<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645924.13	166684	GAATTCCAGTACAAAGTTGAATAGAAGTGGTGAGAGCAGACATCTTTTGT	166733
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1	GAATTCCAGTACAAAGTTGAATAGAAGTGGTGAGAGCAGACATCTTTTGT	50

AL645924.13	166734	TAATGATGGAACTCTGAATGCTTTCTCCCCAAAGATAAGCGTGATGTTAG	166783
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	51	TAATGATGGAACTCTGAATGCTTTCTCCCCAAAGATAAGCGTGATGTTAG	100

AL645924.13	166784	CTGTAGGATTTTCGTAGCTACCCTTTGTCAGGCCAAGGCAGTTGCCACCT	166833
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	101	CTGTAGGATTTTCGTAGCTACCCTTTGTCAGGCCAAGGCAGTTGCCACCT	150

AL645924.13	166834	ACTCATAGCTTGCTGAGAGTTCTTATTAGGAATAGATGTTAGATTTTTTT	166883
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	151	ACTCATAGCTTGCTGAGAGTTCTTATTAGGAATAGATGTTAGATTTTTTT	200

AL645924.13	166884	TTTCAGATGCTTTTTTTGTGTGTCAACGGAGATTATCATGTTATTTTTAT	166933
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	201	TTTCAGATGCTTTTTTTGTGTGTCAACGGAGATTATCATGTTATTTTTAT	250

AL645924.13	166934	TATGGTAAATTACATTGATGGTTTTTTTTACTCGATAAATACTGACTTTT	166983
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	251	TATGGTAAATTACATTGATGGTTTTTTTTACTCGATAAATACTGACTTTT	300

AL645924.13	166984	TATTAGTATCCACTCCATCACTCAACAGCAATAGCAGCATGCAGATGCCA	167033
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	301	TATTAGTATCCACTCCATCACTCAACAGCAATAGCAGCATGCAGATGCCA	350

AL645924.13	167034	TGAGGGCAGGGCTGTGTGTACACACAACACTCACCAGTACATCCCAGTGC	167083
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	351	TGAGGGCAGGGCTGTGTGTACACACAACACTCACCAGTACATCCCAGTGC	400

AL645924.13	167084	CTAGTACACAGTAGGCACTCAGTTATATCATTGAAACAGGGAACGCTTGG	167133
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	401	CTAGTACACAGTAGGCACTCAGTTATATCATTGAAACAGGGAACGCTTGG	450

AL645924.13	167134	CTGATTCATTTACATTTTAATTTATTTTATTTTTTTTATTATTATACTTT	167183
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	451	CTGATTCATTTACATTTTAATTTATTTTATTTTTTTTATTATTATACTTT	500

AL645924.13	167184	AAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTAGTTACATATGTATAC	167233
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	501	AAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTAGTTACATATGTATAC	550

AL645924.13	167234	ATGTCCCATGCTGGTGCGCTGCACCCACTAACTCATCATCTAGCATTAGG	167283
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	551	ATGTCCCATGCTGGTGCGCTGCACCCACTAACTCATCATCTAGCATTAGG	600

AL645924.13	167284	TATATCTCCCAATTCTATCCCTCCCCCCTCCCCCCACCCCACAACAGTCC	167333
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	601	TATATCTCCCAATTCTATCCCTCCCCCCTCCCCCCACCCCACAACAGTCC	650

AL645924.13	167334	CCAGAGTGTGATGTTCCCCTTCCTGTGTCCATATGTTCTCATTGTTCAAT	167383
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	651	CCAGAGTGTGATGTTCCCCTTCCTGTGTCCATATGTTCTCATTGTTCAAT	700

AL645924.13	167384	TCCCACCTATGAGTGAGAATATGCGGTGTTTGCATATTTTCTTTTTGAAT	167433
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	701	TCCCACCTATGAGTGAGAATATGCGGTGTTTGCATATTTTCTTTTTGAAT	750

AL645924.13	167434	AGTGTGACTTACTCTTTTTGGCATATGATAGCTATGGTATCACATAAACA	167483
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	751	AGTGTGACTTACTCTTTTTGGCATATGATAGCTATGGTATCACATAAACA	800

AL645924.13	167484	ATTGTAAACTGTGTCGAGCTGCCAAAAGTTTGAATCTCATGCCAGTATAT	167533
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	801	ATTGTAAACTGTGTCGAGCTGCCAAAAGTTTGAATCTCATGCCAGTATAT	850

AL645924.13	167534	ACATTCAGCCTTCTCACCATAGCTATTTGAGAGTTATAATTATCTATAGC	167583
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	851	ACATTCAGCCTTCTCACCATAGCTATTTGAGAGTTATAATTATCTATAGC	900

AL645924.13	167584	ACTGAAAGAGACTTTGGGCTCATCTGGTCCGATTCTCTTATTTCATGAAT	167633
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	901	ACTGAAAGAGACTTTGGGCTCATCTGGTCCGATTCTCTTATTTCATGAAT	950

AL645924.13	167634	TAGAACACTAAATCCACTCAGACTGGGTGACTCGTCTGTCAGAACATGCA	167683
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	951	TAGAACACTAAATCCACTCAGACTGGGTGACTCGTCTGTCAGAACATGCA	1000

AL645924.13	167684	ATAAACAGAAAACAAGGGGTTGTTTGCCTGATGCCATAGCATCCAAAGGT	167733
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1001	ATAAACAGAAAACAAGGGGTTGTTTGCCTGATGCCATAGCATCCAAAGGT	1050

AL645924.13	167734	CAGGGTAGCTGGAACTCTTGGTGTCTTCTTGTCTTACAAAATGATGGAAG	167783
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1051	CAGGGTAGCTGGAACTCTTGGTGTCTTCTTGTCTTACAAAATGATGGAAG	1100

AL645924.13	167784	ACGCATCATTTTAGTTCTCTGGTAGAAAGAGGATCAGAGAACCAGCTGGG	167833
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1101	ACGCATCATTTTAGTTCTCTGGTAGAAAGAGGATCAGAGAACCAGCTGGG	1150

AL645924.13	167834	AATCACAAATATGCTACAAAGATAAAAGACAGAATTTGGCCCTAAATAAA	167883
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1151	AATCACAAATATGCTACAAAGATAAAAGACAGAATTTGGCCCTAAATAAA	1200

AL645924.13	167884	AATAGATTCTTAAAAATAGAGAAGAGATCAGATATGTTGCTAAGAAAATG	167933
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1201	AATAGATTCTTAAAAATAGAGAAGAGATCAGATATGTTGCTAAGAAAATG	1250

AL645924.13	167934	CAGATGTTAGACCATATCCATGGTTCACAGTCCTTGTGAAAGCTTAAAAA	167983
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1251	CAGATGTTAGACCATATCCATGGTTCACAGTCCTTGTGAAAGCTTAAAAA	1300

AL645924.13	167984	ATATAGATGCCAGGACCCAATCCCAGAGATTCTGCCTTATTTGGTCCAGG	168033
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1301	ATATAGATGCCAGGACCCAATCCCAGAGATTCTGCCTTATTTGGTCCAGG	1350

AL645924.13	168034	AAGAGCATAAGCATACATTGATTGATTTTTGAATGTTAAAAAAAATTACT	168083
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1351	AAGAGCATAAGCATACATTGATTGATTTTTGAATGTTAAAAAAAATTACT	1400

AL645924.13	168084	CCTGCATTCCTGGGATAAATCCCACTCGTTCATGGTACATTATCCTTTTA	168133
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1401	CCTGCATTCCTGGGATAAATCCCACTCGTTCATGGTACATTATCCTTTTA	1450

AL645924.13	168134	CGCATTATTGAATTCAGTTTCCTAAAATTTTGTTAGGAATTTTTGGATCA	168183
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1451	CGCATTATTGAATTCAGTTTCCTAAAATTTTGTTAGGAATTTTTGGATCA	1500

AL645924.13	168184	ATATTCATTAGGGATATGGGCCCACAGTCTTTGTCTGATTTTGGTGTCAA	168233
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1501	ATATTCATTAGGGATATGGGCCCACAGTCTTTGTCTGATTTTGGTGTCAA	1550

AL645924.13	168234	GACAGTGTCATAGATGAGTTGTGAAGGATTCTGTCCTCTTCAGTTTTATG	168283
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1551	GACAGTGTCATAGATGAGTTGTGAAGGATTCTGTCCTCTTCAGTTTTATG	1600

AL645924.13	168284	GAAGAGTTTGTGTAGTGTTAGTTCTTCTTAAATGTTTGGTAGAATTCACT	168333
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1601	GAAGAGTTTGTGTAGTGTTAGTTCTTCTTAAATGTTTGGTAGAATTCACT	1650

AL645924.13	168334	ATTAATCTATCTGGAACTGGAGTTTTCTTTGTAGGAAGATTTTTAACTAC	168383
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1651	ATTAATCTATCTGGAACTGGAGTTTTCTTTGTAGGAAGATTTTTAACTAC	1700

AL645924.13	168384	AAATTTAATTTCTTGAATAAATATAGGGTTTTCACATTATTTCAGAAATT	168433
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1701	AAATTTAATTTCTTGAATAAATATAGGGTTTTCACATTATTTCAGAAATT	1750

AL645924.13	168434	TCTTCTTGAGAGAGATTTGGTAGTTTATGCCTTTTAAGAAATTTCATCTA	168483
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1751	TCTTCTTGAGAGAGATTTGGTAGTTTATGCCTTTTAAGAAATTTCATCTA	1800

AL645924.13	168484	AGTTGTTGAATTTATTGGCATAAGTTGTTTGTAATATTTCCTTATAATCC	168533
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1801	AGTTGTTGAATTTATTGGCATAAGTTGTTTGTAATATTTCCTTATAATCC	1850

AL645924.13	168534	TTTTAATATATGTAGGATCCACCGCGATGTCACCTCTCTCGTTCCTGTTA	168583
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1851	TTTTAATATATGTAGGATCCACCGCGATGTCACCTCTCTCGTTCCTGTTA	1900

AL645924.13	168584	TTAAGTTGTATCTTCTGTTTTCATTCTGAACTGTGTTGATAGAGTTTTAT	168633
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1901	TTAAGTTGTATCTTCTGTTTTCATTCTGAACTGTGTTGATAGAGTTTTAT	1950

AL645924.13	168634	CAATTTTACTGATATTCTCAAAGGAACTATTTTAGCTTCATTGATTTTCT	168683
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL158068.18	1951	CAATTTTACTGATATTCTCAAAGGAACTATTTTAGCTTCATTGATTTTCT	2000

Overview

Query
AL645924.13 - 168683 bps
Hit
AL158068.18 - 178338 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link