<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1245 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AC007080.2	1	GATCTACATACTGAGTTCCAGAAGAGACAAGCCTACAGAAAGAATCTATG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	119746	GATCTACATACTGAGTTCCAGAAGAGACAAGCCTACAGAAAGAATCTATG	119795

AC007080.2	51	TAAAAACAAACAAACAAACAAACAAAAACAAAACAAACAACCTGCCCCCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	119796	TAAAAACAAACAAACAAACAAACAAAAACAAAACAAACAACCTGCCCCCC	119845

AC007080.2	101	CCCAAAAAACAAAAAACCAAGCAAACCAGCAAGCCAAACCCTAAAGAAGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	119846	CCCAAAAAACAAAAAACCAAGCAAACCAGCAAGCCAAACCCTAAAGAAGA	119895

AC007080.2	151	CCAAAGCAAACCTTAAACCCCAGACCCTAACATCAGAATGATAGCTTGTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	119896	CCAAAGCAAACCTTAAACCCCAGACCCTAACATCAGAATGATAGCTTGTT	119945

AC007080.2	201	TTTCCCTCCCCCCAAAAACGGAGAGAACTATATTGCCTGCCAGTGTCCAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	119946	TTTCCCTCCCCCCAAAAACGGAGAGAACTATATTGCCTGCCAGTGTCCAC	119995

AC007080.2	251	TCATGCTTGCTCTTTGCAGAGTGGCCACTGTTTGACGCATGCTTTACTGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	119996	TCATGCTTGCTCTTTGCAGAGTGGCCACTGTTTGACGCATGCTTTACTGA	120045

AC007080.2	301	TGGGTCCCTCTGACAGCTGAAACTGATCTTCCATGACATTCACACACACA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	120046	TGGGTCCCTCTGACAGCTGAAACTGATCTTCCATGACATTCACACACACA	120095

AC007080.2	351	CACACACACACACACACACACACACACAAAGCCTAAAATGTGAGCCTCTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	120096	CACACACACACACACACACACACACACAAAGCCTAAAATGTGAGCCTCTT	120145

AC007080.2	401	CTGGCCCCCTACTGTGTGTGGTACCCCCCGCTCCCCAGTCATTTCAGTGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	120146	CTGGCCCCCTACTGTGTGTGGTACCCCCCGCTCCCCAGTCATTTCAGTGT	120195

AC007080.2	451	CCTAGGGCAGCCCTCTGACCTAACAGGAGAGTGGAGGGGAGACTCCTGCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	120196	CCTAGGGCAGCCCTCTGACCTAACAGGAGAGTGGAGGGGAGACTCCTGCA	120245

AC007080.2	501	GGTTCAATCGCTCAATCTGCTCAATGGATCAATCTCATTCAACTATCTTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	120246	GGTTCAATCGCTCAATCTGCTCAATGGATCAATCTCATTCAACTATCTTC	120295

AC007080.2	551	AAAGCAGCGGGCAGCCGCTGAATGAGATGAAGTTGGGATTAGAGCGCCAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	120296	AAAGCAGCGGGCAGCCGCTGAATGAGATGAAGTTGGGATTAGAGCGCCAC	120345

AC007080.2	601	CTCGTGGCAGAACTGGCAGGTGCCGGGAAAACGGTCTGAAAGACCAGGGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	120346	CTCGTGGCAGAACTGGCAGGTGCCGGGAAAACGGTCTGAAAGACCAGGGG	120395

AC007080.2	651	TTGGGAGAAGTGTGGAGGGATGGTTTCCTCTTTGGACCATTGCAACCTCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	120396	TTGGGAGAAGTGTGGAGGGATGGTTTCCTCTTTGGACCATTGCAACCTCT	120445

AC007080.2	701	CAACTGTGACATGCAGACAAGTTCCCGAAACTCCCCAGGGAGGCCTCACT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	120446	CAACTGTGACATGCAGACAAGTTCCCGAAACTCCCCAGGGAGGCCTCACT	120495

AC007080.2	751	TTCGCCACGGTGTGTTAAATGTTTCACATGTTTCTCAGAATTCTATACGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	120496	TTCGCCACGGTGTGTTAAATGTTTCACATGTTTCTCAGAATTCTATACGA	120545

AC007080.2	801	CAGTGGCGGTGCCTATTCCACCATTAGGAGATCCTCAGCCAAGTTAACTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	120546	CAGTGGCGGTGCCTATTCCACCATTAGGAGATCCTCAGCCAAGTTAACTG	120595

AC007080.2	851	AACCGCGGAACTTATCATTACGTAGCAAAGCTGCAGCCAGTCCGTGGCTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	120596	AACCGCGGAACTTATCATTACGTAGCAAAGCTGCAGCCAGTCCGTGGCTC	120645

AC007080.2	901	ATGTGTTATTACAACCTCCGTTTCGGAGGCGAACAAGCTCCCGAGGTAAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	120646	ATGTGTTATTACAACCTCCGTTTCGGAGGCGAACAAGCTCCCGAGGTAAG	120695

AC007080.2	951	GGTGCAGGCCTCAGGATCCGTAAGCGGCAACCCTAGGCACCACACTGCTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	120696	GGTGCAGGCCTCAGGATCCGTAAGCGGCAACCCTAGGCACCACACTGCTA	120745

AC007080.2	1001	CCACCCAGGAGCTGCCTCTTAAACTGTAGCCGGCTGCTGAACTCTATCTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	120746	CCACCCAGGAGCTGCCTCTTAAACTGTAGCCGGCTGCTGAACTCTATCTA	120795

AC007080.2	1051	GGTACACATCTCCTGAAAGCATACCTAAGAATACTTTAAGTGCTATAACA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	120796	GGTACACATCTCCTGAAAGCATACCTAAGAATACTTTAAGTGCTATAACA	120845

AC007080.2	1101	ACCTTGGGTGAACTGAACGGCTATAAGCTCTTAGAGTAAACTGGTCTCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	120846	ACCTTGGGTGAACTGAACGGCTATAAGCTCTTAGAGTAAACTGGTCTCTG	120895

AC007080.2	1151	GTCCAGCCATAAATTCCTGTACAGTGTGACTCTGAGCTGAAGGTTAACTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	120896	GTCCAGCCATAAATTCCTGTACAGTGTGACTCTGAGCTGAAGGTTAACTG	120945

AC007080.2	1201	CCTGACCATCTAACCGCTACCTCTCTGCTTCTGTAAGCAAAGCTT	1245
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109719.2	120946	CCTGACCATCTAACCGCTACCTCTCTGCTTCTGTAAGCAAAGCTT	120990

Overview

Query
AC007080.2 - 39909 bps
Hit
AF109719.2 - 120990 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1245 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link