<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1703 bps / non-identical: 300 bps

Full alignment

FP565795.1	1	TGCTGGTATTAGAATTCCCTTTGTCCTTGAACTTTGAGAGTTTGATTATT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	77883	TGCTGGTATTAGAATTCCCTTTGTCCTTGAACTTTGAGAGTTTGATTATT	77932

FP565795.1	51	GTATGCCTTAGGGAAATCTTATTTGGGTTAAATCTGTTTGGTGTTCTCTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	77933	GTATGCCTTAGGGAAATCTTATTTGGGTTAAATCTGTTTGGTGTTCTCTG	77982

FP565795.1	101	ACCTTCCTGTACCTGAATACTTATGTCTTTCTCGAGTTGTGGAAAATTTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	77983	ACCTTCCTGTACCTGAATACTTATGTCTTTCTCGAGTTGTGGAAAATTTT	78032

FP565795.1	151	CTGTTATTATTTATTCAACTAAGTTTCTACCCCTTGCTTTTGCTCAACCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	78033	CTGTTATTATTTATTCAACTAAGTTTCTACCCCTTGCTTTTGCTCAACCC	78082

FP565795.1	201	CCTCTTGAACACCAATAATTATTAGATTTGGTCTTTTGAGGTAATTTGCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	78083	CCTCTTGAACACCAATAATTATTAGATTTGGTCTTTTGAGGTAATTTGCT	78132

FP565795.1	251	ATATCTTGTAGGAGATCTTTATTTATTTTTATCTTGTTTTCTCCTTCATG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	78133	ATATCTTGTAGGAGATCTTTATTTATTTTTATCTTGTTTTCTCCTTCATG	78182

FP565795.1	301	TATTTTCAAATAGTCTTCCAGCTTACTGATTCTTTCCTCTGCTTAGTTCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	78183	TATTTTCAAATAGTCTTCCAGCTTACTGATTCTTTCCTCTGCTTAGTTCA	78232

FP565795.1	351	TTCTGCTATTAAGAGACTAATTTTTTTTAGTTCAGCAAATGTGTTTCTCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	78233	TTCTGCTATTAAGAGACTAATTTTTTTTAGTTCAGCAAATGTGTTTCTCA	78282

FP565795.1	401	GTTCCAAGATTTCTGTTTTTTTTTTAAAATTTGAATATCTTTGTTAAATT	450
			|||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||
AL049612.11	78283	GTTCCAAGATTTCTGTTTTTTTT--AAAATTTGAATCTCTTTGTTAAATT	78330

FP565795.1	451	ACTCTGATAAAATTTTTAATTTCTTTTCGGTATTATCTTGGAGATGACTG	500
			||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	78331	ACTC--ATAAAATTTTTAATTTCTTTTCGGTATTATCTTGGAGATGACTG	78378

FP565795.1	501	AATTTCCTTAAAACTACTCTTTTGAATTTTTGGTCAGAAAGCTGGCATAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	78379	AATTTCCTTAAAACTACTCTTTTGAATTTTTGGTCAGAAAGCTGGCATAT	78428

FP565795.1	551	GGATCTCTCATTAGGGTCAGTTTTTGTTTCTTTTCTTTTGTTTTGTCTTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	78429	GGATCTCTCATTAGGGTCAGTTTTTGTTTCTTTTCTTTTGTTTTGTCTTT	78478

FP565795.1	601	GCTTTGTCCATTTGGGGAGATCATGGCTCCTCGTTTACTGTTGTTTCTTG	650
			| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	78479	GTTTTGTCCATTTGGGGAGATCATGGCTCCTCGTTTACTGTTGTTTCTTG	78528

FP565795.1	651	TGGGTGAACATCTATGTCTTTGCATTGAAGGACTGGTTATTTATTCCAGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	78529	TGGGTGAACATCTATGTCTTTGCATTGAAGGACTGGTTATTTATTCCAGT	78578

FP565795.1	701	CTTCTCTGCCCAGCTTTATTTTGTTTTAATTGAATACATTTGCTTAGAGG	750
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
AL049612.11	78579	CTTCTCTGCCCAGCTTTATTTTGTTTTAATTGAATATATTTGCTTAGAGG	78628

FP565795.1	751	TTCCTTACCACTAAACTACTGCCTCCCTTATGGCTTCAAGAGGTGCCTTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	78629	TTCCTTACCACTAAACTACTGCCTCCCTTATGGCTTCAAGAGGTGCCTTA	78678

FP565795.1	801	AACCCAGTTTTGCCTCAGCTCTAGCAAAGGATCAGAACATTGCTGTTCCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	78679	AACCCAGTTTTGCCTCAGCTCTAGCAAAGGATCAGAACATTGCTGTTCCC	78728

FP565795.1	851	AGATGGGGGAGGTCCTGATTGGCATATCCCAGCAGTGTGGGAAGGCTGGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	78729	AGATGGGGGAGGTCCTGATTGGCATATCCCAGCAGTGTGGGAAGGCTGGC	78778

FP565795.1	901	TTAGGAGTTTGTGCCCAGGAGACTTGTGGGACAAACTTCCTATAGCCTCG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	78779	TTAGGAGTTTGTGCCCAGGAGACTTGTGGGACAAACTTCCTATAGCCTCG	78828

FP565795.1	951	TGCTGCTGAACAGCCACTCTCGTTTGGCGTCTCCTGTGGCTGAATTACAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	78829	TGCTGCTGAACAGCCACTCTCGTTTGGCGTCTCCTGTGGCTGAATTACAG	78878

FP565795.1	1001	AACAGAGTTTCCGGGGCTGAGTTACAGAGCAGAGTTTCCAGGGCTGGGTG	1050
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
AL049612.11	78879	AACAGAGTTTCCGGGGCTGAGTTACAGAGCAGAGTTTCTAGGGCTGGGTG	78928

FP565795.1	1051	TGGGAATCCTGCTTGTCTCCTTTGTCTCTGGGCTGTCCTTAGGGATATTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||
AL049612.11	78929	TGGGAATCCTGCTTGTCTCCTTTGTCTCTG-----TCCTTAGGGATATTT	78973

FP565795.1	1101	CTCCCTTCAGGCACTCATGATGCTTCCTGTGGGTTAAGAGAGGGACAGAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	78974	CTCCCTTCAGGCACTCATGATGCTTCCTGTGGGTTAAGAGAGGGACAGAT	79023

FP565795.1	1151	CTCCTGCCAGGGAACCCAAGATGGTGGGGAAGCTATTTGTCTACATCAAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	79024	CTCCTGCCAGGGAACCCAAGATGGTGGGGAAGCTATTTGTCTACATCAAT	79073

FP565795.1	1201	TTCACCTTTTCCAATGCAGAAACAGTGAGATGGGGGAACTTTTTCATGTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	79074	TTCACCTTTTCCAATGCAGAAACAGTGAGATGGGGGAACTTTTTCATGTG	79123

FP565795.1	1251	CTTGGTACTGGGCAGAATAGGAAGAGGGGTGTCATGGATGTGAAGTCCAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	79124	CTTGGTACTGGGCAGAATAGGAAGAGGGGTGTCATGGATGTGAAGTCCAA	79173

FP565795.1	1301	TTCTCTTACCATCTGCTCAGTTTTTTCACTTCTTGGTGGCCCCAGGAATG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	79174	TTCTCTTACCATCTGCTCAGTTTTTTCACTTCTTGGTGGCCCCAGGAATG	79223

FP565795.1	1351	GTTTTATCTTTGTATTTGATTTCTGGGATATTTCTGGTGATAATCTCAGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	79224	GTTTTATCTTTGTATTTGATTTCTGGGATATTTCTGGTGATAATCTCAGC	79273

FP565795.1	1401	ACTGTATATTTGTTTTAGGCTTTGCGTGTTTGGGGATGAGTGAATCCAGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	79274	ACTGTATATTTGTTTTAGGCTTTGCGTGTTTGGGGATGAGTGAATCCAGC	79323

FP565795.1	1451	TTGTTTCTATGCTGCCATCTTGGAACTGGAAGTCCTTTTACACAGGTTAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	79324	TTGTTTCTATGCTGCCATCTTGGAACTGGAAGTCCTTTTACACAGGTTAT	79373

FP565795.1	1501	TTAAGCTTTTCCTCCAGGGATAGCAAATGCACTCTATTGTCCCAGCTTCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	79374	TTAAGCTTTTCCTCCAGGGATAGCAAATGCACTCTATTGTCCCAGCTTCC	79423

FP565795.1	1551	ATAAGTTGGCAGTGCCATCTGGGATCCTCTGGTGAGAAGAGATGTCACAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	79424	ATAAGTTGGCAGTGCCATCTGGGATCCTCTGGTGAGAAGAGATGTCACAA	79473

FP565795.1	1601	TCGATTAGCAATGTCTGCCATGGGTGTGAGTGGGCCAGGCAGTGGTATGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	79474	TCGATTAGCAATGTCTGCCATGGGTGTGAGTGGGCCAGGCAGTGGTATGT	79523

FP565795.1	1651	GTGCTGAGGATTTGCCATCTGGGATCAACTGCTTCAGATCTATGAGTCTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	79524	GTGCTGAGGATTTGCCATCTGGGATCAACTGCTTCAGATCTATGAGTCTG	79573

FP565795.1	1701	ATC	1703
			|||
AL049612.11	79574	ATC	79576

Compact alignment

skip 400 bps 100% identity alignment

FP565795.1	401	GTTCCAAGATTTCTGTTTTTTTTTTAAAATTTGAATATCTTTGTTAAATT	450
			|||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||
AL049612.11	78283	GTTCCAAGATTTCTGTTTTTTTT--AAAATTTGAATCTCTTTGTTAAATT	78330

FP565795.1	451	ACTCTGATAAAATTTTTAATTTCTTTTCGGTATTATCTTGGAGATGACTG	500
			||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	78331	ACTC--ATAAAATTTTTAATTTCTTTTCGGTATTATCTTGGAGATGACTG	78378

skip 100 bps 100% identity alignment

FP565795.1	601	GCTTTGTCCATTTGGGGAGATCATGGCTCCTCGTTTACTGTTGTTTCTTG	650
			| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL049612.11	78479	GTTTTGTCCATTTGGGGAGATCATGGCTCCTCGTTTACTGTTGTTTCTTG	78528

skip 50 bps 100% identity alignment

FP565795.1	701	CTTCTCTGCCCAGCTTTATTTTGTTTTAATTGAATACATTTGCTTAGAGG	750
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
AL049612.11	78579	CTTCTCTGCCCAGCTTTATTTTGTTTTAATTGAATATATTTGCTTAGAGG	78628

skip 250 bps 100% identity alignment

FP565795.1	1001	AACAGAGTTTCCGGGGCTGAGTTACAGAGCAGAGTTTCCAGGGCTGGGTG	1050
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
AL049612.11	78879	AACAGAGTTTCCGGGGCTGAGTTACAGAGCAGAGTTTCTAGGGCTGGGTG	78928

FP565795.1	1051	TGGGAATCCTGCTTGTCTCCTTTGTCTCTGGGCTGTCCTTAGGGATATTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||
AL049612.11	78929	TGGGAATCCTGCTTGTCTCCTTTGTCTCTG-----TCCTTAGGGATATTT	78973

skip 603 bps 100% identity alignment

Overview

Query
FP565795.1 - 44161 bps
Hit
AL049612.11 - 79576 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1703 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.76390170311703177883795761
Short-link