<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 4611 bps / non-identical: 300 bps

Full alignment

AC226348.2	1	CATCTCAGAGTTTTTCACTTGTAGCCATATGGATAGGAAGAGAGGGAACA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	93179	CATCTCAGAGTTTTTCACTTGTAGCCATATGGATAGGAAGAGAGGGAACA	93228

AC226348.2	51	TAGCTCACACTTGCCTTTGATAACCTTGGCCCAGAAGGGATTTCTTACAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	93229	TAGCTCACACTTGCCTTTGATAACCTTGGCCCAGAAGGGATTTCTTACAT	93278

AC226348.2	101	TCCTATTGGCGGAAATGCAGTCACATGGTTCCAAACTAACTGCAAGTGAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	93279	TCCTATTGGCGGAAATGCAGTCACATGGTTCCAAACTAACTGCAAGTGAG	93328

AC226348.2	151	GCTGGGAAATGTAGTCTTTCTGCATGCCCAGGAAGAGGAATGGTGTGAAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	93329	GCTGGGAAATGTAGTCTTTCTGCATGCCCAGGAAGAGGAATGGTGTGAAC	93378

AC226348.2	201	ATAGCATTGTCTTTGACACACTAAGTATGTGCTAAAGAGTTCTTACTCTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	93379	ATAGCATTGTCTTTGACACACTAAGTATGTGCTAAAGAGTTCTTACTCTT	93428

AC226348.2	251	ATAGGAGGTTTGTCTGTCCTGTGTAACTTTCTCAGTTTTTGCTTAGATAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	93429	ATAGGAGGTTTGTCTGTCCTGTGTAACTTTCTCAGTTTTTGCTTAGATAG	93478

AC226348.2	301	TTTCAGGCAATGTTGTTTGGTGCATTCAGCTTGATGATTATTATGTCCTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	93479	TTTCAGGCAATGTTGTTTGGTGCATTCAGCTTGATGATTATTATGTCCTC	93528

AC226348.2	351	TTGGCAAAGTAGTCAAGATTCCCATCAGTTTGAATGAAAGTGTTTTACAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	93529	TTGGCAAAGTAGTCAAGATTCCCATCAGTTTGAATGAAAGTGTTTTACAA	93578

AC226348.2	401	ATTGGTCAGGAAATGTTAATACTTTAAAAGGCCCTTCTATTCCTCCACTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	93579	ATTGGTCAGGAAATGTTAATACTTTAAAAGGCCCTTCTATTCCTCCACTC	93628

AC226348.2	451	TACAGATAAGAACAACAGAGTCCTAGAGAGAGGAGATCATGGGTCTCTCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	93629	TACAGATAAGAACAACAGAGTCCTAGAGAGAGGAGATCATGGGTCTCTCT	93678

AC226348.2	501	CATGAGTGGCAGAATTGAAACCAACATGGCAGTAACTTTGCCTTCCCCCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	93679	CATGAGTGGCAGAATTGAAACCAACATGGCAGTAACTTTGCCTTCCCCCA	93728

AC226348.2	551	TCATGTTGTTCTCCCTCTATATTCACTCTGCTGATTTCTTCATTTGCTCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	93729	TCATGTTGTTCTCCCTCTATATTCACTCTGCTGATTTCTTCATTTGCTCC	93778

AC226348.2	601	ATACAGACCTCCCAGTGCCAAGTGTGTAAGTGTGTCCGGAATTGGTGGGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
AF186996.5	93779	ATACAGACCTCCCAGTGCCAAGTGTGTAAGTGTGTCCAGAATTGGTGGGT	93828

AC226348.2	651	TCTTGGCCTCACTGACTTCAAGAATGAAGCCGCAGACCCTCCTGGTGAGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	93829	TCTTGGCCTCACTGACTTCAAGAATGAAGCCGCAGACCCTCCTGGTGAGT	93878

AC226348.2	701	GTTACAGTTCTTAAAGGTGGCGTGTCTGGAGTTTGTTCCTTCTGATGTTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	93879	GTTACAGTTCTTAAAGGTGGCGTGTCTGGAGTTTGTTCCTTCTGATGTTC	93928

AC226348.2	751	GGATGTGTTTGAAGTTTCTTCCTTCTGGTGGGGTTTGTGGTTTCGCTGGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	93929	GGATGTGTTTGAAGTTTCTTCCTTCTGGTGGGGTTTGTGGTTTCGCTGGT	93978

AC226348.2	801	TCAGGAGTGAAGCTGCAGACCTTCATGGAGAGTGTTACTGCTCTTAAGGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	93979	TCAGGAGTGAAGCTGCAGACCTTCATGGAGAGTGTTACTGCTCTTAAGGC	94028

AC226348.2	851	TGCACGTCTGGAGTTGTTCATTTCTCCTGGTGGGTTCATGGTCTCGCTGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	94029	TGCACGTCTGGAGTTGTTCATTTCTCCTGGTGGGTTCATGGTCTCGCTGG	94078

AC226348.2	901	CTTCAGGAGTGAAGCTGCAGACCTTCTCGGTGTTACAGCTCATAAAGGCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	94079	CTTCAGGAGTGAAGCTGCAGACCTTCTCGGTGTTACAGCTCATAAAGGCA	94128

AC226348.2	951	GTGTGGACCCAAAGAGTGAGCAGCAAGAAGATTTATTGCAAAGAGCAAAA	1000
			|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
AF186996.5	94129	GTGTGGACCCAAAGAGTGAGCAGCAACAAGATTTATTGCAAAGAGCAAAA	94178

AC226348.2	1001	GAACAAAGCTTCCACAGTGTGGAAGGGGACTCCAGCAGGTTGCCACTGCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	94179	GAACAAAGCTTCCACAGTGTGGAAGGGGACTCCAGCAGGTTGCCACTGCT	94228

AC226348.2	1051	GGCTCGGGCAGCCTGCTTTTATTCTCTTACCTGGCCCCACCCACATCCTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	94229	GGCTCGGGCAGCCTGCTTTTATTCTCTTACCTGGCCCCACCCACATCCTG	94278

AC226348.2	1101	CTGATTGGTCCATTTTACAGAGAGCCTGAGTGGTCTGTTTTGACAGGACA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	94279	CTGATTGGTCCATTTTACAGAGAGCCTGAGTGGTCTGTTTTGACAGGACA	94328

AC226348.2	1151	CTGATTGGTGCGTTTACAATCCCTGAGCTAGACACAATGGCTCCCCACGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	94329	CTGATTGGTGCGTTTACAATCCCTGAGCTAGACACAATGGCTCCCCACGT	94378

AC226348.2	1201	CCCCACTAGATTAGCTAGATACAGAGTGTCCACACAAAGGTTCTCCAAGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	94379	CCCCACTAGATTAGCTAGATACAGAGTGTCCACACAAAGGTTCTCCAAGT	94428

AC226348.2	1251	CCCCACCATAATGGCTAGATACAGAGTGTTGATTGTTGCATTCACAAACC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	94429	CCCCACCATAATGGCTAGATACAGAGTGTTGATTGTTGCATTCACAAACC	94478

AC226348.2	1301	CTGAGCTAGACACAGGGTGCTGATTGTTGTGTTTACAAACCTTGAGCTAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	94479	CTGAGCTAGACACAGGGTGCTGATTGTTGTGTTTACAAACCTTGAGCTAG	94528

AC226348.2	1351	ATACAGAGTGCCGATTGGTGTATTTATAATCCCTTAGCTAGACATAAAGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	94529	ATACAGAGTGCCGATTGGTGTATTTATAATCCCTTAGCTAGACATAAAGG	94578

AC226348.2	1401	TTCTACAAGTCCCCAGCAGACTCAGGAGCACAGCTGGCTTCACCCAGTGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	94579	TTCTACAAGTCCCCAGCAGACTCAGGAGCACAGCTGGCTTCACCCAGTGG	94628

AC226348.2	1451	ATCCCGCACAGGAGCTGCAGGTGGAGCTGCCGGCCAGTCCCTCTCCGTGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	94629	ATCCCGCACAGGAGCTGCAGGTGGAGCTGCCGGCCAGTCCCTCTCCGTGT	94678

AC226348.2	1501	GCCCACACTCTTCATCCCTTGGGTGGTCGATGGGACTGGGTGCCATGGAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	94679	GCCCACACTCTTCATCCCTTGGGTGGTCGATGGGACTGGGTGCCATGGAG	94728

AC226348.2	1551	CAGGGGGCGGTGCTCGTCGGGGAGGCTCGGGCCGCACAGGAGCCCACGGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	94729	CAGGGGGCGGTGCTCGTCGGGGAGGCTCGGGCCGCACAGGAGCCCACGGA	94778

AC226348.2	1601	GGGGGGAGGCTAAGGAATGGCGGGCTGCAGGTCCCGAGCCCTGCCCCGCG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	94779	GGGGGGAGGCTAAGGAATGGCGGGCTGCAGGTCCCGAGCCCTGCCCCGCG	94828

AC226348.2	1651	GGGAGGCAGCTAAGGCCCGGCGAGAAGTCGAGCACAGCAGCTGCTGGCCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	94829	GGGAGGCAGCTAAGGCCCGGCGAGAAGTCGAGCACAGCAGCTGCTGGCCC	94878

AC226348.2	1701	AGGTGCCAAGCCCCTCACTGCCCGGGCTGGCCAGGCTGGCCGGCAGATCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
AF186996.5	94879	AGGTGCCAAGCCCCTCACTGCCCGGGCTGGCCAGGCTGGCCTGCAGATCC	94928

AC226348.2	1751	TAGTGCGGGGCTGCCAAGCCCACGCCCACCCGGAACTCCAGCCGGCAGGC	1800
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
AF186996.5	94929	TAGTGCGGGGCTGCCAAGCCCACGCCCACCCGGAACTCCAGCCGGCAGAC	94978

AC226348.2	1801	AAGTAGCGCGCATAGCCCCGGTTCCGGCTCACGTCTCTCTCTCCACACCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	94979	AAGTAGCGCGCATAGCCCCGGTTCCGGCTCACGTCTCTCTCTCCACACCT	95028

AC226348.2	1851	CCCTGCGAGCTGAGGGAGCCAGCTCCGACCTTGGCCAGCCCAGAAAGGGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95029	CCCTGCGAGCTGAGGGAGCCAGCTCCGACCTTGGCCAGCCCAGAAAGGGG	95078

AC226348.2	1901	CTCCCACCGTGCAGCTGCGGGCTGAAGGGCTCCTCAAGTGCCGCCAAAGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95079	CTCCCACCGTGCAGCTGCGGGCTGAAGGGCTCCTCAAGTGCCGCCAAAGT	95128

AC226348.2	1951	GGGAGCCCAGGTAGAGGAGGCATCGAGAGCGAACGAGGGCTGTGAGGGCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95129	GGGAGCCCAGGTAGAGGAGGCATCGAGAGCGAACGAGGGCTGTGAGGGCT	95178

AC226348.2	2001	GCCAGCATGCTGTCACCTCTCATAAGGAGTGATTAATCTGAGCTTCTCCA	2050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95179	GCCAGCATGCTGTCACCTCTCATAAGGAGTGATTAATCTGAGCTTCTCCA	95228

AC226348.2	2051	GAAAGTCCATTCCTGGTAGGCACTGGGAATAAGAAATCTCAGAGTATAAA	2100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95229	GAAAGTCCATTCCTGGTAGGCACTGGGAATAAGAAATCTCAGAGTATAAA	95278

AC226348.2	2101	AAAACATCAACTGGTAGTACTTTTGTGAATGGCTCCCAAATTAGATCCTT	2150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95279	AAAACATCAACTGGTAGTACTTTTGTGAATGGCTCCCAAATTAGATCCTT	95328

AC226348.2	2151	TACTTTTTTTTTTCATGAAGCACAGTTGCCCAAAACACGCTTAGCCTGAG	2200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95329	TACTTTTTTTTTTCATGAAGCACAGTTGCCCAAAACACGCTTAGCCTGAG	95378

AC226348.2	2201	ATGAAGCGCATATTAGAGAAAGTTTCTCTCTATAGCATTATGTATTACTC	2250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95379	ATGAAGCGCATATTAGAGAAAGTTTCTCTCTATAGCATTATGTATTACTC	95428

AC226348.2	2251	GAATGAGCATTAAAAAGAGGAGACGGGACATGCTCTCTCTAGCTATTATT	2300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95429	GAATGAGCATTAAAAAGAGGAGACGGGACATGCTCTCTCTAGCTATTATT	95478

AC226348.2	2301	ACCTCCACTATAGAGTTGACATACACAAGCTCATTATTGCATTATGTTTT	2350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95479	ACCTCCACTATAGAGTTGACATACACAAGCTCATTATTGCATTATGTTTT	95528

AC226348.2	2351	ATTCAACAAAATAATGTTGAAGCTTATATTGAATTCTCTAAAACATCTTT	2400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95529	ATTCAACAAAATAATGTTGAAGCTTATATTGAATTCTCTAAAACATCTTT	95578

AC226348.2	2401	GTCTCCAGCATAGTGTGCCTCAAGTGTCTCCTTGGTGCCTGAATTTTCTC	2450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95579	GTCTCCAGCATAGTGTGCCTCAAGTGTCTCCTTGGTGCCTGAATTTTCTC	95628

AC226348.2	2451	CAGAATTATAGTGCTGAAGCTATGGAAATGGTGAAATTATATGCAATCTG	2500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95629	CAGAATTATAGTGCTGAAGCTATGGAAATGGTGAAATTATATGCAATCTG	95678

AC226348.2	2501	CAAAACAATGTGGCTATAACGTGGTAATTGGCCTTCCACATAATTAAAGG	2550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95679	CAAAACAATGTGGCTATAACGTGGTAATTGGCCTTCCACATAATTAAAGG	95728

AC226348.2	2551	AACATTTCCTCATCAGAGCTGTTCCATCAGAGACCCAAAGGCTATCGTTA	2600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95729	AACATTTCCTCATCAGAGCTGTTCCATCAGAGACCCAAAGGCTATCGTTA	95778

AC226348.2	2601	TACAAATCACCCACTTAGGAAAACCTTTATTCCCAGTAGCCTATAAAAAT	2650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95779	TACAAATCACCCACTTAGGAAAACCTTTATTCCCAGTAGCCTATAAAAAT	95828

AC226348.2	2651	CTGGTTATGCAAACAGATTTGCTTATTCAGTAACATTAATGGCTTCTCAT	2700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95829	CTGGTTATGCAAACAGATTTGCTTATTCAGTAACATTAATGGCTTCTCAT	95878

AC226348.2	2701	AGTTAAAAAGTCATCAATGTGATTGACCTATAATCTGTTTCCTCTGTGAC	2750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95879	AGTTAAAAAGTCATCAATGTGATTGACCTATAATCTGTTTCCTCTGTGAC	95928

AC226348.2	2751	CAAGTGTCATTTTTATTTTGACAGTTAGGAGCCTTTTGACTCTTTCACAG	2800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95929	CAAGTGTCATTTTTATTTTGACAGTTAGGAGCCTTTTGACTCTTTCACAG	95978

AC226348.2	2801	CTGGCATGAAGGTACAGGGAGGGAAATCTCAAAAACCAACAACCTGTGTA	2850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	95979	CTGGCATGAAGGTACAGGGAGGGAAATCTCAAAAACCAACAACCTGTGTA	96028

AC226348.2	2851	TTCCCAGCCTATTAATCAATAGAAAATCACTTCAACTGGATTAGGGTCTT	2900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96029	TTCCCAGCCTATTAATCAATAGAAAATCACTTCAACTGGATTAGGGTCTT	96078

AC226348.2	2901	GTACCTGGCAGAAAGGCTGTTATGGACATTGGAATTGGATTTTTACACTA	2950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96079	GTACCTGGCAGAAAGGCTGTTATGGACATTGGAATTGGATTTTTACACTA	96128

AC226348.2	2951	GATATGTCACCTCTTTGCGTCAGATCACATTCGTTTTTGATAGACTCTTG	3000
			|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96129	GATATGACACCTCTTTGCGTCAGATCACATTCGTTTTTGATAGACTCTTG	96178

AC226348.2	3001	CCGAAAAATTGCTCCAGGGTCTGTGCAGTAGCTAAAGCCTTTTTGTTGTT	3050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96179	CCGAAAAATTGCTCCAGGGTCTGTGCAGTAGCTAAAGCCTTTTTGTTGTT	96228

AC226348.2	3051	GTTGTTGTTTTAAAAGCAGCATTCAATGTTTTCATGAAGACCTTCCCCGC	3100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96229	GTTGTTGTTTTAAAAGCAGCATTCAATGTTTTCATGAAGACCTTCCCCGC	96278

AC226348.2	3101	AGTGATTTCATTGGGAATATGGTCTTTAGCTCTGGTCCTGAATAACTCAC	3150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96279	AGTGATTTCATTGGGAATATGGTCTTTAGCTCTGGTCCTGAATAACTCAC	96328

AC226348.2	3151	ACTGAGGAAACCTCTAACAAGTGTTTTATTGGAAGATGTCTGATGGATGG	3200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96329	ACTGAGGAAACCTCTAACAAGTGTTTTATTGGAAGATGTCTGATGGATGG	96378

AC226348.2	3201	TTGGTTTTAATAACGAATCTCTTCCCTTTTTCTGTCCTCTGTGTTCTATT	3250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96379	TTGGTTTTAATAACGAATCTCTTCCCTTTTTCTGTCCTCTGTGTTCTATT	96428

AC226348.2	3251	CTCCTTTCTCTACACATTATTCTGGGAGGATTCACCTATTCCCAAAGTCC	3300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96429	CTCCTTTCTCTACACATTATTCTGGGAGGATTCACCTATTCCCAAAGTCC	96478

AC226348.2	3301	TTTCCTCTTTATTTCCATTCCAGAGCTCTCTGTATAACTCCAGGCTGATG	3350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96479	TTTCCTCTTTATTTCCATTCCAGAGCTCTCTGTATAACTCCAGGCTGATG	96528

AC226348.2	3351	AATCCAACGGCCCAGTTGTTATCTCCACTTGGCTGTCTTTCTTGCATTGA	3400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96529	AATCCAACGGCCCAGTTGTTATCTCCACTTGGCTGTCTTTCTTGCATTGA	96578

AC226348.2	3401	CCTCATCTTACCTTGCCTCTCCTGATTTCCTCTTCTGCCTGGGCTCACCA	3450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96579	CCTCATCTTACCTTGCCTCTCCTGATTTCCTCTTCTGCCTGGGCTCACCA	96628

AC226348.2	3451	CTTCAGATTCACACCACCATCCACCCAGCTTCCAAAACACCTGGGCCTCC	3500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96629	CTTCAGATTCACACCACCATCCACCCAGCTTCCAAAACACCTGGGCCTCC	96678

AC226348.2	3501	TCCTTCATTCCTCCCTCTTTCTCAGTCAAGTTAGTCTACTGTCTCCTCTC	3550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96679	TCCTTCATTCCTCCCTCTTTCTCAGTCAAGTTAGTCTACTGTCTCCTCTC	96728

AC226348.2	3551	CATCCTCACTGCCACAGCCTTGGTCCAGCCAACCATCTTGTCTCACTTGG	3600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96729	CATCCTCACTGCCACAGCCTTGGTCCAGCCAACCATCTTGTCTCACTTGG	96778

AC226348.2	3601	CGTATTGCAGCCTCCTACCTGGTCTACTCACCTCCCACTCTCCTCCAGCC	3650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96779	CGTATTGCAGCCTCCTACCTGGTCTACTCACCTCCCACTCTCCTCCAGCC	96828

AC226348.2	3651	AGACTGCTCTTTTTATAGCACAAAGTGGATCATTACTCCCCTGCCTAAAA	3700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96829	AGACTGCTCTTTTTATAGCACAAAGTGGATCATTACTCCCCTGCCTAAAA	96878

AC226348.2	3701	ACATCTACTGTCTCCCTTTGTCTACAGGATAAACACGACAAAGAGCCTTT	3750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96879	ACATCTACTGTCTCCCTTTGTCTACAGGATAAACACGACAAAGAGCCTTT	96928

AC226348.2	3751	AAGATTTGGCTCCAACTTACCTCTATATTAGTCACTTTTTAGAATTATAT	3800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96929	AAGATTTGGCTCCAACTTACCTCTATATTAGTCACTTTTTAGAATTATAT	96978

AC226348.2	3801	GAACATCTCTCAGCTCCTCACCCTCTCACGTCTTGATTTTTGCACGTGCT	3850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96979	GAACATCTCTCAGCTCCTCACCCTCTCACGTCTTGATTTTTGCACGTGCT	97028

AC226348.2	3851	CTTCCCTCTGCTGGGAATGATCTTCCACACCTCTCCTATCGACCTGGCTA	3900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	97029	CTTCCCTCTGCTGGGAATGATCTTCCACACCTCTCCTATCGACCTGGCTA	97078

AC226348.2	3901	ATTCCTACCATTTTCTAGTCTTCAACTGAGGAGTCCTGTGGTGGAGAAAG	3950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	97079	ATTCCTACCATTTTCTAGTCTTCAACTGAGGAGTCCTGTGGTGGAGAAAG	97128

AC226348.2	3951	ATTTCTCACCACCTGATAGAGATTGCATGTCCACCCACCTCCGGACTTTT	4000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	97129	ATTTCTCACCACCTGATAGAGATTGCATGTCCACCCACCTCCGGACTTTT	97178

AC226348.2	4001	ATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTTGACGGAGTTTCGCTCTGACCAT	4050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	97179	ATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTTGACGGAGTTTCGCTCTGACCAT	97228

AC226348.2	4051	GCAGACTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAATCTCCGCCTC	4100
			|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	97229	GCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAATCTCCGCCTC	97278

AC226348.2	4101	CCGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTCAGCCTTCTGAGTATCTGGAATTAC	4150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	97279	CCGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTCAGCCTTCTGAGTATCTGGAATTAC	97328

AC226348.2	4151	GGGTGCCCACCACCACATCTGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAAAGA	4200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	97329	GGGTGCCCACCACCACATCTGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAAAGA	97378

AC226348.2	4201	CAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTTTCGAACTCCTGGCCTCAAGT	4250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	97379	CAGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGTTTTCGAACTCCTGGCCTCAAGT	97428

AC226348.2	4251	GATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAAGAACAA	4300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	97429	GATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAAGAACAA	97478

AC226348.2	4301	CTGCACCTAGCCAATCGGGTGCCCCTTCTATTTGCTCCCATTGCCCCAGG	4350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	97479	CTGCACCTAGCCAATCGGGTGCCCCTTCTATTTGCTCCCATTGCCCCAGG	97528

AC226348.2	4351	CATACTGTCACCATAACTCTTACCATTCTGAGTTGAAAATGATTTTTTTT	4400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	97529	CATACTGTCACCATAACTCTTACCATTCTGAGTTGAAAATGATTTTTTTT	97578

AC226348.2	4401	CTTTTTATTTCTCTCATTAAATGCAAAGCTCATTGAAAAGAGGACAGTGG	4450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	97579	CTTTTTATTTCTCTCATTAAATGCAAAGCTCATTGAAAAGAGGACAGTGG	97628

AC226348.2	4451	TTGTTCACTGTTGTACTCCTAACCTTTGACTCAGTGTCCTGAGGTTGGCT	4500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	97629	TTGTTCACTGTTGTACTCCTAACCTTTGACTCAGTGTCCTGAGGTTGGCT	97678

AC226348.2	4501	TTAGAGCTGTGCACACATGTTCAGACATTGGAGCACATCTTATCTAGCAC	4550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	97679	TTAGAGCTGTGCACACATGTTCAGACATTGGAGCACATCTTATCTAGCAC	97728

AC226348.2	4551	CTCTTTTGAGGTGGCTTAGAGAAAAGTCAGTAGGTACTTCCCCAAGAATG	4600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	97729	CTCTTTTGAGGTGGCTTAGAGAAAAGTCAGTAGGTACTTCCCCAAGAATG	97778

AC226348.2	4601	AAACAGAAGCT	4611
			|||||||||||
AF186996.5	97779	AAACAGAAGCT	97789

Compact alignment

skip 600 bps 100% identity alignment

AC226348.2	601	ATACAGACCTCCCAGTGCCAAGTGTGTAAGTGTGTCCGGAATTGGTGGGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
AF186996.5	93779	ATACAGACCTCCCAGTGCCAAGTGTGTAAGTGTGTCCAGAATTGGTGGGT	93828

skip 300 bps 100% identity alignment

AC226348.2	951	GTGTGGACCCAAAGAGTGAGCAGCAAGAAGATTTATTGCAAAGAGCAAAA	1000
			|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
AF186996.5	94129	GTGTGGACCCAAAGAGTGAGCAGCAACAAGATTTATTGCAAAGAGCAAAA	94178

skip 700 bps 100% identity alignment

AC226348.2	1701	AGGTGCCAAGCCCCTCACTGCCCGGGCTGGCCAGGCTGGCCGGCAGATCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
AF186996.5	94879	AGGTGCCAAGCCCCTCACTGCCCGGGCTGGCCAGGCTGGCCTGCAGATCC	94928

AC226348.2	1751	TAGTGCGGGGCTGCCAAGCCCACGCCCACCCGGAACTCCAGCCGGCAGGC	1800
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
AF186996.5	94929	TAGTGCGGGGCTGCCAAGCCCACGCCCACCCGGAACTCCAGCCGGCAGAC	94978

skip 1150 bps 100% identity alignment

AC226348.2	2951	GATATGTCACCTCTTTGCGTCAGATCACATTCGTTTTTGATAGACTCTTG	3000
			|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	96129	GATATGACACCTCTTTGCGTCAGATCACATTCGTTTTTGATAGACTCTTG	96178

skip 1050 bps 100% identity alignment

AC226348.2	4051	GCAGACTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAATCTCCGCCTC	4100
			|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF186996.5	97229	GCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAATCTCCGCCTC	97278

skip 511 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AC226348.2 - 39932 bps
Hit
AF186996.5 - 97789 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 4611 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.86990461114611193179977891
Short-link