<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 6394 bps / non-identical: 150 bps

Full alignment

C  AC136896.6	6394	ATATCTTTTCCTTAACCATTGTAAGGTTCATGGCTGAAACTCGTATAACA	6345
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1	ATATCTTTTCCTTAACCATTGTAAGGTTCATGGCTGAAACTCGTATAACA	50

C  AC136896.6	6344	GAAGACAGATTATCAAGAAAAACATACAAATGTATTTAGTATAAGATTTA	6295
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	51	GAAGACAGATTATCAAGAAAAACATACAAATGTATTTAGTATAAGATTTA	100

C  AC136896.6	6294	TGTTACACTGGAGCCTTCATAAACGAAGACCCAAACAAACAGGGAAAATG	6245
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	101	TGTTACACTGGAGCCTTCATAAACGAAGACCCAAACAAACAGGGAAAATG	150

C  AC136896.6	6244	GCATATGTTTATGCTTGGGTCTGATGAAGAGTGGACAGTTGCATAGAGGT	6195
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	151	GCATATGTTTATGCTTGGGTCTGATGAAGAGTGGACAGTTGCATAGAGGT	200

C  AC136896.6	6194	GTAATTGGATGAAAGGAGGTGTGATCTGACAATGAGGAAACAGGGAGAAC	6145
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	201	GTAATTGGATGAAAGGAGGTGTGATCTGACAATGAGGAAACAGGGAGAAC	250

C  AC136896.6	6144	TTAGCAAGGTCTGTGTGTTCAGATTCTTCTTGGTGTCTCCACATTTCATA	6095
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	251	TTAGCAAGGTCTGTGTGTTCAGATTCTTCTTGGTGTCTCCACATTTCATA	300

C  AC136896.6	6094	CCTTTCCTCAGGGTACAGGGAGGTACAGGGAGAATACCGCTGGGATGAGG	6045
			||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	301	CCTTTCCTCCGGGTACAGGGAGGTACAGGGAGAATACCGCTGGGATGAGG	350

C  AC136896.6	6044	TTCTTATGATAGTGGAAGATTAGACAATTATTTTATGGCCTGCTTCAGGG	5995
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	351	TTCTTATGATAGTGGAAGATTAGACAATTATTTTATGGCCTGCTTCAGGG	400

C  AC136896.6	5994	AAGAATGGTAGGAGAATGTCTGTGAGTGACCTTTCTGCTTCTGTTGTTCC	5945
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	401	AAGAATGGTAGGAGAATGTCTGTGAGTGACCTTTCTGCTTCTGTTGTTCC	450

C  AC136896.6	5944	CTCAAAGGCCACGGTGCCATATTTTGGGGCAGTGTGTACTGATCCCCTCA	5895
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	451	CTCAAAGGCCACGGTGCCATATTTTGGGGCAGTGTGTACTGATCCCCTCA	500

C  AC136896.6	5894	GTCAACTAGGTTGAAACTAGGTTGCAACATTTGGTGTATTCCATCAAACC	5845
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	501	GTCAACTAGGTTGAAACTAGGTTGCAACATTTGGTGTATTCCATCAAACC	550

C  AC136896.6	5844	TGACATCAGTATTTGCCAAAATTATAAAACTCTCTGGGCCAAGACTCCAA	5795
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	551	TGACATCAGTATTTGCCAAAATTATAAAACTCTCTGGGCCAAGACTCCAA	600

C  AC136896.6	5794	AGCATCTAAAGAAAACAGAAGAACCCAGAAAGTCCTAATAATACATGAAG	5745
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	601	AGCATCTAAAGAAAACAGAAGAACCCAGAAAGTCCTAATAATACATGAAG	650

C  AC136896.6	5744	GGTAAATATAGCATGAAGGGTATGGTTTTTAAATTTCATATCCTCATTAG	5695
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	651	GGTAAATATAGCATGAAGGGTATGGTTTTTAAATTTCATATCCTCATTAG	700

C  AC136896.6	5694	TGAATCAGCAGAATGACTGAGACATAACCCTAGATTTTCCTATGACTTTT	5645
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	701	TGAATCAGCAGAATGACTGAGACATAACCCTAGATTTTCCTATGACTTTT	750

C  AC136896.6	5644	GGTAAAATTTTATGTTACCAATTTTATTCAGACTGCACCAGTGTGGTCTA	5595
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	751	GGTAAAATTTTATGTTACCAATTTTATTCAGACTGCACCAGTGTGGTCTA	800

C  AC136896.6	5594	CATGGTAAGACAAACAGCTTCAGAGTGGAACTCTTAAGGCACTGGGTGAT	5545
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	801	CATGGTAAGACAAACAGCTTCAGAGTGGAACTCTTAAGGCACTGGGTGAT	850

C  AC136896.6	5544	TCACAAATTGAACCGAGTCAGATGCACAGTAGTTGTATATTAAGTACATG	5495
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	851	TCACAAATTGAACCGAGTCAGATGCACAGTAGTTGTATATTAAGTACATG	900

C  AC136896.6	5494	CACAAATGACACTAATGGACATTGCTGCCATGGCACGTCTCAGTCATCTG	5445
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	901	CACAAATGACACTAATGGACATTGCTGCCATGGCACGTCTCAGTCATCTG	950

C  AC136896.6	5444	CCCTGGTGCTGTTCTTTTTGCAATATCAGAATTAGTAACATAAAACAGAG	5395
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	951	CCCTGGTGCTGTTCTTTTTGCAATATCAGAATTAGTAACATAAAACAGAG	1000

C  AC136896.6	5394	GGCCTGGATACCAAATTCATGAGTGACATGTTGTTCGGAGGGAAAGCAAG	5345
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1001	GGCCTGGATACCAAATTCATGAGTGACATGTTGTTCGGAGGGAAAGCAAG	1050

C  AC136896.6	5344	TAGGTTGAAATGCCATGTTAGTCAATGCCATCATCCTTATCTCGTGTACC	5295
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1051	TAGGTTGAAATGCCATGTTAGTCAATGCCATCATCCTTATCTCGTGTACC	1100

C  AC136896.6	5294	ATATAATACGTACACATAAGCCATGCTGCCAGTAGTCCCTTCCCTCTCTG	5245
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1101	ATATAATACGTACACATAAGCCATGCTGCCAGTAGTCCCTTCCCTCTCTG	1150

C  AC136896.6	5244	TTCCAGGCCTTGGAGAACCATGGTCACTTTTGAGAAGTACCACAAATTAG	5195
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1151	TTCCAGGCCTTGGAGAACCATGGTCACTTTTGAGAAGTACCACAAATTAG	1200

C  AC136896.6	5194	AGTCATCTGGAGAATTCCACCAAGCATGGCAGCATGTTTGACACTCAATA	5145
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1201	AGTCATCTGGAGAATTCCACCAAGCATGGCAGCATGTTTGACACTCAATA	1250

C  AC136896.6	5144	AGTTATTATTAAAGAATTACATTATGGACTGACTTAATGGATAGACTATA	5095
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1251	AGTTATTATTAAAGAATTACATTATGGACTGACTTAATGGATAGACTATA	1300

C  AC136896.6	5094	AACTAAAGCATTGAAGAATGGTCTGGAAAGATGAAGCCTTGAAACTGGTT	5045
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1301	AACTAAAGCATTGAAGAATGGTCTGGAAAGATGAAGCCTTGAAACTGGTT	1350

C  AC136896.6	5044	AAGAGAAGAGGTCGTGAGAGGGACAATGTGCCATTGTATCATTCTGGTTC	4995
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1351	AAGAGAAGAGGTCGTGAGAGGGACAATGTGCCATTGTATCATTCTGGTTC	1400

C  AC136896.6	4994	CGTACATTGGTTAAGTACGGGAGCCAGACTGCTTGGGTTCAAATCTAGGT	4945
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1401	CGTACATTGGTTAAGTACGGGAGCCAGACTGCTTGGGTTCAAATCTAGGT	1450

C  AC136896.6	4944	CTTACACCTGCATGTTATGTTACTTACCCCCTTTACACTTAAGTTTCCTT	4895
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1451	CTTACACCTGCATGTTATGTTACTTACCCCCTTTACACTTAAGTTTCCTT	1500

C  AC136896.6	4894	ATTTGTAAAACAAAGATCAGAATATCAGCCCCTTTCTCTAGAGGGCATTC	4845
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1501	ATTTGTAAAACAAAGATCAGAATATCAGCCCCTTTCTCTAGAGGGCATTC	1550

C  AC136896.6	4844	TTGAAGAGCCAATGTATAAGCACATTCACTGGGCTTAGAAAGATATACAG	4795
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1551	TTGAAGAGCCAATGTATAAGCACATTCACTGGGCTTAGAAAGATATACAG	1600

C  AC136896.6	4794	GACACAGCAGCACTTATCAGCATTATTGGTTATTATTGTTGTCATTATTA	4745
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1601	GACACAGCAGCACTTATCAGCATTATTGGTTATTATTGTTGTCATTATTA	1650

C  AC136896.6	4744	TTTAAATTATTTTTCATTAGATAAAGAGCTAGTAAGAAGTAGGCTTAGTC	4695
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1651	TTTAAATTATTTTTCATTAGATAAAGAGCTAGTAAGAAGTAGGCTTAGTC	1700

C  AC136896.6	4694	TGAATCATTCCAGAGGTCAGAAATAGTATTAGCAGATGAAGAAAAACTTT	4645
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1701	TGAATCATTCCAGAGGTCAGAAATAGTATTAGCAGATGAAGAAAAACTTT	1750

C  AC136896.6	4644	CTAATAATCTGAGCAGCCCTGAAATGGGAATGGGTTGTTCTGAAGAACAC	4595
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1751	CTAATAATCTGAGCAGCCCTGAAATGGGAATGGGTTGTTCTGAAGAACAC	1800

C  AC136896.6	4594	CTCACCCCTGGAAATCTGCCAATCATTTTCTATGACGTTTTTGAGAGAGT	4545
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1801	CTCACCCCTGGAAATCTGCCAATCATTTTCTATGACGTTTTTGAGAGAGT	1850

C  AC136896.6	4544	TCATATGAAAACATATTTTATTTGTTTCAATTCAAGTGCTCCTCATGGGA	4495
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1851	TCATATGAAAACATATTTTATTTGTTTCAATTCAAGTGCTCCTCATGGGA	1900

C  AC136896.6	4494	GTCCCTTTGACCCAACCCTACCCCAAAATGGTATAGGAGGACCAATGCGT	4445
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1901	GTCCCTTTGACCCAACCCTACCCCAAAATGGTATAGGAGGACCAATGCGT	1950

C  AC136896.6	4444	GTGTCTTGGGAGAAGGCTGGGATAATATGACTCATTTAGGCTACACAGAG	4395
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	1951	GTGTCTTGGGAGAAGGCTGGGATAATATGACTCATTTAGGCTACACAGAG	2000

C  AC136896.6	4394	AGGACTCACTTCTCTGTGGTCTGCTAGTATCTGCACCTAAAAAACTTTGA	4345
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	2001	AGGACTCACTTCTCTGTGGTCTGCTAGTATCTGCACCTAAAAAACTTTGA	2050

C  AC136896.6	4344	GTATTGTTCGGCTCCAGAGGAGAAGACTTCAAACTGAAATTTAGTGCTCA	4295
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	2051	GTATTGTTCGGCTCCAGAGGAGAAGACTTCAAACTGAAATTTAGTGCTCA	2100

C  AC136896.6	4294	GATTCACAGAGTAGGGGGTGGGAAAGACATTTACATATGTAAGACAAGAA	4245
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	2101	GATTCACAGAGTAGGGGGTGGGAAAGACATTTACATATGTAAGACAAGAA	2150

C  AC136896.6	4244	TAAAGTTTCAAAGAAAATACTTCAATGAAATGAGATTTCTTTTTAAAAAG	4195
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	2151	TAAAGTTTCAAAGAAAATACTTCAATGAAATGAGATTTCTTTTTAAAAAG	2200

C  AC136896.6	4194	GGAGTTCAAGGTAAGAAACAAAGGCTTTGGGCTGCAAAGCCAAACTGTCT	4145
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	2201	GGAGTTCAAGGTAAGAAACAAAGGCTTTGGGCTGCAAAGCCAAACTGTCT	2250

C  AC136896.6	4144	GGGTTGAAATTGTTTCCTTCCCTTATTAGCTTTGTGATCTTGAGCTATTG	4095
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
  AC127511.7	2251	GGGTTGAAATTGTTTCCTTCCCTTATTAGCTTTGTGACCTTGAGCTATTG	2300

C  AC136896.6	4094	TTTAACATCCTTCTGCCTGAATTTGCTTAACCAAAATTCAGGACAGTAAT	4045
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	2301	TTTAACATCCTTCTGCCTGAATTTGCTTAACCAAAATTCAGGACAGTAAT	2350

C  AC136896.6	4044	AGAACCTACCTCAGATGGCTGTTGTGAGGATTAAATGGTGTCTTTCTGTG	3995
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	2351	AGAACCTACCTCAGATGGCTGTTGTGAGGATTAAATGGTGTCTTTCTGTG	2400

C  AC136896.6	3994	TGTACTGATATAACACGATACCTGAGACTTGGTAGTGTATGAATAATATA	3945
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
  AC127511.7	2401	TGTACTGATATAACACGATACCTGAGACTTGGTAGTTTATGAATAATATA	2450

C  AC136896.6	3944	AATGTATTTCTCATGGTTCTGGAGGTGGGGAAGTCCAAGATCAAGGTGCT	3895
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	2451	AATGTATTTCTCATGGTTCTGGAGGTGGGGAAGTCCAAGATCAAGGTGCT	2500

C  AC136896.6	3894	GGTGGATTCAGTGTCTGGTGAGGACAGCTCTCTGCTTCCAAGATGGTATC	3845
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	2501	GGTGGATTCAGTGTCTGGTGAGGACAGCTCTCTGCTTCCAAGATGGTATC	2550

C  AC136896.6	3844	TCTTGATGCACCCTTACAGGGAGGAAGGCATGAATGCTGTCTGTCCTCAC	3795
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	2551	TCTTGATGCACCCTTACAGGGAGGAAGGCATGAATGCTGTCTGTCCTCAC	2600

C  AC136896.6	3794	ATGGCAGAAGAGGTAGAAGGGCAAAAAGGCCAAATGCTGTGTGAAACCTC	3745
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	2601	ATGGCAGAAGAGGTAGAAGGGCAAAAAGGCCAAATGCTGTGTGAAACCTC	2650

C  AC136896.6	3744	TTTTATGAAAACCTTAATCCCATTCACAAGAAAGGAGTCCTCATGACCCA	3695
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	2651	TTTTATGAAAACCTTAATCCCATTCACAAGAAAGGAGTCCTCATGACCCA	2700

C  AC136896.6	3694	ATCACCTCCTTAAGGCCCCCCTCTTAATACTATTGCATTGGAGATTAAGT	3645
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	2701	ATCACCTCCTTAAGGCCCCCCTCTTAATACTATTGCATTGGAGATTAAGT	2750

C  AC136896.6	3644	CTCAACATGAATTTTAGAGAAATACAAACACTGCAACCATAGTAAATGGT	3595
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	2751	CTCAACATGAATTTTAGAGAAATACAAACACTGCAACCATAGTAAATGGT	2800

C  AC136896.6	3594	GGCTATGTTTCTTCTTTTCCTCCTCACTTTTCTTCTCCTTCTTTTTCTTA	3545
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	2801	GGCTATGTTTCTTCTTTTCCTCCTCACTTTTCTTCTCCTTCTTTTTCTTA	2850

C  AC136896.6	3544	GTATAAAAGTAGTTGTCATAGTAGAAGTGGTAGTACTAGTATTATTTTGC	3495
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	2851	GTATAAAAGTAGTTGTCATAGTAGAAGTGGTAGTACTAGTATTATTTTGC	2900

C  AC136896.6	3494	TAGAATCTTTCCTTATTCCTGGCAATTTGCCTTGGATGACATAGGTAGAT	3445
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	2901	TAGAATCTTTCCTTATTCCTGGCAATTTGCCTTGGATGACATAGGTAGAT	2950

C  AC136896.6	3444	AGTGGATGTTTCTAGTGTTTTTGCCATTAAGGAATGCAAGATAAAATGAT	3395
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	2951	AGTGGATGTTTCTAGTGTTTTTGCCATTAAGGAATGCAAGATAAAATGAT	3000

C  AC136896.6	3394	ATAGAACAAACACAAGACATATATGAGAAAAAAATATATAAAAGTCAAAT	3345
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3001	ATAGAACAAACACAAGACATATATGAGAAAAAAATATATAAAAGTCAAAT	3050

C  AC136896.6	3344	CATAAAGGCTATTATTGTAACTGTTACGGAAAAAATGAAGAAGGAACAAT	3295
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3051	CATAAAGGCTATTATTGTAACTGTTACGGAAAAAATGAAGAAGGAACAAT	3100

C  AC136896.6	3294	GACAAAAACTCTCTCTTTGACCAAACTTTAATCAGCCTCCTCTGAGTCCA	3245
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3101	GACAAAAACTCTCTCTTTGACCAAACTTTAATCAGCCTCCTCTGAGTCCA	3150

C  AC136896.6	3244	GCTAGGTTCCGTCTTTGGGCATGTTCCCCAGGGGCCCAAGTGTAGCATGA	3195
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3151	GCTAGGTTCCGTCTTTGGGCATGTTCCCCAGGGGCCCAAGTGTAGCATGA	3200

C  AC136896.6	3194	ATCCTGCTAAGTCAGTTTAGCCAGAACTCACCACCCTTGATATCTGATGA	3145
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3201	ATCCTGCTAAGTCAGTTTAGCCAGAACTCACCACCCTTGATATCTGATGA	3250

C  AC136896.6	3144	CATTCTCTATCCTCCTCCATCCCCTGGGCGACATCTGGCCACCATGGCCT	3095
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3251	CATTCTCTATCCTCCTCCATCCCCTGGGCGACATCTGGCCACCATGGCCT	3300

C  AC136896.6	3094	GCCTTCAGCAGGTTGGTTGAGGTTGGTTTAGCCAGAATCTCTTTAACCCT	3045
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3301	GCCTTCAGCAGGTTGGTTGAGGTTGGTTTAGCCAGAATCTCTTTAACCCT	3350

C  AC136896.6	3044	GATGTTTCCCCTTAGTAATTTTCCCTCCACTGGATCCCACCCTCTGTTCC	2995
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3351	GATGTTTCCCCTTAGTAATTTTCCCTCCACTGGATCCCACCCTCTGTTCC	3400

C  AC136896.6	2994	TTGCATATAAATTCTCACTTTTCCTTGTTAAATCTGGAGTTGAGCCCAAG	2945
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3401	TTGCATATAAATTCTCACTTTTCCTTGTTAAATCTGGAGTTGAGCCCAAG	3450

C  AC136896.6	2944	TTCTGCACTGAGGGCTTCATTTTCCTACCGTAACAGTGTCTTGAGTAAAA	2895
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3451	TTCTGCACTGAGGGCTTCATTTTCCTACCGTAACAGTGTCTTGAGTAAAA	3500

C  AC136896.6	2894	TCTGACTTTACCCCTTCATTGTCTAGCTCTGGTTTTCGTTTGACAGGAGT	2845
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3501	TCTGACTTTACCCCTTCATTGTCTAGCTCTGGTTTTCGTTTGACAGGAGT	3550

C  AC136896.6	2844	CACCATTAAATCCTGTTTACAAGATGTATATGTAACTGCCTTGATTTGAA	2795
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3551	CACCATTAAATCCTGTTTACAAGATGTATATGTAACTGCCTTGATTTGAA	3600

C  AC136896.6	2794	AATTGAAAATTTTGAAAGTTTTACTCTGTTCATAAATGCATGAAAGAATT	2745
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3601	AATTGAAAATTTTGAAAGTTTTACTCTGTTCATAAATGCATGAAAGAATT	3650

C  AC136896.6	2744	TTGGGACATTACAATGAAAATAAATGTTGATTTAGAATATATATTGAGAT	2695
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3651	TTGGGACATTACAATGAAAATAAATGTTGATTTAGAATATATATTGAGAT	3700

C  AC136896.6	2694	AATATGAAGTTCAAAGGTATGTTGGGAGGACTGGTTCCAGCAGGCCTGTA	2645
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3701	AATATGAAGTTCAAAGGTATGTTGGGAGGACTGGTTCCAGCAGGCCTGTA	3750

C  AC136896.6	2644	ATTAGCCTGAGCTGTCAGACTGAAATAAGAAATGTACCTGCATAGTCTTA	2595
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3751	ATTAGCCTGAGCTGTCAGACTGAAATAAGAAATGTACCTGCATAGTCTTA	3800

C  AC136896.6	2594	GCACCTAGTAAAGGCATGAAACATAATCATTGGCAATACTGATGGCAAAC	2545
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3801	GCACCTAGTAAAGGCATGAAACATAATCATTGGCAATACTGATGGCAAAC	3850

C  AC136896.6	2544	ACAGATCCAAGGAGTTTTGGGGGATTCGTACCAACTTTTCAGCATTGTTT	2495
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3851	ACAGATCCAAGGAGTTTTGGGGGATTCGTACCAACTTTTCAGCATTGTTT	3900

C  AC136896.6	2494	ATTGATGAGAAACGCAGAAGTATCTGCTGTTTGGGTTGGATGTGTGGCAG	2445
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3901	ATTGATGAGAAACGCAGAAGTATCTGCTGTTTGGGTTGGATGTGTGGCAG	3950

C  AC136896.6	2444	GAAAATGCCCACGTGATCAGGAGAGTACTAAAACATCCTGACCACATTCC	2395
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	3951	GAAAATGCCCACGTGATCAGGAGAGTACTAAAACATCCTGACCACATTCC	4000

C  AC136896.6	2394	GCCCTCAGCTCCCTGGGTCCACCGTGTTCTGTGCACTGGTCAGTGGTTCG	2345
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4001	GCCCTCAGCTCCCTGGGTCCACCGTGTTCTGTGCACTGGTCAGTGGTTCG	4050

C  AC136896.6	2344	TGATCTCAGAGCAGAGGTGTTTCCATAAGGCCAAATGGAGCTCGCAGCTG	2295
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4051	TGATCTCAGAGCAGAGGTGTTTCCATAAGGCCAAATGGAGCTCGCAGCTG	4100

C  AC136896.6	2294	GACCCGGAGGGAGCCTTTAACTGCCGTGGATATTCTTTATTTAATACTGC	2245
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4101	GACCCGGAGGGAGCCTTTAACTGCCGTGGATATTCTTTATTTAATACTGC	4150

C  AC136896.6	2244	TGCTGAATTGAACCCTTTTCCTGCAATAAACCATGGCTTTGTAAGCATGG	2195
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4151	TGCTGAATTGAACCCTTTTCCTGCAATAAACCATGGCTTTGTAAGCATGG	4200

C  AC136896.6	2194	TTGTTTGGGGTCCTCTGAGGCTTCTTAGCAATAGAATCCTGCCTAACTGC	2145
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4201	TTGTTTGGGGTCCTCTGAGGCTTCTTAGCAATAGAATCCTGCCTAACTGC	4250

C  AC136896.6	2144	CACCATTAGTGAAAAAGAATAGCCTACTTACAAAAAAAAAAATTACAGAA	2095
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4251	CACCATTAGTGAAAAAGAATAGCCTACTTACAAAAAAAAAAATTACAGAA	4300

C  AC136896.6	2094	GTAGCTCACTTCCCTTTATTTCATTTTTATTTACAACTATTTCTTGGCTG	2045
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4301	GTAGCTCACTTCCCTTTATTTCATTTTTATTTACAACTATTTCTTGGCTG	4350

C  AC136896.6	2044	TGATAATATGAAAGATAAATTTTAACAGCAAGAAAGTTATCAACATTTAT	1995
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4351	TGATAATATGAAAGATAAATTTTAACAGCAAGAAAGTTATCAACATTTAT	4400

C  AC136896.6	1994	CTAAAAATTAATATTTCCAGAATTCAAGGACCAATAGCATCTATTGAGAG	1945
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4401	CTAAAAATTAATATTTCCAGAATTCAAGGACCAATAGCATCTATTGAGAG	4450

C  AC136896.6	1944	ACTTAACTCAGGTAATAATGATAATAAATATCTTTGCAATGAAACCTGCA	1895
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4451	ACTTAACTCAGGTAATAATGATAATAAATATCTTTGCAATGAAACCTGCA	4500

C  AC136896.6	1894	AATGCTAATTACATCTGCGAGTTCCATGTGATGGTATATTTCCATCAGCA	1845
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4501	AATGCTAATTACATCTGCGAGTTCCATGTGATGGTATATTTCCATCAGCA	4550

C  AC136896.6	1844	AATAGAATAATCCTTCTGTGCTAGAATGGAAGGGGTTTAATGAAAAAAAA	1795
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4551	AATAGAATAATCCTTCTGTGCTAGAATGGAAGGGGTTTAATGAAAAAAAA	4600

C  AC136896.6	1794	AAAGAATGATAACTCCTTTGGGTAAGCATTCTCTTATGCCTTTAATAAGT	1745
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4601	AAAGAATGATAACTCCTTTGGGTAAGCATTCTCTTATGCCTTTAATAAGT	4650

C  AC136896.6	1744	CTGCACCTTTCATTATCTAGTCAGTTAACTTTGTCTTCTGCTTTCAATTT	1695
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4651	CTGCACCTTTCATTATCTAGTCAGTTAACTTTGTCTTCTGCTTTCAATTT	4700

C  AC136896.6	1694	TAAATCACTGTCTTCATTCATGAGCTAAAACTATGCAGAAAACACAGCAG	1645
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4701	TAAATCACTGTCTTCATTCATGAGCTAAAACTATGCAGAAAACACAGCAG	4750

C  AC136896.6	1644	GATGTTTAATTAATGCTCACTCAGCTACTTTCATGACTATTTTTCAAGTC	1595
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4751	GATGTTTAATTAATGCTCACTCAGCTACTTTCATGACTATTTTTCAAGTC	4800

C  AC136896.6	1594	AACATTTTAAAATTATTCTCTTTTTGTGGAGAATACAGCAAAGCGCACTT	1545
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4801	AACATTTTAAAATTATTCTCTTTTTGTGGAGAATACAGCAAAGCGCACTT	4850

C  AC136896.6	1544	CAGAATTCAAACAATCACTGCTTCTTGGTATGGTTATACTGGGACTGTTA	1495
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4851	CAGAATTCAAACAATCACTGCTTCTTGGTATGGTTATACTGGGACTGTTA	4900

C  AC136896.6	1494	TGCATGTGTTATGGATTAAAGCAAATAAAGAATAAAGTCAGTGAACTGGA	1445
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4901	TGCATGTGTTATGGATTAAAGCAAATAAAGAATAAAGTCAGTGAACTGGA	4950

C  AC136896.6	1444	ATCTCCAACCATGGGAGAAAGAATGCACAGCTATAAGATTGATGAAGTTA	1395
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	4951	ATCTCCAACCATGGGAGAAAGAATGCACAGCTATAAGATTGATGAAGTTA	5000

C  AC136896.6	1394	GGTAAGATCAGGTAGCCCTGAATTTGAATTAAAGTATCATGGTGAGCTCA	1345
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5001	GGTAAGATCAGGTAGCCCTGAATTTGAATTAAAGTATCATGGTGAGCTCA	5050

C  AC136896.6	1344	TGATGTATTATAGCTTAAACATATATATTTTCTACAACATTCCACTGAAA	1295
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5051	TGATGTATTATAGCTTAAACATATATATTTTCTACAACATTCCACTGAAA	5100

C  AC136896.6	1294	AATCCTAGAAACAATGTCTACTGTAATGGCAATCAGTACCCCCAGGGGAT	1245
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5101	AATCCTAGAAACAATGTCTACTGTAATGGCAATCAGTACCCCCAGGGGAT	5150

C  AC136896.6	1244	CTGGAAAGCAGTCTCTAAATACTATTTGGTAGAAAAGGAAACCAGGGACC	1195
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5151	CTGGAAAGCAGTCTCTAAATACTATTTGGTAGAAAAGGAAACCAGGGACC	5200

C  AC136896.6	1194	TTTGAATAATTAGTCATTCTATGTTTGAGCCAAGAAATGTACGAGACAAG	1145
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5201	TTTGAATAATTAGTCATTCTATGTTTGAGCCAAGAAATGTACGAGACAAG	5250

C  AC136896.6	1144	CCTAGAGCATCTTTTATAACAGACTGCAAATAATCTATTAAAAACTATTG	1095
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5251	CCTAGAGCATCTTTTATAACAGACTGCAAATAATCTATTAAAAACTATTG	5300

C  AC136896.6	1094	AAAGTATATCCAAAGGTCTTGGAAATAAATTTTAATTTCTGCCCACTGGC	1045
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5301	AAAGTATATCCAAAGGTCTTGGAAATAAATTTTAATTTCTGCCCACTGGC	5350

C  AC136896.6	1044	AAAAGATAAGAAAGAATAAGGTTTAGTAAGAATAAGCACAATGGATTGAA	995
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5351	AAAAGATAAGAAAGAATAAGGTTTAGTAAGAATAAGCACAATGGATTGAA	5400

C  AC136896.6	994	ATCTATCAAATATGTTTATCTCTTGCCTTTAGAAAGGTATTTTTTAAATA	945
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5401	ATCTATCAAATATGTTTATCTCTTGCCTTTAGAAAGGTATTTTTTAAATA	5450

C  AC136896.6	944	TGTTGGTCATTTTTGCAAAATAATGAGCTGGTTCCCTAGCATCACTCAAA	895
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5451	TGTTGGTCATTTTTGCAAAATAATGAGCTGGTTCCCTAGCATCACTCAAA	5500

C  AC136896.6	894	CTAGTAAGTAAAGGGGAAAGACTCAAGTATTTGTCCACCTTTTCCTCTAC	845
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5501	CTAGTAAGTAAAGGGGAAAGACTCAAGTATTTGTCCACCTTTTCCTCTAC	5550

C  AC136896.6	844	GAATTACACCTTAGGGCATCCAGGCAATCAGGCAGTCTTAGGTTTATCCC	795
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5551	GAATTACACCTTAGGGCATCCAGGCAATCAGGCAGTCTTAGGTTTATCCC	5600

C  AC136896.6	794	CATAGAAGTATCACATCCCCACCTGCGATTAAACATACTTCAGTCATCTA	745
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5601	CATAGAAGTATCACATCCCCACCTGCGATTAAACATACTTCAGTCATCTA	5650

C  AC136896.6	744	GGAGACTATGTTCTAGGTCAGATTTTAAATTTTTGGTAAAACTTATTTCA	695
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5651	GGAGACTATGTTCTAGGTCAGATTTTAAATTTTTGGTAAAACTTATTTCA	5700

C  AC136896.6	694	CTTAAAAGTGAATACCTGAAGAGGCCCACTGCTCAAAGCAGGAAGCTGGG	645
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5701	CTTAAAAGTGAATACCTGAAGAGGCCCACTGCTCAAAGCAGGAAGCTGGG	5750

C  AC136896.6	644	GTCCTTGGGTGGAAGGTATAAAGAACTGACCAATGAAGAAGCTAGGGCCA	595
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5751	GTCCTTGGGTGGAAGGTATAAAGAACTGACCAATGAAGAAGCTAGGGCCA	5800

C  AC136896.6	594	CTCTGCTGTAAATGTATAATGACTGTGCAGAGGCCTTTAAGCTCCACAGT	545
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5801	CTCTGCTGTAAATGTATAATGACTGTGCAGAGGCCTTTAAGCTCCACAGT	5850

C  AC136896.6	544	GTATATCCTCTATAGGCATGAAAGCCCTGATGGACAATGACCAGAGCATC	495
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5851	GTATATCCTCTATAGGCATGAAAGCCCTGATGGACAATGACCAGAGCATC	5900

C  AC136896.6	494	ACCCCCAGCCCTCCACCTGGGTCACTACACCACTGCAGTTTCTGCATTCA	445
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5901	ACCCCCAGCCCTCCACCTGGGTCACTACACCACTGCAGTTTCTGCATTCA	5950

C  AC136896.6	444	CCATCCGGTAACTCTTCTTTGGTATTCTATGTCATGACATGATTTGGATC	395
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	5951	CCATCCGGTAACTCTTCTTTGGTATTCTATGTCATGACATGATTTGGATC	6000

C  AC136896.6	394	TACTTGTCACATACATGGCTATCAAGTCAGTCTATGAGCAGACCAGAAAG	345
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	6001	TACTTGTCACATACATGGCTATCAAGTCAGTCTATGAGCAGACCAGAAAG	6050

C  AC136896.6	344	GGGGTCACTAGAGAACTAAAAAGAAAAAATTAACGCAAAAACAGAAACTA	295
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	6051	GGGGTCACTAGAGAACTAAAAAGAAAAAATTAACGCAAAAACAGAAACTA	6100

C  AC136896.6	294	AAACAACAGGAAGAAAAGGGAACTTGGAGGAAACAGAAAGAATGTACAGG	245
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	6101	AAACAACAGGAAGAAAAGGGAACTTGGAGGAAACAGAAAGAATGTACAGG	6150

C  AC136896.6	244	GAAATAATACACAATAAATTATTATTATTGATCTTAAAGAGATAATCATT	195
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	6151	GAAATAATACACAATAAATTATTATTATTGATCTTAAAGAGATAATCATT	6200

C  AC136896.6	194	ATTGCAGTCAAGAGACAAGTTCAGAAAAAAAATAACTGTTGGAAAAAAAA	145
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	6201	ATTGCAGTCAAGAGACAAGTTCAGAAAAAAAATAACTGTTGGAAAAAAAA	6250

C  AC136896.6	144	TAAGATAGTCCAAATAGAATGAAAGGAAGATAAAGTTGAAAAAATATAGG	95
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	6251	TAAGATAGTCCAAATAGAATGAAAGGAAGATAAAGTTGAAAAAATATAGG	6300

C  AC136896.6	94	CCCAATGATTAGGAAAACAGAGCTGAAAAGCAGTGGAGAAAATATATGCA	45
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	6301	CCCAATGATTAGGAAAACAGAGCTGAAAAGCAGTGGAGAAAATATATGCA	6350

C  AC136896.6	44	AAATAAATGATTCCCTCCAGAAGTCATCTGAATTGTAGGAATTC	1
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	6351	AAATAAATGATTCCCTCCAGAAGTCATCTGAATTGTAGGAATTC	6394

Compact alignment

skip 300 bps 100% identity alignment

C  AC136896.6	6094	CCTTTCCTCAGGGTACAGGGAGGTACAGGGAGAATACCGCTGGGATGAGG	6045
			||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC127511.7	301	CCTTTCCTCCGGGTACAGGGAGGTACAGGGAGAATACCGCTGGGATGAGG	350

skip 1900 bps 100% identity alignment

C  AC136896.6	4144	GGGTTGAAATTGTTTCCTTCCCTTATTAGCTTTGTGATCTTGAGCTATTG	4095
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
  AC127511.7	2251	GGGTTGAAATTGTTTCCTTCCCTTATTAGCTTTGTGACCTTGAGCTATTG	2300

skip 100 bps 100% identity alignment

C  AC136896.6	3994	TGTACTGATATAACACGATACCTGAGACTTGGTAGTGTATGAATAATATA	3945
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
  AC127511.7	2401	TGTACTGATATAACACGATACCTGAGACTTGGTAGTTTATGAATAATATA	2450

skip 3944 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AC136896.6 - 214946 bps
Hit
AC127511.7 - 201949 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 6394 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link