<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL049612.11	1	GATCATGCAGAGTTGGGCTTTCATTCAGCATCCCCGGGAATCAGGACATT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	77503	GATCATGCAGAGTTGGGCTTTCATTCAGCATCCCCGGGAATCAGGACATT	77552

AL049612.11	51	GCACTCACACACACGCTTGCCACACAGCCTGGCAGGAGCCAAGACAAGGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	77553	GCACTCACACACACGCTTGCCACACAGCCTGGCAGGAGCCAAGACAAGGT	77602

AL049612.11	101	TGCAACACTTTCATCTTTAAGAAAGGAGTTTGAAAATATTCGCTGCAAAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	77603	TGCAACACTTTCATCTTTAAGAAAGGAGTTTGAAAATATTCGCTGCAAAT	77652

AL049612.11	151	TAACACAACTTTTCTGGCTGGTATGTACCCACAAATGGATGCAGCTGCAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	77653	TAACACAACTTTTCTGGCTGGTATGTACCCACAAATGGATGCAGCTGCAC	77702

AL049612.11	201	CCCGGACCGACCTGGGCTCCCTGAAAGATCAGAGGGAAATGTGAGGGACA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	77703	CCCGGACCGACCTGGGCTCCCTGAAAGATCAGAGGGAAATGTGAGGGACA	77752

AL049612.11	251	AACCCATTCAGTGCAGAGCTCTCTTTCTTCAAGCAAGGGAAAAAAGATTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	77753	AACCCATTCAGTGCAGAGCTCTCTTTCTTCAAGCAAGGGAAAAAAGATTT	77802

AL049612.11	301	CCAAATTTGAAAATGACCTTCGCACCTCCCCTCCTTTCTGTTCCCCTCTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	77803	CCAAATTTGAAAATGACCTTCGCACCTCCCCTCCTTTCTGTTCCCCTCTT	77852

AL049612.11	351	CAGTGGAATGTTTGAACAAGCACTGATGACTCGCTCCCAAATAGCCCAGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	77853	CAGTGGAATGTTTGAACAAGCACTGATGACTCGCTCCCAAATAGCCCAGA	77902

AL049612.11	401	TAAGGTTTTACAAGAACAGGTGGGCCTGCTTGAAAGATAAACTTTTTCTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	77903	TAAGGTTTTACAAGAACAGGTGGGCCTGCTTGAAAGATAAACTTTTTCTG	77952

AL049612.11	451	AAGCAACAAGAAGACAAATGATCCGAAACTTGCAATTTGGTTAATGTTTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	77953	AAGCAACAAGAAGACAAATGATCCGAAACTTGCAATTTGGTTAATGTTTC	78002

AL049612.11	501	TCTCTCTCTCTCTGCCTTGTGTGTACACAGCTCCTTCTGGCCGGCAGCAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78003	TCTCTCTCTCTCTGCCTTGTGTGTACACAGCTCCTTCTGGCCGGCAGCAG	78052

AL049612.11	551	GAAGAGTGGCCCTGTGTGTGCCAGGCCCTGCAGTCTCTCCTCTCAGCTGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78053	GAAGAGTGGCCCTGTGTGTGCCAGGCCCTGCAGTCTCTCCTCTCAGCTGG	78102

AL049612.11	601	TGTCTCCAGTGAGGGACCTGAGTCATCGCACACATGAGCCTGTGCTCAGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78103	TGTCTCCAGTGAGGGACCTGAGTCATCGCACACATGAGCCTGTGCTCAGC	78152

AL049612.11	651	CTGCACATCTCCCGCCTCCCACCAGCTGCTCCTCAACTGCCAGGGCCAGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78153	CTGCACATCTCCCGCCTCCCACCAGCTGCTCCTCAACTGCCAGGGCCAGA	78202

AL049612.11	701	CTGTGGCAAAATCTCACTCCTCTGCCGATGCTGGGGTTTCCCTCGTGTCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78203	CTGTGGCAAAATCTCACTCCTCTGCCGATGCTGGGGTTTCCCTCGTGTCT	78252

AL049612.11	751	GGGAGGTGGTGTGCTTGGTGGCCTGAGCACTGCAGTGAATCCATGTTTCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78253	GGGAGGTGGTGTGCTTGGTGGCCTGAGCACTGCAGTGAATCCATGTTTCC	78302

AL049612.11	801	CTCCCAGCACCCTGTTCTGTCCTCCAACTTGGCCGACAGCTCTGGCCAGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78303	CTCCCAGCACCCTGTTCTGTCCTCCAACTTGGCCGACAGCTCTGGCCAGG	78352

AL049612.11	851	GACGCAGCCCAGCTGGTGCCCACCCCGCACTCTGTCCATTTCATAAGAGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78353	GACGCAGCCCAGCTGGTGCCCACCCCGCACTCTGTCCATTTCATAAGAGC	78402

AL049612.11	901	CCTTGGTTTCCTCACTTCCCTCAGATTTTGCCAAGAGAATGGTCCTGGTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78403	CCTTGGTTTCCTCACTTCCCTCAGATTTTGCCAAGAGAATGGTCCTGGTG	78452

AL049612.11	951	TGGCCCAGAAAGGCCAGCGGGGTGCAGCCTGGGACTGAAAGCAGAGGCGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78453	TGGCCCAGAAAGGCCAGCGGGGTGCAGCCTGGGACTGAAAGCAGAGGCGG	78502

AL049612.11	1001	CTCTGGTGGGGAAAAAGTAGCTCTCCCAGCCTAGCCCTACTGGTGGGCGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78503	CTCTGGTGGGGAAAAAGTAGCTCTCCCAGCCTAGCCCTACTGGTGGGCGG	78552

AL049612.11	1051	CACCTCCTGGCTCCAGGCCATCTTTTGTCCCAGTCCTAGGTAAGAAAAAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78553	CACCTCCTGGCTCCAGGCCATCTTTTGTCCCAGTCCTAGGTAAGAAAAAC	78602

AL049612.11	1101	ACAAACAAAAGCCAGTCCCATGGCACTCGAGAAGCAGGAGGCCGTTCCCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78603	ACAAACAAAAGCCAGTCCCATGGCACTCGAGAAGCAGGAGGCCGTTCCCT	78652

AL049612.11	1151	GACAGCAACATGCTGTGTGCACAGACACACGGGTGGACAGGAGGCAGAGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78653	GACAGCAACATGCTGTGTGCACAGACACACGGGTGGACAGGAGGCAGAGC	78702

AL049612.11	1201	TCGGGGTTGCTGCGGAGCGGGCAGGACACTGGAGCGGCAGGCAGTGCGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78703	TCGGGGTTGCTGCGGAGCGGGCAGGACACTGGAGCGGCAGGCAGTGCGGA	78752

AL049612.11	1251	CCCGCCGGGCAGCCGTGCACGGTTGTCGTCCTCAGCGGCAGGAGCCAGTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78753	CCCGCCGGGCAGCCGTGCACGGTTGTCGTCCTCAGCGGCAGGAGCCAGTT	78802

AL049612.11	1301	TGTTGCTCAGGGCCTTGTCTTTTTACAAAGAGCCCCAGGCCCCGGGGGCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78803	TGTTGCTCAGGGCCTTGTCTTTTTACAAAGAGCCCCAGGCCCCGGGGGCT	78852

AL049612.11	1351	TCTCTGGGTGCCTCTTTGCTGCCATGTCTGCACGCGGGCGGAGAGCAGAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78853	TCTCTGGGTGCCTCTTTGCTGCCATGTCTGCACGCGGGCGGAGAGCAGAC	78902

AL049612.11	1401	CAGGCTACCGACCCTCTCGCTTTGCTGTCTTCACGTGGAAAAGCCAGTGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78903	CAGGCTACCGACCCTCTCGCTTTGCTGTCTTCACGTGGAAAAGCCAGTGT	78952

AL049612.11	1451	CGTAGCCCCAAAGGAGGGGAAACTGTATTGATTTGGGGAGCCTCTATGTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	78953	CGTAGCCCCAAAGGAGGGGAAACTGTATTGATTTGGGGAGCCTCTATGTT	79002

AL049612.11	1501	GATTTCAAAACAGATTGTCTCCTGTGTTCTCAAAGACTGGAAGCGAACCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	79003	GATTTCAAAACAGATTGTCTCCTGTGTTCTCAAAGACTGGAAGCGAACCC	79052

AL049612.11	1551	CACAACCGCCTTAGGCCACAAAAGCTTTATCCTTTCTAATTAGCATCCCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	79053	CACAACCGCCTTAGGCCACAAAAGCTTTATCCTTTCTAATTAGCATCCCT	79102

AL049612.11	1601	GTGACCTGCTCTGCGCCCTGCAGATATTTTGCTCAGCCAGCCAGAAGGAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	79103	GTGACCTGCTCTGCGCCCTGCAGATATTTTGCTCAGCCAGCCAGAAGGAG	79152

AL049612.11	1651	GGAGGCCAGACACCAGCCCCCACAGACCTGCGGCTGCGACCCCCTGCCTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	79153	GGAGGCCAGACACCAGCCCCCACAGACCTGCGGCTGCGACCCCCTGCCTG	79202

AL049612.11	1701	GGGACGATGGGGTCGGGGTCCAGTAGCTGCCCCAGAAACAAGTGGGGCTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	79203	GGGACGATGGGGTCGGGGTCCAGTAGCTGCCCCAGAAACAAGTGGGGCTG	79252

AL049612.11	1751	CAGGAGGCTGATGGTGAGCTTGGAGGTTGGCAGAATTCTAAATCTGGGCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	79253	CAGGAGGCTGATGGTGAGCTTGGAGGTTGGCAGAATTCTAAATCTGGGCA	79302

AL049612.11	1801	CTGCAGGGTCCCCACAGGTCACGACCCTACTCTGCTCCACCCAGGCTCCG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	79303	CTGCAGGGTCCCCACAGGTCACGACCCTACTCTGCTCCACCCAGGCTCCG	79352

AL049612.11	1851	GAGGACCTGAGCAGGAACCTCTGCAGGGGGGGCCCGGGGCTCCCTGTCCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	79353	GAGGACCTGAGCAGGAACCTCTGCAGGGGGGGCCCGGGGCTCCCTGTCCT	79402

AL049612.11	1901	CTCAGCAGCCGGCAGTGCTCCCTGACAGCCCGGGCCTCTCCCTCCAGTAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	79403	CTCAGCAGCCGGCAGTGCTCCCTGACAGCCCGGGCCTCTCCCTCCAGTAG	79452

AL049612.11	1951	TTCGGTAGTTTGCTGTCACCAACATGGCTGGGCCTGGGACAGGCTCCTCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354892.19	79453	TTCGGTAGTTTGCTGTCACCAACATGGCTGGGCCTGGGACAGGCTCCTCC	79502

Overview

Query
AL049612.11 - 79576 bps
Hit
AL354892.19 - 79502 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link