<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2643 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
C AC152943.1 198492 AATTCTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAGAAGCACCTGAAAAAATGT 198443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 187899 AATTCTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAGAAGCACCTGAAAAAATGT 187948 C AC152943.1 198442 TCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATT 198393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 187949 TCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATT 187998 C AC152943.1 198392 CCACCTCACACCAGTCAGAATGTCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCA 198343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 187999 CCACCTCACACCAGTCAGAATGTCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCA 188048 C AC152943.1 198342 GATGCTGGCGTGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGG 198293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188049 GATGCTGGCGTGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGG 188098 C AC152943.1 198292 GATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCAGTTCCTCAG 198243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188099 GATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCAGTTCCTCAG 188148 C AC152943.1 198242 AAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCACTCCTGGGCA 198193 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188149 AAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCACTCCTGGGCA 188198 C AC152943.1 198192 TATATCCAGAAGATGCCCCAACTGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATG 198143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188199 TATATCCAGAAGATGCCCCAACTGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATG 188248 C AC152943.1 198142 TTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGATG 198093 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188249 TTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGATG 188298 C AC152943.1 198092 CCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACAATGG 198043 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188299 CCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACAATGG 188348 C AC152943.1 198042 AGTACTACTCAGCTGTTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGGCAAA 197993 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188349 AGTACTACTCAGCTGTTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGGCAAA 188398 C AC152943.1 197992 TGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACATTCACAAAG 197943 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188399 TGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACATTCACAAAG 188448 C AC152943.1 197942 GAACTCACACAATATGTACTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCCAAACCT 197893 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188449 GAACTCACACAATATGTACTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCCAAACCT 188498 C AC152943.1 197892 AGGATACCCAAGATATAAGATACAATTTGCTAAACACATGAAACTCAAGA 197843 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188499 AGGATACCCAAGATATAAGATACAATTTGCTAAACACATGAAACTCAAGA 188548 C AC152943.1 197842 AGAATGAAGACTGAAGTGTGGACACTATGCCCCTCCTTAGAATTGGGAAC 197793 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188549 AGAATGAAGACTGAAGTGTGGACACTATGCCCCTCCTTAGAATTGGGAAC 188598 C AC152943.1 197792 AAAACACCCATGGAAGGAGTTACAAAGACAAAGTTTGGAGCTGAGATGAA 197743 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188599 AAAACACCCATGGAAGGAGTTACAAAGACAAAGTTTGGAGCTGAGATGAA 188648 C AC152943.1 197742 AGGATGGACCATGTAGAGACTGCCATATCCAGGGATCCACCCCATAATCA 197693 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188649 AGGATGGACCATGTAGAGACTGCCATATCCAGGGATCCACCCCATAATCA 188698 C AC152943.1 197692 GCATCCAAACGCTGACACCATTGCATATACTAGCAAGATTTTATTGAAAG 197643 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188699 GCATCCAAACGCTGACACCATTGCATATACTAGCAAGATTTTATTGAAAG 188748 C AC152943.1 197642 GACCCAGATGTAGCTGTCTCTTGTGAGACTATGCTGGGGCCTAGCAAACA 197593 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188749 GACCCAGATGTAGCTGTCTCTTGTGAGACTATGCTGGGGCCTAGCAAACA 188798 C AC152943.1 197592 CAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTAATGGATGGATCACAGGGCTCCCAA 197543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188799 CAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTAATGGATGGATCACAGGGCTCCCAA 188848 C AC152943.1 197542 TGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTAAAGGGATCTGCAACCCTA 197493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188849 TGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTAAAGGGATCTGCAACCCTA 188898 C AC152943.1 197492 TAGGTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTACCCCGGAGCTCTTGACTCT 197443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188899 TAGGTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTACCCCGGAGCTCTTGACTCT 188948 C AC152943.1 197442 AGCTGCATATGTATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGGAAAGAGA 197393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188949 AGCTGCATATGTATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGGAAAGAGA 188998 C AC152943.1 197392 GGCCCATTGGACTTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAATGCCAG 197343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 188999 GGCCCATTGGACTTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAATGCCAG 189048 C AC152943.1 197342 GGCCAAAAAGGGGGAGTGGGTGGGTAGTGGAGTGGGGGTGGGTGGGTATG 197293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189049 GGCCAAAAAGGGGGAGTGGGTGGGTAGTGGAGTGGGGGTGGGTGGGTATG 189098 C AC152943.1 197292 GGGGACTTTTGGTATAGCATTGGAAATGTAAATGAGCTAAATACCTAATA 197243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189099 GGGGACTTTTGGTATAGCATTGGAAATGTAAATGAGCTAAATACCTAATA 189148 C AC152943.1 197242 AAAAATGGAAAAAAAAAGTTGAAAGTTTGAAAAGCACAGTGTTACGACTG 197193 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189149 AAAAATGGAAAAAAAAAGTTGAAAGTTTGAAAAGCACAGTGTTACGACTG 189198 C AC152943.1 197192 GTGAATGAGAAGAGCCAATTAATGCTTTAGATATTTGCACTGTGCTGGGC 197143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189199 GTGAATGAGAAGAGCCAATTAATGCTTTAGATATTTGCACTGTGCTGGGC 189248 C AC152943.1 197142 AGTGGTGGTACACACCTTTAACCCCAGCAGTGGCAGAGTCGGGTGGATCC 197093 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189249 AGTGGTGGTACACACCTTTAACCCCAGCAGTGGCAGAGTCGGGTGGATCC 189298 C AC152943.1 197092 CTGTGTGTTCGAGGCTAGCTGGGTCTACAGAGTCAGTTCCAGGGCAGTCA 197043 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189299 CTGTGTGTTCGAGGCTAGCTGGGTCTACAGAGTCAGTTCCAGGGCAGTCA 189348 C AC152943.1 197042 GGGCTATGTATTAAGATCCTATCTTGAAAGAAAGAAAAAAGAAAAAAACC 196993 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189349 GGGCTATGTATTAAGATCCTATCTTGAAAGAAAGAAAAAAGAAAAAAACC 189398 C AC152943.1 196992 TTGCACTGTATCTTTCTGGGGTTCAGGAAGCAAGCTCACCAGCACACACA 196943 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189399 TTGCACTGTATCTTTCTGGGGTTCAGGAAGCAAGCTCACCAGCACACACA 189448 C AC152943.1 196942 CACACACATGCACACACACACACACACACACACACACACATGCACACATG 196893 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189449 CACACACATGCACACACACACACACACACACACACACACATGCACACATG 189498 C AC152943.1 196892 CACACACACACACACACACACACACACATGCACACACACACACACACACA 196843 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189499 CACACACACACACACACACACACACACATGCACACACACACACACACACA 189548 C AC152943.1 196842 CACACATGCACACACACACACACACACACACACATGCACACACACACACA 196793 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189549 CACACATGCACACACACACACACACACACACACATGCACACACACACACA 189598 C AC152943.1 196792 CACACACACACACACATGCACACACACACACACACACATGCACACACACA 196743 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189599 CACACACACACACACATGCACACACACACACACACACATGCACACACACA 189648 C AC152943.1 196742 CACACACACACACACACACACATGCACACACACACACACACACACACACA 196693 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189649 CACACACACACACACACACACATGCACACACACACACACACACACACACA 189698 C AC152943.1 196692 CACACACACAGCCTTGTTCTCCTTTCTTAGCTGAACTCCTAAAATTCTTT 196643 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189699 CACACACACAGCCTTGTTCTCCTTTCTTAGCTGAACTCCTAAAATTCTTT 189748 C AC152943.1 196642 GTGTTTCCTAATTGGAGTGTCTTGTTATTTATAACAAGCTCCCAGTCTCC 196593 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189749 GTGTTTCCTAATTGGAGTGTCTTGTTATTTATAACAAGCTCCCAGTCTCC 189798 C AC152943.1 196592 AGCTGGAAGATTCCTCACTAGAAAGACTCACAGAACTCTGCCCTGGGTTT 196543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189799 AGCTGGAAGATTCCTCACTAGAAAGACTCACAGAACTCTGCCCTGGGTTT 189848 C AC152943.1 196542 TATTGAGGACATAACTCAGGAACAGTCAAATGGAAAGCTAAGGGAAAAAG 196493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189849 TATTGAGGACATAACTCAGGAACAGTCAAATGGAAAGCTAAGGGAAAAAG 189898 C AC152943.1 196492 GACAATGGTGCAGCAGACAGAGATCCTGTGCCCTCCACGTACCCCTGCCT 196443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189899 GACAATGGTGCAGCAGACAGAGATCCTGTGCCCTCCACGTACCCCTGCCT 189948 C AC152943.1 196442 GGCATAGTACGTGGTACTATTCAAGAAAAAAAATGAAAATCCTGCATTCT 196393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189949 GGCATAGTACGTGGTACTATTCAAGAAAAAAAATGAAAATCCTGCATTCT 189998 C AC152943.1 196392 TTCAGGCCTTTGGAGATCCTGTCCATCCCCTCTTTTGGAGACCCCCTCTA 196343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 189999 TTCAGGCCTTTGGAGATCCTGTCCATCCCCTCTTTTGGAGACCCCCTCTA 190048 C AC152943.1 196342 CCCTCTTCTCACACTGAAGTCAAAGGCATGGAGATGGTCAGGAAGTGACC 196293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 190049 CCCTCTTCTCACACTGAAGTCAAAGGCATGGAGATGGTCAGGAAGTGACC 190098 C AC152943.1 196292 TGGGCAGCCGCCTCACAGCTAGGACAGAATGGCTGTCAGAACCCAAGGCT 196243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 190099 TGGGCAGCCGCCTCACAGCTAGGACAGAATGGCTGTCAGAACCCAAGGCT 190148 C AC152943.1 196242 ATTGCCCCCCAGATCAGTTGTGGAGGTCCCCCCCCCAGAATATATACCTC 196193 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 190149 ATTGCCCCCCAGATCAGTTGTGGAGGTCCCCCCCCCAGAATATATACCTC 190198 C AC152943.1 196192 TCTGATGTGGAGTTCAGACAATGGCCTTGAGCCAGTAGTCTGTGAGAGCA 196143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 190199 TCTGATGTGGAGTTCAGACAATGGCCTTGAGCCAGTAGTCTGTGAGAGCA 190248 C AC152943.1 196142 AGCGGAGCTCCCACGCTAACAAAAAAATCACTACAAAGCCAGCGCTGTGC 196093 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 190249 AGCGGAGCTCCCACGCTAACAAAAAAATCACTACAAAGCCAGCGCTGTGC 190298 C AC152943.1 196092 ATTTTCTTCCTTTCTTTTTAAAGATTTATTTGTATTTATGTGCCTGTGTG 196043 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 190299 ATTTTCTTCCTTTCTTTTTAAAGATTTATTTGTATTTATGTGCCTGTGTG 190348 C AC152943.1 196042 TTGGTGGATGCCTGCTAAGGCCAGAAGACAGAGTCAGAGCTGGAGCTGGA 195993 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 190349 TTGGTGGATGCCTGCTAAGGCCAGAAGACAGAGTCAGAGCTGGAGCTGGA 190398 C AC152943.1 195992 GTTACAGGTGGTTGTGAGCCACCAGACACGAATGCTAGGAACTGAACTTG 195943 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 190399 GTTACAGGTGGTTGTGAGCCACCAGACACGAATGCTAGGAACTGAACTTG 190448 C AC152943.1 195942 GTTCTCTGCAAGAGCAACAAGCACCCTTTAGCTGCTAAGCCAGCTCGCCA 195893 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 190449 GTTCTCTGCAAGAGCAACAAGCACCCTTTAGCTGCTAAGCCAGCTCGCCA 190498 C AC152943.1 195892 GCCCAGTTACCTCACTTCACATGTGATTTGTGATTATGGAATT 195850 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AC153841.1 190499 GCCCAGTTACCTCACTTCACATGTGATTTGTGATTATGGAATT 190541
