<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 5843 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CT009615.13	1	AAGCTTCATCCTTTTGTGGGAAGGGAAGAGCAAGTAGAGCGCGTGATTCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	104325	AAGCTTCATCCTTTTGTGGGAAGGGAAGAGCAAGTAGAGCGCGTGATTCA	104374

CT009615.13	51	AATAATTTGTAGAAGGATGAAAAACAACCCTTGCCTTGTTGGAGAACCTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	104375	AATAATTTGTAGAAGGATGAAAAACAACCCTTGCCTTGTTGGAGAACCTG	104424

CT009615.13	101	GAGTAGGGAAAACATCAATCATACAAGGTCTTGCTCAGAGAATTTTGAGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	104425	GAGTAGGGAAAACATCAATCATACAAGGTCTTGCTCAGAGAATTTTGAGC	104474

CT009615.13	151	GGATCTGTTCCTGAAAAACTCAAGGGGAAAAAGGTAAGTGCTACTAGTAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	104475	GGATCTGTTCCTGAAAAACTCAAGGGGAAAAAGGTAAGTGCTACTAGTAC	104524

CT009615.13	201	TATAAACCTATTCGTTACTAGTGCTAGTTTTATGATTGGCATGAGAAGAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	104525	TATAAACCTATTCGTTACTAGTGCTAGTTTTATGATTGGCATGAGAAGAA	104574

CT009615.13	251	AGATTATGCAGCATATTCATTTCCACTTATTTTATTTTTCAGGTGGTTGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	104575	AGATTATGCAGCATATTCATTTCCACTTATTTTATTTTTCAGGTGGTTGC	104624

CT009615.13	301	ATTGGATGTGGCTGATTTTTTATATGTAATATCAAATCAAGGATCTTCCG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	104625	ATTGGATGTGGCTGATTTTTTATATGTAATATCAAATCAAGGATCTTCCG	104674

CT009615.13	351	AGGAAAGAATCAGGTGTTTAATCAAGGAAATTGAACTATGTGGTAATGTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	104675	AGGAAAGAATCAGGTGTTTAATCAAGGAAATTGAACTATGTGGTAATGTG	104724

CT009615.13	401	ATACTTTTTGTTAAAGAAGTTCATCACATATTTGATGCAGCAACATCAGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	104725	ATACTTTTTGTTAAAGAAGTTCATCACATATTTGATGCAGCAACATCAGG	104774

CT009615.13	451	AGCCCGTAGTTTCGCATACATTTTGAAACATGCCCTTGAAAGAGGTGTAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	104775	AGCCCGTAGTTTCGCATACATTTTGAAACATGCCCTTGAAAGAGGTGTAA	104824

CT009615.13	501	TTCAAGTAAGATTTTTCTCTTGAAACTTGGTCCTTTACATTTCACACATT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	104825	TTCAAGTAAGATTTTTCTCTTGAAACTTGGTCCTTTACATTTCACACATT	104874

CT009615.13	551	AGTCCAATAATTAGTCTTATATAGTAAATAATGCAAAATCTTTGTATATA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	104875	AGTCCAATAATTAGTCTTATATAGTAAATAATGCAAAATCTTTGTATATA	104924

CT009615.13	601	GTGTATATTTGCTACAACAGTGAATGAGCACAGAATGCACATGGAAAATG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	104925	GTGTATATTTGCTACAACAGTGAATGAGCACAGAATGCACATGGAAAATG	104974

CT009615.13	651	ATACAACCTTAAAAAGAATATTTCAACCAGTTAAAGTGGTTGAACCATCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	104975	ATACAACCTTAAAAAGAATATTTCAACCAGTTAAAGTGGTTGAACCATCT	105024

CT009615.13	701	GTTGAAGAAACCATAGAAATTCTTAAAGGCCTCCGCGGAACATATGAGTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105025	GTTGAAGAAACCATAGAAATTCTTAAAGGCCTCCGCGGAACATATGAGTC	105074

CT009615.13	751	GCATTATAAACTTCATTACACAGATGAAGCTCTTGTTGCAGCTGCAAATT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105075	GCATTATAAACTTCATTACACAGATGAAGCTCTTGTTGCAGCTGCAAATT	105124

CT009615.13	801	TGTCTCAGCAATATGTAAGGTAAAAATGTGTTACTAAAATTATTATTAGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105125	TGTCTCAGCAATATGTAAGGTAAAAATGTGTTACTAAAATTATTATTAGC	105174

CT009615.13	851	GCCAATTCTACAACATATATTATAACAGAAATGAGTCTCTAGTTTTTCAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105175	GCCAATTCTACAACATATATTATAACAGAAATGAGTCTCTAGTTTTTCAC	105224

CT009615.13	901	ATATGTTTCTGCGCGAGTAAATTTCAGCGAGCGTTTCTTACCTGATAAGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105225	ATATGTTTCTGCGCGAGTAAATTTCAGCGAGCGTTTCTTACCTGATAAGG	105274

CT009615.13	951	CAATTGATTTGATTGATGAAGCTGGATCACATGTTCAACTTTGTCATGCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105275	CAATTGATTTGATTGATGAAGCTGGATCACATGTTCAACTTTGTCATGCA	105324

CT009615.13	1001	AAGGTGCGAAATGGTAATTAATATGTGATATAACTTATAATTCTCTAATG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105325	AAGGTGCGAAATGGTAATTAATATGTGATATAACTTATAATTCTCTAATG	105374

CT009615.13	1051	TTTGGATCAATCAAATGAGTATTTTTGTTGAATCCTTTTGAAACAGAACA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105375	TTTGGATCAATCAAATGAGTATTTTTGTTGAATCCTTTTGAAACAGAACA	105424

CT009615.13	1101	AAAAGAGGGGTAATGTTTCTATTCCTAGTGTGAAAAAGTGTGATATTCAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105425	AAAAGAGGGGTAATGTTTCTATTCCTAGTGTGAAAAAGTGTGATATTCAA	105474

CT009615.13	1151	CATGTTATTTCTTCTTGGATTGGAGTACCAGTCAGTGATGTATCAAAGGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105475	CATGTTATTTCTTCTTGGATTGGAGTACCAGTCAGTGATGTATCAAAGGA	105524

CT009615.13	1201	AGAAGGCGAAAATCTCCTCAACTTAGAAGACATGCTTCACAAACACGTCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105525	AGAAGGCGAAAATCTCCTCAACTTAGAAGACATGCTTCACAAACACGTCA	105574

CT009615.13	1251	TCGGTCAAAACGAAGCAATCAGCACAATCTGCCGAGCTATTCGCCGCGCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105575	TCGGTCAAAACGAAGCAATCAGCACAATCTGCCGAGCTATTCGCCGCGCT	105624

CT009615.13	1301	AGAGTCGGTCTAAGAAACTGCAGAAGGCCTATTGCAAGTTTCATGTTCAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105625	AGAGTCGGTCTAAGAAACTGCAGAAGGCCTATTGCAAGTTTCATGTTCAC	105674

CT009615.13	1351	CGGTCCCTCAGGCGTAGGAAAAACTGAATTAGCCAATGCATTAGCTACAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105675	CGGTCCCTCAGGCGTAGGAAAAACTGAATTAGCCAATGCATTAGCTACAA	105724

CT009615.13	1401	ACTATTTTGGTTCAAAAGATTCATTGATAAGATTAGATATGAGTGAGTAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105725	ACTATTTTGGTTCAAAAGATTCATTGATAAGATTAGATATGAGTGAGTAC	105774

CT009615.13	1451	ATGGATAGATACAATGTAGCTAGGTTAATTGGAGCACCTCCTGGCTATAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105775	ATGGATAGATACAATGTAGCTAGGTTAATTGGAGCACCTCCTGGCTATAT	105824

CT009615.13	1501	CGGTTTTGATGATGGCGGTCAATTAACCGAAGCTATTCGGAAAAATTCAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105825	CGGTTTTGATGATGGCGGTCAATTAACCGAAGCTATTCGGAAAAATTCAC	105874

CT009615.13	1551	ATGCAGTTGTTTTGTTTGATGAGATTGAAAAAGCACATTCAGATGTTTTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105875	ATGCAGTTGTTTTGTTTGATGAGATTGAAAAAGCACATTCAGATGTTTTC	105924

CT009615.13	1601	AACTTAATGCTACAAATTCTTGATGATGGAAGACTCACAGATGGAAAAGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105925	AACTTAATGCTACAAATTCTTGATGATGGAAGACTCACAGATGGAAAAGG	105974

CT009615.13	1651	TCAAACAGTTGACTTTAAAAGCACACTTATTATAATGACTAGCAATCTTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	105975	TCAAACAGTTGACTTTAAAAGCACACTTATTATAATGACTAGCAATCTTG	106024

CT009615.13	1701	GTAACAACATCATTGAAGGGACAAATAATGAAACTATGCAAATTATTGAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106025	GTAACAACATCATTGAAGGGACAAATAATGAAACTATGCAAATTATTGAT	106074

CT009615.13	1751	CATAAAAAGAATTTGGTTATGGAGGAGCTGAAGAATCATTTTAGACCAGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106075	CATAAAAAGAATTTGGTTATGGAGGAGCTGAAGAATCATTTTAGACCAGA	106124

CT009615.13	1801	GTTTTTGAATAGGCTTGATGAGATAATTGTTTTTAAAGAACTAACAAAAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106125	GTTTTTGAATAGGCTTGATGAGATAATTGTTTTTAAAGAACTAACAAAAT	106174

CT009615.13	1851	TGGAAGTGGAACAAATTGCAAATATAATGTTGAGAGAAGTTTGTGAAAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106175	TGGAAGTGGAACAAATTGCAAATATAATGTTGAGAGAAGTTTGTGAAAAA	106224

CT009615.13	1901	ATGATGGTTAAAGATATACATCTTTCTTTAACATGTAGGTTTAGGGATTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106225	ATGATGGTTAAAGATATACATCTTTCTTTAACATGTAGGTTTAGGGATTA	106274

CT009615.13	1951	TGTGATTCAAAATGGATATAACCCTAGCTATGGTGCAAGACCATTAAGAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106275	TGTGATTCAAAATGGATATAACCCTAGCTATGGTGCAAGACCATTAAGAA	106324

CT009615.13	2001	GGACTATTGCAAGATTTTTGGAAGATACATTGGCTGAAAAGATGTTAAGG	2050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106325	GGACTATTGCAAGATTTTTGGAAGATACATTGGCTGAAAAGATGTTAAGG	106374

CT009615.13	2051	AAAGAAATAAAGGAAGGTGACTCAGTTGTTGTTGATATCAATGTTGATGA	2100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106375	AAAGAAATAAAGGAAGGTGACTCAGTTGTTGTTGATATCAATGTTGATGA	106424

CT009615.13	2101	GGGAAATGTTGTTGTGTTGAATCAAAAAAATGTGAAAAGGGAAGATCTTT	2150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106425	GGGAAATGTTGTTGTGTTGAATCAAAAAAATGTGAAAAGGGAAGATCTTT	106474

CT009615.13	2151	TTATAAGTTTTGTTGATCATTCAGATGGTTGTGATTATTTAGTTGATGGA	2200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106475	TTATAAGTTTTGTTGATCATTCAGATGGTTGTGATTATTTAGTTGATGGA	106524

CT009615.13	2201	AAGAGAAAAGACATGGTTGGAATTTCATGCAATTTGATGGGAAAAATGTT	2250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106525	AAGAGAAAAGACATGGTTGGAATTTCATGCAATTTGATGGGAAAAATGTT	106574

CT009615.13	2251	GGACATGTTTGGACATAGAAAAAGTCCATAACTATATATATATATATATA	2300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106575	GGACATGTTTGGACATAGAAAAAGTCCATAACTATATATATATATATATA	106624

CT009615.13	2301	AGTTGCATTATTTTTTCTGTTTATTATTGCAATCAAGATTTTTCAATTTT	2350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106625	AGTTGCATTATTTTTTCTGTTTATTATTGCAATCAAGATTTTTCAATTTT	106674

CT009615.13	2351	GTATAATTTATAACTATATGGAATTTGAATGTTCTTTTAAAGAAAAGACT	2400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106675	GTATAATTTATAACTATATGGAATTTGAATGTTCTTTTAAAGAAAAGACT	106724

CT009615.13	2401	CTTCATTTATTTATTTGTCATGCATGTTCCAAAGCAACTTTACTTCACTG	2450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106725	CTTCATTTATTTATTTGTCATGCATGTTCCAAAGCAACTTTACTTCACTG	106774

CT009615.13	2451	AGAAGATAAAAAGCTATGAATTGAAGCAAGTAAGATGGATTTTTACAAGG	2500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106775	AGAAGATAAAAAGCTATGAATTGAAGCAAGTAAGATGGATTTTTACAAGG	106824

CT009615.13	2501	AATACATACAATACAATATACGGGCTGGTATGATGACCAGTATAAGAGAT	2550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106825	AATACATACAATACAATATACGGGCTGGTATGATGACCAGTATAAGAGAT	106874

CT009615.13	2551	ATGATTAAAATAATCACATATCAATATCATATGTCAGACACCAACAAGTG	2600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106875	ATGATTAAAATAATCACATATCAATATCATATGTCAGACACCAACAAGTG	106924

CT009615.13	2601	TTGAATATCTAACACATTTTCAATATAAAGTGTCGTTACTTAAAACCGTC	2650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106925	TTGAATATCTAACACATTTTCAATATAAAGTGTCGTTACTTAAAACCGTC	106974

CT009615.13	2651	TCTATGAAACTCGAAGCTTGATTCTCATAGTAAAAATAGGTCCTTAATAA	2700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	106975	TCTATGAAACTCGAAGCTTGATTCTCATAGTAAAAATAGGTCCTTAATAA	107024

CT009615.13	2701	AAAAAAAATGCACAATTTTTTTAAAAGATTAATATACTAACTATCTAAAT	2750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107025	AAAAAAAATGCACAATTTTTTTAAAAGATTAATATACTAACTATCTAAAT	107074

CT009615.13	2751	GACCAAGGATTATGCCTCTTCCATAAGAAGGGTCGAATGTAATATCATTC	2800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107075	GACCAAGGATTATGCCTCTTCCATAAGAAGGGTCGAATGTAATATCATTC	107124

CT009615.13	2801	TATTTTATTTTTCTGTTTTGAAGGATTATTTTTCTCACATTTATCACCAC	2850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107125	TATTTTATTTTTCTGTTTTGAAGGATTATTTTTCTCACATTTATCACCAC	107174

CT009615.13	2851	ATAAAAAATTCAACAACCATAATCAAATTAATGTCCCTACAAAATGGTTA	2900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107175	ATAAAAAATTCAACAACCATAATCAAATTAATGTCCCTACAAAATGGTTA	107224

CT009615.13	2901	TTAAGAAAGTTCAAACAAAAATGATTGAGTGGCACTCCAATAATGGACCT	2950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107225	TTAAGAAAGTTCAAACAAAAATGATTGAGTGGCACTCCAATAATGGACCT	107274

CT009615.13	2951	TGTCTTTCTTTCATCCTCAATTGGCGTTTGAAAGAAGGTGGAAATTTGTG	3000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107275	TGTCTTTCTTTCATCCTCAATTGGCGTTTGAAAGAAGGTGGAAATTTGTG	107324

CT009615.13	3001	GTCACAAACAAATTGTTGATATGGTAAATAGCACATACTTGAAATAGCAA	3050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107325	GTCACAAACAAATTGTTGATATGGTAAATAGCACATACTTGAAATAGCAA	107374

CT009615.13	3051	AACAAAGTTTGTTACACCCCCATGATTTTAGCTGACTAAGCCTTAGTAGT	3100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107375	AACAAAGTTTGTTACACCCCCATGATTTTAGCTGACTAAGCCTTAGTAGT	107424

CT009615.13	3101	TTTTTCCAACAGAATCTTCATTATTTCTTTCTTTGTGGGTAGGTTAAAAC	3150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107425	TTTTTCCAACAGAATCTTCATTATTTCTTTCTTTGTGGGTAGGTTAAAAC	107474

CT009615.13	3151	ATCTAAACCTTCCATCTTTCTCTCCCTTTCTATCCAAAAATCATAATTTG	3200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107475	ATCTAAACCTTCCATCTTTCTCTCCCTTTCTATCCAAAAATCATAATTTG	107524

CT009615.13	3201	GTATTTCATTTCTGAAAGAACAACTTCTTCTCGTTTTCTGCATGCCTTCT	3250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107525	GTATTTCATTTCTGAAAGAACAACTTCTTCTCGTTTTCTGCATGCCTTCT	107574

CT009615.13	3251	CACACACCTAGGTAATGTATATAATATGCAACTCTTCTAAGAAATAATTT	3300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107575	CACACACCTAGGTAATGTATATAATATGCAACTCTTCTAAGAAATAATTT	107624

CT009615.13	3301	GATTATGGTTATATTATAATTAATTCTTATTTTTCAATAATGGATGTGTA	3350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107625	GATTATGGTTATATTATAATTAATTCTTATTTTTCAATAATGGATGTGTA	107674

CT009615.13	3351	TTTGATTTCTTGTTTGACAAACAAATTATACATAGAATAGAACACTATAA	3400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107675	TTTGATTTCTTGTTTGACAAACAAATTATACATAGAATAGAACACTATAA	107724

CT009615.13	3401	CAACGAATGCTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTCCATGTTGTGTGAGGTCAT	3450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107725	CAACGAATGCTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTCCATGTTGTGTGAGGTCAT	107774

CT009615.13	3451	ATATATCTTGATGTCCAAATATGAATCATGTTTAATGACACAAACTATAT	3500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107775	ATATATCTTGATGTCCAAATATGAATCATGTTTAATGACACAAACTATAT	107824

CT009615.13	3501	AAAAACAAATCCTTATACAAATGTGTCAAGAGTTGGTAACATGATTCTCT	3550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107825	AAAAACAAATCCTTATACAAATGTGTCAAGAGTTGGTAACATGATTCTCT	107874

CT009615.13	3551	TTCAGAAAAATAATTTGAATTCAATTTCTATAGTCGCTTATTTGAGAGAT	3600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107875	TTCAGAAAAATAATTTGAATTCAATTTCTATAGTCGCTTATTTGAGAGAT	107924

CT009615.13	3601	AATCCAATCCGTAAAAAAAAAAAAAACGGATTTCTTGCGGCTGAGTTTAT	3650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107925	AATCCAATCCGTAAAAAAAAAAAAAACGGATTTCTTGCGGCTGAGTTTAT	107974

CT009615.13	3651	GATTTCTTTGAGACGTGTACCGGAGGTCAAATAACCTAATGTGGAGGGTT	3700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	107975	GATTTCTTTGAGACGTGTACCGGAGGTCAAATAACCTAATGTGGAGGGTT	108024

CT009615.13	3701	AGAAAAAAATTACAAATCCTTATTGATTATTTTTCATTTGGTATAGAATT	3750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108025	AGAAAAAAATTACAAATCCTTATTGATTATTTTTCATTTGGTATAGAATT	108074

CT009615.13	3751	TATTTTGTTTTCTTCTAATTTTGGTTGTGTTCCTTATAATTTTATAAATT	3800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108075	TATTTTGTTTTCTTCTAATTTTGGTTGTGTTCCTTATAATTTTATAAATT	108124

CT009615.13	3801	TCTCTATAGAGTATTGAACTTGAACATTCAAATTTTGTAATTTTCTTTCT	3850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108125	TCTCTATAGAGTATTGAACTTGAACATTCAAATTTTGTAATTTTCTTTCT	108174

CT009615.13	3851	TATTTACATACAATTTTGAGGCATATGTAATTTTTGTCATTAGTAACTCT	3900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108175	TATTTACATACAATTTTGAGGCATATGTAATTTTTGTCATTAGTAACTCT	108224

CT009615.13	3901	TTGAAGATAATTGTGTCTTTTATTTATTTTTCATAACAATACAGGCAGGG	3950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108225	TTGAAGATAATTGTGTCTTTTATTTATTTTTCATAACAATACAGGCAGGG	108274

CT009615.13	3951	TCTTATTAAGAGAATCTTTGAGAGGACAAGGATGGAGCCAAATATGGAGC	4000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108275	TCTTATTAAGAGAATCTTTGAGAGGACAAGGATGGAGCCAAATATGGAGC	108324

CT009615.13	4001	AAAAGCCACCAAAGATGAATGTAAACATTCCAGAGTTAGATATGATGAAT	4050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108325	AAAAGCCACCAAAGATGAATGTAAACATTCCAGAGTTAGATATGATGAAT	108374

CT009615.13	4051	GCTTTCAAGAAAAACTCCCACATGCTTGTGTCACCAACATCTCTAGCGTC	4100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108375	GCTTTCAAGAAAAACTCCCACATGCTTGTGTCACCAACATCTCTAGCGTC	108424

CT009615.13	4101	ACCAACATCTCTTAAGTCAAACCCAAGGAAATCTTCCAGTGGAAGGTGGA	4150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108425	ACCAACATCTCTTAAGTCAAACCCAAGGAAATCTTCCAGTGGAAGGTGGA	108474

CT009615.13	4151	ATTGTCTATGCTCACCCACCACACATGCTGGCTCCTTTAGGTGCCGACAC	4200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108475	ATTGTCTATGCTCACCCACCACACATGCTGGCTCCTTTAGGTGCCGACAC	108524

CT009615.13	4201	CATAGGTCCAGTGGAATGATCCGTGGTGGATCCGTTGGCTCAAACCTTGC	4250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108525	CATAGGTCCAGTGGAATGATCCGTGGTGGATCCGTTGGCTCAAACCTTGC	108574

CT009615.13	4251	CCAATTGGGGAATAAAGCCGGTGCCATTAGCGACTCACTCCATGCTCAGT	4300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108575	CCAATTGGGGAATAAAGCCGGTGCCATTAGCGACTCACTCCATGCTCAGT	108624

CT009615.13	4301	AGCTTGCATTGCAAGTAATGTTGTTGCACATATAAGTATACTCATAATAT	4350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108625	AGCTTGCATTGCAAGTAATGTTGTTGCACATATAAGTATACTCATAATAT	108674

CT009615.13	4351	AATATAAATACATGAGCCAATTTGTTTAAGAGTTTCTTCATATGTCCTTT	4400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108675	AATATAAATACATGAGCCAATTTGTTTAAGAGTTTCTTCATATGTCCTTT	108724

CT009615.13	4401	GTCTTTTCAAGAATGTGAAAATTTTACTTTTCTGTTGAACAAACTCATCA	4450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108725	GTCTTTTCAAGAATGTGAAAATTTTACTTTTCTGTTGAACAAACTCATCA	108774

CT009615.13	4451	AGGTATTCAATTTATTTGTGTGTAGATCATTGGAAAAAATATATCATAAT	4500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108775	AGGTATTCAATTTATTTGTGTGTAGATCATTGGAAAAAATATATCATAAT	108824

CT009615.13	4501	TGGGAGGTTTTGTCAATCTATCCTTGTTTGTCTAGCTTTATTCTATATAT	4550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108825	TGGGAGGTTTTGTCAATCTATCCTTGTTTGTCTAGCTTTATTCTATATAT	108874

CT009615.13	4551	TATATGTTATGTTATAGCAATAAGTGTAGAAATTGTAAACTCTTACATTT	4600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108875	TATATGTTATGTTATAGCAATAAGTGTAGAAATTGTAAACTCTTACATTT	108924

CT009615.13	4601	ATTCTAGAGGCTAGAAAACTTGTGCAATAGAAGGGGTTGCATCTTTCATT	4650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108925	ATTCTAGAGGCTAGAAAACTTGTGCAATAGAAGGGGTTGCATCTTTCATT	108974

CT009615.13	4651	TTGATTCTATGAAGATGTGCAAAGTTTTATATTCAAGAAATATTATATAA	4700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	108975	TTGATTCTATGAAGATGTGCAAAGTTTTATATTCAAGAAATATTATATAA	109024

CT009615.13	4701	AGTAGTTGAAAACTTGCGATCCTTCTGCAAATAGATATTATAGAAGGTTG	4750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109025	AGTAGTTGAAAACTTGCGATCCTTCTGCAAATAGATATTATAGAAGGTTG	109074

CT009615.13	4751	ATCTTCTCCATTTTCTTTAGTTTGGAAATTTTCACTGCAAGATATATGAC	4800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109075	ATCTTCTCCATTTTCTTTAGTTTGGAAATTTTCACTGCAAGATATATGAC	109124

CT009615.13	4801	TTAAGAGCAAATATTTTTCAAAAAAACGTTAATTTATTTCGTAAACGTCT	4850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109125	TTAAGAGCAAATATTTTTCAAAAAAACGTTAATTTATTTCGTAAACGTCT	109174

CT009615.13	4851	AAATGACATTCACTAAAAAAAAAATAATTGTTAAATGATCTATAATTTAG	4900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109175	AAATGACATTCACTAAAAAAAAAATAATTGTTAAATGATCTATAATTTAG	109224

CT009615.13	4901	AACAAACATATTTTATTACAATTACATATAATTTGAGACGGAAAGAGTAT	4950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109225	AACAAACATATTTTATTACAATTACATATAATTTGAGACGGAAAGAGTAT	109274

CT009615.13	4951	GTAAGAGCAACACCTACAGACTTCGATATTACCAATCACGAAACACACCC	5000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109275	GTAAGAGCAACACCTACAGACTTCGATATTACCAATCACGAAACACACCC	109324

CT009615.13	5001	AAAAATATCTCGTTGAATTGAATTTGTCGAAATCAAATTGAGCAATAAGA	5050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109325	AAAAATATCTCGTTGAATTGAATTTGTCGAAATCAAATTGAGCAATAAGA	109374

CT009615.13	5051	ACAACTTCGTCTTTATCATCGGCTCTCCATATTGCTTGTCCTTGCAATAT	5100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109375	ACAACTTCGTCTTTATCATCGGCTCTCCATATTGCTTGTCCTTGCAATAT	109424

CT009615.13	5101	TTATTTTGTAGATTGTCGCGAAGAATATGCGTACATAAACTCAATTTTAC	5150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109425	TTATTTTGTAGATTGTCGCGAAGAATATGCGTACATAAACTCAATTTTAC	109474

CT009615.13	5151	TTAAACTGAGTTTTTGTACGCATGCAACTTGAGTTTACGTACATTCATAG	5200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109475	TTAAACTGAGTTTTTGTACGCATGCAACTTGAGTTTACGTACATTCATAG	109524

CT009615.13	5201	GTTAAAAAAAAAGGAAAAATAGAAAATCGCTCAAAAATTCACTTATCAAG	5250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109525	GTTAAAAAAAAAGGAAAAATAGAAAATCGCTCAAAAATTCACTTATCAAG	109574

CT009615.13	5251	GCAATGAATTTTTTTTAGTACGATCAACTTTGTTCATCTCCGGTGAATGT	5300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109575	GCAATGAATTTTTTTTAGTACGATCAACTTTGTTCATCTCCGGTGAATGT	109624

CT009615.13	5301	TAGGTCCTCTTTCATTCAAAAAAGAAATTAATGAATTTTTGGGTGCAACC	5350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109625	TAGGTCCTCTTTCATTCAAAAAAGAAATTAATGAATTTTTGGGTGCAACC	109674

CT009615.13	5351	ACATATTTTAGGGTGTAACTATAATTTTTTTTAATGAAGGTGATTGAAAG	5400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109675	ACATATTTTAGGGTGTAACTATAATTTTTTTTAATGAAGGTGATTGAAAG	109724

CT009615.13	5401	TTGTTTTTTGCCTTCAGATGTGGCGGTAGATAGTTGTCGGAGTGGTGACC	5450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109725	TTGTTTTTTGCCTTCAGATGTGGCGGTAGATAGTTGTCGGAGTGGTGACC	109774

CT009615.13	5451	GACCGACAAGTAGATGCAACCGTTAGATCAGTGGTAATTGATAGACTGCA	5500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109775	GACCGACAAGTAGATGCAACCGTTAGATCAGTGGTAATTGATAGACTGCA	109824

CT009615.13	5501	CGTGGCCACAATGATTCGAGGTTAAAAAAAAAAGGAAAAATAGAAAATCG	5550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109825	CGTGGCCACAATGATTCGAGGTTAAAAAAAAAAGGAAAAATAGAAAATCG	109874

CT009615.13	5551	CTCAAAAATTCACTTATCAAGGCAATGAATTTTTTTTAGTACGATCAACT	5600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109875	CTCAAAAATTCACTTATCAAGGCAATGAATTTTTTTTAGTACGATCAACT	109924

CT009615.13	5601	TTGTTCATCTCCGGTGAATGTTAGGTCCTCTTTCATTCAAAAAAGAAATT	5650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109925	TTGTTCATCTCCGGTGAATGTTAGGTCCTCTTTCATTCAAAAAAGAAATT	109974

CT009615.13	5651	AATGAATTTTTGGGTGCAACCACATATTTTAGGGTGTAACTATAATTTTT	5700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	109975	AATGAATTTTTGGGTGCAACCACATATTTTAGGGTGTAACTATAATTTTT	110024

CT009615.13	5701	TTTAATGAAGGTGATTGAAAGTTGTTTTTTGCCTTCAGATGTGGCGGTAG	5750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	110025	TTTAATGAAGGTGATTGAAAGTTGTTTTTTGCCTTCAGATGTGGCGGTAG	110074

CT009615.13	5751	ATAGTTGTCGGAGTGGTGACCGACCGACAAGTAGATGCAACCGTTAGATC	5800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	110075	ATAGTTGTCGGAGTGGTGACCGACCGACAAGTAGATGCAACCGTTAGATC	110124

CT009615.13	5801	AGTGGTAATTGATAGACTGCACGTGGCCACAATGATTCGAGGT	5843
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC146751.10	110125	AGTGGTAATTGATAGACTGCACGTGGCCACAATGATTCGAGGT	110167

Overview

Query
CT009615.13 - 141050 bps
Hit
AC146751.10 - 119297 bps
Total alignments
9
Best alignment
alignment #1 (HSP: 5843 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100556458431584311043251101671
287.581592982084221139121264215611
392.666408751986020734-126036268801
476.412818781986020737126037268841
593.041021592309323251126934270911
691.881963082307823385127079273861
799.979384977855191529611095231192971
899.693083255840616411095231098461
999.693083245199552211098431101671
Short-link