<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL136360.21	101728	GAATTCTTCCTGTGAGTGGGAAGTGCCGCGTCCACCACCCCCAGCCACTT	101777
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1	GAATTCTTCCTGTGAGTGGGAAGTGCCGCGTCCACCACCCCCAGCCACTT	50

AL136360.21	101778	GGCCGGGGCAGGGCTGAGTGCCCCCAGTTGGGAGTGACCCAGGCTGGGTC	101827
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	51	GGCCGGGGCAGGGCTGAGTGCCCCCAGTTGGGAGTGACCCAGGCTGGGTC	100

AL136360.21	101828	TGGGCCAGACACTCCAGACTGGGTAGGCACTCCCAGCTCCCTCTCCCATG	101877
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	101	TGGGCCAGACACTCCAGACTGGGTAGGCACTCCCAGCTCCCTCTCCCATG	150

AL136360.21	101878	GATTCCAGGGGAGGGGGCTGCCTCGTGGCTCAGCAGCTGCTCCCCCCGGC	101927
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	151	GATTCCAGGGGAGGGGGCTGCCTCGTGGCTCAGCAGCTGCTCCCCCCGGC	200

AL136360.21	101928	AGGTGTCCAAGAAGCCACCAGCTCTGACGCCCTATGGTGTCACCCCCTGC	101977
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	201	AGGTGTCCAAGAAGCCACCAGCTCTGACGCCCTATGGTGTCACCCCCTGC	250

AL136360.21	101978	TGGCTCCCTTCGCTTTAGGAAGCCATGGCCCAGGGCGTGCACCGTCCTCC	102027
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	251	TGGCTCCCTTCGCTTTAGGAAGCCATGGCCCAGGGCGTGCACCGTCCTCC	300

AL136360.21	102028	CAGGCCAGCCCAGCGTGCAGCCCTGTACTGAGATGGAGAGAACACAGCCT	102077
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	301	CAGGCCAGCCCAGCGTGCAGCCCTGTACTGAGATGGAGAGAACACAGCCT	350

AL136360.21	102078	CCCCGCAGGCACTGAGGCCCCTAGAGCTTGTGTTCCCGACTGATGTGTCA	102127
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	351	CCCCGCAGGCACTGAGGCCCCTAGAGCTTGTGTTCCCGACTGATGTGTCA	400

AL136360.21	102128	GGAGGACCAGAGGAGCCCCTCTATGAGAAGACCTGGCCACCCACTGCAGG	102177
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	401	GGAGGACCAGAGGAGCCCCTCTATGAGAAGACCTGGCCACCCACTGCAGG	450

AL136360.21	102178	CCTCCCCCATGGATGCAGCCTAGGGGCCACCGAGGACCCGCGGGCGTCTG	102227
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	451	CCTCCCCCATGGATGCAGCCTAGGGGCCACCGAGGACCCGCGGGCGTCTG	500

AL136360.21	102228	GGGTCACATGCTCTCAGGCCACAAGGTCTCTCCCATGAGCCTCCTGCAGG	102277
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	501	GGGTCACATGCTCTCAGGCCACAAGGTCTCTCCCATGAGCCTCCTGCAGG	550

AL136360.21	102278	CTAGTGACCAGTGGCTGCAAACAGGCTGGCTCCTGAGACAGCCAGTGCTC	102327
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	551	CTAGTGACCAGTGGCTGCAAACAGGCTGGCTCCTGAGACAGCCAGTGCTC	600

AL136360.21	102328	CAAGCAGCTCCTCCAGACTCTTCCCGTCCCACGTGCCCCTCTGCCTTCCC	102377
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	601	CAAGCAGCTCCTCCAGACTCTTCCCGTCCCACGTGCCCCTCTGCCTTCCC	650

AL136360.21	102378	TCATGCACAGTGGCCTCACTGCCAGCCCAGCAGGACACCTGTGACTCACC	102427
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	651	TCATGCACAGTGGCCTCACTGCCAGCCCAGCAGGACACCTGTGACTCACC	700

AL136360.21	102428	TCCACCTCACAGCAGGCTGCGACAGAGGCACCAACACGATCCCCTCTTTG	102477
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	701	TCCACCTCACAGCAGGCTGCGACAGAGGCACCAACACGATCCCCTCTTTG	750

AL136360.21	102478	CACGTGGGGAAACTGAGGCACCAAAAGGTCACAGGGCTCAAAAGTGCGCC	102527
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	751	CACGTGGGGAAACTGAGGCACCAAAAGGTCACAGGGCTCAAAAGTGCGCC	800

AL136360.21	102528	AGCCAGGATTTCAGCCGCATCCTCACCCTGTACCATGGTTCCCTGTCTCT	102577
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	801	AGCCAGGATTTCAGCCGCATCCTCACCCTGTACCATGGTTCCCTGTCTCT	850

AL136360.21	102578	GTGGTGGCCCCTGGAAATGTGCTCCCGGGGTCCTGCTTTCAGGCCACCCC	102627
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	851	GTGGTGGCCCCTGGAAATGTGCTCCCGGGGTCCTGCTTTCAGGCCACCCC	900

AL136360.21	102628	CCCCCCCCCGGGTATCTCAGCCCCTCCCATGTACTTCCTTACCCAGGTCT	102677
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	901	CCCCCCCCCGGGTATCTCAGCCCCTCCCATGTACTTCCTTACCCAGGTCT	950

AL136360.21	102678	GGGTCTGGGCTCCAAGAGCATCCCTTGAAGTGGGGCACAGGGCCCCCTGT	102727
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	951	GGGTCTGGGCTCCAAGAGCATCCCTTGAAGTGGGGCACAGGGCCCCCTGT	1000

AL136360.21	102728	ACCCTTCAGGGATGTCACCTCCGGCTGCCACCCACAGAGCGGCCAGCACT	102777
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1001	ACCCTTCAGGGATGTCACCTCCGGCTGCCACCCACAGAGCGGCCAGCACT	1050

AL136360.21	102778	CAGGCTCACCATCAAGGTGCTGGCTCCTCGTGGGGACACCTGGTGCCACT	102827
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1051	CAGGCTCACCATCAAGGTGCTGGCTCCTCGTGGGGACACCTGGTGCCACT	1100

AL136360.21	102828	GCAGGAGGCCGGCCAGGGGTGAGTATATGGGGTGCAGATGGTGCTGTGGG	102877
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1101	GCAGGAGGCCGGCCAGGGGTGAGTATATGGGGTGCAGATGGTGCTGTGGG	1150

AL136360.21	102878	TTTGAGCAGTGGCCTTCCCCACCACCACCGTGTGTACCACCCTGCCCTCT	102927
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1151	TTTGAGCAGTGGCCTTCCCCACCACCACCGTGTGTACCACCCTGCCCTCT	1200

AL136360.21	102928	TTCAAGTGGCGGCTGTGTCACCCACGCGGCTTGCCTGTGCCCACTGAACA	102977
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1201	TTCAAGTGGCGGCTGTGTCACCCACGCGGCTTGCCTGTGCCCACTGAACA	1250

AL136360.21	102978	TGGGTCATCTTTTCTGGGTGACCTGGGTCATCACAATGAATTGGTCAGGA	103027
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1251	TGGGTCATCTTTTCTGGGTGACCTGGGTCATCACAATGAATTGGTCAGGA	1300

AL136360.21	103028	CCTCGCTGCTGTGGTCTGCGGGTGCTGGAAGTCCGTTCCTTCTTCCCTTC	103077
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1301	CCTCGCTGCTGTGGTCTGCGGGTGCTGGAAGTCCGTTCCTTCTTCCCTTC	1350

AL136360.21	103078	AATTACGCAGCATTTGCCTGACAGCGTGTGCGGTGCTGGGGAGGCAGGGA	103127
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1351	AATTACGCAGCATTTGCCTGACAGCGTGTGCGGTGCTGGGGAGGCAGGGA	1400

AL136360.21	103128	CAGCTGAGTCCAGATCACAGTCCTGCTGCTATGCCACACCAGCCTCGCCC	103177
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1401	CAGCTGAGTCCAGATCACAGTCCTGCTGCTATGCCACACCAGCCTCGCCC	1450

AL136360.21	103178	CTCTTGGTGCTTCCTGCCCCCTGGGGGAGCCAGGTGCCCATCCTGTGGCT	103227
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1451	CTCTTGGTGCTTCCTGCCCCCTGGGGGAGCCAGGTGCCCATCCTGTGGCT	1500

AL136360.21	103228	CAAGGAAGCATTTGGTTTCTCCCCAGGAAGAGAACACCCACTCTGGCCGA	103277
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1501	CAAGGAAGCATTTGGTTTCTCCCCAGGAAGAGAACACCCACTCTGGCCGA	1550

AL136360.21	103278	GACAGCCTGATTTTCTCCTGGCTTCAAAAACATTTTCACCGCCTCCCATG	103327
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1551	GACAGCCTGATTTTCTCCTGGCTTCAAAAACATTTTCACCGCCTCCCATG	1600

AL136360.21	103328	TGTGTGGGTCCTGGGTGGCCGGGCCTGCCCCCATTGTGGTGGGACGTCCC	103377
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1601	TGTGTGGGTCCTGGGTGGCCGGGCCTGCCCCCATTGTGGTGGGACGTCCC	1650

AL136360.21	103378	AGTGATCCAGGGAGCTGCCCGTAGCCACTGCTGGGCCCTCCCACCAGCGC	103427
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1651	AGTGATCCAGGGAGCTGCCCGTAGCCACTGCTGGGCCCTCCCACCAGCGC	1700

AL136360.21	103428	GGTGCTGCCCCTGCCTGCGTTCCCTGGGCAGCACTCTGAGCCCCAACAGG	103477
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1701	GGTGCTGCCCCTGCCTGCGTTCCCTGGGCAGCACTCTGAGCCCCAACAGG	1750

AL136360.21	103478	CCCGCCAGGCCTTGATGTACCCGCCGCACCCAGGCCTCCATCCTGCCGCA	103527
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1751	CCCGCCAGGCCTTGATGTACCCGCCGCACCCAGGCCTCCATCCTGCCGCA	1800

AL136360.21	103528	GTTTCAGTGGGATGTCCCACATGGGCTTTGCTGTTCGTAACCCGAGCCCA	103577
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1801	GTTTCAGTGGGATGTCCCACATGGGCTTTGCTGTTCGTAACCCGAGCCCA	1850

AL136360.21	103578	GGCCAAGGCTGCCTAGCCCTCCAGGCTGAGGGGCAGCCCTGCCCCTGCCC	103627
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1851	GGCCAAGGCTGCCTAGCCCTCCAGGCTGAGGGGCAGCCCTGCCCCTGCCC	1900

AL136360.21	103628	CTGCCCTTGGAAAGATACTCGCAGCCTGGGGTTCCTTCAGGGTCCTGGCT	103677
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1901	CTGCCCTTGGAAAGATACTCGCAGCCTGGGGTTCCTTCAGGGTCCTGGCT	1950

AL136360.21	103678	GGAGGGCCTGGCGGCACGGGTTGGGAGGGTGGGAAAGGCAGAAGCCGGGC	103727
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL132868.24	1951	GGAGGGCCTGGCGGCACGGGTTGGGAGGGTGGGAAAGGCAGAAGCCGGGC	2000

Overview

Query
AL136360.21 - 103727 bps
Hit
AL132868.24 - 193444 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link