<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL121750.22	147970	GATCTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGAGCATCACAGCAAAAC	148019
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1	GATCTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGAGCATCACAGCAAAAC	50

AL121750.22	148020	CCTGTCTCTACAAAATACAAAAAAGTTAACCAGGCACGGTGGCACGTGCC	148069
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	51	CCTGTCTCTACAAAATACAAAAAAGTTAACCAGGCACGGTGGCACGTGCC	100

AL121750.22	148070	TGTAGTCCCAGCTACTCAGGTTAGGATGGAGAATCGCTTGGGCCTGGGGA	148119
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	101	TGTAGTCCCAGCTACTCAGGTTAGGATGGAGAATCGCTTGGGCCTGGGGA	150

AL121750.22	148120	GGTCGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGTGCCACTGCACTCTAGCCTGGGT	148169
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	151	GGTCGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGTGCCACTGCACTCTAGCCTGGGT	200

AL121750.22	148170	GACAGTGAGACCCTGCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGCTGGGCGCA	148219
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	201	GACAGTGAGACCCTGCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGCTGGGCGCA	250

AL121750.22	148220	GTGGCTCACGCCTATAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCGGAT	148269
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	251	GTGGCTCACGCCTATAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCGGAT	300

AL121750.22	148270	CATCTAAGGTCAGGAATTCGAGATTAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCC	148319
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	301	CATCTAAGGTCAGGAATTCGAGATTAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCC	350

AL121750.22	148320	GTCTCTACTAAAAATATAAAAATTGGGCCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTG	148369
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	351	GTCTCTACTAAAAATATAAAAATTGGGCCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTG	400

AL121750.22	148370	TAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATGCCGAGGTAGGCGG	148419
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	401	TAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATGCCGAGGTAGGCGG	450

AL121750.22	148420	ATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCC	148469
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	451	ATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCC	500

AL121750.22	148470	ATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGTGTGCCTG	148519
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	501	ATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGTGTGCCTG	550

AL121750.22	148520	TAGTCCCAGCTACTCGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCTCTG	148569
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	551	TAGTCCCAGCTACTCGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCTCTG	600

AL121750.22	148570	AGGCGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCTCCACTGCACTCGAGCCTGAG	148619
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	601	AGGCGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCTCCACTGCACTCGAGCCTGAG	650

AL121750.22	148620	CGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAATTCTTTTAGCTGGG	148669
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	651	CGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAATTCTTTTAGCTGGG	700

AL121750.22	148670	CTTGGTGGTGGGCTCTATAATCCCAGCTACTGAGGAGGCTGAGGTGGGAG	148719
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	701	CTTGGTGGTGGGCTCTATAATCCCAGCTACTGAGGAGGCTGAGGTGGGAG	750

AL121750.22	148720	AATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATTGTGCCA	148769
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	751	AATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATTGTGCCA	800

AL121750.22	148770	TTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAA	148819
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	801	TTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAA	850

AL121750.22	148820	AAATTTGAGATGAAGTTTCAGAACAGAACATTGTAGGCTGAAAAACTCCA	148869
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	851	AAATTTGAGATGAAGTTTCAGAACAGAACATTGTAGGCTGAAAAACTCCA	900

AL121750.22	148870	GAGTTAATAGTTCAAATGCCCAACTTCTGAGTGAGTAATTGTTAGTTCAA	148919
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	901	GAGTTAATAGTTCAAATGCCCAACTTCTGAGTGAGTAATTGTTAGTTCAA	950

AL121750.22	148920	ACGCCCAACTTCTGAGTGAGTATGTTTGTGTCTGGTGATGGGGCATCCAC	148969
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	951	ACGCCCAACTTCTGAGTGAGTATGTTTGTGTCTGGTGATGGGGCATCCAC	1000

AL121750.22	148970	GCCAGGTCTTCTTTTGCTTTCTGAACATTTGCTCTTGACACTGCTTCTTT	149019
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1001	GCCAGGTCTTCTTTTGCTTTCTGAACATTTGCTCTTGACACTGCTTCTTT	1050

AL121750.22	149020	TAATTCAGTAAACTGTGCTTTTAAATCTTCCACTTAGGAAATTGAGAGGC	149069
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1051	TAATTCAGTAAACTGTGCTTTTAAATCTTCCACTTAGGAAATTGAGAGGC	1100

AL121750.22	149070	TGACTGAGCGACTAGAAGAAAAAGAGAGGGAGATGCAGCAGCTGCTGAGC	149119
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1101	TGACTGAGCGACTAGAAGAAAAAGAGAGGGAGATGCAGCAGCTGCTGAGC	1150

AL121750.22	149120	CAGCCCCAACACGAGCGAGAGAAGGAAGTCGTCCTGCTACGGAGGAGCAT	149169
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1151	CAGCCCCAACACGAGCGAGAGAAGGAAGTCGTCCTGCTACGGAGGAGCAT	1200

AL121750.22	149170	GGCAGAAGGGGAGCGCGCCCGGGCCGCCAGTGACGTCCTGTGCCGCTCCT	149219
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1201	GGCAGAAGGGGAGCGCGCCCGGGCCGCCAGTGACGTCCTGTGCCGCTCCT	1250

AL121750.22	149220	TGGCCAACGAGACCCATCAGCTGCGGAGGACGCTGACCGCCACCGCCCAC	149269
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1251	TGGCCAACGAGACCCATCAGCTGCGGAGGACGCTGACCGCCACCGCCCAC	1300

AL121750.22	149270	ATGTGTCAGCATCTGGCCAAGTGTCTGGATGAACGACAGCATGCACAAAG	149319
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1301	ATGTGTCAGCATCTGGCCAAGTGTCTGGATGAACGACAGCATGCACAAAG	1350

AL121750.22	149320	GAATGTGGGGGAGAGAAGTCCTGACCAGGTAGGCCACAGTGTAAGCAGAG	149369
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1351	GAATGTGGGGGAGAGAAGTCCTGACCAGGTAGGCCACAGTGTAAGCAGAG	1400

AL121750.22	149370	TGTGGGGAAGACCTCTGTGTGCTGGGAGCATCGCCTACAGGCCCCTGATC	149419
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1401	TGTGGGGAAGACCTCTGTGTGCTGGGAGCATCGCCTACAGGCCCCTGATC	1450

AL121750.22	149420	ACAGAGGTGGGGGGGCGCCCCAGAACCCACTTCTGTTCTCAGTAACGAGA	149469
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1451	ACAGAGGTGGGGGGGCGCCCCAGAACCCACTTCTGTTCTCAGTAACGAGA	1500

AL121750.22	149470	GTCAGCTGACGGGGCAAAGCTCACTCATCCAAGGGTTTCTTTTAAAATGA	149519
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1501	GTCAGCTGACGGGGCAAAGCTCACTCATCCAAGGGTTTCTTTTAAAATGA	1550

AL121750.22	149520	TGGAACATGCAAAATGTAATAGGAAAGCAGGCAGCCACCTCACTGCCCAG	149569
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1551	TGGAACATGCAAAATGTAATAGGAAAGCAGGCAGCCACCTCACTGCCCAG	1600

AL121750.22	149570	CACCAGGCCTGTGGCCGACCCCGCTCCCAGGTGGGAGATGGCACTTGGCT	149619
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1601	CACCAGGCCTGTGGCCGACCCCGCTCCCAGGTGGGAGATGGCACTTGGCT	1650

AL121750.22	149620	TTCATCTGCCTCAGCTGAGGATGAGGAGGAGGAGCTGAGCCTGGCAGAGC	149669
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1651	TTCATCTGCCTCAGCTGAGGATGAGGAGGAGGAGCTGAGCCTGGCAGAGC	1700

AL121750.22	149670	TGCCTGGAGGAAGTGTAGTCACATCCTCCATCCGAGGAAACTGAAGCAGA	149719
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1701	TGCCTGGAGGAAGTGTAGTCACATCCTCCATCCGAGGAAACTGAAGCAGA	1750

AL121750.22	149720	GCCAGGTGGTACTGCTGGGGATGGGGAGTGCCTCCAGTTCCACACCCCAA	149769
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1751	GCCAGGTGGTACTGCTGGGGATGGGGAGTGCCTCCAGTTCCACACCCCAA	1800

AL121750.22	149770	ACTCCTGGAAGGACCGTGAGTGCCCGCCTTCTTCAGGCTCAGTGTGTCTG	149819
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1801	ACTCCTGGAAGGACCGTGAGTGCCCGCCTTCTTCAGGCTCAGTGTGTCTG	1850

AL121750.22	149820	AGTGCATGCAGGCACAGCTGGAACCGCCATCTCCAAAGCTGGCTTTAGGC	149869
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1851	AGTGCATGCAGGCACAGCTGGAACCGCCATCTCCAAAGCTGGCTTTAGGC	1900

AL121750.22	149870	ATGTCCTTGCCAGCAGCACGGCCTCCCGCAAGCTTGGAGACCTGGCTCAG	149919
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1901	ATGTCCTTGCCAGCAGCACGGCCTCCCGCAAGCTTGGAGACCTGGCTCAG	1950

AL121750.22	149920	GGCCACAGCCTCCTCATCATCAAAGCAAGGGCCGGGGGCAGCGGCACCAA	149969
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL110117.3	1951	GGCCACAGCCTCCTCATCATCAAAGCAAGGGCCGGGGGCAGCGGCACCAA	2000

Overview

Query
AL121750.22 - 149969 bps
Hit
AL110117.3 - 129323 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link