<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 3330 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  CR956641.9	202624	GAATTCTTCTCATTGTTTATTTAATGAGTAAACCAGATCAAAGCGTGATG	202575
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	161807	GAATTCTTCTCATTGTTTATTTAATGAGTAAACCAGATCAAAGCGTGATG	161856

C  CR956641.9	202574	AATAATATAGTAACTCTGTCTTGAGAAGTTGAAATCCATTATTTTGGTCT	202525
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	161857	AATAATATAGTAACTCTGTCTTGAGAAGTTGAAATCCATTATTTTGGTCT	161906

C  CR956641.9	202524	TCTCTGTCTTTTCCTAGGTGCCTTTCTTTCTCTTCAACTTCATATATGCA	202475
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	161907	TCTCTGTCTTTTCCTAGGTGCCTTTCTTTCTCTTCAACTTCATATATGCA	161956

C  CR956641.9	202474	TGTGTTAATTTCTCATACTAATAAACTTGAACTTTGATTCATACTTGTTG	202425
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	161957	TGTGTTAATTTCTCATACTAATAAACTTGAACTTTGATTCATACTTGTTG	162006

C  CR956641.9	202424	TCTTTAATTTATTTTCTTTCAATGTCAAGAGTCTCATCTTCACTTAAGTA	202375
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162007	TCTTTAATTTATTTTCTTTCAATGTCAAGAGTCTCATCTTCACTTAAGTA	162056

C  CR956641.9	202374	TAGGTTTCTTGTAAATTACACTTTTATTTCCTCCGATGATAAGATAAGAT	202325
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162057	TAGGTTTCTTGTAAATTACACTTTTATTTCCTCCGATGATAAGATAAGAT	162106

C  CR956641.9	202324	AACAACTGGACACAAGCTGGGGTAATACATGGTTTTGGACTGAAACCAGA	202275
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162107	AACAACTGGACACAAGCTGGGGTAATACATGGTTTTGGACTGAAACCAGA	162156

C  CR956641.9	202274	GCATGTCCTCTTTTCTAATGATTGCTAAGCCTAGGCCTGAAAGCTTCCAG	202225
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162157	GCATGTCCTCTTTTCTAATGATTGCTAAGCCTAGGCCTGAAAGCTTCCAG	162206

C  CR956641.9	202224	CCTCCACACAATCTAGTCTCCCATGCTGACAGGTTCAATCTGGTTTCTCT	202175
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162207	CCTCCACACAATCTAGTCTCCCATGCTGACAGGTTCAATCTGGTTTCTCT	162256

C  CR956641.9	202174	CAACTTCTGACTGAATTGCTTTGTTAGCCTCATTCTAACTTTGGCAATTT	202125
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162257	CAACTTCTGACTGAATTGCTTTGTTAGCCTCATTCTAACTTTGGCAATTT	162306

C  CR956641.9	202124	TTTTCCTAATCTTCTGGATCCTTCTCATTTCCAGGGCAGTTCTGTCTACA	202075
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162307	TTTTCCTAATCTTCTGGATCCTTCTCATTTCCAGGGCAGTTCTGTCTACA	162356

C  CR956641.9	202074	CTTGTGTCCTGTATGTTCTCTCTGTAATCTAACTTTGTAAAACTGTTCTG	202025
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162357	CTTGTGTCCTGTATGTTCTCTCTGTAATCTAACTTTGTAAAACTGTTCTG	162406

C  CR956641.9	202024	GTAAAACTGCAATACACACACCGCATACCACACCACACTTTCTCTCTTGC	201975
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162407	GTAAAACTGCAATACACACACCGCATACCACACCACACTTTCTCTCTTGC	162456

C  CR956641.9	201974	TGATGTTCTCATGAGAGTTGGGCGTATCCTATTTCTGACTTGTTCTATCA	201925
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162457	TGATGTTCTCATGAGAGTTGGGCGTATCCTATTTCTGACTTGTTCTATCA	162506

C  CR956641.9	201924	GATCTTTCTCTAATTAATCATTTTGTCTGGCCGTCAATAAGATATTGCTT	201875
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162507	GATCTTTCTCTAATTAATCATTTTGTCTGGCCGTCAATAAGATATTGCTT	162556

C  CR956641.9	201874	TCAAACATGGTTCCTTATTTCTACAAACATTACTTCATTGTTAGATCTGG	201825
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162557	TCAAACATGGTTCCTTATTTCTACAAACATTACTTCATTGTTAGATCTGG	162606

C  CR956641.9	201824	CAGGATTTTCCCTGTCCAATTCAATTAAAATATTAGTACAGTAAGAGGCC	201775
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162607	CAGGATTTTCCCTGTCCAATTCAATTAAAATATTAGTACAGTAAGAGGCC	162656

C  CR956641.9	201774	TGTGATTAAATGAGAAAAATGGAGGTAGCAGAAAGAGTTGCATGGACAGA	201725
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162657	TGTGATTAAATGAGAAAAATGGAGGTAGCAGAAAGAGTTGCATGGACAGA	162706

C  CR956641.9	201724	GAGCAACTCAAAGGAGAGGAAGAAGCCAAGATAGAAGTGGACAGACACAT	201675
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162707	GAGCAACTCAAAGGAGAGGAAGAAGCCAAGATAGAAGTGGACAGACACAT	162756

C  CR956641.9	201674	AAATAGCCACAGGTAGTTATGAATATCATTTAGGCATAGAATAGCCGGAC	201625
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162757	AAATAGCCACAGGTAGTTATGAATATCATTTAGGCATAGAATAGCCGGAC	162806

C  CR956641.9	201624	GGTGGTAGTACACGCCTTAAATCCCAGCACTTGGGTGGCAGAGGCAGGCA	201575
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162807	GGTGGTAGTACACGCCTTAAATCCCAGCACTTGGGTGGCAGAGGCAGGCA	162856

C  CR956641.9	201574	GAATTCTGAGTTCAAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAG	201525
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162857	GAATTCTGAGTTCAAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAG	162906

C  CR956641.9	201524	GCTACACAGAGAAACCCTGTCAAAAAAAAAGCATAAAGAGATAGAATAAT	201475
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162907	GCTACACAGAGAAACCCTGTCAAAAAAAAAGCATAAAGAGATAGAATAAT	162956

C  CR956641.9	201474	TGCATGTGTCTGATCTTGGTGGGCAGCTTGTATCATTATCAATTAGCTCT	201425
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	162957	TGCATGTGTCTGATCTTGGTGGGCAGCTTGTATCATTATCAATTAGCTCT	163006

C  CR956641.9	201424	GAAAATATTGTGTGGGTATCTTGTGCATTGAGAATTTATTAATATATAAA	201375
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163007	GAAAATATTGTGTGGGTATCTTGTGCATTGAGAATTTATTAATATATAAA	163056

C  CR956641.9	201374	TCTGTCTTGTAAATTATAAACTTCTAGAGTTTGTTTCTACCGGGTGGATG	201325
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163057	TCTGTCTTGTAAATTATAAACTTCTAGAGTTTGTTTCTACCGGGTGGATG	163106

C  CR956641.9	201324	GGTGTTGTAGCAGCTGACTGTGGGGAGGATGGTTGTTGTATGGGTCTCCA	201275
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163107	GGTGTTGTAGCAGCTGACTGTGGGGAGGATGGTTGTTGTATGGGTCTCCA	163156

C  CR956641.9	201274	TGGCAGTGAAAGGAACTCGGGAGCTCCAAGCACTGCAGGAGAGTTGGCAG	201225
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163157	TGGCAGTGAAAGGAACTCGGGAGCTCCAAGCACTGCAGGAGAGTTGGCAG	163206

C  CR956641.9	201224	GCAGACAGTAGCTGGACGGAGCACAGGAACTTGGAGGTTCTACTATATAT	201175
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163207	GCAGACAGTAGCTGGACGGAGCACAGGAACTTGGAGGTTCTACTATATAT	163256

C  CR956641.9	201174	CCCTCAACAGTCATAGACAAAAGGTATGTAGTAAGGGTGTGTCTGCATTC	201125
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163257	CCCTCAACAGTCATAGACAAAAGGTATGTAGTAAGGGTGTGTCTGCATTC	163306

C  CR956641.9	201124	AAGCTGGATTGTATCTTTGGATATGATCCCTTGCCACAACAGCAATGGTG	201075
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163307	AAGCTGGATTGTATCTTTGGATATGATCCCTTGCCACAACAGCAATGGTG	163356

C  CR956641.9	201074	CTGGATTAAAATTTCTAAACAGAAGTCCTTACACATGCAGCATGGAGCAG	201025
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163357	CTGGATTAAAATTTCTAAACAGAAGTCCTTACACATGCAGCATGGAGCAG	163406

C  CR956641.9	201024	TCTCTACCCTACATCAAACTGGGTCTGCCACTATTCCTGCTGACCAGAAG	200975
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163407	TCTCTACCCTACATCAAACTGGGTCTGCCACTATTCCTGCTGACCAGAAG	163456

C  CR956641.9	200974	GACTCTCTGAAACAACGTTGGCCAGGTTGCTTGGCTATCACTGAGCTGCT	200925
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163457	GACTCTCTGAAACAACGTTGGCCAGGTTGCTTGGCTATCACTGAGCTGCT	163506

C  CR956641.9	200924	CCTTTGCTTTGCCTGTCACCTCCAACCTTCCGCTTCACCATCTGAAGATC	200875
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163507	CCTTTGCTTTGCCTGTCACCTCCAACCTTCCGCTTCACCATCTGAAGATC	163556

C  CR956641.9	200874	CACAGAGTGGATTGTTTTATTTTTGTGGTTGTTTTATCTGAATATATGCT	200825
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163557	CACAGAGTGGATTGTTTTATTTTTGTGGTTGTTTTATCTGAATATATGCT	163606

C  CR956641.9	200824	TGTCTCTGTAACACTCATATGCCTAGTGTCCATGAGTGACAGAGGAGGGT	200775
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163607	TGTCTCTGTAACACTCATATGCCTAGTGTCCATGAGTGACAGAGGAGGGT	163656

C  CR956641.9	200774	CTCGGGTCCCCTGGAACTGGGGTTACAGACAGCTGGCTTCTATCATGGAG	200725
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163657	CTCGGGTCCCCTGGAACTGGGGTTACAGACAGCTGGCTTCTATCATGGAG	163706

C  CR956641.9	200724	CCATTGGAAACCAAACACAGTTTCCCTGGAATAACAACCAGTGCTCTTAA	200675
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163707	CCATTGGAAACCAAACACAGTTTCCCTGGAATAACAACCAGTGCTCTTAA	163756

C  CR956641.9	200674	CAAATAACAAGTACCAAGTTTTCCTAACAACTGAGCTATCTTTCTGCCCT	200625
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163757	CAAATAACAAGTACCAAGTTTTCCTAACAACTGAGCTATCTTTCTGCCCT	163806

C  CR956641.9	200624	TTAATTGTGTTTGTGTGTGTGTGCTTATGTGTATGTTTGTGTTGTATATA	200575
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163807	TTAATTGTGTTTGTGTGTGTGTGCTTATGTGTATGTTTGTGTTGTATATA	163856

C  CR956641.9	200574	TGTCTCCCTCTGTGTATGTCAGTATGTATAAGGGAAAAAGAGAGAGAGAG	200525
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163857	TGTCTCCCTCTGTGTATGTCAGTATGTATAAGGGAAAAAGAGAGAGAGAG	163906

C  CR956641.9	200524	AAGAGAGAGAAATGGGAGATGAGTGTTTGTGCACAACAATATAGGGCCCT	200475
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163907	AAGAGAGAGAAATGGGAGATGAGTGTTTGTGCACAACAATATAGGGCCCT	163956

C  CR956641.9	200474	TGTAGGGTAGAATGCAGTGGAGCCCTAGGAACTGGCAGTTTAAACTTCCT	200425
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	163957	TGTAGGGTAGAATGCAGTGGAGCCCTAGGAACTGGCAGTTTAAACTTCCT	164006

C  CR956641.9	200424	TATTAAGCATGCTGAGAACCAAACTCAGATTCTCAGGAACTGCTCTTCAC	200375
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164007	TATTAAGCATGCTGAGAACCAAACTCAGATTCTCAGGAACTGCTCTTCAC	164056

C  CR956641.9	200374	CACTGAACCATCTCTCTGACTCTTTGACTCAGAACTAGACTACATAGTTT	200325
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164057	CACTGAACCATCTCTCTGACTCTTTGACTCAGAACTAGACTACATAGTTT	164106

C  CR956641.9	200324	TCTAACACTTCCAAATTGGAGTGAGAGGCACATTGGTTTTATAAGAGAAT	200275
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164107	TCTAACACTTCCAAATTGGAGTGAGAGGCACATTGGTTTTATAAGAGAAT	164156

C  CR956641.9	200274	AATTAGCTTCTGGGAACTAGAAATCACTACAACTTGCCTTCTCACCCAGA	200225
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164157	AATTAGCTTCTGGGAACTAGAAATCACTACAACTTGCCTTCTCACCCAGA	164206

C  CR956641.9	200224	CCAAATATTGGGCATAGAATCTTGGGAGTAGTGTTTGGGTACTAGTTTCC	200175
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164207	CCAAATATTGGGCATAGAATCTTGGGAGTAGTGTTTGGGTACTAGTTTCC	164256

C  CR956641.9	200174	TTAACCAGACCCATGTCCTCTTTGTCCTGTTCACAAGTCCTCCTGAGTCC	200125
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164257	TTAACCAGACCCATGTCCTCTTTGTCCTGTTCACAAGTCCTCCTGAGTCC	164306

C  CR956641.9	200124	TGGCACAGGGGGCAATAAGTCAGTAATTCTTCATCAGTTCATGGGAAAAT	200075
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164307	TGGCACAGGGGGCAATAAGTCAGTAATTCTTCATCAGTTCATGGGAAAAT	164356

C  CR956641.9	200074	GCCCAAACATACTTAGGTTTAGTTAGATCTCAAAAATAAATATGTTCATG	200025
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164357	GCCCAAACATACTTAGGTTTAGTTAGATCTCAAAAATAAATATGTTCATG	164406

C  CR956641.9	200024	TGTATAGTATCTATTTATATTAACTGTATTAGGAACTGGAAGTTTTAAGA	199975
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164407	TGTATAGTATCTATTTATATTAACTGTATTAGGAACTGGAAGTTTTAAGA	164456

C  CR956641.9	199974	TATTTACTTCACTAAAGACATTATCAAATAACTATAACCTGAGGTTAAAA	199925
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164457	TATTTACTTCACTAAAGACATTATCAAATAACTATAACCTGAGGTTAAAA	164506

C  CR956641.9	199924	AGTGGGACTCGGTGACCCAGGGCCATCATGATAGTTATTCTTGACTGTCA	199875
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164507	AGTGGGACTCGGTGACCCAGGGCCATCATGATAGTTATTCTTGACTGTCA	164556

C  CR956641.9	199874	AAGTTACATCAGAAATTAACTGAAACCCATCCTCTTCTTCCTCTTCTTTC	199825
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164557	AAGTTACATCAGAAATTAACTGAAACCCATCCTCTTCTTCCTCTTCTTTC	164606

C  CR956641.9	199824	TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTTTCTTCTTCTTTCTTCTTTCTC	199775
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164607	TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTTTCTTCTTCTTTCTTCTTTCTC	164656

C  CR956641.9	199774	TTCCTCTTCTTCCTCTTCTTCCTTGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT	199725
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164657	TTCCTCTTCTTCCTCTTCTTCCTTGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT	164706

C  CR956641.9	199724	CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCT	199675
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164707	CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCT	164756

C  CR956641.9	199674	TCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC	199625
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164757	TCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC	164806

C  CR956641.9	199624	TCCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTTTTTCTTCTCTAAATCTTTAGTTGGAAA	199575
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164807	TCCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTTTTTCTTCTCTAAATCTTTAGTTGGAAA	164856

C  CR956641.9	199574	GACATAGTTTTTATTTAACTTTTTATTGATTCATTCTGAATTTTACATAA	199525
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164857	GACATAGTTTTTATTTAACTTTTTATTGATTCATTCTGAATTTTACATAA	164906

C  CR956641.9	199524	TGAACCCCAATCTCATTCACCTCCTGTCCCTCCATACCCACCCTCTTTCC	199475
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164907	TGAACCCCAATCTCATTCACCTCCTGTCCCTCCATACCCACCCTCTTTCC	164956

C  CR956641.9	199474	TTGCAAACTCTCACTCCTAAAAGAAAAAGGCAGAAAGAAGCTAATTGTGG	199425
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	164957	TTGCAAACTCTCACTCCTAAAAGAAAAAGGCAGAAAGAAGCTAATTGTGG	165006

C  CR956641.9	199424	AAACTGTAGTGTATCACAATGTGTCTCAAGGTATATTTGTCTACATTTCT	199375
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	165007	AAACTGTAGTGTATCACAATGTGTCTCAAGGTATATTTGTCTACATTTCT	165056

C  CR956641.9	199374	TTATTTACAATATTTCATTGGAATGCGTCATTAGTCTAGGTCAAAGGCTC	199325
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	165057	TTATTTACAATATTTCATTGGAATGCGTCATTAGTCTAGGTCAAAGGCTC	165106

C  CR956641.9	199324	TGTCTTCTACTACACTATCAAAACTGGATC	199295
			||||||||||||||||||||||||||||||
  AC154819.2	165107	TGTCTTCTACTACACTATCAAAACTGGATC	165136

Overview

Query
CR956641.9 - 202624 bps
Hit
AC154819.2 - 165136 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 3330 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
110003330199295202624-11618071651361
Short-link