGATATTTACTGAT	40450

AL136158.25	1651	GGCTCCTCTAAAGGACACACAGGATATCTTATAAATAATCAACAAGTACT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	40451	GGCTCCTCTAAAGGACACACAGGATATCTTATAAATAATCAACAAGTACT	40500

AL136158.25	1701	CATAGAGACTCCTGGGCTTTCTGCTTAGCTTGCAGAACTCACAGCAGTAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	40501	CATAGAGACTCCTGGGCTTTCTGCTTAGCTTGCAGAACTCACAGCAGTAC	40550

AL136158.25	1751	TAAATGTTTTTCAGTCTGTAAATGATGATTTTAATCTTTTTACTGATAGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	40551	TAAATGTTTTTCAGTCTGTAAATGATGATTTTAATCTTTTTACTGATAGT	40600

AL136158.25	1801	TTATATATAGTTCAGTCAGTTCCTTTGTTGGTAACTTGTGCTACATTTCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	40601	TTATATATAGTTCAGTCAGTTCCTTTGTTGGTAACTTGTGCTACATTTCA	40650

AL136158.25	1851	TTTCAATACACCAGCTAGATCTCTGTTTTCACAATTGGAAACATCATTCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	40651	TTTCAATACACCAGCTAGATCTCTGTTTTCACAATTGGAAACATCATTCT	40700

AL136158.25	1901	TGCTCAAAAAATTCCTTTTTAAATTGGTCATATAAGACCTCATTCTGATC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	40701	TGCTCAAAAAATTCCTTTTTAAATTGGTCATATAAGACCTCATTCTGATC	40750

AL136158.25	1951	TTCCCAGACCTTTAGCTGCAGGCAATAATTGTATTGACCGAGCTTTAATA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450393.4	40751	TTCCCAGACCTTTAGCTGCAGGCAATAATTGTATTGACCGAGCTTTAATA	40800

Overview

Query
AL136158.25 - 190737 bps
Hit
AL450393.4 - 40800 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link