<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2955 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AC144775.2	1	GATCCACAAAGAAAAATTGGTGATTCCCAGCCAGATTCCATTGGCTTGCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176003	GATCCACAAAGAAAAATTGGTGATTCCCAGCCAGATTCCATTGGCTTGCC	176052

AC144775.2	51	ACTCCTACAAGTCCTATGATCCCTGCAAGGGCCCTGATTCCCAGACAGCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176053	ACTCCTACAAGTCCTATGATCCCTGCAAGGGCCCTGATTCCCAGACAGCC	176102

AC144775.2	101	CCAAAAGAGTCCACAGTTACATAGCAGCACCAAACAGAGGCAGGTCATAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176103	CCAAAAGAGTCCACAGTTACATAGCAGCACCAAACAGAGGCAGGTCATAT	176152

AC144775.2	151	CAAGATACCAGCCATATTCCACAGGACTCAACAAACTTCTAAAAACCCTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176153	CAAGATACCAGCCATATTCCACAGGACTCAACAAACTTCTAAAAACCCTG	176202

AC144775.2	201	ACACCAAGAGTGCACCCTATACATCACAGAAGAGGAAATGTTCCTCATGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176203	ACACCAAGAGTGCACCCTATACATCACAGAAGAGGAAATGTTCCTCATGG	176252

AC144775.2	251	TTGATTATAGGTCTGTGGTACCATAAAACCTTCAGCAGGGAGAGGGCTTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176253	TTGATTATAGGTCTGTGGTACCATAAAACCTTCAGCAGGGAGAGGGCTTA	176302

AC144775.2	301	TCCCCTCTGAGAGAGGTGAGCTGACCCAACATGTGTACACTCTTTCCATT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176303	TCCCCTCTGAGAGAGGTGAGCTGACCCAACATGTGTACACTCTTTCCATT	176352

AC144775.2	351	TTTGTCTGAAATCCTAGATCTTTTAATCTGTGGTCAGAACCCTAGAGGTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176353	TTTGTCTGAAATCCTAGATCTTTTAATCTGTGGTCAGAACCCTAGAGGTT	176402

AC144775.2	401	CAGGGTTCCTGGATATTCCCAGCGTGGTGGAAAAGTTTTCTATGTAGAGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176403	CAGGGTTCCTGGATATTCCCAGCGTGGTGGAAAAGTTTTCTATGTAGAGG	176452

AC144775.2	451	ACCTTGTATTTGGAAGAATAAAGATTGGAGGGTCTTGGACACTCTTCACA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176453	ACCTTGTATTTGGAAGAATAAAGATTGGAGGGTCTTGGACACTCTTCACA	176502

AC144775.2	501	CTTAGGACACCTGTGTCTAAGAGGTACAAATCCAAGACCCTTGCTTCAGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176503	CTTAGGACACCTGTGTCTAAGAGGTACAAATCCAAGACCCTTGCTTCAGA	176552

AC144775.2	551	GCAGGGTTCCTGGATAAAAACAGATAGCATAGAACCAGAACCCTTGCTTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176553	GCAGGGTTCCTGGATAAAAACAGATAGCATAGAACCAGAACCCTTGCTTT	176602

AC144775.2	601	TGTTCAAAGTCCTAAAATGACAGAAGCATTCCCTGCCTAGTTCTGGGGTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176603	TGTTCAAAGTCCTAAAATGACAGAAGCATTCCCTGCCTAGTTCTGGGGTC	176652

AC144775.2	651	TCAGTTGTGTCACTGACTCACCTGTAGGAATAGTTATCTTCTATCAGTTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176653	TCAGTTGTGTCACTGACTCACCTGTAGGAATAGTTATCTTCTATCAGTTC	176702

AC144775.2	701	CTTGGAGTACTGCATGGAACCAATTATGGACTGGATCATTTTATTCATAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176703	CTTGGAGTACTGCATGGAACCAATTATGGACTGGATCATTTTATTCATAT	176752

AC144775.2	751	CCAACATTGTCTTCTCATGTTGTGATTTAATGATGTTGAATTCAGTGTTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176753	CCAACATTGTCTTCTCATGTTGTGATTTAATGATGTTGAATTCAGTGTTC	176802

AC144775.2	801	ATCCTGTGTTAGGGCATGGCCCAAGAAGCAAATAATCTGCTGAATTAAGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176803	ATCCTGTGTTAGGGCATGGCCCAAGAAGCAAATAATCTGCTGAATTAAGG	176852

AC144775.2	851	AATCAATAATCATGTGCAAACAGGCTATATCATGGACTACCCAAGCCAAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176853	AATCAATAATCATGTGCAAACAGGCTATATCATGGACTACCCAAGCCAAG	176902

AC144775.2	901	TGCATGCCACATCCTGGCTCATTCACACTGGGTCCCCTAGGTGCTAATTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176903	TGCATGCCACATCCTGGCTCATTCACACTGGGTCCCCTAGGTGCTAATTA	176952

AC144775.2	951	AACTTACTATCCTGGGCAGAGGACAGCAGAGCCAGGGGACCAAATGGAGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	176953	AACTTACTATCCTGGGCAGAGGACAGCAGAGCCAGGGGACCAAATGGAGC	177002

AC144775.2	1001	TACCTGACCTTCAAGGGCTTCCTGGGCAAGCATGTAGGAATAGACTACTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177003	TACCTGACCTTCAAGGGCTTCCTGGGCAAGCATGTAGGAATAGACTACTT	177052

AC144775.2	1051	CTATGACAATTTTACACTACACTGTGCCACAGGCATGGGACCAGTAGATA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177053	CTATGACAATTTTACACTACACTGTGCCACAGGCATGGGACCAGTAGATA	177102

AC144775.2	1101	TCTGTAATGACTTTCCTCTTATTTTTAAGGCAGGGATTCTCATTCCTTGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177103	TCTGTAATGACTTTCCTCTTATTTTTAAGGCAGGGATTCTCATTCCTTGG	177152

AC144775.2	1151	TTCCTGTTGTTATATGAATTCCCAGAGGATACAACTAGTATTTACAGTAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177153	TTCCTGTTGTTATATGAATTCCCAGAGGATACAACTAGTATTTACAGTAG	177202

AC144775.2	1201	AAAGGCTTTATCACATCTCCTCCCCCAGGAGATTCCTGTGTGACAACAAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177203	AAAGGCTTTATCACATCTCCTCCCCCAGGAGATTCCTGTGTGACAACAAG	177252

AC144775.2	1251	GAAACACCAGGAGCAGCCTTCCCTGGTGAATACTTTGGACCTCTATGGAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177253	GAAACACCAGGAGCAGCCTTCCCTGGTGAATACTTTGGACCTCTATGGAT	177302

AC144775.2	1301	TCAACACTAACAGGACCTGCAAAGTGTGCATCACACAAATCCTCAGACCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177303	TCAACACTAACAGGACCTGCAAAGTGTGCATCACACAAATCCTCAGACCC	177352

AC144775.2	1351	CATCAAATGTCCCAGAGCCCCAGTCCTGAACAAAACACACACAACTATGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177353	CATCAAATGTCCCAGAGCCCCAGTCCTGAACAAAACACACACAACTATGT	177402

AC144775.2	1401	TCACACACAGACACAATTAGAATGCCAAATAAATCCAGAGAGGTGCCATC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177403	TCACACACAGACACAATTAGAATGCCAAATAAATCCAGAGAGGTGCCATC	177452

AC144775.2	1451	TCTCAGAATAAAATGAACAATATCAGAGTAAAGCCTTGAAGCCTGCAGGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177453	TCTCAGAATAAAATGAACAATATCAGAGTAAAGCCTTGAAGCCTGCAGGA	177502

AC144775.2	1501	ATTGCATTCACACACTGAGTGACAGTAAGTGTGAGCAGGTCCTTCTAGCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177503	ATTGCATTCACACACTGAGTGACAGTAAGTGTGAGCAGGTCCTTCTAGCT	177552

AC144775.2	1551	GTTTACAGCAACAATCAGAATGCAAAAACCCCAAGGTCAAGTACAAAAGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177553	GTTTACAGCAACAATCAGAATGCAAAAACCCCAAGGTCAAGTACAAAAGA	177602

AC144775.2	1601	AGATGATAATAAACACACAGCACCTTGTTTATCCAACAATTAAACACCTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177603	AGATGATAATAAACACACAGCACCTTGTTTATCCAACAATTAAACACCTT	177652

AC144775.2	1651	TCAGGGCTACTTAATTGAATGATGGGAGATGACACACTCCATTCATGGAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177653	TCAGGGCTACTTAATTGAATGATGGGAGATGACACACTCCATTCATGGAA	177702

AC144775.2	1701	GGAAATTGGGTTAACAGATGGCACAATACAGTCAACAGGGTACTGGGCAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177703	GGAAATTGGGTTAACAGATGGCACAATACAGTCAACAGGGTACTGGGCAT	177752

AC144775.2	1751	AATTCCTACCTGTAGTTCAAATCCTCATACATGTAAAGGTCCAGGATTCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177753	AATTCCTACCTGTAGTTCAAATCCTCATACATGTAAAGGTCCAGGATTCC	177802

AC144775.2	1801	ACACATTTCCTCCATGTCATTACTGATCTTCCTCATATCCAAATTCAATC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177803	ACACATTTCCTCCATGTCATTACTGATCTTCCTCATATCCAAATTCAATC	177852

AC144775.2	1851	CTTGTAGTTCATTTATATTTGATTTCTGCTTAGTGATTTTGGACTTTTGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177853	CTTGTAGTTCATTTATATTTGATTTCTGCTTAGTGATTTTGGACTTTTGG	177902

AC144775.2	1901	GTTGAAGTATTTCTAGCAGATCCTGCAGATAGATAAACACAAATGAATTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177903	GTTGAAGTATTTCTAGCAGATCCTGCAGATAGATAAACACAAATGAATTT	177952

AC144775.2	1951	GCATACTTGATGGCCCAGGGGCAGGGGAGACCGTTCTGAGTCCCAAGAAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	177953	GCATACTTGATGGCCCAGGGGCAGGGGAGACCGTTCTGAGTCCCAAGAAG	178002

AC144775.2	2001	AAGATGGAGGGAGAGAAAAGATAAAGACGGGGTGAATCCTTAAAAGAGCA	2050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	178003	AAGATGGAGGGAGAGAAAAGATAAAGACGGGGTGAATCCTTAAAAGAGCA	178052

AC144775.2	2051	GAAAAGCTATCTTCCAGCTGGTTTGCTAAGCTATGTTCCTCTTCCTAACC	2100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	178053	GAAAAGCTATCTTCCAGCTGGTTTGCTAAGCTATGTTCCTCTTCCTAACC	178102

AC144775.2	2101	ACCATTGTCAGAAATATGCCACACTTCCTGTTACAGGCCCTGTTGCCTTG	2150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	178103	ACCATTGTCAGAAATATGCCACACTTCCTGTTACAGGCCCTGTTGCCTTG	178152

AC144775.2	2151	AAATGTATAAGCTGCCTCAGACATAAAGATATGGGAAACATTGTCAGGTC	2200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	178153	AAATGTATAAGCTGCCTCAGACATAAAGATATGGGAAACATTGTCAGGTC	178202

AC144775.2	2201	ATATCAGATGGGATACAGGGAAATCCTGAAGTTCATAGTGCTTAGCACTA	2250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	178203	ATATCAGATGGGATACAGGGAAATCCTGAAGTTCATAGTGCTTAGCACTA	178252

AC144775.2	2251	TCCAGCCATAATTAATCTGGAAGATGAAGTGCTTCAACTCCCTTCCATGA	2300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	178253	TCCAGCCATAATTAATCTGGAAGATGAAGTGCTTCAACTCCCTTCCATGA	178302

AC144775.2	2301	AAGGACACACTGTTATTCTCATAGTGTCCACTCCTGACATTTTTTGCCAC	2350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	178303	AAGGACACACTGTTATTCTCATAGTGTCCACTCCTGACATTTTTTGCCAC	178352

AC144775.2	2351	TCAAAATGAAATTAAATAGCTCCCAGAAAAGTAGCTGCAGGTTTGTCAAT	2400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	178353	TCAAAATGAAATTAAATAGCTCCCAGAAAAGTAGCTGCAGGTTTGTCAAT	178402

AC144775.2	2401	TCCTGGCTCTGTCATACTAATCATCAGAAATTCTTGACTCTTTTTCTGAC	2450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	178403	TCCTGGCTCTGTCATACTAATCATCAGAAATTCTTGACTCTTTTTCTGAC	178452

AC144775.2	2451	ATTGACAAAGTCCAAGGCTTCAGCTTGTGAGACCTACTCCTGGACGGCCC	2500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	178453	ATTGACAAAGTCCAAGGCTTCAGCTTGTGAGACCTACTCCTGGACGGCCC	178502

AC144775.2	2501	AGCTCAAGCCTAACTTTACCAGGAAGATCCCCAACTCTGCCCAGGAGTCA	2550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	178503	AGCTCAAGCCTAACTTTACCAGGAAGATCCCCAACTCTGCCCAGGAGTCA	178552

AC144775.2	2551	CTGTGCCTTCTCCAGAATGATTTCCTTCTTCCTTTTTCATGAGAAAGTAT	2600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	178553	CTGTGCCTTCTCCAGAATGATTTCCTTCTTCCTTTTTCATGAGAAAGTAT	178602

AC144775.2	2601	TCCCACTTCCTTCTCTGTTGGTCTGGTCTCTCCTTCATCGCCATTCTCTT	2650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	178603	TCCCACTTCCTTCTCTGTTGGTCTGGTCTCTCCTTCATCGCCATTCTCTT	178652

AC144775.2	2651	TCTGACATAGCCTGAGCAGTCAGGAAAACATTCCTGCTGGTGAACCCAGA	2700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	178653	TCTGACATAGCCTGAGCAGTCAGGAAAACATTCCTGCTGGTGAACCCAGA	178702

AC144775.2	2701	GCAAACCGAAGGGATGAACCACAGGCAGTTGCTGTCACCACAACACAGGT	2750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	178703	GCAAACCGAAGGGATGAACCACAGGCAGTTGCTGTCACCACAACACAGGT	178752

AC144775.2	2751	GACAACACAGAAGATTCTAGTTCTCTCCTAGATACAAGAGATTCTCCAAG	2800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	178753	GACAACACAGAAGATTCTAGTTCTCTCCTAGATACAAGAGATTCTCCAAG	178802

AC144775.2	2801	GAAGGCATTACTGATGATGTCACTAGCAACTGCCTTGATCTACCTGCTAA	2850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	178803	GAAGGCATTACTGATGATGTCACTAGCAACTGCCTTGATCTACCTGCTAA	178852

AC144775.2	2851	CTAGTTCTCCCCAACTTGGTCCTTTTCTGGGGTGCCTCTCCTGGAGCCTC	2900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	178853	CTAGTTCTCCCCAACTTGGTCCTTTTCTGGGGTGCCTCTCCTGGAGCCTC	178902

AC144775.2	2901	TCATGGACCCGTGGGATCCCCTTTGGCAACCTCTCCTTCCTAAGTAGGAG	2950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC134588.5	178903	TCATGGACCCGTGGGATCCCCTTTGGCAACCTCTCCTTCCTAAGTAGGAG	178952

AC144775.2	2951	AATTC	2955
			|||||
AC134588.5	178953	AATTC	178957

Overview

Query
AC144775.2 - 151084 bps
Hit
AC134588.5 - 178957 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2955 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100293429551295511760031789571
295.571239514508613220639124191387731
395.54111971312161321925211055411187451
495.49517061512168927839140109462411
597.34630969842783334816146577535521
693.744585656278333348811251091307611
791.624043553933870394081975531031301
896.69412946853677941463153551582581
995.67404848234035645178161591664201
1092.1855777511448635237311413511489151
1192.54545673884691454301166423738091
1294.22246753071454957856701829641136201
1395.442376028207575458575114207323951
1495.2481059629631347276211686041782691
1589.5649617598692147681111303711379711
1696.4713605155289052410605111198811354171
1793.666580835093034101383143849522251
1892.014501611410798711410019523156411
1991.9344636110107987114096190834969451
2092.344381586710823411410011686041744841
2195.081001212121137027149147168243804231
Short-link