<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2001 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL353770.18	128898	GAATTCTACCTTTAATTCACCTTTAATTCTACCTTTAATTTTTGCTTTGT	128947
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1	GAATTCTACCTTTAATTCACCTTTAATTCTACCTTTAATTTTTGCTTTGT	50

AL353770.18	128948	AGATTTTGGAAAAATTTCGTTCAGTGCACATAGGTTTATAATTTTTATAC	128997
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	51	AGATTTTGGAAAAATTTCGTTCAGTGCACATAGGTTTATAATTTTTATAC	100

AL353770.18	128998	CTTCTTGACATATTGTCTCTTTAACATTACAGCATGTCCTTCTTTATCTC	129047
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	101	CTTCTTGACATATTGTCTCTTTAACATTACAGCATGTCCTTCTTTATCTC	150

AL353770.18	129048	TGATGTATCAGTCTGTTCTCACAGTGCTAATAAAGACATACTTGCGACTG	129097
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	151	TGATGTATCAGTCTGTTCTCACAGTGCTAATAAAGACATACTTGCGACTG	200

AL353770.18	129098	GGTAATTTATAAACGAAAGAGGTTTGACCTGGCTAGGGAGGCCTCACAAT	129147
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	201	GGTAATTTATAAACGAAAGAGGTTTGACCTGGCTAGGGAGGCCTCACAAT	250

AL353770.18	129148	CACGGTGTAAGGCAAGGAGGAGCAAAGTCACATCTTACAATCATAGCGGC	129197
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	251	CACGGTGTAAGGCAAGGAGGAGCAAAGTCACATCTTACAATCATAGCGGC	300

AL353770.18	129198	ACGCAAGAAAGCATGCTTTATAAAAGCATCACATGGCCGGGCGCTGTGGC	129247
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	301	ACGCAAGAAAGCATGCTTTATAAAAGCATCACATGGCCGGGCGCTGTGGC	350

AL353770.18	129248	TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCATAA	129297
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	351	TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCATAA	400

AL353770.18	129298	GGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTA	129347
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	401	GGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTA	450

AL353770.18	129348	CTAAAAATGCAAAAAAATTAGCCGGGCGAGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCC	129397
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	451	CTAAAAATGCAAAAAAATTAGCCGGGCGAGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCC	500

AL353770.18	129398	CAGCTACTCCGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCCGGGGGGCG	129447
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	501	CAGCTACTCCGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCCGGGGGGCG	550

AL353770.18	129448	GAGTGTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACA	129497
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	551	GAGTGTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACA	600

AL353770.18	129498	GCGAGACTCCGTCTCAAAAAAACAAAAACAAACAAAAACAAACAAACAAA	129547
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	601	GCGAGACTCCGTCTCAAAAAAACAAAAACAAACAAAAACAAACAAACAAA	650

AL353770.18	129548	CAAAAAAGCATCACATAACTGGTATGAGATAGTATCTCATTGTGGTTTTG	129597
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	651	CAAAAAAGCATCACATAACTGGTATGAGATAGTATCTCATTGTGGTTTTG	700

AL353770.18	129598	ATTTGCCTTTCTCTAATGACCAGCGATGATGAGCTTTTCTTCATATGTTT	129647
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	701	ATTTGCCTTTCTCTAATGACCAGCGATGATGAGCTTTTCTTCATATGTTT	750

AL353770.18	129648	GTTGGCTGCATAAATGTCCTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTTG	129697
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	751	GTTGGCTGCATAAATGTCCTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTTG	800

AL353770.18	129698	CCCACATTTTGATGGGGTTGTTTGTCTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTT	129747
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	801	CCCACATTTTGATGGGGTTGTTTGTCTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTT	850

AL353770.18	129748	TGTAGATTCTAGATATTCGCCTTTTGTCAGATGGACAGATTGTAAAAATT	129797
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	851	TGTAGATTCTAGATATTCGCCTTTTGTCAGATGGACAGATTGTAAAAATT	900

AL353770.18	129798	TTCTCCCATTCCGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGATAGTTTCTTTAGC	129847
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	901	TTCTCCCATTCCGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGATAGTTTCTTTAGC	950

AL353770.18	129848	TGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACCAGATCCCATTCGTCTATTTTGGCTT	129897
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	951	TGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACCAGATCCCATTCGTCTATTTTGGCTT	1000

AL353770.18	129898	TTGTTGCCATTGCTTTTGGTGTTTTAGTCATGAAGTCCTTGCCCATGCCT	129947
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1001	TTGTTGCCATTGCTTTTGGTGTTTTAGTCATGAAGTCCTTGCCCATGCCT	1050

AL353770.18	129948	ATGTCCTGGATGGTATTGCCTAGATTTTCTTCTAGGGTTTTTATGGTTTT	129997
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1051	ATGTCCTGGATGGTATTGCCTAGATTTTCTTCTAGGGTTTTTATGGTTTT	1100

AL353770.18	129998	AGGTCTTATGTTTAAGTCTTTAATCCATCGTGAGTTAAATTTTGTATAAG	130047
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1101	AGGTCTTATGTTTAAGTCTTTAATCCATCGTGAGTTAAATTTTGTATAAG	1150

AL353770.18	130048	GTGTAAGGAAGGGGTCCAGTTTCAGTTTTCTGCGTATGGCCAGCCAGTTT	130097
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1151	GTGTAAGGAAGGGGTCCAGTTTCAGTTTTCTGCGTATGGCCAGCCAGTTT	1200

AL353770.18	130098	TCCCAATACCATTTATTAAATAGGCAATTATTTCCGCATTGCTTGTTTTT	130147
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1201	TCCCAATACCATTTATTAAATAGGCAATTATTTCCGCATTGCTTGTTTTT	1250

AL353770.18	130148	GTCAAGTTTCTCAAAGATCAGATGGTTGTAAATGTGTGGTGTTATTTCTG	130197
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1251	GTCAAGTTTCTCAAAGATCAGATGGTTGTAAATGTGTGGTGTTATTTCTG	1300

AL353770.18	130198	AGGCCTCTGTTCTGTTCCATTGGTCTATATCTCTGTTTTGGTACCAGTAC	130247
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1301	AGGCCTCTGTTCTGTTCCATTGGTCTATATCTCTGTTTTGGTACCAGTAC	1350

AL353770.18	130248	CATGCTGTTTTGGTCACTGTAGCCTTATAGTATACTTTGAAGTCAGGTAG	130297
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1351	CATGCTGTTTTGGTCACTGTAGCCTTATAGTATACTTTGAAGTCAGGTAG	1400

AL353770.18	130298	CATGATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTACTTTTGCATCTTTTAAAGAAGC	130347
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1401	CATGATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTACTTTTGCATCTTTTAAAGAAGC	1450

AL353770.18	130348	TGAGGAAGAAAGGAGGGCAAGTATACATTTGTAAAGTTTGTGATATTAAT	130397
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1451	TGAGGAAGAAAGGAGGGCAAGTATACATTTGTAAAGTTTGTGATATTAAT	1500

AL353770.18	130398	CTTCTTATCTGCCATTTCTGGTTCTCTTTATTTTTGTACACCTGAAAAAC	130447
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1501	CTTCTTATCTGCCATTTCTGGTTCTCTTTATTTTTGTACACCTGAAAAAC	1550

AL353770.18	130448	CATCTGGTGTCAACCTATTGGTTGGTCCAATATGGATTTGCTCATATCCT	130497
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1551	CATCTGGTGTCAACCTATTGGTTGGTCCAATATGGATTTGCTCATATCCT	1600

AL353770.18	130498	TTTGCCATTATTGTCAAATATATTACATTTCCATAGGTTATGAATCCAAC	130547
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1601	TTTGCCATTATTGTCAAATATATTACATTTCCATAGGTTATGAATCCAAC	1650

AL353770.18	130548	AATCTGTGTATATACATATCATTTTATGCAATTGCATTTTAAATCATTTA	130597
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1651	AATCTGTGTATATACATATCATTTTATGCAATTGCATTTTAAATCATTTA	1700

AL353770.18	130598	AGGAAAGAAGACAAAATATCCAATTATACTCTAAAAATTATCTACATAAT	130647
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1701	AGGAAAGAAGACAAAATATCCAATTATACTCTAAAAATTATCTACATAAT	1750

AL353770.18	130648	TCAATTTACCAGCCTCTTTGTTTTCTCATATGGGGTTGAACACGTATCAG	130697
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1751	TCAATTTACCAGCCTCTTTGTTTTCTCATATGGGGTTGAACACGTATCAG	1800

AL353770.18	130698	GAATCAGCTTGGAAATCTTTTGTTAGTGTTAATAAATATCAAGATAAATC	130747
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1801	GAATCAGCTTGGAAATCTTTTGTTAGTGTTAATAAATATCAAGATAAATC	1850

AL353770.18	130748	TTCCAGCAACACATTTTCTCAATTTTTGTTTATATGAAAATGTCTATTTT	130797
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1851	TTCCAGCAACACATTTTCTCAATTTTTGTTTATATGAAAATGTCTATTTT	1900

AL353770.18	130798	TTTTTTTTTTTTCCGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTG	130847
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1901	TTTTTTTTTTTTCCGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTG	1950

AL353770.18	130848	CAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTTCAAGCTCCGCCTCCCAGGTTCACACC	130897
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL162233.14	1951	CAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTTCAAGCTCCGCCTCCCAGGTTCACACC	2000

AL353770.18	130898	A	130898
			|
AL162233.14	2001	A	2001

Overview

Query
AL353770.18 - 130898 bps
Hit
AL162233.14 - 179833 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2001 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link