<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 5356 bps / non-identical: 50 bps

Full alignment

AC024940.39	200597	CATCATGTTTTAAGTCACAAAGTTAATGAGCAGGTGAAGGCGTATTTGAA	200646
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1	CATCATGTTTTAAGTCACAAAGTTAATGAGCAGGTGAAGGCGTATTTGAA	50

AC024940.39	200647	ACCGGACAGCCTTGACAATTTCAGAGCTTTATGTGCCACTTTGCACAGTG	200696
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	51	ACCGGACAGCCTTGACAATTTCAGAGCTTTATGTGCCACTTTGCACAGTG	100

AC024940.39	200697	CATTGCACATAGTTCACAAAGTTTCCAGTACATGATAGAATCTCAATCAG	200746
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	101	CATTGCACATAGTTCACAAAGTTTCCAGTACATGATAGAATCTCAATCAG	150

AC024940.39	200747	TTTTAGTCACTTTCTCTGCTCTTTTCCAACTTACGCAAAGTCTATTTTTA	200796
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	151	TTTTAGTCACTTTCTCTGCTCTTTTCCAACTTACGCAAAGTCTATTTTTA	200

AC024940.39	200797	ATATTTGCTTGTGGAAGCTACCCTATCTTATGGAACAGAATTACCATTAA	200846
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	201	ATATTTGCTTGTGGAAGCTACCCTATCTTATGGAACAGAATTACCATTAA	250

AC024940.39	200847	GTAATGAATTACCTAATCTCAATATGAGAATATGATGACATCAGATAATA	200896
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	251	GTAATGAATTACCTAATCTCAATATGAGAATATGATGACATCAGATAATA	300

AC024940.39	200897	TATTGCATGTTATGTTTTCTTTGTTCCACACAGATGATGGTAAAAGGAGC	200946
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	301	TATTGCATGTTATGTTTTCTTTGTTCCACACAGATGATGGTAAAAGGAGC	350

AC024940.39	200947	TATCTTACTCAGTGGACAAAAGGAAATCAGAAACAAAGGTATACATAATG	200996
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	351	TATCTTACTCAGTGGACAAAAGGAAATCAGAAACAAAGGTATACATAATG	400

AC024940.39	200997	TATTCATTTTAAAATATGTGCTCTAACTTCATTTTTTCTTGTTAAGGATA	201046
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	401	TATTCATTTTAAAATATGTGCTCTAACTTCATTTTTTCTTGTTAAGGATA	450

AC024940.39	201047	TATAGACATTATATATATGGGGATTATATATATTAAGAAAATATATTTAT	201096
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	451	TATAGACATTATATATATGGGGATTATATATATTAAGAAAATATATTTAT	500

AC024940.39	201097	ATATAGTCAAACATATATGTGTGTGTGTATATATATATGTGTGTATATAT	201146
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	501	ATATAGTCAAACATATATGTGTGTGTGTATATATATATGTGTGTATATAT	550

AC024940.39	201147	GTATGTGTATATATATATAGTGAAAAGAAGAACGAGCACTTATTTCAATT	201196
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	551	GTATGTGTATATATATATAGTGAAAAGAAGAACGAGCACTTATTTCAATT	600

AC024940.39	201197	TGTGGATGAAGGGAATAGTTAGCACAGCCTGAGGGAAGCTACTAAATGTC	201246
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	601	TGTGGATGAAGGGAATAGTTAGCACAGCCTGAGGGAAGCTACTAAATGTC	650

AC024940.39	201247	CTGATGAAGGAGAGTTCTACTGTTTCTTTTATTGTCAGATCATTGAGTAC	201296
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	651	CTGATGAAGGAGAGTTCTACTGTTTCTTTTATTGTCAGATCATTGAGTAC	700

AC024940.39	201297	ATTAGAAAAGTGGTGTACAACCGCATATTCTCACTCATAGGTGGGAATTG	201346
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	701	ATTAGAAAAGTGGTGTACAACCGCATATTCTCACTCATAGGTGGGAATTG	750

AC024940.39	201347	AACGGTGAGAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCATACTCTGAGGAC	201396
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	751	AACGGTGAGAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCATACTCTGAGGAC	800

AC024940.39	201397	TGTTGTGGGGTGGGGGGATGGTGGAGGGATAGCATTGGGAGATATACCTA	201446
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	801	TGTTGTGGGGTGGGGGGATGGTGGAGGGATAGCATTGGGAGATATACCTA	850

AC024940.39	201447	ATGCTAGATGACGAGTTAGTGGGTGCAGCGCACCAGCATGGCACATGTAT	201496
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	851	ATGCTAGATGACGAGTTAGTGGGTGCAGCGCACCAGCATGGCACATGTAT	900

AC024940.39	201497	ACATATGTAACTAACCTGCACATTGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAG	201546
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	901	ACATATGTAACTAACCTGCACATTGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAG	950

AC024940.39	201547	AATAATAATAATAATAAATAAAAAATAAAAAAAAGAAAAGTGGTGTACAA	201596
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	951	AATAATAATAATAATAAATAAAAAATAAAAAAAAGAAAAGTGGTGTACAA	1000

AC024940.39	201597	AATCCCAGTATTGTTATTATCTAAATTATGCAGTCTTCTTTATTTGTGTA	201646
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1001	AATCCCAGTATTGTTATTATCTAAATTATGCAGTCTTCTTTATTTGTGTA	1050

AC024940.39	201647	TGTACTTCCTATTATTTGATTTATTTGTCTTGAAAACAGGGCCCAATTTA	201696
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1051	TGTACTTCCTATTATTTGATTTATTTGTCTTGAAAACAGGGCCCAATTTA	1100

AC024940.39	201697	CTCTTTCTGTCCATGAGCTATTCTCTTTTATCTAAGTGTACCAGTGATTC	201746
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1101	CTCTTTCTGTCCATGAGCTATTCTCTTTTATCTAAGTGTACCAGTGATTC	1150

AC024940.39	201747	AGGAAACTTTCAGCATCGTATCTCTTCGTCTCCTATTTACACAGCCTGGA	201796
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1151	AGGAAACTTTCAGCATCGTATCTCTTCGTCTCCTATTTACACAGCCTGGA	1200

AC024940.39	201797	ATGGAAACTTCTCGTTCCCACTCAGCATCAGTGCTGATCTGGCTCCTGCA	201846
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1201	ATGGAAACTTCTCGTTCCCACTCAGCATCAGTGCTGATCTGGCTCCTGCA	1250

AC024940.39	201847	GCCGTCCTGTTTGTCTACACCCTTCACCCCAGTGGGGAAATTGTGGCTGA	201896
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1251	GCCGTCCTGTTTGTCTACACCCTTCACCCCAGTGGGGAAATTGTGGCTGA	1300

AC024940.39	201897	CAGTGTCAGATTCCAGGTTGACAAGTGCTTTAAACACAAGGTGATGTTTC	201946
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1301	CAGTGTCAGATTCCAGGTTGACAAGTGCTTTAAACACAAGGTGATGTTTC	1350

AC024940.39	201947	TCCTATTTCTGGCCTGAGAAGTGGGAACAGTTTGCTCCCTGCTGTCTTCT	201996
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1351	TCCTATTTCTGGCCTGAGAAGTGGGAACAGTTTGCTCCCTGCTGTCTTCT	1400

AC024940.39	201997	CGCCTGACTGCTATCACCTTCACGTGGGAAACTTACACTCAGTGCTGGCA	202046
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1401	CGCCTGACTGCTATCACCTTCACGTGGGAAACTTACACTCAGTGCTGGCA	1450

AC024940.39	202047	TAATTGAATTATTAGGGGATGTGAGAATCACCAAACACAATGCATGATCC	202096
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1451	TAATTGAATTATTAGGGGATGTGAGAATCACCAAACACAATGCATGATCC	1500

AC024940.39	202097	TTGGCAGCAGTGCCAATCCTGAGACGGCAGCACGTGGTGAAGGGGGTCTC	202146
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1501	TTGGCAGCAGTGCCAATCCTGAGACGGCAGCACGTGGTGAAGGGGGTCTC	1550

AC024940.39	202147	CTGCAAAGAAAGCTGAGGGTGAGAGTGGGCAAAGGAAATACCGTATAGAA	202196
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1551	CTGCAAAGAAAGCTGAGGGTGAGAGTGGGCAAAGGAAATACCGTATAGAA	1600

AC024940.39	202197	ATCTATAAGGATTTATTCAGGAGAGATTAAATGTATTCAGATCATCTTTA	202246
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1601	ATCTATAAGGATTTATTCAGGAGAGATTAAATGTATTCAGATCATCTTTA	1650

AC024940.39	202247	CATAAAATGGTCTCTACTCTCATCTCTTTTTTTTCTCTACTTTAGGTTAA	202296
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1651	CATAAAATGGTCTCTACTCTCATCTCTTTTTTTTCTCTACTTTAGGTTAA	1700

AC024940.39	202297	CATAAAGTTCTCTAACGAGCAGGGCTTACCTGGTTCCAATGCTAGTCTCT	202346
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1701	CATAAAGTTCTCTAACGAGCAGGGCTTACCTGGTTCCAATGCTAGTCTCT	1750

AC024940.39	202347	ATCTTCAAGCGGCGCCTGTCTTATTCTGTGCCCTCGGGGCTGTGGATGGG	202396
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1751	ATCTTCAAGCGGCGCCTGTCTTATTCTGTGCCCTCGGGGCTGTGGATGGG	1800

AC024940.39	202397	AACGTCCTTCTACTGAAATCTGAACAACAGCTGTCAGCTGAAAGTGTAAG	202446
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1801	AACGTCCTTCTACTGAAATCTGAACAACAGCTGTCAGCTGAAAGTGTAAG	1850

AC024940.39	202447	CTCTCTGACTTCCTCGTTTTTCATGTTTCTCTGGACTACCAGAAGTCTTA	202496
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1851	CTCTCTGACTTCCTCGTTTTTCATGTTTCTCTGGACTACCAGAAGTCTTA	1900

AC024940.39	202497	TCCTTCAGATGATGTCTTGAACATGTTGAAAATATTGAATGTTTTCTTCC	202546
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1901	TCCTTCAGATGATGTCTTGAACATGTTGAAAATATTGAATGTTTTCTTCC	1950

AC024940.39	202547	TTTGTTCCTTCGTGGATTATATACGTATTTTTCTTGGCTATCCTAAGAGC	202596
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	1951	TTTGTTCCTTCGTGGATTATATACGTATTTTTCTTGGCTATCCTAAGAGC	2000

AC024940.39	202597	ATGCTTATAACAATACAGAATTTGATAGATAATTATAACAGTTTAGGAAT	202646
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2001	ATGCTTATAACAATACAGAATTTGATAGATAATTATAACAGTTTAGGAAT	2050

AC024940.39	202647	TTTACAACTGTGATTTTTAAAAATCATAGGTGTAATCACAGAAGTGGAAA	202696
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2051	TTTACAACTGTGATTTTTAAAAATCATAGGTGTAATCACAGAAGTGGAAA	2100

AC024940.39	202697	CTTGGAATAAAATGAAATCTCTATGTTCAAGGATATGCTTGGATTCAGTG	202746
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2101	CTTGGAATAAAATGAAATCTCTATGTTCAAGGATATGCTTGGATTCAGTG	2150

AC024940.39	202747	TAAAGTTATTATCTATAAATGGATATTGTATTTTCTTAAACATTTCCAGA	202796
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2151	TAAAGTTATTATCTATAAATGGATATTGTATTTTCTTAAACATTTCCAGA	2200

AC024940.39	202797	CCTGGAATTCCAGAAGTTCACATCCAATTTATTTCGCTTAACAATTGTTG	202846
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2201	CCTGGAATTCCAGAAGTTCACATCCAATTTATTTCGCTTAACAATTGTTG	2250

AC024940.39	202847	GATATTTTCCGTTTATTTCTAACACAATTACATATAAATAACTATTGAAA	202896
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2251	GATATTTTCCGTTTATTTCTAACACAATTACATATAAATAACTATTGAAA	2300

AC024940.39	202897	TTTATGATCATATTTAAATCTAATTTAAATTGTGTACTTTGTGCAAAGTA	202946
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2301	TTTATGATCATATTTAAATCTAATTTAAATTGTGTACTTTGTGCAAAGTA	2350

AC024940.39	202947	TACAAAGACATAAAGAAGGAAATCTTTAAAATCATTTATAGTCCTAACAC	202996
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2351	TACAAAGACATAAAGAAGGAAATCTTTAAAATCATTTATAGTCCTAACAC	2400

AC024940.39	202997	TTAGGCATCTTTATAGTTTTGCTGTAATTTTTCAAGTCTCTTTTCTGAAG	203046
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2401	TTAGGCATCTTTATAGTTTTGCTGTAATTTTTCAAGTCTCTTTTCTGAAG	2450

AC024940.39	203047	GCATATATATTTTACAAACTTGAGATCTCACCAAAAAATAGTTTTGTATT	203096
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2451	GCATATATATTTTACAAACTTGAGATCTCACCAAAAAATAGTTTTGTATT	2500

AC024940.39	203097	TTGCTTTCAACATTCTGTAGTAAGTCCAGTTTTAAGTATAAAATTATAGA	203146
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2501	TTGCTTTCAACATTCTGTAGTAAGTCCAGTTTTAAGTATAAAATTATAGA	2550

AC024940.39	203147	ATTCAGTAATAATATTGAATAACTATAGATCATTATATAAAACATTTTTC	203196
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2551	ATTCAGTAATAATATTGAATAACTATAGATCATTATATAAAACATTTTTC	2600

AC024940.39	203197	TCAATGCAAAACATAAATACATTTAAGTTTTCTATTACAGGGAGCAAAAA	203246
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2601	TCAATGCAAAACATAAATACATTTAAGTTTTCTATTACAGGGAGCAAAAA	2650

AC024940.39	203247	TACTTTTAGTTAGAAGCTTTCAGAATCTGAGGGGACATCAACAAATAAAG	203296
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2651	TACTTTTAGTTAGAAGCTTTCAGAATCTGAGGGGACATCAACAAATAAAG	2700

AC024940.39	203297	GATAAATTTATCTATAAATATGGAATATGGCCATGTGCTGTGCTCACGCC	203346
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2701	GATAAATTTATCTATAAATATGGAATATGGCCATGTGCTGTGCTCACGCC	2750

AC024940.39	203347	TGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCGTTTGTGCTCA	203396
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2751	TGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCGTTTGTGCTCA	2800

AC024940.39	203397	CGAGGTCGAGACCAGCCTGCACAACATGATGAGACTCTGTCTCCCCCGAA	203446
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2801	CGAGGTCGAGACCAGCCTGCACAACATGATGAGACTCTGTCTCCCCCGAA	2850

AC024940.39	203447	AATATAAAAAATGAGCAGGGCACAGTGGTGTGCACCTGTGATCTCAGAAA	203496
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2851	AATATAAAAAATGAGCAGGGCACAGTGGTGTGCACCTGTGATCTCAGAAA	2900

AC024940.39	203497	CTTGGGAGATTGACATGGGAGGATCACTTGAGCCCTGGCGGGGGCAGAGG	203546
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2901	CTTGGGAGATTGACATGGGAGGATCACTTGAGCCCTGGCGGGGGCAGAGG	2950

AC024940.39	203547	TTGCAGTGAACCAAGATCGTGCCACTACACTCCATCCTGGGTGACAGAGC	203596
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	2951	TTGCAGTGAACCAAGATCGTGCCACTACACTCCATCCTGGGTGACAGAGC	3000

AC024940.39	203597	GAGACCCTGTCTCAAAGAAAAAAAAGGAATATGTATATATATATGTGTGT	203646
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	3001	GAGACCCTGTCTCAAAGAAAAAAAAGGAATATGTATATATATATGTGTGT	3050

AC024940.39	203647	GTGTGTGTGTGTGTGTACATATATATGTTTATATATGTACACACACACAC	203696
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	3051	GTGTGTGTGTGTGTGTACATATATATGTTTATATATGTACACACACACAC	3100

AC024940.39	203697	ACTCCTTTTTTTTCCCTTGAGAGTTTCATGGATTCAGAGTAAATAGCTTC	203746
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	3101	ACTCCTTTTTTTTCCCTTGAGAGTTTCATGGATTCAGAGTAAATAGCTTC	3150

AC024940.39	203747	TGCTCATTCTTTCTACAGTTGGAGGTGGCAATATCTTAGGAAAACTGCCT	203796
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	3151	TGCTCATTCTTTCTACAGTTGGAGGTGGCAATATCTTAGGAAAACTGCCT	3200

AC024940.39	203797	CAAGAAAAGACCATCAAGGGACCTCAAAAAGAAAATTCTAGAGGCATTAT	203846
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	3201	CAAGAAAAGACCATCAAGGGACCTCAAAAAGAAAATTCTAGAGGCATTAT	3250

AC024940.39	203847	TCAGGGGTCTCAGAATATATCAGAGCCAAAAGAGGTTGCCCTTGTTTATT	203896
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	3251	TCAGGGGTCTCAGAATATATCAGAGCCAAAAGAGGTTGCCCTTGTTTATT	3300

AC024940.39	203897	ATTGATAGCTATATTAATAGTATAAATCAAGTGAAGTTCTATAAATGAGT	203946
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	3301	ATTGATAGCTATATTAATAGTATAAATCAAGTGAAGTTCTATAAATGAGT	3350

AC024940.39	203947	GAATTCCAATTTATATTCTATAAGTTTATGTTATTTTTTGTATTATCTAT	203996
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	3351	GAATTCCAATTTATATTCTATAAGTTTATGTTATTTTTTGTATTATCTAT	3400

AC024940.39	203997	GTAAGCTTAGTTTTTAGTTTTAAATAATTTTTAAAAGTGCAAGAATTACA	204046
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	3401	GTAAGCTTAGTTTTTAGTTTTAAATAATTTTTAAAAGTGCAAGAATTACA	3450

AC024940.39	204047	CAGAGAACTCCCGTAGACCCTTGGCCTGATTCACCAGTTTGTGAACATTT	204096
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	3451	CAGAGAACTCCCGTAGACCCTTGGCCTGATTCACCAGTTTGTGAACATTT	3500

AC024940.39	204097	CACCGTACTTGTTTTCTCTTTCTCACTCTCTCCACCCCTACACACACACA	204146
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	3501	CACCGTACTTGTTTTCTCTTTCTCACTCTCTCCACCCCTACACACACACA	3550

AC024940.39	204147	CATACATACACACACACACACACACACACACA--GAGTTTATGCCATTTC	204194
			||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||
AC204960.3	3551	CATACATACACACACACACACACACACACACACAGAGTTTATGCCATTTC	3600

AC024940.39	204195	AGTTTTTTCTGAATCATTTGAGACTAGGTTACATACATCAGTCTATTGTG	204244
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	3601	AGTTTTTTCTGAATCATTTGAGACTAGGTTACATACATCAGTCTATTGTG	3650

AC024940.39	204245	AAAGAAAAATACAAACAACTCCGGACCCCAATTCACGATGCTAAAAGGAC	204294
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	3651	AAAGAAAAATACAAACAACTCCGGACCCCAATTCACGATGCTAAAAGGAC	3700

AC024940.39	204295	AAAAAATGAGGCTGAAAACTGAGTCATGGAAGAAGTTGTTTTTCTTTTGT	204344
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	3701	AAAAAATGAGGCTGAAAACTGAGTCATGGAAGAAGTTGTTTTTCTTTTGT	3750

AC024940.39	204345	TCCTAAGCAGATAGCTACTTTTTCTTCCTTGTTAGATTAGTTGGTGGTTT	204394
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	3751	TCCTAAGCAGATAGCTACTTTTTCTTCCTTGTTAGATTAGTTGGTGGTTT	3800

AC024940.39	204395	ACCTATTTTGCCGAGTTTTCCAAAAACATATAATTTTAATTTATTAATGT	204444
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	3801	ACCTATTTTGCCGAGTTTTCCAAAAACATATAATTTTAATTTATTAATGT	3850

AC024940.39	204445	GATGTAATATGATGTGAGGTTTTTTGCTACTCCATCACATTAATTTCTAT	204494
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	3851	GATGTAATATGATGTGAGGTTTTTTGCTACTCCATCACATTAATTTCTAT	3900

AC024940.39	204495	TTTTATCTTTATTATTTCCTTACTGGTGCTGTATTTTGTTGTTATTTTTA	204544
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	3901	TTTTATCTTTATTATTTCCTTACTGGTGCTGTATTTTGTTGTTATTTTTA	3950

AC024940.39	204545	GCTTTTTCACTTAGAAATTTACTTCATTTTCATTAATTTATTTTATTGGG	204594
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	3951	GCTTTTTCACTTAGAAATTTACTTCATTTTCATTAATTTATTTTATTGGG	4000

AC024940.39	204595	CTAGGTGTTTTTAAGCCTATAAGTTTTTCCATGATTTCTACTTTTGAAGT	204644
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4001	CTAGGTGTTTTTAAGCCTATAAGTTTTTCCATGATTTCTACTTTTGAAGT	4050

AC024940.39	204645	ATCTCATAGATCCTGATACATAGCAATTGCACCATTTTTATTTTTCAGAA	204694
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4051	ATCTCATAGATCCTGATACATAGCAATTGCACCATTTTTATTTTTCAGAA	4100

AC024940.39	204695	ATTCCGTAATTTCTGTTTGTATTAACCCTTTCACTGAAAATTTACTTACT	204744
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4101	ATTCCGTAATTTCTGTTTGTATTAACCCTTTCACTGAAAATTTACTTACT	4150

AC024940.39	204745	GGAGTACTTTATAATTTTCATATAAAAAGGAATTTATTTTAGAGTTTTCT	204794
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4151	GGAGTACTTTATAATTTTCATATAAAAAGGAATTTATTTTAGAGTTTTCT	4200

AC024940.39	204795	TTTAAATTTCAAGTTCTATATCTTCATGGCCAGCAATATTTCCACCGGTA	204844
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4201	TTTAAATTTCAAGTTCTATATCTTCATGGCCAGCAATATTTCCACCGGTA	4250

AC024940.39	204845	TATTTTTGTGCCCAAATATATAATGAGTTTTTGCGAATATATCTCATGTG	204894
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4251	TATTTTTGTGCCCAAATATATAATGAGTTTTTGCGAATATATCTCATGTG	4300

AC024940.39	204895	TTGAGAAGATATAGTCTCTATTATCAGTTTGTTTTCTATCCATGAGGTTG	204944
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4301	TTGAGAAGATATAGTCTCTATTATCAGTTTGTTTTCTATCCATGAGGTTG	4350

AC024940.39	204945	GATTATTTTGATTCTTTGTATTCTTACTTATTTTGTAAAATTTATTTAAC	204994
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4351	GATTATTTTGATTCTTTGTATTCTTACTTATTTTGTAAAATTTATTTAAC	4400

AC024940.39	204995	CTTCTTCTGCTGAGTGATGTGTTAAAATACCCTACAAATAGTGCTCTGTT	205044
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4401	CTTCTTCTGCTGAGTGATGTGTTAAAATACCCTACAAATAGTGCTCTGTT	4450

AC024940.39	205045	TCTTCTTGCATCTTCTGTAGTTTCTGCATAGATAATCATAACTGTTGTGC	205094
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4451	TCTTCTTGCATCTTCTGTAGTTTCTGCATAGATAATCATAACTGTTGTGC	4500

AC024940.39	205095	CTTTATTATGAATTGCAGCTTTTAGCAGTAAGTATTCTTCTCTATCTTGT	205144
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4501	CTTTATTATGAATTGCAGCTTTTAGCAGTAAGTATTCTTCTCTATCTTGT	4550

AC024940.39	205145	TTGATGTCTTTTGGCCTTACTTCTACGATTTCCGATAACAGGAGGATTGC	205194
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4551	TTGATGTCTTTTGGCCTTACTTCTACGATTTCCGATAACAGGAGGATTGC	4600

AC024940.39	205195	AGCCTTTGCATTCTTATTATTTTCCTTTACTTTTCCTTTGGATTTCACCT	205244
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4601	AGCCTTTGCATTCTTATTATTTTCCTTTACTTTTCCTTTGGATTTCACCT	4650

AC024940.39	205245	TTTGAAATATGCACTTCACTTGTTTTTTGTATGAAGTACAGCATTATGTT	205294
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4651	TTTGAAATATGCACTTCACTTGTTTTTTGTATGAAGTACAGCATTATGTT	4700

AC024940.39	205295	TTGTTTTAAATATGCATATCTTTGTCTTCTAAAGGAGAATAAAGTCTATT	205344
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4701	TTGTTTTAAATATGCATATCTTTGTCTTCTAAAGGAGAATAAAGTCTATT	4750

AC024940.39	205345	CACTCTATTGATATGATGTATGTGTTAGGCCTCAGCTCTATCATACTATT	205394
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4751	CACTCTATTGATATGATGTATGTGTTAGGCCTCAGCTCTATCATACTATT	4800

AC024940.39	205395	TTTCTTATGATTCTGTATTGTATTTAAAGCTACTTTATTTCTTTAGCTTT	205444
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4801	TTTCTTATGATTCTGTATTGTATTTAAAGCTACTTTATTTCTTTAGCTTT	4850

AC024940.39	205445	TATGTTTGTTTGTTGTTATCTTGCTTAAAGCTTCTTTGAGTATTCAGGCT	205494
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4851	TATGTTTGTTTGTTGTTATCTTGCTTAAAGCTTCTTTGAGTATTCAGGCT	4900

AC024940.39	205495	AGCTTGAATTTTTATTTTAGTGGTTATTTTTATATTTACATATTTTATAA	205544
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4901	AGCTTGAATTTTTATTTTAGTGGTTATTTTTATATTTACATATTTTATAA	4950

AC024940.39	205545	TATCCTAATATCCTAATCTCATTTTTTCTTGCTTAACCTTAATATCTAGT	205594
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	4951	TATCCTAATATCCTAATCTCATTTTTTCTTGCTTAACCTTAATATCTAGT	5000

AC024940.39	205595	CAGTTATGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGGACTTTGGG	205644
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	5001	CAGTTATGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGGACTTTGGG	5050

AC024940.39	205645	AGGCCAAGGCGGGTGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTCGCT	205694
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	5051	AGGCCAAGGCGGGTGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTCGCT	5100

AC024940.39	205695	AACACGGTGAAACCGCGTCTCTACTAAAAATATTAAAAAATTAGCTGGGC	205744
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	5101	AACACGGTGAAACCGCGTCTCTACTAAAAATATTAAAAAATTAGCTGGGC	5150

AC024940.39	205745	GTGGTGGCGGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGACTGAGGCAGGAG	205794
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	5151	GTGGTGGCGGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGACTGAGGCAGGAG	5200

AC024940.39	205795	AATGGCATGAACCTGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCA	205844
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	5201	AATGGCATGAACCTGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCA	5250

AC024940.39	205845	CTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCATTTAAAAAAAAAAAA	205894
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	5251	CTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCATTTAAAAAAAAAAAA	5300

AC024940.39	205895	TCTAGTCAGTTATTTTTAATCTTTGAGTCTTAACTGCTACCTACACAACA	205944
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC204960.3	5301	TCTAGTCAGTTATTTTTAATCTTTGAGTCTTAACTGCTACCTACACAACA	5350

AC024940.39	205945	GTCAGTAA	205952
			||||||||
AC204960.3	5351	GTCAGTAA	5358

Compact alignment

skip 3550 bps 100% identity alignment

AC024940.39	204147	CATACATACACACACACACACACACACACACA--GAGTTTATGCCATTTC	204194
			||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||
AC204960.3	3551	CATACATACACACACACACACACACACACACACAGAGTTTATGCCATTTC	3600

skip 1758 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AC024940.39 - 205952 bps
Hit
AC204960.3 - 37543 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 5356 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link