<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 4721 bps / non-identical: 750 bps

Full alignment

AF111103.1	1	AAGCTTAAAGCAAGCCAAGCAAGCAGCAGAACTTGGCAGCTTTGGCCATG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	58254	AAGCTTAAAGCAAGCCAAGCAAGCAGCAGAACTTGGCAGCTTTGGCCATG	58303

AF111103.1	51	TGGCTGCAGGCTACGATTGGTAAGGTGTAAGAGTCACCCAGGCAGTACTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	58304	TGGCTGCAGGCTACGATTGGTAAGGTGTAAGAGTCACCCAGGCAGTACTG	58353

AF111103.1	101	GTTTTGAAGGCGTGAGGGCATATGAACAGCTGAGGTTTGGCACTGTGAGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	58354	GTTTTGAAGGCGTGAGGGCATATGAACAGCTGAGGTTTGGCACTGTGAGA	58403

AF111103.1	151	GGCCATTGGTGAAGTGCAGACCCAATTGCAGTTGATAGCCCAGAACTGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
AF111102.2	58404	GGCCATTGGTGAAGTGCAGACCCAATTGCAGTTGACAGCCCAGAACTGAA	58453

AF111103.1	201	GAGGCCGTGCTAAGGATTTGAGGCTTGGCACCATGGAGAGAGCCTATGAG	250
			|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	58454	GAGGCCATGCTAAGGATTTGAGGCTTGGCACCATGGAGAGAGCCTATGAG	58503

AF111103.1	251	AGGGTCTTGGTGAACCCTAGTCACAGCAGTAGACTCCAGCATATTGGAGA	300
			|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	58504	AGGGTCTTGGTGAACCCTAGTCGCAACAGTAGACTCCAGCATATTGGAGA	58553

AF111103.1	301	TGCCAGGACCATGGGACGATCACCAAGAACAGCATTAGCAATGGATTAAC	350
			|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	58554	TGCCAGGACCATGGGACGATTACCAAGAACAGCATTAGCAATGGATTAAC	58603

AF111103.1	351	CTGAGCTCACAGTGCTACAGAGGGTAGGGTTGGAGAAGTGATGCCAGCCC	400
			|||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	58604	CTG---------TGCTACAGAGGGTAGGGTTGGAGAAGTGATGCCAGCCC	58644

AF111103.1	401	TTTTTGGAGGAGTCCAAAAGACCATGCATGGATCCCAGACCTTGAAACCA	450
			|||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||
AF111102.2	58645	TTTTTGGAGGAGTCCAAAAGACCATGCATAAATCCCAGACCTTGAAACCA	58694

AF111103.1	451	GAAGATGTAACACTGAAGTTGTCTTGGAGACCCCAAGATACTTGCGATGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	58695	GAAGATGTAACACTGAAGTTGTCTTGGAGACCCCAAGATACTTGCGATGC	58744

AF111103.1	501	TAGTGCTGTGGTCTATCTCCTGAGAAAAGCTGCTAACAGGGAGTGGAGAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	58745	TAGTGCTGTGGTCTATCTCCTGAGAAAAGCTGCTAACAGGGAGTGGAGAC	58794

AF111103.1	551	AGGTCCAGGTGAAAAAAGTTTGTTCCACTCAACAAAGATGAAAAAAAAGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	58795	AGGTCCAGGTGAAAAAAGTTTGTTCCACTCAACAAAGATGAAAAAAAAGA	58844

AF111103.1	601	AGTTGGAGATCTAAAGTCTGCTTTCACATCAGACATAGAGATGCAGAGTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	58845	AGTTGGAGATCTAAAGTCTGCTTTCACATCAGACATAGAGATGCAGAGTT	58894

AF111103.1	651	TGGAGTTTGCCCAGCTGGTTTCCTGCCTCGCTTTGGGAATTCCACTTAAG	700
			||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
AF111102.2	58895	TGGAGTTTGCCCAGCTGGTTTCCGGCCTTGCTTTGGGAATTCCACTTAAG	58944

AF111103.1	701	TGACTGAATGAACCTCAGAAGAGACCTTGAACTTTGGACTTTTAACACTG	750
			|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	58945	TGACTGGATGAACCTCAGAAGAGACCTTGAACTTTGGACTTTTAACACTG	58994

AF111103.1	751	TTGAGACTGCCATAGACTATGGGGACTATTGAATTAAATATATTTTACAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	58995	TTGAGACTGCCATAGACTATGGGGACTATTGAATTAAATATATTTTACAT	59044

AF111103.1	801	TATGCTATGTTTAGGTATGTCCCCCATAAACTCATGTTTGAACAAGCCTA	850
			||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59045	TATGCTATGTTTAGGTATGTCCCC-TTAAACTCATGTTTGAACAAGCCTA	59093

AF111103.1	851	TGGTGGCCAGGGAGTGGAATGTGATGGTTTGCTTGGCCCAGGGAGTGGCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59094	TGGTGGCCAGGGAGTGGAATGTGATGGTTTGCTTGGCCCAGGGAGTGGCA	59143

AF111103.1	901	CTATTAGAAGATGTGGCCCTGTTGCAGTAGGTGTGTCACTATGGGTGTGG	950
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
AF111102.2	59144	CTATTAGAAGATGTGGCCCTGTTGCAGTAGGTGTGTCACTATGGGTGTAG	59193

AF111103.1	951	ACTATAAGATCCTCATCCTCGCTGCCTGGAAGTCAGTATTCTGCTAGCAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59194	ACTATAAGATCCTCATCCTCGCTGCCTGGAAGTCAGTATTCTGCTAGCAG	59243

AF111103.1	1001	CCTTCAGATGAAGATGTAGAACTCTCAGCTCTGCCTGCTCCATGCCTGCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59244	CCTTCAGATGAAGATGTAGAACTCTCAGCTCTGCCTGCTCCATGCCTGCC	59293

AF111103.1	1051	TGGATGCTGCCATGTTTCCTGCCTTGATGATAATGGATTGAACCTCTGAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59294	TGGATGCTGCCATGTTTCCTGCCTTGATGATAATGGATTGAACCTCTGAA	59343

AF111103.1	1101	TCTATAATCCAACCCCAATTAAACATTGTCATTTATAAGACTTGCCTTGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59344	TCTATAATCCAACCCCAATTAAACATTGTCATTTATAAGACTTGCCTTGG	59393

AF111103.1	1151	TCATGTTGTCTGTTCACAGCAGTAAATCCCTAACTAAGACAACCCCATTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59394	TCATGTTGTCTGTTCACAGCAGTAAATCCCTAACTAAGACAACCCCATTC	59443

AF111103.1	1201	TAACTCAGAGAGGATGATGGGCATCGAAGAACCTCCAAAATGGAGTTTGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59444	TAACTCAGAGAGGATGATGGGCATCGAAGAACCTCCAAAATGGAGTTTGC	59493

AF111103.1	1251	TTCAATGCAGCAAAGCCAGGCACTAGCCAAAAGCTTGCCCTTGCTTCAAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59494	TTCAATGCAGCAAAGCCAGGCACTAGCCAAAAGCTTGCCCTTGCTTCAAC	59543

AF111103.1	1301	TGCAGACTGCATGCTGTCCTAACAGGGGACAAGCAGAACACAGAGCAAGC	1350
			| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59544	TTCAGACTGCATGCTGTCCTAACAGGGGACAAGCAGAACACAGAGCAAGC	59593

AF111103.1	1351	TGTACCAAGACAAGTTGGGAGAGTCCTTCAATAATCCTGCTTCATAAAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59594	TGTACCAAGACAAGTTGGGAGAGTCCTTCAATAATCCTGCTTCATAAAAA	59643

AF111103.1	1401	AACATCTGTCATATACTGGGCCAGTACCTTGAAGATGGATGCCCCAGCAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59644	AACATCTGTCATATACTGGGCCAGTACCTTGAAGATGGATGCCCCAGCAC	59693

AF111103.1	1451	TGCAGAAGAACCTTGGGTGACTGTCCAGTCAGCCAGCGATCTCTGCCATT	1500
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
AF111102.2	59694	TGCAGAAGAACCTTGGGTGACTGTCCAGTCAGCCAGCGATCTCTGCCAGT	59743

AF111103.1	1501	CCCATAGCTTTGAAGCTGCTTGCTCTGCACGTCCTGTTTTCTCAGGGAAT	1550
			|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59744	CCCATAGCTTTGAAGCTGATTGCTCTGCACGTCCTGTTTTCTCAGGGAAT	59793

AF111103.1	1551	ATTTATCCTTCTCAGGTCACTGATGGGGGGAAGACTACATAGTTACAGCC	1600
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
AF111102.2	59794	ATTTATCCTTCTCAGGTCACTGATGGGGGGAAGACTACATAGTTACAGTC	59843

AF111103.1	1601	TCACAGGAAGCTTAGGTTGTTTAGGATTTAAGAAATCTATTAACTAGGTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59844	TCACAGGAAGCTTAGGTTGTTTAGGATTTAAGAAATCTATTAACTAGGTC	59893

AF111103.1	1651	TAGGAAGATATTTCAGGTGGATAATTTCCTGTCATGATACAAAAGGAATT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59894	TAGGAAGATATTTCAGGTGGATAATTTCCTGTCATGATACAAAAGGAATT	59943

AF111103.1	1701	AGACATAGAATGTTTTACAAATAGGATAGATAGAACTTTGGATTCATAGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59944	AGACATAGAATGTTTTACAAATAGGATAGATAGAACTTTGGATTCATAGG	59993

AF111103.1	1751	ATAGATAGTAATCTCTCAATGGTTGGCAAATACAAATGAACCAGATGTAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59994	ATAGATAGTAATCTCTCAATGGTTGGCAAATACAAATGAACCAGATGTAA	60043

AF111103.1	1801	TGAATTTAATTCTTATATTAAGAATTAATTAAAATTCTTAATTTTTAAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60044	TGAATTTAATTCTTATATTAAGAATTAATTAAAATTCTTAATTTTTAAAA	60093

AF111103.1	1851	TTAAATCTTAATTATTAAATAAAGAATGAATACTACTTCTTAATAAAGAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60094	TTAAATCTTAATTATTAAATAAAGAATGAATACTACTTCTTAATAAAGAA	60143

AF111103.1	1901	TTAATAATTCTTAATTAAATTCTTAACTTTTCAAAGTTATGTTCTTATAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60144	TTAATAATTCTTAATTAAATTCTTAACTTTTCAAAGTTATGTTCTTATAC	60193

AF111103.1	1951	TTGTTATTGTGTATAGTTTAGGATGTCAGAGAAAGAACCTTTTATAAGAC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60194	TTGTTATTGTGTATAGTTTAGGATGTCAGAGAAAGAACCTTTTATAAGAC	60243

AF111103.1	2001	TAAGGGGGGGCAATGTTGAAATAATGTTGTTGTACCCTGTGTAAAAATGA	2050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60244	TAAGGGGGGGCAATGTTGAAATAATGTTGTTGTACCCTGTGTAAAAATGA	60293

AF111103.1	2051	GTCTCTGTCCTATTCTGCCTACCTATATCACCTTCTGAGTAGTAAAATAA	2100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60294	GTCTCTGTCCTATTCTGCCTACCTATATCACCTTCTGAGTAGTAAAATAA	60343

AF111103.1	2101	AAACCCTATGTGCTGTAGCAAGGAGAGTAGAAGGCAGGATTCTTGGCAGA	2150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60344	AAACCCTATGTGCTGTAGCAAGGAGAGTAGAAGGCAGGATTCTTGGCAGA	60393

AF111103.1	2151	GAGAGGATCTCTGGGAAGAGAGAAGCATGGGGGATTTGCCACCCAGACTC	2200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60394	GAGAGGATCTCTGGGAAGAGAGAAGCATGGGGGATTTGCCACCCAGACTC	60443

AF111103.1	2201	GGAGGAAGCAGGATGTGTGAAACTGAGGAGAGGTGACCAGCCATGTGGCA	2250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60444	GGAGGAAGCAGGATGTGTGAAACTGAGGAGAGGTGACCAGCCATGTGGCA	60493

AF111103.1	2251	GAATTAGAATAGTATGAATGGGATAACTGAATTATGAGATAGCTGGAAAA	2300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60494	GAATTAGAATAGTATGAATGGGATAACTGAATTATGAGATAGCTGGAAAA	60543

AF111103.1	2301	GGCCTAGCATAAAGCATAAGCATTCATAAATAAATATGAGTCTGCTCTTA	2350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60544	GGCCTAGCATAAAGCATAAGCATTCATAAATAAATATGAGTCTGCTCTTA	60593

AF111103.1	2351	TTTTTCAGAGCAAGGGAGGACAAGCAGGAATCTCCGACAGATACAGGAGC	2400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60594	TTTTTCAGAGCAAGGGAGGACAAGCAGGAATCTCCGACAGATACAGGAGC	60643

AF111103.1	2401	AGGAGAAAGCAGACACAGCAAGCCTTTCCTTCTTCCATGTCTTCATGTAG	2450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60644	AGGAGAAAGCAGACACAGCAAGCCTTTCCTTCTTCCATGTCTTCATGTAG	60693

AF111103.1	2451	GCTTCCAGCAGAAGGCGTGGCCCACATCAGAAAGGGGGAGGGGCTCCTAC	2500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60694	GCTTCCAGCAGAAGGCGTGGCCCACATCAGAAAGGGGGAGGGGCTCCTAC	60743

AF111103.1	2501	ACAAATATTCTGGATTACAGGTGTGTCTTCCTATCTCAAAGAAAAGGATC	2550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60744	ACAAATATTCTGGATTACAGGTGTGTCTTCCTATCTCAAAGAAAAGGATC	60793

AF111103.1	2551	AGAAATTGATCTTCCCACTTCAAATTAAGCAAAAAGCCTCACAGATGGTG	2600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60794	AGAAATTGATCTTCCCACTTCAAATTAAGCAAAAAGCCTCACAGATGGTG	60843

AF111103.1	2601	TGCTCCATTTTGAGGTTTTAGTTAACGCCACATGTAGCTCGCATCAAAGA	2650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60844	TGCTCCATTTTGAGGTTTTAGTTAACGCCACATGTAGCTCGCATCAAAGA	60893

AF111103.1	2651	ACCAACACCATGGTCCCTGTCCGAGTTCTGGAACTGCTCTCTTTGGGGCT	2700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60894	ACCAACACCATGGTCCCTGTCCGAGTTCTGGAACTGCTCTCTTTGGGGCT	60943

AF111103.1	2701	TTGCAGCTCCTTTTAGCACTCATGGCTCTGCCTCCTGCCTTCCCTCTTAC	2750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60944	TTGCAGCTCCTTTTAGCACTCATGGCTCTGCCTCCTGCCTTCCCTCTTAC	60993

AF111103.1	2751	AAGGAGTTTTCTTCCCACGGGTGGAAAAGCACGTAAAGATCTTCTGGATG	2800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	60994	AAGGAGTTTTCTTCCCACGGGTGGAAAAGCACGTAAAGATCTTCTGGATG	61043

AF111103.1	2801	TAAGTTTGATGAGAGCAGGGCGGTCTGAGACCTGAGAGCCCTGGAGCACT	2850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61044	TAAGTTTGATGAGAGCAGGGCGGTCTGAGACCTGAGAGCCCTGGAGCACT	61093

AF111103.1	2851	GCAGACAGGAAGGAGGTCCTGGGGCAGCTCAGCAGCCTGGATCCCCTTTA	2900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61094	GCAGACAGGAAGGAGGTCCTGGGGCAGCTCAGCAGCCTGGATCCCCTTTA	61143

AF111103.1	2901	CCCTCAGCTCTGTGGGCTCAGACGCTGTCGTTTTTGTTTCTTCCACCAGG	2950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61144	CCCTCAGCTCTGTGGGCTCAGACGCTGTCGTTTTTGTTTCTTCCACCAGG	61193

AF111103.1	2951	CGGCGCTGTTGCCCAGGAAAGTGATGCTTCTCTTTCATCTTCAAGGTGAG	3000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61194	CGGCGCTGTTGCCCAGGAAAGTGATGCTTCTCTTTCATCTTCAAGGTGAG	61243

AF111103.1	3001	ACCCTGGAGGGTCTGCAGTGGGAGGGAAGATGGGAAAGAGGGCACCTTTC	3050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61244	ACCCTGGAGGGTCTGCAGTGGGAGGGAAGATGGGAAAGAGGGCACCTTTC	61293

AF111103.1	3051	TCTGCAGGAACGCTCTAGATGTTGGGATGTCATGGGCTGTTACAAATTAG	3100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61294	TCTGCAGGAACGCTCTAGATGTTGGGATGTCATGGGCTGTTACAAATTAG	61343

AF111103.1	3101	CATTCAAGCATTTGAGTGGAATTGATCTTGTTCATTGGGAATCAAAAACT	3150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61344	CATTCAAGCATTTGAGTGGAATTGATCTTGTTCATTGGGAATCAAAAACT	61393

AF111103.1	3151	AACATCGGCTCAAGTGCAAAGATGAGCACACACTGTGTCTTCTTCCTGGG	3200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61394	AACATCGGCTCAAGTGCAAAGATGAGCACACACTGTGTCTTCTTCCTGGG	61443

AF111103.1	3201	ATGAGGCTGTGACAAACTGGGCATGGTAGGTCCATAAAATGAAATATCAT	3250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61444	ATGAGGCTGTGACAAACTGGGCATGGTAGGTCCATAAAATGAAATATCAT	61493

AF111103.1	3251	CTGTATTTTTAATTTTATGCTTTTGACAAATTGTCATTTCAATACACTCT	3300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61494	CTGTATTTTTAATTTTATGCTTTTGACAAATTGTCATTTCAATACACTCT	61543

AF111103.1	3301	ATTTCAACCATCATTTCCTGTCCTGATACAAAGCTCTGTTGGCTGGTGGG	3350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61544	ATTTCAACCATCATTTCCTGTCCTGATACAAAGCTCTGTTGGCTGGTGGG	61593

AF111103.1	3351	ACAGTGATGTCCAAACATTCCTGTGCCCTCCACTCCTGTCCTCACACTCT	3400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61594	ACAGTGATGTCCAAACATTCCTGTGCCCTCCACTCCTGTCCTCACACTCT	61643

AF111103.1	3401	GGATGTGTAGGAGAAAGAGAAGGAGTATTTTTCAAATCATATTTTTAAAA	3450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61644	GGATGTGTAGGAGAAAGAGAAGGAGTATTTTTCAAATCATATTTTTAAAA	61693

AF111103.1	3451	TTTTATTGTCATGAGATGTAATCATTTTTGTATGTGAATATGTATGTGCA	3500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61694	TTTTATTGTCATGAGATGTAATCATTTTTGTATGTGAATATGTATGTGCA	61743

AF111103.1	3501	CTAGCACTAGCATTCGATCCCTGGGAACTGAAGTTGCAGATGGTTGACAG	3550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61744	CTAGCACTAGCATTCGATCCCTGGGAACTGAAGTTGCAGATGGTTGACAG	61793

AF111103.1	3551	CCGCCATGTGCTGATGTAACTCACCCTGGATCCTCTGCAACAGCAACACG	3600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61794	CCGCCATGTGCTGATGTAACTCACCCTGGATCCTCTGCAACAGCAACACG	61843

AF111103.1	3601	TGCTTTCAGCCCTGAGCCATCTCTCCAGCCACCATTGGAATGTTCACATG	3650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61844	TGCTTTCAGCCCTGAGCCATCTCTCCAGCCACCATTGGAATGTTCACATG	61893

AF111103.1	3651	GGGACACCACACAGCTGATCACAGCCTGCTGCTGAGCACATGAGAGAAAC	3700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61894	GGGACACCACACAGCTGATCACAGCCTGCTGCTGAGCACATGAGAGAAAC	61943

AF111103.1	3701	TAGAGGCTCAGGAAGAGACAGTGTCAGTGTAGAGCTCAGGAGGGAGGGGA	3750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61944	TAGAGGCTCAGGAAGAGACAGTGTCAGTGTAGAGCTCAGGAGGGAGGGGA	61993

AF111103.1	3751	GCTGGGCAATGATGGGGAGAGGCCTGAGGGACAGAGACAGAGAGGGGCTG	3800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	61994	GCTGGGCAATGATGGGGAGAGGCCTGAGGGACAGAGACAGAGAGGGGCTG	62043

AF111103.1	3801	AGCAGGAGGAGACAGAGGCAAAGGGGGAGACCTAACTCAGCAGAGTCCCC	3850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	62044	AGCAGGAGGAGACAGAGGCAAAGGGGGAGACCTAACTCAGCAGAGTCCCC	62093

AF111103.1	3851	TGTTGGAGGGCATCTCTGTCAGACTGCACTGGACACATCTGCAGAACCCT	3900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	62094	TGTTGGAGGGCATCTCTGTCAGACTGCACTGGACACATCTGCAGAACCCT	62143

AF111103.1	3901	GCTGGCCTCTTCCATTTCATAGTGAACGCTGTGCTGGTTTGAATGAGAAC	3950
			||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	62144	GCTGGCCTCTTACATTTCATAGTGAACGCTGTGCTGGTTTGAATGAGAAC	62193

AF111103.1	3951	AGCCACACAGGCTCATAGGAATGAATCCTTCAAATCCAGCTCCTGGAACT	4000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	62194	AGCCACACAGGCTCATAGGAATGAATCCTTCAAATCCAGCTCCTGGAACT	62243

AF111103.1	4001	GTTCAGGAAGGACTAGGGGGTGTGGCCTTGTTGGAAGGATGTGTGCCACT	4050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	62244	GTTCAGGAAGGACTAGGGGGTGTGGCCTTGTTGGAAGGATGTGTGCCACT	62293

AF111103.1	4051	GGGTTGGGCACTGAGGTTTTAACAGACTTTCTCTATTCCCAGTGTCTCAG	4100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	62294	GGGTTGGGCACTGAGGTTTTAACAGACTTTCTCTATTCCCAGTGTCTCAG	62343

AF111103.1	4101	CCTTTGCTTGGAAATCAAGTCCTGAGCTCTCAGCTGTTCCTCCACCACAC	4150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	62344	CCTTTGCTTGGAAATCAAGTCCTGAGCTCTCAGCTGTTCCTCCACCACAC	62393

AF111103.1	4151	CTTCCCTCTGCCATCATGCACTCAAACCCTCTGAAACTAGAGAAGAGATT	4200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	62394	CTTCCCTCTGCCATCATGCACTCAAACCCTCTGAAACTAGAGAAGAGATT	62443

AF111103.1	4201	AAACATTGTTATATGTTGCCTTGGTTACAGTGTCTTATCACAGTAATAAA	4250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	62444	AAACATTGTTATATGTTGCCTTGGTTACAGTGTCTTATCACAGTAATAAA	62493

AF111103.1	4251	AAACTAACTGAAGCTGGTGTAGTGACACATGCCTTCAGTCCCAATGTGGT	4300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	62494	AAACTAACTGAAGCTGGTGTAGTGACACATGCCTTCAGTCCCAATGTGGT	62543

AF111103.1	4301	GGATTGAATAGGTGGCCCCATAGACTCATGTGTTTGAAAGCTTGGCCTAC	4350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	62544	GGATTGAATAGGTGGCCCCATAGACTCATGTGTTTGAAAGCTTGGCCTAC	62593

AF111103.1	4351	AAGGAGTGGCAATGTTAGGAGTGTGGCCGTGTTAGAGGAAGTGTGTCACT	4400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	62594	AAGGAGTGGCAATGTTAGGAGTGTGGCCGTGTTAGAGGAAGTGTGTCACT	62643

AF111103.1	4401	GTGAGGTTGGGCTTTAAGGTCTCCTATGCTCATGCTCTGCCCAGTGTGGA	4450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	62644	GTGAGGTTGGGCTTTAAGGTCTCCTATGCTCATGCTCTGCCCAGTGTGGA	62693

AF111103.1	4451	ATGACAGCCTCTCCCTGGCTGCCTCTGGATCAAGGTGTAGAAGTCTCTGC	4500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	62694	ATGACAGCCTCTCCCTGGCTGCCTCTGGATCAAGGTGTAGAAGTCTCTGC	62743

AF111103.1	4501	TCCTCCAGCACCATGTCTACCTGCACACTAGCATGCTTCCTGTCATGATG	4550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	62744	TCCTCCAGCACCATGTCTACCTGCACACTAGCATGCTTCCTGTCATGATG	62793

AF111103.1	4551	GACTAAATCCCTGAAACTGTAAGCCAGCCTCTACTAAATGTTTCTCTTTA	4600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	62794	GACTAAATCCCTGAAACTGTAAGCCAGCCTCTACTAAATGTTTCTCTTTA	62843

AF111103.1	4601	GAAGGGTTGCCTTGGCCAGGCAGTGGTGACACACGACTTTAATCCCAGTA	4650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	62844	GAAGGGTTGCCTTGGCCAGGCAGTGGTGACACACGACTTTAATCCCAGTA	62893

AF111103.1	4651	CTTGGAAGGCAGAGGCAGGTGGATTTCTGAGTTCAAGGTCAGCCTGGTCT	4700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	62894	CTTGGAAGGCAGAGGCAGGTGGATTTCTGAGTTCAAGGTCAGCCTGGTCT	62943

AF111103.1	4701	ACTGAGTGAGTTCCAGGACAG	4721
			|||||||||||||||||||||
AF111102.2	62944	ACTGAGTGAGTTCCAGGACAG	62964

Compact alignment

skip 150 bps 100% identity alignment

AF111103.1	151	GGCCATTGGTGAAGTGCAGACCCAATTGCAGTTGATAGCCCAGAACTGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
AF111102.2	58404	GGCCATTGGTGAAGTGCAGACCCAATTGCAGTTGACAGCCCAGAACTGAA	58453

AF111103.1	201	GAGGCCGTGCTAAGGATTTGAGGCTTGGCACCATGGAGAGAGCCTATGAG	250
			|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	58454	GAGGCCATGCTAAGGATTTGAGGCTTGGCACCATGGAGAGAGCCTATGAG	58503

AF111103.1	251	AGGGTCTTGGTGAACCCTAGTCACAGCAGTAGACTCCAGCATATTGGAGA	300
			|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	58504	AGGGTCTTGGTGAACCCTAGTCGCAACAGTAGACTCCAGCATATTGGAGA	58553

AF111103.1	301	TGCCAGGACCATGGGACGATCACCAAGAACAGCATTAGCAATGGATTAAC	350
			|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	58554	TGCCAGGACCATGGGACGATTACCAAGAACAGCATTAGCAATGGATTAAC	58603

AF111103.1	351	CTGAGCTCACAGTGCTACAGAGGGTAGGGTTGGAGAAGTGATGCCAGCCC	400
			|||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	58604	CTG---------TGCTACAGAGGGTAGGGTTGGAGAAGTGATGCCAGCCC	58644

AF111103.1	401	TTTTTGGAGGAGTCCAAAAGACCATGCATGGATCCCAGACCTTGAAACCA	450
			|||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||
AF111102.2	58645	TTTTTGGAGGAGTCCAAAAGACCATGCATAAATCCCAGACCTTGAAACCA	58694

skip 200 bps 100% identity alignment

AF111103.1	651	TGGAGTTTGCCCAGCTGGTTTCCTGCCTCGCTTTGGGAATTCCACTTAAG	700
			||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
AF111102.2	58895	TGGAGTTTGCCCAGCTGGTTTCCGGCCTTGCTTTGGGAATTCCACTTAAG	58944

AF111103.1	701	TGACTGAATGAACCTCAGAAGAGACCTTGAACTTTGGACTTTTAACACTG	750
			|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	58945	TGACTGGATGAACCTCAGAAGAGACCTTGAACTTTGGACTTTTAACACTG	58994

skip 50 bps 100% identity alignment

AF111103.1	801	TATGCTATGTTTAGGTATGTCCCCCATAAACTCATGTTTGAACAAGCCTA	850
			||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59045	TATGCTATGTTTAGGTATGTCCCC-TTAAACTCATGTTTGAACAAGCCTA	59093

skip 50 bps 100% identity alignment

AF111103.1	901	CTATTAGAAGATGTGGCCCTGTTGCAGTAGGTGTGTCACTATGGGTGTGG	950
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
AF111102.2	59144	CTATTAGAAGATGTGGCCCTGTTGCAGTAGGTGTGTCACTATGGGTGTAG	59193

skip 350 bps 100% identity alignment

AF111103.1	1301	TGCAGACTGCATGCTGTCCTAACAGGGGACAAGCAGAACACAGAGCAAGC	1350
			| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59544	TTCAGACTGCATGCTGTCCTAACAGGGGACAAGCAGAACACAGAGCAAGC	59593

skip 100 bps 100% identity alignment

AF111103.1	1451	TGCAGAAGAACCTTGGGTGACTGTCCAGTCAGCCAGCGATCTCTGCCATT	1500
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
AF111102.2	59694	TGCAGAAGAACCTTGGGTGACTGTCCAGTCAGCCAGCGATCTCTGCCAGT	59743

AF111103.1	1501	CCCATAGCTTTGAAGCTGCTTGCTCTGCACGTCCTGTTTTCTCAGGGAAT	1550
			|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	59744	CCCATAGCTTTGAAGCTGATTGCTCTGCACGTCCTGTTTTCTCAGGGAAT	59793

AF111103.1	1551	ATTTATCCTTCTCAGGTCACTGATGGGGGGAAGACTACATAGTTACAGCC	1600
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
AF111102.2	59794	ATTTATCCTTCTCAGGTCACTGATGGGGGGAAGACTACATAGTTACAGTC	59843

skip 2300 bps 100% identity alignment

AF111103.1	3901	GCTGGCCTCTTCCATTTCATAGTGAACGCTGTGCTGGTTTGAATGAGAAC	3950
			||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF111102.2	62144	GCTGGCCTCTTACATTTCATAGTGAACGCTGTGCTGGTTTGAATGAGAAC	62193

skip 771 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AF111103.1 - 159179 bps
Hit
AF111102.2 - 158443 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 4721 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.434624472114721158254629641
284.6156228043473137534149781526051
385.521307222464078630150341526051
477.8990924263782240247153118555411
590.55198826983080433501160227629641
697.111573017007531122317162949799681
786.5335153343537840711164128694891
893.6210374122602231534574181885940621
992.883609451819846501190419948841
1091.6226193389806411452194886982741
1188.52234132793696940247194886982721
1298.78242725421254211012571038021
1384.7817362758308043356111032441059121
1496.1183120762673474811038011058791
1598.4153561606662522231711057541218601
1685.5433065334353784071111059961114151
1796.7752715801223152811511237771296201
1898.78216182231712231711295791519691
1980.7851629908308044071111315621415241
2096.9441354537223152685111538861584431
Short-link