<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 986 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

  CT573420.5	1	AAGCTTATATAGAAGATACAAAATTCCTTCAAGTAAATGGAAATACCTTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	986	AAGCTTATATAGAAGATACAAAATTCCTTCAAGTAAATGGAAATACCTTT	937

  CT573420.5	51	GAAGAGAGACTAAAATGTTTCTTTATATTTTTAAAATAAATTTAATAAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	936	GAAGAGAGACTAAAATGTTTCTTTATATTTTTAAAATAAATTTAATAAAA	887

  CT573420.5	101	TTGAAACATAAACTCCCTTTAAAACAGAAGGAACAAGGCCCAAACACAAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	886	TTGAAACATAAACTCCCTTTAAAACAGAAGGAACAAGGCCCAAACACAAC	837

  CT573420.5	151	GTGTAGAATAACAAGCATACTAATCAACAAGAGAATAATCTACCTAATAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	836	GTGTAGAATAACAAGCATACTAATCAACAAGAGAATAATCTACCTAATAG	787

  CT573420.5	201	TGTAGATGTCTAAAGTACCAATCCAAGTAGGGCTGTTTTGAGGGGGATGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	786	TGTAGATGTCTAAAGTACCAATCCAAGTAGGGCTGTTTTGAGGGGGATGT	737

  CT573420.5	251	ACCATATCCAATTGGAAGAACTAATTTTGGCATTTTATTGTCATCCCCTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	736	ACCATATCCAATTGGAAGAACTAATTTTGGCATTTTATTGTCATCCCCTT	687

  CT573420.5	301	TATACTCTATGTATTTGTCAGATGGAAGATCAATGACATACACATTATTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	686	TATACTCTATGTATTTGTCAGATGGAAGATCAATGACATACACATTATTG	637

  CT573420.5	351	TTTTTATAACCCCACATGTGTGGATTGGTCAATGCATAATACCTTTTTTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	636	TTTTTATAACCCCACATGTGTGGATTGGTCAATGCATAATACCTTTTTTC	587

  CT573420.5	401	CGGAGCATAAAATAATGCAATGTCATCTAAAGTTTTCAACTTGACATAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	586	CGGAGCATAAAATAATGCAATGTCATCTAAAGTTTTCAACTTGACATAAT	537

  CT573420.5	451	TCATGGTTGAGAAATCTATCTTGTACACATTAAATATTGCATTGGACCTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	536	TCATGGTTGAGAAATCTATCTTGTACACATTAAATATTGCATTGGACCTA	487

  CT573420.5	501	ATATTCAGCACTAAAAGATATTCATCACATCTAACCAGCCTTACGTGTGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	486	ATATTCAGCACTAAAAGATATTCATCACATCTAACCAGCCTTACGTGTGA	437

  CT573420.5	551	CATAGCAGGAGTTACACTACGAGTACTCTTGAATTCTAAAAAAATTATAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	436	CATAGCAGGAGTTACACTACGAGTACTCTTGAATTCTAAAAAAATTATAT	387

  CT573420.5	601	TCGCAGAATTCAAGTTGAGTATCCCTATGTTGGCTTTGTTAGTGACAACG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	386	TCGCAGAATTCAAGTTGAGTATCCCTATGTTGGCTTTGTTAGTGACAACG	337

  CT573420.5	651	TATATGGTATTGTGCAAAACAACAAAGTCAACAACCTTATGTGATGTCAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	336	TATATGGTATTGTGCAAAACAACAAAGTCAACAACCTTATGTGATGTCAA	287

  CT573420.5	701	ATAAGTAACCCAATCAAGATTTCGAGATTGATAGACATGCAAATTGTGAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	286	ATAAGTAACCCAATCAAGATTTCGAGATTGATAGACATGCAAATTGTGAT	237

  CT573420.5	751	AAATTTTAAACAAAACCACCAAGTCAAATTCAGTTGAGCCTCTAGAAAAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	236	AAATTTTAAACAAAACCACCAAGTCAAATTCAGTTGAGCCTCTAGAAAAA	187

  CT573420.5	801	ACAAGCAAGACTTGGCAAGCAAAACCATAGATATCAACTTCAAAGGGTGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	186	ACAAGCAAGACTTGGCAAGCAAAACCATAGATATCAACTTCAAAGGGTGA	137

  CT573420.5	851	GTGGTTGATTACCATCATTCTTCTTGTAAATGGATTAAGTAGTATAAATG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	136	GTGGTTGATTACCATCATTCTTCTTGTAAATGGATTAAGTAGTATAAATG	87

  CT573420.5	901	ACTTATATTCTGACAATATCAAATATCCGCTAGAAGACCCTTGATAGGCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	86	ACTTATATTCTGACAATATCAAATATCCGCTAGAAGACCCTTGATAGGCA	37

  CT573420.5	951	TACATGAAGTAGTTATTGATCATGAATTTGATTGAT	986
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AC141435.28	36	TACATGAAGTAGTTATTGATCATGAATTTGATTGAT	1

Overview

Query
CT573420.5 - 126234 bps
Hit
AC141435.28 - 132497 bps
Total alignments
11
Best alignment
alignment #1 (HSP: 986 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100937986198611986-1
298.423433796581566193142540429181
385.711362876636666652149192494771
486.591001949201992212121268214601
586.7498196924079260212126821460-1
691.9674112945889469916074160852-1
788.37731299553795665160736608641
81003638957619579811215951216321
993.818124295775960161121344121586-1
1087.563120958939601211215941217121
1184.51112719764497914149192494751
Short-link