<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2727 bps / non-identical: 150 bps

Full alignment

AC207589.3	37077	GGAATGAAATGCCTTGGAGGTCCTGATTTCAGCGAGGCCAATTTTAGTGC	37126
			||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	3	GGAATGAAATGCCTTGGGGGTCCTGATTTCAGCGAGGCCAATTTTAGTGC	52

AC207589.3	37127	AGAAGAAGAAAGGGCTCCATAATAACTGCCCCAGATGGGAACGAAATGCC	37176
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	53	AGAAGAAGAAAGGGCTCCATAATAACTGCCCCAGATGGGAACGAAATGCC	102

AC207589.3	37177	TTGGGGGTCCTGATTCCAGTGAGGCCAATTTTAGCGCAGAAGAAGGGCTC	37226
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	103	TTGGGGGTCCTGATTCCAGTGAGGCCAATTTTAGCGCAGAAGAAGGGCTC	152

AC207589.3	37227	TGTAATAACTGCCCCAAACAGGAATGAAATGCCTTGGGGGTCCTGATTTC	37276
			|||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||
AC216025.3	153	TGTAATAACTGCCCCAGATGGGAATGAAATGCCTTGGAGGTCCTGATTTC	202

AC207589.3	37277	AGCGAGGCCAATTTTAGTGCAGAAGAAGAAAGGGCTCCATAATAACTGCC	37326
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	203	AGCGAGGCCAATTTTAGTGCAGAAGAAGAAAGGGCTCCATAATAACTGCC	252

AC207589.3	37327	CCAGATGGGAACGAAATGCCTTGGGGGTCCTGATTCCAGTGAGGCCAATT	37376
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	253	CCAGATGGGAACGAAATGCCTTGGGGGTCCTGATTCCAGTGAGGCCAATT	302

AC207589.3	37377	TTAGCGCAGAAGAAGGGCTCTGTAATAACTGCCCCAGATGGGAATGAAAT	37426
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||
AC216025.3	303	TTAGCGCAGAAGAAGGGCTCTGTAATAACTGCCCCAAACAGGAATGAAAT	352

AC207589.3	37427	GCCTTGGGGGTCCTGATTTCAGCGAGGCCAATTTTAGTGCAGAAGAAGAA	37476
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	353	GCCTTGGGGGTCCTGATTTCAGCGAGGCCAATTTTAGTGCAGAAGAAGAA	402

AC207589.3	37477	AGGGCTCCATAATAACTGCCCCAGATGGGAACGAAATGCCTTGGGGGTCC	37526
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	403	AGGGCTCCATAATAACTGCCCCAGATGGGAACGAAATGCCTTGGGGGTCC	452

AC207589.3	37527	TGATTCCAGTGAGGCCAATTTTAGCGCAGAAGAAGGGCTCTGTAATAACT	37576
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	453	TGATTCCAGTGAGGCCAATTTTAGCGCAGAAGAAGGGCTCTGTAATAACT	502

AC207589.3	37577	GCCCCAGATGGGAATGAAATGCCTTGGGGGTCCTGATTTCAGCGAGGCCA	37626
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	503	GCCCCAGATGGGAATGAAATGCCTTGGGGGTCCTGATTTCAGCGAGGCCA	552

AC207589.3	37627	ATTTTAGTGCAGAAGAAGAAAGGGCTCCATAATAACTGCCCCAGATGGGA	37676
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	553	ATTTTAGTGCAGAAGAAGAAAGGGCTCCATAATAACTGCCCCAGATGGGA	602

AC207589.3	37677	ACGAAATGCCTTGGGGGTCCTGATTTCAGTGAGGCCAATTTTAGCGCAGA	37726
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	603	ACGAAATGCCTTGGGGGTCCTGATTTCAGTGAGGCCAATTTTAGCGCAGA	652

AC207589.3	37727	AGAAGGGCTCTGTAATAACTGCCCCAAACAGGAATGAAATGCCTTGGGGG	37776
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	653	AGAAGGGCTCTGTAATAACTGCCCCAAACAGGAATGAAATGCCTTGGGGG	702

AC207589.3	37777	TCCTGATTTCAGCGAGGCCAATTTTAGTGCAGAAGAAGAAAGGGCTCCAT	37826
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	703	TCCTGATTTCAGCGAGGCCAATTTTAGTGCAGAAGAAGAAAGGGCTCCAT	752

AC207589.3	37827	AATAACTGCCCCAGATGGGAACGAAATGCCTTGGGGGTCCTGATTTCAGT	37876
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	753	AATAACTGCCCCAGATGGGAACGAAATGCCTTGGGGGTCCTGATTTCAGT	802

AC207589.3	37877	GAGGCCAATTTTAGCGCAGAAGAAGGGCTCTGTAATAACTGCCCCAGATG	37926
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	803	GAGGCCAATTTTAGCGCAGAAGAAGGGCTCTGTAATAACTGCCCCAGATG	852

AC207589.3	37927	GGAACGAAATGCCTTGGGGGTCCTGATTTCAGCGAGGCCAATTTTAGTGC	37976
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	853	GGAACGAAATGCCTTGGGGGTCCTGATTTCAGCGAGGCCAATTTTAGTGC	902

AC207589.3	37977	AGAAGAAGGGCTCTGTAATAACTGCCCCAGATGGGAATGAAATGCCTTGG	38026
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	903	AGAAGAAGGGCTCTGTAATAACTGCCCCAGATGGGAATGAAATGCCTTGG	952

AC207589.3	38027	GGGTCCTGATTTCAGTGAGGCCAATTTTAGCGCAGAAGAAGGGCTCTGTA	38076
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	953	GGGTCCTGATTTCAGTGAGGCCAATTTTAGCGCAGAAGAAGGGCTCTGTA	1002

AC207589.3	38077	ATAACTGCCCCAGATGGGAGTGAAATGCCTTGGGGGTCCTGTCTTGGGAC	38126
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1003	ATAACTGCCCCAGATGGGAGTGAAATGCCTTGGGGGTCCTGTCTTGGGAC	1052

AC207589.3	38127	CAAGACTGGGTTGGGAATGGAAGTTTGAGCTAAATCAGAGCTGGCAAAGA	38176
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1053	CAAGACTGGGTTGGGAATGGAAGTTTGAGCTAAATCAGAGCTGGCAAAGA	1102

AC207589.3	38177	CCTGACACATGTACCACCACCCCCCTCTCCTGTGACCATGGCAGACATTA	38226
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1103	CCTGACACATGTACCACCACCCCCCTCTCCTGTGACCATGGCAGACATTA	1152

AC207589.3	38227	CTAGGTGATCATGATACTCTTTCCACAGAGCCCTGATGTGCCCTCAGAAT	38276
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1153	CTAGGTGATCATGATACTCTTTCCACAGAGCCCTGATGTGCCCTCAGAAT	1202

AC207589.3	38277	CCTCCTCAGTGCAGTTTTCTAAGTGGCCAATATCAGCAGGTAGAGATGGT	38326
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1203	CCTCCTCAGTGCAGTTTTCTAAGTGGCCAATATCAGCAGGTAGAGATGGT	1252

AC207589.3	38327	GCAAGAGATGAAAACTGTCCCTGGACCAGTGACTTCCCAGGCTCCATCAG	38376
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1253	GCAAGAGATGAAAACTGTCCCTGGACCAGTGACTTCCCAGGCTCCATCAG	1302

AC207589.3	38377	GCTGAAGATTCTAGAGAAAATTTAGAAGAGTATAAAGGAAACTTACCTGC	38426
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1303	GCTGAAGATTCTAGAGAAAATTTAGAAGAGTATAAAGGAAACTTACCTGC	1352

AC207589.3	38427	CAGCCTCGGTTTCCAGGGCAGGCTTTATACTCCCCTCCTCCTCCCACCAT	38476
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1353	CAGCCTCGGTTTCCAGGGCAGGCTTTATACTCCCCTCCTCCTCCCACCAT	1402

AC207589.3	38477	GGGCTCTTGTCCCCTCGCTCCACACCCACCCTCAGCTCTGACCAAGCAGG	38526
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1403	GGGCTCTTGTCCCCTCGCTCCACACCCACCCTCAGCTCTGACCAAGCAGG	1452

AC207589.3	38527	ACTGGGAGACAAGAGAAGTTCAGCAAAGTAGCAGGCTCCACGTCTGCTCT	38576
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1453	ACTGGGAGACAAGAGAAGTTCAGCAAAGTAGCAGGCTCCACGTCTGCTCT	1502

AC207589.3	38577	CTTGGCCAGGCAAAGACCAGAAACCATGTTTGAGTGAAGACCCTTTAGTG	38626
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1503	CTTGGCCAGGCAAAGACCAGAAACCATGTTTGAGTGAAGACCCTTTAGTG	1552

AC207589.3	38627	AGTTAAGGCAGCAGTCAACATCTCTCATTAGGTTAACCAAAATATATATC	38676
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1553	AGTTAAGGCAGCAGTCAACATCTCTCATTAGGTTAACCAAAATATATATC	1602

AC207589.3	38677	CCCCACCCCCACCCCCATTCTGTGATAATTGTGGACTTTCATGTTGGTGA	38726
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1603	CCCCACCCCCACCCCCATTCTGTGATAATTGTGGACTTTCATGTTGGTGA	1652

AC207589.3	38727	TCTGTGACTTAGTGAAAAGACCTGCAGGCCCGTTCTTGGACCCACCAGCA	38776
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1653	TCTGTGACTTAGTGAAAAGACCTGCAGGCCCGTTCTTGGACCCACCAGCA	1702

AC207589.3	38777	ACAGCCAGAGGGTGGGGTCGGGCCAGAGCCTTGCAGCCATGTGGGTGAGG	38826
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1703	ACAGCCAGAGGGTGGGGTCGGGCCAGAGCCTTGCAGCCATGTGGGTGAGG	1752

AC207589.3	38827	TCAGGCCAGAGCCCGGCAGCCATGTGGGTGAGGTCAGGCCAGAGCCCGGC	38876
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1753	TCAGGCCAGAGCCCGGCAGCCATGTGGGTGAGGTCAGGCCAGAGCCCGGC	1802

AC207589.3	38877	AGCCATGTGGGTGGGGTCAGGCCAGAGCCCGGCAGCCATGTGGGTGAGGT	38926
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1803	AGCCATGTGGGTGGGGTCAGGCCAGAGCCCGGCAGCCATGTGGGTGAGGT	1852

AC207589.3	38927	CAGGCCAGAGCCCGGCAGCCATGTGGGTGGGGTCAGGCCAGAGCCCGGCA	38976
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1853	CAGGCCAGAGCCCGGCAGCCATGTGGGTGGGGTCAGGCCAGAGCCCGGCA	1902

AC207589.3	38977	GCCATGTGGGTGAGGTCAGGCCAGAGCCCGGCAGCCATGTGGGTGGGGTC	39026
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1903	GCCATGTGGGTGAGGTCAGGCCAGAGCCCGGCAGCCATGTGGGTGGGGTC	1952

AC207589.3	39027	AGGCCAGAGCCCGGCAGCCATGTGGGTGAGGTCAGGCCAGAGCCTGGCAG	39076
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	1953	AGGCCAGAGCCCGGCAGCCATGTGGGTGAGGTCAGGCCAGAGCCTGGCAG	2002

AC207589.3	39077	CCATGTGGGTGGGGTGGGGGGCAGACATCCCATAGAGATCTAGAGTTCCA	39126
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	2003	CCATGTGGGTGGGGTGGGGGGCAGACATCCCATAGAGATCTAGAGTTCCA	2052

AC207589.3	39127	AACGAGGAACTGGACTGAGATCACCCCGTCTCGGTTTGAGATCCACGGGG	39176
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	2053	AACGAGGAACTGGACTGAGATCACCCCGTCTCGGTTTGAGATCCACGGGG	2102

AC207589.3	39177	CCCACACGTGATTTCCCACAGGTGGCAGCGTGGAGGCCCCCAGGATGGGG	39226
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	2103	CCCACACGTGATTTCCCACAGGTGGCAGCGTGGAGGCCCCCAGGATGGGG	2152

AC207589.3	39227	TTCACCCACCCGCCGGGCCACCTCTCTGGGTGCCAGAGCAGCCTGGCCAG	39276
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	2153	TTCACCCACCCGCCGGGCCACCTCTCTGGGTGCCAGAGCAGCCTGGCCAG	2202

AC207589.3	39277	TGGTGAGACGGGGACAGGCTCTGCTGACCCGCCAGGGGGACCCCGCCCCG	39326
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	2203	TGGTGAGACGGGGACAGGCTCTGCTGACCCGCCAGGGGGACCCCGCCCCG	2252

AC207589.3	39327	GGCTGACCCGAAGGGCCCCGGTGAGTACCCAACTGCTGCCTTCTCCCCTC	39376
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	2253	GGCTGACCCGAAGGGCCCCGGTGAGTACCCAACTGCTGCCTTCTCCCCTC	2302

AC207589.3	39377	TCCTGCCCCCGCGGCCGTGTCCTCTCTCACTCACTCCTCCCAAACTGGAG	39426
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	2303	TCCTGCCCCCGCGGCCGTGTCCTCTCTCACTCACTCCTCCCAAACTGGAG	2352

AC207589.3	39427	ACTGGTCGGTGACATTTTCAATTCTGCATGTTGTTTACCAAGCACTGTGC	39476
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	2353	ACTGGTCGGTGACATTTTCAATTCTGCATGTTGTTTACCAAGCACTGTGC	2402

AC207589.3	39477	GGGGGAACAAGGTGAGCCAGACCCCATCCCTGCCTGCAAGGAACAGAGAG	39526
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	2403	GGGGGAACAAGGTGAGCCAGACCCCATCCCTGCCTGCAAGGAACAGAGAG	2452

AC207589.3	39527	AGGGACCCAGAATGATAATGGTAGCCATCCCTAGCCACTCTCGGTAATCA	39576
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	2453	AGGGACCCAGAATGATAATGGTAGCCATCCCTAGCCACTCTCGGTAATCA	2502

AC207589.3	39577	CAGCAGTGGTTACCATCCTCTGCTACATAAAACGTGTCGGGCTCCCCTGG	39626
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	2503	CAGCAGTGGTTACCATCCTCTGCTACATAAAACGTGTCGGGCTCCCCTGG	2552

AC207589.3	39627	GGCGAACTTTCATTCTCTTGGCAGAGTGGCTGGGAGGCTTATTGTCCCAT	39676
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	2553	GGCGAACTTTCATTCTCTTGGCAGAGTGGCTGGGAGGCTTATTGTCCCAT	2602

AC207589.3	39677	TTGATGGGTGTAGAAACCAAGGCACAGAGAGAGAGTGAGGGGAGAATCCT	39726
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	2603	TTGATGGGTGTAGAAACCAAGGCACAGAGAGAGAGTGAGGGGAGAATCCT	2652

AC207589.3	39727	GGGCTCCCACCCTGCCCTGCACCTGCTGGGCCCAGCCCTGGTTGGCCCAG	39776
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	2653	GGGCTCCCACCCTGCCCTGCACCTGCTGGGCCCAGCCCTGGTTGGCCCAG	2702

AC207589.3	39777	GATCATCCTGTGGCGGGGGTGAGGGTT	39803
			|||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	2703	GATCATCCTGTGGCGGGGGTGAGGGTT	2729

Compact alignment

AC207589.3	37077	GGAATGAAATGCCTTGGAGGTCCTGATTTCAGCGAGGCCAATTTTAGTGC	37126
			||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
AC216025.3	3	GGAATGAAATGCCTTGGGGGTCCTGATTTCAGCGAGGCCAATTTTAGTGC	52

skip 100 bps 100% identity alignment

AC207589.3	37227	TGTAATAACTGCCCCAAACAGGAATGAAATGCCTTGGGGGTCCTGATTTC	37276
			|||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||
AC216025.3	153	TGTAATAACTGCCCCAGATGGGAATGAAATGCCTTGGAGGTCCTGATTTC	202

skip 100 bps 100% identity alignment

AC207589.3	37377	TTAGCGCAGAAGAAGGGCTCTGTAATAACTGCCCCAGATGGGAATGAAAT	37426
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||
AC216025.3	303	TTAGCGCAGAAGAAGGGCTCTGTAATAACTGCCCCAAACAGGAATGAAAT	352

skip 2377 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AC207589.3 - 39803 bps
Hit
AC216025.3 - 36437 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2727 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.70660272737077398031327291
Short-link