<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2210 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AC127511.7	199740	GAATACTGTATTATTGTAACAGTGATGAATAAGTCACTTTTAATTCTCGT	199789
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1	GAATACTGTATTATTGTAACAGTGATGAATAAGTCACTTTTAATTCTCGT	50

AC127511.7	199790	ATAAAAGTCAAAAGGCAAAAGTATTAGAAATAATTACAACTAAAAATGTT	199839
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	51	ATAAAAGTCAAAAGGCAAAAGTATTAGAAATAATTACAACTAAAAATGTT	100

AC127511.7	199840	AATGATGCACAATATAAATGGATGTAAATAAGTGTGTGGGAAATAGTAGT	199889
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	101	AATGATGCACAATATAAATGGATGTAAATAAGTGTGTGGGAAATAGTAGT	150

AC127511.7	199890	AAAGTGTAGTCTTTATATGTAATTGATGTTAAGATATTATCATAAGATAG	199939
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	151	AAAGTGTAGTCTTTATATGTAATTGATGTTAAGATATTATCATAAGATAG	200

AC127511.7	199940	TGTTATACGTTTAAGATATTTTATATAAGCTACACCGTAACCACGAAGAT	199989
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	201	TGTTATACGTTTAAGATATTTTATATAAGCTACACCGTAACCACGAAGAT	250

AC127511.7	199990	AATAACTATAGAAGTTACAGAAAAGAAGAGAAAGGAATCAAAGCATATCA	200039
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	251	AATAACTATAGAAGTTACAGAAAAGAAGAGAAAGGAATCAAAGCATATCA	300

AC127511.7	200040	ATACAAAAAAAATAATGAAGCACAAAGACAGCAGGAGAGTTAAAGAGGAG	200089
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	301	ATACAAAAAAAATAATGAAGCACAAAGACAGCAGGAGAGTTAAAGAGGAG	350

AC127511.7	200090	CAATAGATAAAAGACAAATAGAAACAATTACCAAAATGCCAATAGTGAAT	200139
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	351	CAATAGATAAAAGACAAATAGAAACAATTACCAAAATGCCAATAGTGAAT	400

AC127511.7	200140	CCTTCCCAATCAGTATTTACTTTAAATGTAAATGAATTAAACTCCTCAAT	200189
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	401	CCTTCCCAATCAGTATTTACTTTAAATGTAAATGAATTAAACTCCTCAAT	450

AC127511.7	200190	CAAAAGACACAAGAGAGTTTGAATGGATAAGAAAACAAGATCCGACTCTT	200239
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	451	CAAAAGACACAAGAGAGTTTGAATGGATAAGAAAACAAGATCCGACTCTT	500

AC127511.7	200240	TTTTTGTGTGTGTTTTGTTTCTTGAGACAGGGTGTTACACTATTGCCTAG	200289
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	501	TTTTTGTGTGTGTTTTGTTTCTTGAGACAGGGTGTTACACTATTGCCTAG	550

AC127511.7	200290	GCTGGAGTGCAGTGGGGTAAATATGGCTCACCTCAGCCTCTGCCTCCTAG	200339
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	551	GCTGGAGTGCAGTGGGGTAAATATGGCTCACCTCAGCCTCTGCCTCCTAG	600

AC127511.7	200340	GTTCAGGTGATCCTTCTGCCTCATCCTCCCAAATAGCTGTGACTACAGGC	200389
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	601	GTTCAGGTGATCCTTCTGCCTCATCCTCCCAAATAGCTGTGACTACAGGC	650

AC127511.7	200390	ATGCACCACCATGTCTAGCTAATTTAAAACTTTGTTTTTTGTAGAGATGG	200439
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	651	ATGCACCACCATGTCTAGCTAATTTAAAACTTTGTTTTTTGTAGAGATGG	700

AC127511.7	200440	TGTTTTCCCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAAT	200489
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	701	TGTTTTCCCACATTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAAT	750

AC127511.7	200490	CCACTCATCTCAGCCTCCCAAAGTACTGGGATTACACAACTCTATTTTAT	200539
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	751	CCACTCATCTCAGCCTCCCAAAGTACTGGGATTACACAACTCTATTTTAT	800

AC127511.7	200540	CTACAAGAAACTCACAGTAGATTTAAGGACACACATAGACTGAAAATGAA	200589
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	801	CTACAAGAAACTCACAGTAGATTTAAGGACACACATAGACTGAAAATGAA	850

AC127511.7	200590	GGGATGGAAAAGGGTATCTCATGATAAAGGGCCATGAAAAGAGAGCAGGG	200639
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	851	GGGATGGAAAAGGGTATCTCATGATAAAGGGCCATGAAAAGAGAGCAGGG	900

AC127511.7	200640	ATGGCTATATTTACATAAGACAAAATAAATTTAAGTTAAAAACTGTCACA	200689
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	901	ATGGCTATATTTACATAAGACAAAATAAATTTAAGTTAAAAACTGTCACA	950

AC127511.7	200690	AGAGATAAAGAAGAACAATATGTAATGATAAAAAGATTGATTCACCAGAG	200739
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	951	AGAGATAAAGAAGAACAATATGTAATGATAAAAAGATTGATTCACCAGAG	1000

AC127511.7	200740	AGATATAACAATTATAAGTAAATATGCACCCAACGTAAGAACAACTGAAA	200789
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1001	AGATATAACAATTATAAGTAAATATGCACCCAACGTAAGAACAACTGAAA	1050

AC127511.7	200790	ATATAATGCAAACATTGACAGAACTGAAGGGAGAAACAGCAGTGCAATAA	200839
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1051	ATATAATGCAAACATTGACAGAACTGAAGGGAGAAACAGCAGTGCAATAA	1100

AC127511.7	200840	TAGTAGTAGATTTCAATACCTCTCTCTCAGTTATGGATAAAACAACCAGA	200889
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1101	TAGTAGTAGATTTCAATACCTCTCTCTCAGTTATGGATAAAACAACCAGA	1150

AC127511.7	200890	CAGAACATCAACAAAGAGGTACAGTGGGCTGGAACAACACCAGACATACA	200939
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1151	CAGAACATCAACAAAGAGGTACAGTGGGCTGGAACAACACCAGACATACA	1200

AC127511.7	200940	TAAAACATTTCACCTGCAGCAGAATACACATTTTTCTAAAGCACATACAG	200989
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1201	TAAAACATTTCACCTGCAGCAGAATACACATTTTTCTAAAGCACATACAG	1250

AC127511.7	200990	AACATTCACATTTTATGTCACAAAACAAATGTAATCAATTTAAGAAGACA	201039
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1251	AACATTCACATTTTATGTCACAAAACAAATGTAATCAATTTAAGAAGACA	1300

AC127511.7	201040	GAAATTTCCTACCACATGGAATGAAACCAGAAATCCACAGTAGAAGAAAA	201089
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1301	GAAATTTCCTACCACATGGAATGAAACCAGAAATCCACAGTAGAAGAAAA	1350

AC127511.7	201090	ACTAGAAAATTCATACATATGTGGAAATTACACAACACACATTTGTACAA	201139
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1351	ACTAGAAAATTCATACATATGTGGAAATTACACAACACACATTTGTACAA	1400

AC127511.7	201140	CCAATGGGCCAAAGAAGAAATCAAAGGGGAACTTAGAAGATACCTTGAAA	201189
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1401	CCAATGGGCCAAAGAAGAAATCAAAGGGGAACTTAGAAGATACCTTGAAA	1450

AC127511.7	201190	CAGATAAAAATGAAAATGCAGCATATCAAAACTTATTGGCATCTAAGAAA	201239
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1451	CAGATAAAAATGAAAATGCAGCATATCAAAACTTATTGGCATCTAAGAAA	1500

AC127511.7	201240	AGCAGCACCAAGAGGAAAATTTATAAACAACCTAACTCCTTCGGGAATTA	201289
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1501	AGCAGCACCAAGAGGAAAATTTATAAACAACCTAACTCCTTCGGGAATTA	1550

AC127511.7	201290	GAAAAAGAAGCACAAACTAGTCTAAATGTAGTAGAGGGAGGAAAATAATA	201339
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1551	GAAAAAGAAGCACAAACTAGTCTAAATGTAGTAGAGGGAGGAAAATAATA	1600

AC127511.7	201340	AATATTAGAGCAGAAATAAACAAAGTAGGGAATCTAAAAACAATAAACAG	201389
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1601	AATATTAGAGCAGAAATAAACAAAGTAGGGAATCTAAAAACAATAAACAG	1650

AC127511.7	201390	AATCAGAGAATCAGCAAAGAGTTTGTCCCTTGAAAAAAAATAAAACTGAC	201439
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1651	AATCAGAGAATCAGCAAAGAGTTTGTCCCTTGAAAAAAAATAAAACTGAC	1700

AC127511.7	201440	AAACTTTTATGTAGATTCAGAAAAAAAGAAAAGTCAAATAAATTAGAAAT	201489
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1701	AAACTTTTATGTAGATTCAGAAAAAAAGAAAAGTCAAATAAATTAGAAAT	1750

AC127511.7	201490	AAAAGGAGACATTGCAACTGATGCCACAGAAATAAAAAGACTTGTAAAAG	201539
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1751	AAAAGGAGACATTGCAACTGATGCCACAGAAATAAAAAGACTTGTAAAAG	1800

AC127511.7	201540	ACAACAATGAACAATTATATGCCAATAAAATGAATAATCTAGAAGAAATT	201589
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1801	ACAACAATGAACAATTATATGCCAATAAAATGAATAATCTAGAAGAAATT	1850

AC127511.7	201590	GGTAAATTCCTAGATACACACAACCTACTAAGACTGAATCACAAAGAAAT	201639
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1851	GGTAAATTCCTAGATACACACAACCTACTAAGACTGAATCACAAAGAAAT	1900

AC127511.7	201640	AGGAAGTCTAAATAGATCAATAACTAGTAAGGAAGTTGAATCTATAATCA	201689
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1901	AGGAAGTCTAAATAGATCAATAACTAGTAAGGAAGTTGAATCTATAATCA	1950

AC127511.7	201690	AAAACCTCCCAACAAAGAAAAGCCCAGGACCAGATAGTTCACTAGTGAAT	201739
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	1951	AAAACCTCCCAACAAAGAAAAGCCCAGGACCAGATAGTTCACTAGTGAAT	2000

AC127511.7	201740	TCTACCAAACATTTAAGGAAGAATTAATGCCAATCCTTCTCAAACTCTTC	201789
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	2001	TCTACCAAACATTTAAGGAAGAATTAATGCCAATCCTTCTCAAACTCTTC	2050

AC127511.7	201790	AAAAAAAACTAAAGAGGAACAAAGACTCAAACTTATGAGTCCTGCATTAC	201839
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	2051	AAAAAAAACTAAAGAGGAACAAAGACTCAAACTTATGAGTCCTGCATTAC	2100

AC127511.7	201840	TCTCATATGAAAAGTGGTCAAAAATATTCCAAGAAAAGAAAACAAGAGGC	201889
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	2101	TCTCATATGAAAAGTGGTCAAAAATATTCCAAGAAAAGAAAACAAGAGGC	2150

AC127511.7	201890	CAATGTCCTTGATGAATATAGATGCCAAACTCCTCAATAAAGTATCAACA	201939
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC136992.4	2151	CAATGTCCTTGATGAATATAGATGCCAAACTCCTCAATAAAGTATCAACA	2200

AC127511.7	201940	AACTGAATTC	201949
			||||||||||
AC136992.4	2201	AACTGAATTC	2210

Overview

Query
AC127511.7 - 201949 bps
Hit
AC136992.4 - 15965 bps
Total alignments
19
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2210 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100206822101997402019491122101
283.95120243160667160909-1646567071
384.25148295188215188509-1646767581
483.271332871075421078281646967551
578.9510029656784570791647167551
680.711092859870098984-1647667551
780.810727382711829831648067551
879.3842493579136039-1650067551
981.91129297122456122752-1905193431
1079.221012972226422560-1905293351
1184.93155296103721104016-1905293431
1282.88135300150798151097-1905293431
1384.1142288188218188505-1905293341
1483.1124275189107189381-1905393361
1582.11112523579036041-1907993351
1689.864769163400163468-1908191491
1780.31012597792978187-1908393411
1890.915479108250108328-1925893341
1979.63124469187023187491-115480159651
Short-link