<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
AL365336.20 1 CGGGTGTGTTGGGGTGCCCTGGACTGGGCGAGGTGGGAGTGCTGGTTTCT 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 188738 CGGGTGTGTTGGGGTGCCCTGGACTGGGCGAGGTGGGAGTGCTGGTTTCT 188787 AL365336.20 51 GGTGATGGTGAGTGGTCTTGGTTTCTGTTAGTAAGATCCTTCTGTTTACT 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 188788 GGTGATGGTGAGTGGTCTTGGTTTCTGTTAGTAAGATCCTTCTGTTTACT 188837 AL365336.20 101 TTTCGACATCTGTTATTCTCTGCAGTTAGTTGATTTAGTTGTCTCTGGTT 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 188838 TTTCGACATCTGTTATTCTCTGCAGTTAGTTGATTTAGTTGTCTCTGGTT 188887 AL365336.20 151 AGAGCTTGTTCCTCAGGTGATTCTGTTAGCCTCTATCAGCAGACCTGGGA 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 188888 AGAGCTTGTTCCTCAGGTGATTCTGTTAGCCTCTATCAGCAGACCTGGGA 188937 AL365336.20 201 GACTAGCTCTCTCCTCTGAGTTTCAGTGGTCAGAGATCTCTCTGCAGGCA 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 188938 GACTAGCTCTCTCCTCTGAGTTTCAGTGGTCAGAGATCTCTCTGCAGGCA 188987 AL365336.20 251 AGCTCTCCTCTTACAGGGAAGGTGCACATATATCTGGTGTTAGGACCTCC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 188988 AGCTCTCCTCTTACAGGGAAGGTGCACATATATCTGGTGTTAGGACCTCC 189037 AL365336.20 301 CTCCTGGCCGAAGATGAAGGCCCAAAACAGGACCTGTCCCCGAAGCTGAG 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189038 CTCCTGGCCGAAGATGAAGGCCCAAAACAGGACCTGTCCCCGAAGCTGAG 189087 AL365336.20 351 TTGCTTTGGCTTGTCCCAGAAGCTGTTAGCTTCTGTATTCCACACCCTCA 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189088 TTGCTTTGGCTTGTCCCAGAAGCTGTTAGCTTCTGTATTCCACACCCTCA 189137 AL365336.20 401 CCTGTGCAGAATACTCTCGGAGGAGTCCCGGAACCAAGATGTCAAATGAT 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189138 CCTGTGCAGAATACTCTCGGAGGAGTCCCGGAACCAAGATGTCAAATGAT 189187 AL365336.20 451 CATTTTCATTACGTTTACCATACCAAACCATGAGCATGGGAGATCTTTTT 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189188 CATTTTCATTACGTTTACCATACCAAACCATGAGCATGGGAGATCTTTTT 189237 AL365336.20 501 TCTTCTAATATCTTCTTTAATTTCTTTCTTCAAAGACTCAAAGTTCTTTT 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189238 TCTTCTAATATCTTCTTTAATTTCTTTCTTCAAAGACTCAAAGTTCTTTT 189287 AL365336.20 551 CATTTAAGTCTTACTTGCTTCGTTAGAGTAACAACATGATGTTTTATACT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189288 CATTTAAGTCTTACTTGCTTCGTTAGAGTAACAACATGATGTTTTATACT 189337 AL365336.20 601 ATTTAGGACTATTGTTAAGGATGTTGTTTCCCTATTTTTTTTCTCAGTCC 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189338 ATTTAGGACTATTGTTAAGGATGTTGTTTCCCTATTTTTTTTCTCAGTCC 189387 AL365336.20 651 ATTTATTCTTTGTATGTACATTGGCTACTGAGTTTTCGAGTAATTTTTTT 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189388 ATTTATTCTTTGTATGTACATTGGCTACTGAGTTTTCGAGTAATTTTTTT 189437 AL365336.20 701 TTATCAAGCTACTTCATTGAAGGAGTTTATCAGTTATAGGAGTTTTCTGG 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189438 TTATCAAGCTACTTCATTGAAGGAGTTTATCAGTTATAGGAGTTTTCTGG 189487 AL365336.20 751 AAGGACTTTGGGATATCACTCATATATACTATCATATCATCTATAAATAG 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189488 AAGGACTTTGGGATATCACTCATATATACTATCATATCATCTATAAATAG 189537 AL365336.20 801 TGATATTTTGAGTTCTTCCTTCCCAATTTGTATTCCCTTGATGTTCTTTA 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189538 TGATATTTTGAGTTCTTCCTTCCCAATTTGTATTCCCTTGATGTTCTTTA 189587 AL365336.20 851 GTTGTCTAATTGCTCTAGCTAAGTTTCTTTCCATTTAATTTGATGTTGGC 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189588 GTTGTCTAATTGCTCTAGCTAAGTTTCTTTCCATTTAATTTGATGTTGGC 189637 AL365336.20 901 TATCAGCTTGCTGTACATTACCTTTATTGTGCCTTGCATCCATTGTCTAT 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189638 TATCAGCTTGCTGTACATTACCTTTATTGTGCCTTGCATCCATTGTCTAT 189687 AL365336.20 951 CCAAGACTTTTATCATAAAGGGGTGTTAGATTTTTTCAAAGACTTTTCTA 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189688 CCAAGACTTTTATCATAAAGGGGTGTTAGATTTTTTCAAAGACTTTTCTA 189737 AL365336.20 1001 CATCTAATGAAAAGACCATGTGTTTTACTTTTGTTCTGTTTGATTATATG 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189738 CATCTAATGAAAAGACCATGTGTTTTACTTTTGTTCTGTTTGATTATATG 189787 AL365336.20 1051 GTGGGGCTACATTGACGGATTTTCATATTTTAACCTTCTCTGCATCTGTA 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189788 GTGGGGCTACATTGACGGATTTTCATATTTTAACCTTCTCTGCATCTGTA 189837 AL365336.20 1101 GAATGAAGCCTACTTGATCACAGAGGATAATGATTTTTTATGTATTGTTG 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189838 GAATGAAGCCTACTTGATCACAGAGGATAATGATTTTTTATGTATTGTTG 189887 AL365336.20 1151 AATTCAGTTTGCCAGCCATTTATTGATTATTTTTGCATCAATATTCATAA 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189888 AATTCAGTTTGCCAGCCATTTATTGATTATTTTTGCATCAATATTCATAA 189937 AL365336.20 1201 GGCAAATTGTCCTGAAATTTTTATCCTTGTTTAAGTGTTTGTGTGGTTTT 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189938 GGCAAATTGTCCTGAAATTTTTATCCTTGTTTAAGTGTTTGTGTGGTTTT 189987 AL365336.20 1251 AGTATTAGGGTCATTTTGCTATCATAGAAAGAATATGTCAGTGTTCCTTA 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 189988 AGTATTAGGGTCATTTTGCTATCATAGAAAGAATATGTCAGTGTTCCTTA 190037 AL365336.20 1301 TGTGTCTATTTTGTGGAATATTTTGAGGATTATTATTATTGACTGTTCTT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 190038 TGTGTCTATTTTGTGGAATATTTTGAGGATTATTATTATTGACTGTTCTT 190087 AL365336.20 1351 TGAAATTCTGGTAGTATTCTGTACTAAAAGTATCTGGCAGTATGTTTTTT 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 190088 TGAAATTCTGGTAGTATTCTGTACTAAAAGTATCTGGCAGTATGTTTTTT 190137 AL365336.20 1401 ATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTTGGTTAGAAG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 190138 ATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTTGGTTAGAAG 190187 AL365336.20 1451 ATTTTTTAATGACTGCTTTTATTTCCTTAGTGGTTATAGACCTACTTAAG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 190188 ATTTTTTAATGACTGCTTTTATTTCCTTAGTGGTTATAGACCTACTTAAG 190237 AL365336.20 1501 GTGTTTACATAATATTTATTTAACTTGGGTAAGTGGTATTTATAATGAAC 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 190238 GTGTTTACATAATATTTATTTAACTTGGGTAAGTGGTATTTATAATGAAC 190287 AL365336.20 1551 ACTGTCTATTTCATTTAAATTTTTCAAATTTTTGAAGTACATGTTTTTGA 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 190288 ACTGTCTATTTCATTTAAATTTTTCAAATTTTTGAAGTACATGTTTTTGA 190337 AL365336.20 1601 TGTAACACCTAATGATTCTTTGAATTTATTTGTTGTCTGGTGCTGTAGCT 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 190338 TGTAACACCTAATGATTCTTTGAATTTATTTGTTGTCTGGTGCTGTAGCT 190387 AL365336.20 1651 GCCTTTTTACTTTTGATTTTATTGATTTATATATTTTTCTTTGCCTTTTA 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 190388 GCCTTTTTACTTTTGATTTTATTGATTTATATATTTTTCTTTGCCTTTTA 190437 AL365336.20 1701 GTTAGTTGGGCCAAGGGTTTGTCTATCTTACTGATTTTCTGAAAGAACCA 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 190438 GTTAGTTGGGCCAAGGGTTTGTCTATCTTACTGATTTTCTGAAAGAACCA 190487 AL365336.20 1751 GCTCTCTCTTTGTTTTATTGAGTCTATCTACTGTTCTCTTTGTTTCTAAT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 190488 GCTCTCTCTTTGTTTTATTGAGTCTATCTACTGTTCTCTTTGTTTCTAAT 190537 AL365336.20 1801 TTATTGATTTCAACTCTGAATTTGGTTGTTACTTAGCACTCAATCCTCTT 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 190538 TTATTGATTTCAACTCTGAATTTGGTTGTTACTTAGCACTCAATCCTCTT 190587 AL365336.20 1851 GAGTGTGTTTGCTTCTTTTTGTTCAAGAACTTTCATGTGTGCTTTTAAGT 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 190588 GAGTGTGTTTGCTTCTTTTTGTTCAAGAACTTTCATGTGTGCTTTTAAGT 190637 AL365336.20 1901 CATTAAGATGAGGAATTTTTGGAGGACTGTGTTTGAGGATAGGCATTGGT 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 190638 CATTAAGATGAGGAATTTTTGGAGGACTGTGTTTGAGGATAGGCATTGGT 190687 AL365336.20 1951 TAAATTTGGTTTTGTCATGTAATATGCTATTTTCTCCATTTATAGTGATC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL136158.25 190688 TAAATTTGGTTTTGTCATGTAATATGCTATTTTCTCCATTTATAGTGATC 190737