<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 4215 bps / non-identical: 50 bps

Full alignment

C  AL008628.1	143096	GATCACTGAATACCTTCTCCAGCAGTGAGCAAGAGTTTCCGTTTCAGGGT	143047
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	35396	GATCACTGAATACCTTCTCCAGCAGTGAGCAAGAGTTTCCGTTTCAGGGT	35445

C  AL008628.1	143046	ACCCTTGACACTTCTAAAAGTCTGGGGGTTTTTTGCTTTTTGTTTTTTTG	142997
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	35446	ACCCTTGACACTTCTAAAAGTCTGGGGGTTTTTTGCTTTTTGTTTTTTTG	35495

C  AL008628.1	142996	AGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTCGATCT	142947
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	35496	AGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTCGATCT	35545

C  AL008628.1	142946	CGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGAGTTCAAGCGATTCTCTTGCCTCA	142897
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	35546	CGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGAGTTCAAGCGATTCTCTTGCCTCA	35595

C  AL008628.1	142896	GCCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACGCCCGGCTAAT	142847
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	35596	GCCTCCCGAGCAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACGCCCGGCTAAT	35645

C  AL008628.1	142846	TTTTGTATTTTTAGTACAGAAGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATTGTC	142797
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	35646	TTTTGTATTTTTAGTACAGAAGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATTGTC	35695

C  AL008628.1	142796	TCAATCTCTTGACCTCGTGATCCGCTGGTTTTCAAAAACCAATTTGGTAG	142747
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	35696	TCAATCTCTTGACCTCGTGATCCGCTGGTTTTCAAAAACCAATTTGGTAG	35745

C  AL008628.1	142746	ATGAAAAATCTATCTCATTGATTGAATGCTGCTTTGTCTGTCAGTGAAGT	142697
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	35746	ATGAAAAATCTATCTCATTGATTGAATGCTGCTTTGTCTGTCAGTGAAGT	35795

C  AL008628.1	142696	TAGATATCTTATTAGTTTATTTTGTTAATGAGACTTTTTAATTATTCTTT	142647
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	35796	TAGATATCTTATTAGTTTATTTTGTTAATGAGACTTTTTAATTATTCTTT	35845

C  AL008628.1	142646	CATGCCCTCCTTCAGTTCATGTTTACACCTGTAACTACTGCAGTCCCATT	142597
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	35846	CATGCCCTCCTTCAGTTCATGTTTACACCTGTAACTACTGCAGTCCCATT	35895

C  AL008628.1	142596	ATTTTTCTTGATGGAATAGGAGAACTCAGCCCAGATTCTTATCCACCCAG	142547
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	35896	ATTTTTCTTGATGGAATAGGAGAACTCAGCCCAGATTCTTATCCACCCAG	35945

C  AL008628.1	142546	ACTATCTCTAGGAGAACTACTTGGTGTCAGCCTTGCAAATACCATTCTCA	142497
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	35946	ACTATCTCTAGGAGAACTACTTGGTGTCAGCCTTGCAAATACCATTCTCA	35995

C  AL008628.1	142496	GAGGTTTCGTGTCATGGGGGGAGTAGCCGCCTCAGATGCACCCAGATCCC	142447
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	35996	GAGGTTTCGTGTCATGGGGGGAGTAGCCGCCTCAGATGCACCCAGATCCC	36045

C  AL008628.1	142446	ACCAGGTGTCGTGCGTAGCACCCCATGAAGGGAGAGCAGCCAGGGTGTGT	142397
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36046	ACCAGGTGTCGTGCGTAGCACCCCATGAAGGGAGAGCAGCCAGGGTGTGT	36095

C  AL008628.1	142396	GGAGCCATGTCCAACCATGAGAGGGAAGGCTGCTTTTTCTACTGTTCCCA	142347
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36096	GGAGCCATGTCCAACCATGAGAGGGAAGGCTGCTTTTTCTACTGTTCCCA	36145

C  AL008628.1	142346	ATCCTTTTCTCCATCTTTTGACTTTCTGCCACCAACTATAGATAGACAGA	142297
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36146	ATCCTTTTCTCCATCTTTTGACTTTCTGCCACCAACTATAGATAGACAGA	36195

C  AL008628.1	142296	GATTGAGACCCCCAAAACAAAGTTGATTTATTGCAAAATAAATGTGTGAT	142247
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36196	GATTGAGACCCCCAAAACAAAGTTGATTTATTGCAAAATAAATGTGTGAT	36245

C  AL008628.1	142246	ACTCTCTCACATTGCCTGTTTCCTTACCTGGTTGGCAGTAGGTCCTCAGA	142197
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36246	ACTCTCTCACATTGCCTGTTTCCTTACCTGGTTGGCAGTAGGTCCTCAGA	36295

C  AL008628.1	142196	AGTTTGCGCCGTGGCTGGGCACACACCTGTAATCTGAGCACTTTGGCAGG	142147
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36296	AGTTTGCGCCGTGGCTGGGCACACACCTGTAATCTGAGCACTTTGGCAGG	36345

C  AL008628.1	142146	CTGAGGTGGGAGAATCACTTAAGGCCAGGAGTTTGACACTGGCCTGAGAA	142097
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36346	CTGAGGTGGGAGAATCACTTAAGGCCAGGAGTTTGACACTGGCCTGAGAA	36395

C  AL008628.1	142096	ACATAGCGAGACCCTGTCTTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTCTGCACT	142047
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36396	ACATAGCGAGACCCTGTCTTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTCTGCACT	36445

C  AL008628.1	142046	GCATACACAGTCCTGCAGGGTTCCCTCTCCTCTCCAGACTGAGGTTGTCA	141997
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36446	GCATACACAGTCCTGCAGGGTTCCCTCTCCTCTCCAGACTGAGGTTGTCA	36495

C  AL008628.1	141996	GCGAAGCCATGACAAGCGGCTGAGAGACCTGCAGATGCTGGACGCTGCTG	141947
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36496	GCGAAGCCATGACAAGCGGCTGAGAGACCTGCAGATGCTGGACGCTGCTG	36545

C  AL008628.1	141946	CTTAGGTGGCAGTAGGCGTGGCGGTTGTCAGGCCAAACTCCTCTTTCATT	141897
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36546	CTTAGGTGGCAGTAGGCGTGGCGGTTGTCAGGCCAAACTCCTCTTTCATT	36595

C  AL008628.1	141896	TCAGAGGCCATGAGGTCCTGCAGGACAAGTTTATTTTGAGCACTAAAGAT	141847
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36596	TCAGAGGCCATGAGGTCCTGCAGGACAAGTTTATTTTGAGCACTAAAGAT	36645

C  AL008628.1	141846	GACCTGTTAGTCTAATGCAGTGTGGTACAGTGGTACTTACAATTTTTATA	141797
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36646	GACCTGTTAGTCTAATGCAGTGTGGTACAGTGGTACTTACAATTTTTATA	36695

C  AL008628.1	141796	GAAACTAAATTTTGACTATTTTCTAATGAAGTCTGCATACAAATGGGCAG	141747
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36696	GAAACTAAATTTTGACTATTTTCTAATGAAGTCTGCATACAAATGGGCAG	36745

C  AL008628.1	141746	AAATCAGTGTCCTGTCATATTATTCCAAGTTAATGAGGCAAACTACATTT	141697
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36746	AAATCAGTGTCCTGTCATATTATTCCAAGTTAATGAGGCAAACTACATTT	36795

C  AL008628.1	141696	TCCTTTTGTATTATTCCATTAATGAGGCGAACTACATTTTAAGAGCTATG	141647
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36796	TCCTTTTGTATTATTCCATTAATGAGGCGAACTACATTTTAAGAGCTATG	36845

C  AL008628.1	141646	ATAGATTAGTAAGATCATTTCGTGATTTGGAAACTGTTCCCTTTTTTGTT	141597
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36846	ATAGATTAGTAAGATCATTTCGTGATTTGGAAACTGTTCCCTTTTTTGTT	36895

C  AL008628.1	141596	CTCAAAGTAATTTTCTTCACAAATCCAACTTAAGGTTCTATGGTTCAGTC	141547
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36896	CTCAAAGTAATTTTCTTCACAAATCCAACTTAAGGTTCTATGGTTCAGTC	36945

C  AL008628.1	141546	CCTCATTTTGCTGAAGAACCTTATGCCCCACATGGCTCACCCAAAACCAA	141497
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36946	CCTCATTTTGCTGAAGAACCTTATGCCCCACATGGCTCACCCAAAACCAA	36995

C  AL008628.1	141496	GCTGATTCTTCGTTGCAGAACTTAGACTGAAGCCTCCACCGCTTGGCCCC	141447
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	36996	GCTGATTCTTCGTTGCAGAACTTAGACTGAAGCCTCCACCGCTTGGCCCC	37045

C  AL008628.1	141446	AGCCCCATGTTCTTGGGTAATGCTGAGCTTGCACCTCCTGTGTTGGGGAA	141397
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37046	AGCCCCATGTTCTTGGGTAATGCTGAGCTTGCACCTCCTGTGTTGGGGAA	37095

C  AL008628.1	141396	GGGCTGTAGGGACGTGGTAGGGCCCTGCAGTCCTGACTGCCGTTGTCTGC	141347
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37096	GGGCTGTAGGGACGTGGTAGGGCCCTGCAGTCCTGACTGCCGTTGTCTGC	37145

C  AL008628.1	141346	TTCCACGGGCCGCACAGCCAGGCCACTGCAACACCAAGCTACTCGGTGTG	141297
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37146	TTCCACGGGCCGCACAGCCAGGCCACTGCAACACCAAGCTACTCGGTGTG	37195

C  AL008628.1	141296	TTGGCCTCTGGACCCAAGCTGACAGCTGTGAGCTCACAACTGCTCCAAGC	141247
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37196	TTGGCCTCTGGACCCAAGCTGACAGCTGTGAGCTCACAACTGCTCCAAGC	37245

C  AL008628.1	141246	TTGGAGTCACCTGTTATTCTCAGTGTGTGGTCACAAGTGCTCATGCTGGA	141197
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37246	TTGGAGTCACCTGTTATTCTCAGTGTGTGGTCACAAGTGCTCATGCTGGA	37295

C  AL008628.1	141196	GGTGAGCTGGAGACCACGTGTGTAAGATGAGCACACACGGGCTGACCCTG	141147
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37296	GGTGAGCTGGAGACCACGTGTGTAAGATGAGCACACACGGGCTGACCCTG	37345

C  AL008628.1	141146	GCCAGATGTGAGGAGCATGTCACCAGTCCTGCAGACCAGTAGCTCAGAGA	141097
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37346	GCCAGATGTGAGGAGCATGTCACCAGTCCTGCAGACCAGTAGCTCAGAGA	37395

C  AL008628.1	141096	CAAGGGCAGCAGTCACAAAGGGATGACATCACGGCAGGAAGGTGGGTCTT	141047
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37396	CAAGGGCAGCAGTCACAAAGGGATGACATCACGGCAGGAAGGTGGGTCTT	37445

C  AL008628.1	141046	GGGGGACTTTCAGTAGCTAGACTGGGGTAAAACACCACAATGGGAGGACA	140997
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37446	GGGGGACTTTCAGTAGCTAGACTGGGGTAAAACACCACAATGGGAGGACA	37495

C  AL008628.1	140996	CTGGGGAAGGTGAGTCAGCCTTAGAGACCACAGAGGCTGCTGAATGCCAG	140947
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37496	CTGGGGAAGGTGAGTCAGCCTTAGAGACCACAGAGGCTGCTGAATGCCAG	37545

C  AL008628.1	140946	GCAAGTCGTGGCTTTTCTACCCACCTCATACTGGGGAGGTTTTGAAGTTT	140897
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37546	GCAAGTCGTGGCTTTTCTACCCACCTCATACTGGGGAGGTTTTGAAGTTT	37595

C  AL008628.1	140896	TTTGAGGTGATGTGATGAGAAATCTGTTAGTTCAGGACCTGTATCTGGGC	140847
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37596	TTTGAGGTGATGTGATGAGAAATCTGTTAGTTCAGGACCTGTATCTGGGC	37645

C  AL008628.1	140846	CCCAGACAAGGGGGTTGGTCCTGAGGGCAGCCCAGGAGCATGTGCCAGCA	140797
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37646	CCCAGACAAGGGGGTTGGTCCTGAGGGCAGCCCAGGAGCATGTGCCAGCA	37695

C  AL008628.1	140796	CAAGGCCACGCCTCCGTGGACACCGCAGCATGCCAGCACAAGGCCACGCC	140747
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37696	CAAGGCCACGCCTCCGTGGACACCGCAGCATGCCAGCACAAGGCCACGCC	37745

C  AL008628.1	140746	TCCGTGGACACCGCAGCATGCCAGCACAAGGCCACGCCTCCGTGGACACC	140697
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37746	TCCGTGGACACCGCAGCATGCCAGCACAAGGCCACGCCTCCGTGGACACC	37795

C  AL008628.1	140696	GCAGCATGCCAGCACAAGGCCACGCCTCCGTGGACACCGCAGCATGCCAG	140647
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37796	GCAGCATGCCAGCACAAGGCCACGCCTCCGTGGACACCGCAGCATGCCAG	37845

C  AL008628.1	140646	CACAAGGCCACGCCTCCGTGGACACCGCAGCATGCCAGCACGAGGCCACG	140597
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37846	CACAAGGCCACGCCTCCGTGGACACCGCAGCATGCCAGCACGAGGCCACG	37895

C  AL008628.1	140596	CCTCCGTGGACACCGCAGCATGCCAGCACGAGGCCACGCCTCCGTGGACA	140547
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37896	CCTCCGTGGACACCGCAGCATGCCAGCACGAGGCCACGCCTCCGTGGACA	37945

C  AL008628.1	140546	CCGCAGCATGTCAGCACAAGGCCATGCCTCCGTGGACACCGCAGCATGTC	140497
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37946	CCGCAGCATGTCAGCACAAGGCCATGCCTCCGTGGACACCGCAGCATGTC	37995

C  AL008628.1	140496	CAGGGAGGACCAGCCTGGTGGAGGCACACCCTGCAAGGCCACTCTTCCCT	140447
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	37996	CAGGGAGGACCAGCCTGGTGGAGGCACACCCTGCAAGGCCACTCTTCCCT	38045

C  AL008628.1	140446	CATAGCTAAAGCCCCAGGTGGCCTGCACACTGCATGTGTGGTCACGCACT	140397
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38046	CATAGCTAAAGCCCCAGGTGGCCTGCACACTGCATGTGTGGTCACGCACT	38095

C  AL008628.1	140396	GGGAGTCCTGGTCACAGTGTGGCCCACCTCGCGGATGCTTCCAGTGCACC	140347
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38096	GGGAGTCCTGGTCACAGTGTGGCCCACCTCGCGGATGCTTCCAGTGCACC	38145

C  AL008628.1	140346	TGTGGAGCAGGGACAGTACCCATGGCAGGGCTGGACGGCCTGGGCCTTCT	140297
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38146	TGTGGAGCAGGGACAGTACCCATGGCAGGGCTGGACGGCCTGGGCCTTCT	38195

C  AL008628.1	140296	TTGTGGAGCACCATGGACTATCACGATACCTTTAAAAAATCACATGAGTT	140247
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38196	TTGTGGAGCACCATGGACTATCACGATACCTTTAAAAAATCACATGAGTT	38245

C  AL008628.1	140246	TGTATGTAATCAGGCCTTCTAGTAGAGACAAACAGGACAAGGTGTCATGG	140197
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38246	TGTATGTAATCAGGCCTTCTAGTAGAGACAAACAGGACAAGGTGTCATGG	38295

C  AL008628.1	140196	ACTGGGAAGTTATGGAAATTTTAAAGCACGAAAAGTGTGTGTGAGTGAAG	140147
			|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38296	ACTGGGAAGTTATGGAAATTTTAAAGTACGAAAAGTGTGTGTGAGTGAAG	38345

C  AL008628.1	140146	TTTGTGGAGAATGGGGAGAAGCTCACAAGTCCCAGAAGTGCTGCTCCATG	140097
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38346	TTTGTGGAGAATGGGGAGAAGCTCACAAGTCCCAGAAGTGCTGCTCCATG	38395

C  AL008628.1	140096	CCTCAACCAGGGCCCTAGAGGGATGGGCTTGGTCATGGGCGCCATGGCCT	140047
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38396	CCTCAACCAGGGCCCTAGAGGGATGGGCTTGGTCATGGGCGCCATGGCCT	38445

C  AL008628.1	140046	GCATGGGTCCAGGGGGCCCCAGGGAAGAGGAGTGGTTGGGCTGCTCAAGT	139997
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38446	GCATGGGTCCAGGGGGCCCCAGGGAAGAGGAGTGGTTGGGCTGCTCAAGT	38495

C  AL008628.1	139996	CTTTGTTTGCAGAGTCCGACCTCTCACCACCAATACCAGATTCTCCTGGG	139947
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38496	CTTTGTTTGCAGAGTCCGACCTCTCACCACCAATACCAGATTCTCCTGGG	38545

C  AL008628.1	139946	GTAGGGTTTAACACGCAGATCTGTGACTCCACTCCTGAGCCGGGTTCTCT	139897
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38546	GTAGGGTTTAACACGCAGATCTGTGACTCCACTCCTGAGCCGGGTTCTCT	38595

C  AL008628.1	139896	GGGGATGCAACCCTTAAATTTGCGTTTTTTCATGACCCTCCCTCTGATTT	139847
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38596	GGGGATGCAACCCTTAAATTTGCGTTTTTTCATGACCCTCCCTCTGATTT	38645

C  AL008628.1	139846	AAGTACGGGGATACTGCTGACCTGGTGCTGCCTTGCCACCCTTTACATGC	139797
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38646	AAGTACGGGGATACTGCTGACCTGGTGCTGCCTTGCCACCCTTTACATGC	38695

C  AL008628.1	139796	TGTGTCATTTGGGTTAAGACATTTGACAACTTACTAATCTTCTGACTATG	139747
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38696	TGTGTCATTTGGGTTAAGACATTTGACAACTTACTAATCTTCTGACTATG	38745

C  AL008628.1	139746	TGTTCCCACAGGGAGGTGGGGAAGACAGGGCTCCAGCTACCACAGGACGG	139697
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38746	TGTTCCCACAGGGAGGTGGGGAAGACAGGGCTCCAGCTACCACAGGACGG	38795

C  AL008628.1	139696	GCTCTGGGTATAGCCGTTCCAGTCAGGGACAGCCGTGGAGAGACCAGGGA	139647
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38796	GCTCTGGGTATAGCCGTTCCAGTCAGGGACAGCCGTGGAGAGACCAGGGA	38845

C  AL008628.1	139646	CCAGGTAAGAAGGCCAGTGGTCACTCTGCTGGGCCACCTGCATGGCACTG	139597
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38846	CCAGGTAAGAAGGCCAGTGGTCACTCTGCTGGGCCACCTGCATGGCACTG	38895

C  AL008628.1	139596	CCTCTCACCTTGTGCTTTTGCTGATAACTGCCTTCCTCTGTTTCAGAAAG	139547
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38896	CCTCTCACCTTGTGCTTTTGCTGATAACTGCCTTCCTCTGTTTCAGAAAG	38945

C  AL008628.1	139546	GTTGTATAGTTCCAGTAAATAAACAGATAAATATACCAATGCATCTAATT	139497
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38946	GTTGTATAGTTCCAGTAAATAAACAGATAAATATACCAATGCATCTAATT	38995

C  AL008628.1	139496	TTTATCATTTAGTGAAATAAAGACAAATAATTTCCATGGTTGATGCTAGC	139447
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38996	TTTATCATTTAGTGAAATAAAGACAAATAATTTCCATGGTTGATGCTAGC	39045

C  AL008628.1	139446	CCTGTCTGCATCTGGCCACTTTATTCATTTTCTATCAGTTCATTCTGCTC	139397
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	39046	CCTGTCTGCATCTGGCCACTTTATTCATTTTCTATCAGTTCATTCTGCTC	39095

C  AL008628.1	139396	AAGATCCAGTTTTTGTAATTTACTTGCTAGAAGGTACTTGTAAAGTTTAC	139347
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	39096	AAGATCCAGTTTTTGTAATTTACTTGCTAGAAGGTACTTGTAAAGTTTAC	39145

C  AL008628.1	139346	ATGTGGAAGATCCATTGTTCTCATGAAAAAAGGACAGGTTATAGTGTTTC	139297
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	39146	ATGTGGAAGATCCATTGTTCTCATGAAAAAAGGACAGGTTATAGTGTTTC	39195

C  AL008628.1	139296	ACCAATAGCTGCATTCAGGTAATAGGATTCTGATATTTTCCGTGACTTGG	139247
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	39196	ACCAATAGCTGCATTCAGGTAATAGGATTCTGATATTTTCCGTGACTTGG	39245

C  AL008628.1	139246	ATTACAGTGTGAGGTAGGAAATAGCCCCAACCCTTTGTTTTTTACATATG	139197
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	39246	ATTACAGTGTGAGGTAGGAAATAGCCCCAACCCTTTGTTTTTTACATATG	39295

C  AL008628.1	139196	TTGTACAGATGCTGTTTTAATGCATGTATCGTGCTGAATTTAAATACATC	139147
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	39296	TTGTACAGATGCTGTTTTAATGCATGTATCGTGCTGAATTTAAATACATC	39345

C  AL008628.1	139146	GAGAACTTCACATCAGTATTTGAGCTCAAATTCCGTATAGTTTTGAGAGC	139097
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	39346	GAGAACTTCACATCAGTATTTGAGCTCAAATTCCGTATAGTTTTGAGAGC	39395

C  AL008628.1	139096	CAAACTTTATAAACTTTGAAATTACCTAATATTTATCATTTAATCCCTTA	139047
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	39396	CAAACTTTATAAACTTTGAAATTACCTAATATTTATCATTTAATCCCTTA	39445

C  AL008628.1	139046	AAATCCAAATCAGCCTTTGATTTATGATATCTGTGACTTTCACAACGTCT	138997
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	39446	AAATCCAAATCAGCCTTTGATTTATGATATCTGTGACTTTCACAACGTCT	39495

C  AL008628.1	138996	AAAATGTGTAGAGACTTCGCAAGCTGCTCAAATTATTCCCTAAAACACAG	138947
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	39496	AAAATGTGTAGAGACTTCGCAAGCTGCTCAAATTATTCCCTAAAACACAG	39545

C  AL008628.1	138946	CAAGTCTTCAGTGTGAATCCAGTTGACCTTTGGGGTCTGTCTCGGGTGGA	138897
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	39546	CAAGTCTTCAGTGTGAATCCAGTTGACCTTTGGGGTCTGTCTCGGGTGGA	39595

C  AL008628.1	138896	GTCTGCATGGAGGCT	138882
			|||||||||||||||
  AC239411.3	39596	GTCTGCATGGAGGCT	39610

Compact alignment

skip 2900 bps 100% identity alignment

C  AL008628.1	140196	ACTGGGAAGTTATGGAAATTTTAAAGCACGAAAAGTGTGTGTGAGTGAAG	140147
			|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
  AC239411.3	38296	ACTGGGAAGTTATGGAAATTTTAAAGTACGAAAAGTGTGTGTGAGTGAAG	38345

skip 1265 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AL008628.1 - 143096 bps
Hit
AC239411.3 - 39610 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 4215 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.976304215138882143096-135396396101
Short-link