<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 83 bps / non-identical: 50 bps

Full alignment

AC154775.2	73497	TCTCTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC	73546
			||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
AC156014.2	1397	TCTGTCTATCTATCTATCTATCT-TCTATCTATCTATCTATCTATCTATC	1445

AC154775.2	73547	TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCT	73579
			|||||||||||||||||||||||||||||||||
AC156014.2	1446	TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCT	1478

Compact alignment

AC154775.2	73497	TCTCTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC	73546
			||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
AC156014.2	1397	TCTGTCTATCTATCTATCTATCT-TCTATCTATCTATCTATCTATCTATC	1445

skip 33 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AC154775.2 - 192492 bps
Hit
AC156014.2 - 194272 bps
Total alignments
142
Best alignment
alignment #1 (HSP: 83 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
197.56578373497735791139714781
2100354789910899561142014661
390.22262380170471170850-1171720941
495.1933839535353929-1172121151
581.1572191102660102850-1416743571
689.7436253591934924681738379181
785.072073855433554719-1738477651
886.361632871398001400861738476691
989.923525152120121715-1738579001
1089.613104558638786841-1740478551
1188.153285081012801017871740479181
1282.52445231462161467381740679251
1385.19159303139782140084111292115951
1487.48396655101242101896111294119561
1592.0694512719192593195111299125691
1689.553846580395049100851111305171781
1789.613224758638786861-111312117831
1889.343435152120121715-111313118281
1984.562343877818478570-111313117201
2081.99378835146216147050111334121711
2178.52451346472364856111393115271
2279.3142115102618102732-111412115271
2376.44190670101898102567-111532122101
2474.612578696490765775111533124261
2575.3876330171856172185-112264125961
2682.392325059136591869112265127811
2791.4984612059319694400-112595138041
2894.8765782987829955117838179151
2986.9168011159504796161119226203551
3085.19159300139785140084119228195241
3191.1280911139192593037119230203551
3289.893525152120121715-119244197571
3385.532413827818478565-119249196491
3492.83624638638786849-119255197121
3590.33436625101272101896119255198851
3682.51406850146207147056119256201181
3772.5130210406472465763119323203551
3879.192577216834969069119463202021
3991.1836697349373561121878219451
4097.8735478991089956121886219321
4188.02135216131190131405-133607338231
4278.8139118173067173184-133994341111
4387.7826241435213934138092385001
4485.35223392170457170848138109384971
4593.6316401101261101661-141768421731
4691.43014128645186862141769421751
4788.312524039193092332-141778421791
4887.622413972131921715141778421731
4989.842223277820378529141787421111
5084.05141285139800140084-141893421741
5174.9126789160556945146985478611
5276.761063719260592975147914482831
5396.623058124197124254-152527525851
5498.213156153001153056-152535525901
5598.213156160603160658152535525901
5689.68103157107041107197-158222583761
5792.9656712988529955-158299583691
581003050152999153048162624626731
5998.2530577617276228-165860659161
6010030555237852432-165862659161
6189.253816583295056100887-172067779671
6275.98220939168850169788175002759711
6374.6744224161746161969-175391756151
6492.2387112059319694400175476766851
6585.32561099486894976-176013761211
6679.371363879439594781-176130765121
6781.432175059136591869-176499770151
6891.6793112749192293195-176711779821
6982.58144309131109131417176772770811
7074.842648696490765775-176854777471
7177.662357276834969075-177013777461
7276.88188666101898102563177070777441
7381.26362841146216147056-177103779451
7487.5381625101272101896-177324779551
7588.443335192120121719177452779701
7689.543134638638786849177497779551
7783.972333987818478581177560779771
7877.94431356472264856-177752778871
7978.4539115102618102732177752778671
8091.3649817349373573-178799788791
8110035478991089956-178809788551
8279.06841669192592090-179777799241
8386.0843795455954637179777798551
8472.3952154139786139939-179794799271
8510036492557125619-195616956641
8684.453577259582496548-11013291020551
8785.56200394658256621811013301017171
8872.6631265160787161051-11014661017321
8981.261683236545365775-11017051020561
9091.21351906888669075-11018641020561
9195.1584103146954147056-11019541020561
9289.643867580395049100851-11062371121111
9391.988631205931969440011096121108211
9482.392325059136591869-11106351111511
9591.6893912719192593195-11108471121211
9674.52548696490765775-11109901118831
9776.4419167010189810256711112061118841
9881.99379835146216147050-11112451120821
9987.41398661101236101896-11114601121261
10089.53346515212012171511115881121031
10189.83326475863878686111116331121041
10285.29236387781847857011116961121031
10384.54159309139776140084-11118211121241
10479.26481346472364856-11118891120231
10579.314211510261810273211118891120041
10698.5347682555525622-11124621125291
10779.734731158646186577511134591146321
10876.717564514641214705611137431143861
10978.6335987921549314011137491147201
11081.43134309131109131417-11144081147141
11174.13145505913659186911144741149331
11270.71343986582166218-11146201149571
11394.341221579419294348-11147991149571
11489.3289313519504996399-11149571163131
11593.79101412719192593195-11150421163131
11671.5127910546472265775-11151861162241
11778.862527276834969075-11153451160821
11882.13392850146207147056-11154351162901
11979.47972555400554259-11156311158931
12087.03391641101256101896-11156571163111
12188.61341523212012172311157841163101
12288.99312463863878684911158291162911
12386.75168286139798140083-11160221163081
12477.15311046818768290-11160961162001
12588.151252116958169791-11163211165311
12692.743093983535393211298861302841
12787.6624939217045717084811298871302831
12876.6712346918190118236911302841307631
12994.3257887349373580-11336231337101
13098.1838558991089964-11336361336901
13177695240098160100559-11518051541911
13292.723114159192592339-11596861600971
13387.94254418101241101658-11596861601081
13487.47247408213122171911596861600921
13586.62394089505695463-11596871600891
13683.13194411146183146593-11596951601031
13785.81162308139779140086-11598061601081
13892.444787350173578-11637521638301
13910035478991089956-11637841638301
14080.03275758680576881411866271873771
14184.8912542534965699910211900561925761
14286.265239789319694173-11900581910391
Short-link