<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 5754 bps / non-identical: 550 bps

Full alignment

AC023449.11	169583	GAATTCATGGGTATAACATTTGCAAAGCCAAGGAATAATAGTAATAGCAA	169632
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1	GAATTCATGGGTATAACATTTGCAAAGCCAAGGAATAATAGTAATAGCAA	50

AC023449.11	169633	GGTATAGTATTTACTCTCTGCCAGGCACTTTTTAACACTGTTACTGTCCC	169682
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	51	GGTATAGTATTTACTCTCTGCCAGGCACTTTTTAACACTGTTACTGTCCC	100

AC023449.11	169683	CTCTCTACAGATAAGCAGACTGAGGCAAAGACAGGCCAAGTAGATTGTTT	169732
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	101	CTCTCTACAGATAAGCAGACTGAGGCAAAGACAGGCCAAGTAGATTGTTT	150

AC023449.11	169733	AAGTAGAATTGTTTAATTGTTAAGTGAGCCAGGAGGTGAAGCCAGGTGGC	169782
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	151	AAGTAGAATTGTTTAATTGTTAAGTGAGCCAGGAGGTGAAGCCAGGTGGC	200

AC023449.11	169783	TGGGTGTCCACATTCAACTCTAAAGCAATCCCTGCCTCTCTGGGGTAGCA	169832
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	201	TGGGTGTCCACATTCAACTCTAAAGCAATCCCTGCCTCTCTGGGGTAGCA	250

AC023449.11	169833	ACATAAAGACCAACAGCCTTAGGAATGCAATGAATGGGACAGGATTTGTT	169882
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	251	ACATAAAGACCAACAGCCTTAGGAATGCAATGAATGGGACAGGATTTGTT	300

AC023449.11	169883	TCCCACCTAGTTGAAATGACAAAGACTGAGAATTTCAGCCCCAGAAGGAA	169932
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	301	TCCCACCTAGTTGAAATGACAAAGACTGAGAATTTCAGCCCCAGAAGGAA	350

AC023449.11	169933	TTTTTGAGTCATTTTCAGGTTTTTATGAGAACTCTTCACCAAGTAAAATA	169982
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	351	TTTTTGAGTCATTTTCAGGTTTTTATGAGAACTCTTCACCAAGTAAAATA	400

AC023449.11	169983	ATACAAAATCATCAATGCATGATTGCTTGTAGCTCCACCAAGATGGAGCA	170032
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	401	ATACAAAATCATCAATGCATGATTGCTTGTAGCTCCACCAAGATGGAGCA	450

AC023449.11	170033	GTCCCACTCCTCCAGGTCCTCCTCTCAAGACAAAAAATGCCCTGACACAA	170082
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	451	GTCCCACTCCTCCAGGTCCTCCTCTCAAGACAAAAAATGCCCTGACACAA	500

AC023449.11	170083	CACAACAAATGCACTTGGGGAGACTGACAAGGGGCCGCTGCCTAGGAACC	170132
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	501	CACAACAAATGCACTTGGGGAGACTGACAAGGGGCCGCTGCCTAGGAACC	550

AC023449.11	170133	TGGGAAACCACACGTGGTGTTGCCTCCCAGTATCCCAGGCGCAGCCACAG	170182
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	551	TGGGAAACCACACGTGGTGTTGCCTCCCAGTATCCCAGGCGCAGCCACAG	600

AC023449.11	170183	AGCCTCCCGCCAGACCACCACGGGCACAGACTCAGAAGGCCCCAGGCAGG	170232
			||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	601	AGCCTCCCGCCAGACCACCACAGGCACAGACTCAGAAGGCCCCAGGCAGG	650

AC023449.11	170233	CTGGCATGCTAAGCCTCGGGCCAGGAAAGCTGAGCTAAGGACAGAAAACC	170282
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	651	CTGGCATGCTAAGCCTCGGGCCAGGAAAGCTGAGCTAAGGACAGAAAACC	700

AC023449.11	170283	TTTTGGCAATGCCACCCCTACTCCAGTCAAATATCAAGAAAAAAAAACAA	170332
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	701	TTTTGGCAATGCCACCCCTACTCCAGTCAAATATCAAGAAAAAAAAACAA	750

AC023449.11	170333	ACCACTCCTACCTGTGTCGGTGGCCTGGCAGGTGCTGATTTTCCACCTGC	170382
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	751	ACCACTCCTACCTGTGTCGGTGGCCTGGCAGGTGCTGATTTTCCACCTGC	800

AC023449.11	170383	CCCCTCTACCACAGAGCAGGTGGTGGCCCGCTGTGGTGGGGTTGAGCAGG	170432
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	801	CCCCTCTACCACAGAGCAGGTGGTGGCCCGCTGTGGTGGGGTTGAGCAGG	850

AC023449.11	170433	GAGCTCATGGTGCACCCTCTGCCCGGGGACACAAGTGAGACACACAAGTC	170482
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	851	GAGCTCATGGTGCACCCTCTGCCCGGGGACACAAGTGAGACACACAAGTC	900

AC023449.11	170483	TCCCTGCCATGGTAGAGTCAGGGGGTCCAGGGTGAGTTGAGCCTCTACTC	170532
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	901	TCCCTGCCATGGTAGAGTCAGGGGGTCCAGGGTGAGTTGAGCCTCTACTC	950

AC023449.11	170533	CCATGACGGAAGTCAGCCCTCTGCTTCTCACTCCCCAGGGTCAACAGAGC	170582
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	951	CCATGACGGAAGTCAGCCCTCTGCTTCTCACTCCCCAGGGTCAACAGAGC	1000

AC023449.11	170583	CTAGCAAAGAGCTGAGCTGAGCTCCTGAACCTTGTAGGCAATGAGGTGGT	170632
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1001	CTAGCAAAGAGCTGAGCTGAGCTCCTGAACCTTGTAGGCAATGAGGTGGT	1050

AC023449.11	170633	GTGAATTAGTGCCCAACTTCTACCCAGAAGGGGTCAACAACGAAGAAAGG	170682
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1051	GTGAATTAGTGCCCAACTTCTACCCAGAAGGGGTCAACAACGAAGAAAGG	1100

AC023449.11	170683	CTGAACCTTTATCCCCTGCAGTCCAAGGAGGTGGTGTGAATTTGGCTTGC	170732
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1101	CTGAACCTTTATCCCCTGCAGTCCAAGGAGGTGGTGTGAATTTGGCTTGC	1150

AC023449.11	170733	TCAATGTTCACACTGGTACTGGCAGGGCTCAGTGGGAAGATGGACACAGT	170782
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1151	TCAATGTTCACACTGGTACTGGCAGGGCTCAGTGGGAAGATGGACACAGT	1200

AC023449.11	170783	CACCCACCTGGCCCTTGTGCTACCTCCAGGGGCAATGCTTGCTAAAAAAG	170832
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1201	CACCCACCTGGCCCTTGTGCTACCTCCAGGGGCAATGCTTGCTAAAAAAG	1250

AC023449.11	170833	ATGATTGGATAGGATGTAGAGGCTCATAGCCTAATATCCAAAAAGGCTAG	170882
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1251	ATGATTGGATAGGATGTAGAGGCTCATAGCCTAATATCCAAAAAGGCTAG	1300

AC023449.11	170883	GCTACAACTGAAAACTCCACAAAAGCCAAGAACCAGGAGACCACAATTTG	170932
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1301	GCTACAACTGAAAACTCCACAAAAGCCAAGAACCAGGAGACCACAATTTG	1350

AC023449.11	170933	AATGAGAAAAGGCAATATCAGTTTTTGGAATGTTCTGAAAAGAACTTTAA	170982
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1351	AATGAGAAAAGGCAATATCAGTTTTTGGAATGTTCTGAAAAGAACTTTAA	1400

AC023449.11	170983	AGCAGGCATCATAAAAATGCCTCCACATGTGGTTAAAATTCTCTTGAAAC	171032
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1401	AGCAGGCATCATAAAAATGCCTCCACATGTGGTTAAAATTCTCTTGAAAC	1450

AC023449.11	171033	AAACTGAAAAAATAGAAAAATGCAGCAAAGAAATAGAAATTATTTTTTAA	171082
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1451	AAACTGAAAAAATAGAAAAATGCAGCAAAGAAATAGAAATTATTTTTTAA	1500

AC023449.11	171083	AAGAACCAGATGCAAATTACAGAACTGCAAAATAAAATAACTGAAATGAA	171132
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1501	AAGAACCAGATGCAAATTACAGAACTGCAAAATAAAATAACTGAAATGAA	1550

AC023449.11	171133	AAACAAGCTGGAAAAAATAATAGAGTGGAGACGACAGAGAATAGAAACAA	171182
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1551	AAACAAGCTGGAAAAAATAATAGAGTGGAGACGACAGAGAATAGAAACAA	1600

AC023449.11	171183	TAAACTTGAGGACACGTCAGTGGCATTAACCCAGTCTGAACAACAGAGAG	171232
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1601	TAAACTTGAGGACACGTCAGTGGCATTAACCCAGTCTGAACAACAGAGAG	1650

AC023449.11	171233	AAAATAGACTGAAAAAAAATTTAACAGAGGTTCAGGGAACTGTAAGACAA	171282
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1651	AAAATAGACTGAAAAAAAATTTAACAGAGGTTCAGGGAACTGTAAGACAA	1700

AC023449.11	171283	TAAAAAGAGTTAAGATTTGGGCCGGGCGTGGCGGCTTATGCCTGTAATCT	171332
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1701	TAAAAAGAGTTAAGATTTGGGCCGGGCGTGGCGGCTTATGCCTGTAATCT	1750

AC023449.11	171333	CAACACGTTGCGAGGCCGAGGCAGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCA	171382
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1751	CAACACGTTGCGAGGCCGAGGCAGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCA	1800

AC023449.11	171383	AGACCAGCCTGGTCAACATCGTGAAACCCTGTCTCTACAAAAATACAAAA	171432
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1801	AGACCAGCCTGGTCAACATCGTGAAACCCTGTCTCTACAAAAATACAAAA	1850

AC023449.11	171433	AAACTAGCTGGGTGAGGAGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAA	171482
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1851	AAACTAGCTGGGTGAGGAGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAA	1900

AC023449.11	171483	GTTGGGGCAGGATGATAGCTTGAACCCTGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGC	171532
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1901	GTTGGGGCAGGATGATAGCTTGAACCCTGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGC	1950

AC023449.11	171533	CAAGATCACACTACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGCATGACTCTAT	171582
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	1951	CAAGATCACACTACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGCATGACTCTAT	2000

AC023449.11	171583	CGCAATAAAAATAAAAATAAAAAATAAAAAGAGCTAAGATTCAAATCACT	171632
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2001	CGCAATAAAAATAAAAATAAAAAATAAAAAGAGCTAAGATTCAAATCACT	2050

AC023449.11	171633	GAAGTTAAAGAAAAAGAGGAAAGAGAGGGTGGAACTGGAAAGTGTCAGAA	171682
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2051	GAAGTTAAAGAAAAAGAGGAAAGAGAGGGTGGAACTGGAAAGTGTCAGAA	2100

AC023449.11	171683	GAAATAATGTCTGAAAATTTCTCAAATTTGGTAAAAAATATAAATGTGCT	171732
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2101	GAAATAATGTCTGAAAATTTCTCAAATTTGGTAAAAAATATAAATGTGCT	2150

AC023449.11	171733	GCATGAGTTTCCTGTGCTGCCATAACGAATCACCACAAACCTGTTGTCTT	171782
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
AC124305.3	2151	GCATGAGTTTCCTGTGCTGCCATAACGAATCACCACAAACCTCTTGTCTT	2200

AC023449.11	171783	AAAAGAGCAGAAATGTGTTCTCTCACAGTTCTGGAGGCCTGAAGTCGGAA	171832
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2201	AAAAGAGCAGAAATGTGTTCTCTCACAGTTCTGGAGGCCTGAAGTCGGAA	2250

AC023449.11	171833	ATAAAAAATCACTGGACCAAAATCAAGGTGTCTGCAGGCTCCGAAAGCTC	171882
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2251	ATAAAAAATCACTGGACCAAAATCAAGGTGTCTGCAGGCTCCGAAAGCTC	2300

AC023449.11	171883	CAGGGAAGACTCCATGCCTGGCCTCTTCCAGCTGCAGGCTGTTGGTGTTC	171932
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2301	CAGGGAAGACTCCATGCCTGGCCTCTTCCAGCTGCAGGCTGTTGGTGTTC	2350

AC023449.11	171933	TTGTTTGTGGCTCCGTCACTCCAGCCACTGCCTCCATGATTACATTGCCT	171982
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2351	TTGTTTGTGGCTCCGTCACTCCAGCCACTGCCTCCATGATTACATTGCCT	2400

AC023449.11	171983	TCTCTTTTCTGTGTTTTCTCTGTGTGTCAATTTTCTCTTCTTTTCTTTAC	172032
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2401	TCTCTTTTCTGTGTTTTCTCTGTGTGTCAATTTTCTCTTCTTTTCTTTAC	2450

AC023449.11	172033	AAGGATACCTGTGATAGTATTTAGGGTCCACCTGAGATAATCTAAGATTA	172082
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2451	AAGGATACCTGTGATAGTATTTAGGGTCCACCTGAGATAATCTAAGATTA	2500

AC023449.11	172083	CTCCTTTATCTCAAGATTCTTAACTTAATCACATCTGTAAGACTCCCCAC	172132
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2501	CTCCTTTATCTCAAGATTCTTAACTTAATCACATCTGTAAGACTCCCCAC	2550

AC023449.11	172133	TCCCACCTTTTTTTGGCGACAGGGTCTTACTCTGTCACCAGGCTGGAGTG	172182
			|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2551	TCCCACCTTTTTTTGGTGACAGGGTCTTACTCTGTCACCAGGCTGGAGTG	2600

AC023449.11	172183	AGTGGTGCTCAATGTAGCCTTGACCTCCCGGGCTCAAACGATCCTCCCAC	172232
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2601	AGTGGTGCTCAATGTAGCCTTGACCTCCCGGGCTCAAACGATCCTCCCAC	2650

AC023449.11	172233	CTCAGCTTCCCAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACGATGCCTACCCG	172282
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2651	CTCAGCTTCCCAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACGATGCCTACCCG	2700

AC023449.11	172283	AAAGACCCTTTG-TTTTTTTTTTCATATAAGGTAATGTCCACAGGTTCCA	172331
			|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2701	AAAGACCCTTTGTTTTTTTTTTTCATATAAGGTAATGTCCACAGGTTCCA	2750

AC023449.11	172332	GGGATTTGACATGGATATCTTTTTTTGAGGGGGGGACTGCATTTGTCAGC	172381
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2751	GGGATTTGACATGGATATCTTTTTTTGAGGGGGGGACTGCATTTGTCAGC	2800

AC023449.11	172382	CCACCATGCCTACAGATTCAAGAAGCTTGAATCCCAAATAAAACCCAAAG	172431
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2801	CCACCATGCCTACAGATTCAAGAAGCTTGAATCCCAAATAAAACCCAAAG	2850

AC023449.11	172432	TCCCTAACAAGACACAACGTAATTAAACTTGTGAAAACTAAAGATAAAAA	172481
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2851	TCCCTAACAAGACACAACGTAATTAAACTTGTGAAAACTAAAGATAAAAA	2900

AC023449.11	172482	TCTTCAAAGGAGCCAGACAGAAATGACACATTACTTAGAGGCAATAAACA	172531
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2901	TCTTCAAAGGAGCCAGACAGAAATGACACATTACTTAGAGGCAATAAACA	2950

AC023449.11	172532	ATCTGAATTATAATTTATTTCTTGCCTGAAATAATCAAGACCAAAAAGAA	172581
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2951	ATCTGAATTATAATTTATTTCTTGCCTGAAATAATCAAGACCAAAAAGAA	3000

AC023449.11	172582	AATTTTAATATGTAAAAGTCAAAAGCATAAAACAGCAGCCCTGCTCTTGT	172631
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3001	AATTTTAATATGTAAAAGTCAAAAGCATAAAACAGCAGCCCTGCTCTTGT	3050

AC023449.11	172632	CAGGGGTAGGTTCTGGGTGATACCCAAGCCTCACCTAGTTACCTACCCAT	172681
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3051	CAGGGGTAGGTTCTGGGTGATACCCAAGCCTCACCTAGTTACCTACCCAT	3100

AC023449.11	172682	ACAAACTCCCACCAAGACTGTTTCATGACTCCTAAGTCTTAGCCAAGGAT	172731
			|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3101	ACAAACTCTCACCAAGACTGTTTCATGACTCCTAAGTCTTAGCCAAGGAT	3150

AC023449.11	172732	TTTCACAAAGGTATGCAAAAATGTTAAATTTTAACGGTCTCATGTTTTTC	172781
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3151	TTTCACAAAGGTATGCAAAAATGTTAAATTTTAACGGTCTCATGTTTTTC	3200

AC023449.11	172782	AAGATCTGTTATTCAAAATTACCTTTATTCACTGTCTAATAGATCAACTA	172831
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3201	AAGATCTGTTATTCAAAATTACCTTTATTCACTGTCTAATAGATCAACTA	3250

AC023449.11	172832	CCTCATATTCATGATCTGACCAAATGACTTAAGCAGTGAATATGGAATTG	172881
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3251	CCTCATATTCATGATCTGACCAAATGACTTAAGCAGTGAATATGGAATTG	3300

AC023449.11	172882	ATAGGAACAACACATTGGGCAGTGAGCCTAGTGCTTCTCAAACTTTTTTT	172931
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
AC124305.3	3301	ATAGGAACAACACATTGGGCAGTGAGCCTAGTGCTTCTCAAAC-------	3343

AC023449.11	172932	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCCCTCT	172981
			          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3344	----------TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCCCTCT	3383

AC023449.11	172982	GTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTGGGTTCACTGCAAGCTCC	173031
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3384	GTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTGGGTTCACTGCAAGCTCC	3433

AC023449.11	173032	GCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCAGGT	173081
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3434	GCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCAGGT	3483

AC023449.11	173082	ACTACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATGTTTTGTGTTTTTAGTAG	173131
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3484	ACTACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATGTTTTGTGTTTTTAGTAG	3533

AC023449.11	173132	AGACGGGGTTTCATCCTGTTAGCCAGGACGGTCTCGATCTCCTGACCTCG	173181
			|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3534	AGACAGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGACGGTCTCGATCTCCTGACCTCG	3583

AC023449.11	173182	TGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGAC	173231
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3584	TGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGAC	3633

AC023449.11	173232	ACCGCCCGGCCGCTTCTCAAACTTTAAAATGGAATCACCTGAAGCTCTTC	173281
			||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3634	ACCGCCCGGCCACTTCTCAAACTTTAAAATGGAATCACCTGAAGCTCTTC	3683

AC023449.11	173282	TAACTCAGTTCGTCAGGGGGTGTGGGAGGAGCTGAGAGTCCACATTGCTA	173331
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3684	TAACTCAGTTCGTCAGGGGGTGTGGGAGGAGCTGAGAGTCCACATTGCTA	3733

AC023449.11	173332	ACAAGCTCCCAGCTGATGTTTGTGCTGTGGGATCTGGGACCATACGCTGA	173381
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3734	ACAAGCTCCCAGCTGATGTTTGTGCTGTGGGATCTGGGACCATACGCTGA	3783

AC023449.11	173382	GTAGTAAAGACCTGAGCACAAGGCCACTTCTGTGAGTTTATGATCAGTGT	173431
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3784	GTAGTAAAGACCTGAGCACAAGGCCACTTCTGTGAGTTTATGATCAGTGT	3833

AC023449.11	173432	ATGCATATGTATTAACGCCAGTAAAAGGACAGGATCTTTGAAATTAGGAA	173481
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3834	ATGCATATGTATTAACGCCAGTAAAAGGACAGGATCTTTGAAATTAGGAA	3883

AC023449.11	173482	AATCTGGTTTTAAATACATTTTGCCCTTTCCAGATGACTGACCTTAAAAA	173531
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3884	AATCTGGTTTTAAATACATTTTGCCCTTTCCAGATGACTGACCTTAAAAA	3933

AC023449.11	173532	AGGTATCTACCTCTCTGAGTCTGAGTTTCAACATATACCCAATGAAGGTA	173581
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3934	AGGTATCTACCTCTCTGAGTCTGAGTTTCAACATATACCCAATGAAGGTA	3983

AC023449.11	173582	TTTTAGTAATTGACTCATGACACTACCTGATTTCAATGCTTACTATAAAA	173631
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3984	TTTTAGTAATTGACTCATGACACTACCTGATTTCAATGCTTACTATAAAA	4033

AC023449.11	173632	TGACCATAAAAATAAACATATTGATCAATGGAACAGAATACTGTTCAGAA	173681
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4034	TGACCATAAAAATAAACATATTGATCAATGGAACAGAATACTGTTCAGAA	4083

AC023449.11	173682	ATACCAGCACTTACATCTTCCACTGATATTTTAACTTTTGAAATAAATAT	173731
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4084	ATACCAGCACTTACATCTTCCACTGATATTTTAACTTTTGAAATAAATAT	4133

AC023449.11	173732	TCACAGGAGGTTGCAAAGGCAGCACACAGGTCTCATGGATCCTTAACCCA	173781
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4134	TCACAGGAGGTTGCAAAGGCAGCACACAGGTCTCATGGATCCTTAACCCA	4183

AC023449.11	173782	GTTTCTCCCCCATAGTCACATCTTACATTATTACAGTGCAATATCAAAAC	173831
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4184	GTTTCTCCCCCATAGTCACATCTTACATTATTACAGTGCAATATCAAAAC	4233

AC023449.11	173832	CAGGAATTTGACACTGATACAATGTGAGTGCATAGTTCTGTGTCGTTTTA	173881
			||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4234	CAGGAATTTGACATTGATACAATGTGAGTGCATAGTTCTGTGTCGTTTTA	4283

AC023449.11	173882	GCACATATGTAGATTCGTGTAGCTACCACGACACTCAAGACACAGAACTA	173931
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4284	GCACATATGTAGATTCGTGTAGCTACCACGACACTCAAGACACAGAACTA	4333

AC023449.11	173932	TTCCATGACCGCAAAGATACCTTTGTGCTAGCCCTCACTACCAATCTGTT	173981
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4334	TTCCATGACCGCAAAGATACCTTTGTGCTAGCCCTCACTACCAATCTGTT	4383

AC023449.11	173982	TCCTGTCTCTGCAATTTTATAATTTCAAGAATGGTATATAAACAGTATTA	174031
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4384	TCCTGTCTCTGCAATTTTATAATTTCAAGAATGGTATATAAACAGTATTA	4433

AC023449.11	174032	TACAATGTGTAACCTTTTGATATTGGCTGTTTTTCACTTAGCATAATGCC	174081
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4434	TACAATGTGTAACCTTTTGATATTGGCTGTTTTTCACTTAGCATAATGCC	4483

AC023449.11	174082	CTTGGGATACTTCCCGGTCATTGTATCCATAGTTCATTCTATTTTGCTGC	174131
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4484	CTTGGGATACTTCCCGGTCATTGTATCCATAGTTCATTCTATTTTGCTGC	4533

AC023449.11	174132	TGAGTAGTACTCCATGGTATGAATTTGCTCCAGTTTGTTCAGCCATTCAC	174181
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4534	TGAGTAGTACTCCATGGTATGAATTTGCTCCAGTTTGTTCAGCCATTCAC	4583

AC023449.11	174182	CTATAAGGGACATTCTGGTGTTTCCGGTTTTTGGCTATTTACAAATAATG	174231
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4584	CTATAAGGGACATTCTGGTGTTTCCGGTTTTTGGCTATTTACAAATAATG	4633

AC023449.11	174232	CTGCTGTGAACAATTATGTACACAATTTGTGCAGACATAAGTCTCCATTT	174281
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4634	CTGCTGTGAACAATTATGTACACAATTTGTGCAGACATAAGTCTCCATTT	4683

AC023449.11	174282	CTCTGGGATAAAAGCCCATGATTGTACACTAAGTGTTGTGTGTGTGTGTG	174331
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4684	CTCTGGGATAAAAGCCCATGATTGTACACTAAGTGTTGTGTGTGTGTGTG	4733

AC023449.11	174332	TATGTATATATATATACATATTTTTTTTTTTTTGAGATAGGGTCTCACTG	174381
			|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4734	TATGTATATATATATACATA-TTTTTTTTTTTTGAGATAGGGTCTCACTG	4782

AC023449.11	174382	GAGACTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCCCACTGCAACCTCCACTGCA	174431
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4783	GAGACTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCCCACTGCAACCTCCACTGCA	4832

AC023449.11	174432	CAGATTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTATA	174481
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4833	CAGATTCAAGTGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTATA	4882

AC023449.11	174482	GGTGTGTGCCACCATGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGG	174531
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4883	GGTGTGTGCCACCATGCCTGACTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGG	4932

AC023449.11	174532	GTTTTACCATGTTGGCCACGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAATGATC	174581
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4933	GTTTTACCATGTTGGCCACGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAATGATC	4982

AC023449.11	174582	CACCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTATAGGCGTGAGCCACCGT	174631
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4983	CACCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTATAGGCGTGAGCCACCGT	5032

AC023449.11	174632	GCCCGGCTGCTAAGAGTATATTCACTTGTTTAATAAGCTGCCACAATGTT	174681
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	5033	GCCCGGCTGCTAAGAGTATATTCACTTGTTTAATAAGCTGCCACAATGTT	5082

AC023449.11	174682	TTCCATAGTAGCTGTAGCATCGGGTACATTCCCACCAGTAAGGTATGAGA	174731
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	5083	TTCCATAGTAGCTGTAGCATCGGGTACATTCCCACCAGTAAGGTATGAGA	5132

AC023449.11	174732	GATTCGGTTCCTCTTCTACAGCATTTGGTGCTGTCACTATTTTTTATTTT	174781
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	5133	GATTCGGTTCCTCTTCTACAGCATTTGGTGCTGTCACTATTTTTTATTTT	5182

AC023449.11	174782	AGCTGTTCTAATAGGTGTGTAGTGATATCTTATTGTAGTCTTAATCTGCA	174831
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	5183	AGCTGTTCTAATAGGTGTGTAGTGATATCTTATTGTAGTCTTAATCTGCA	5232

AC023449.11	174832	TTTCCCTAATGGCTAATGATGTTGAACATCTTTTAATGTGTTTATTTGCC	174881
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	5233	TTTCCCTAATGGCTAATGATGTTGAACATCTTTTAATGTGTTTATTTGCC	5282

AC023449.11	174882	ATCTGCATTTCTTTTTTTTTTTTTAGGGGACAGGCTCTCTCTATGTTACC	174931
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	5283	ATCTGCATTTCTTTTTTTTTTTTTAGGGGACAGGCTCTCTCTATGTTACC	5332

AC023449.11	174932	CAGGCTGGAGTGCAGTAGCACCATCATAGCTCACTGCAGCCTGGAGTTCC	174981
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	5333	CAGGCTGGAGTGCAGTAGCACCATCATAGCTCACTGCAGCCTGGAGTTCC	5382

AC023449.11	174982	TGGGCTCAAGTATTCCTCCAGCCTCTGCCTTCCAAAGTGCTGGGACTATA	175031
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	5383	TGGGCTCAAGTATTCCTCCAGCCTCTGCCTTCCAAAGTGCTGGGACTATA	5432

AC023449.11	175032	GGGATGTGCCACCATGCCCAGCCATTGACATTGTTACTATGTTATGTCTT	175081
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	5433	GGGATGTGCCACCATGCCCAGCCATTGACATTGTTACTATGTTATGTCTT	5482

AC023449.11	175082	CAAATCTCTGATCATGAAATAGCTCTCTATTTCCATCTTGTTTTCCTTTC	175131
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	5483	CAAATCTCTGATCATGAAATAGCTCTCTATTTCCATCTTGTTTTCCTTTC	5532

AC023449.11	175132	TTCCATTAGCATTTTATAGTTTTCAGCATGCCAGTCCTGTAAATGTTTTG	175181
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	5533	TTCCATTAGCATTTTATAGTTTTCAGCATGCCAGTCCTGTAAATGTTTTG	5582

AC023449.11	175182	CTAGATTTAAAACTATGTATTTCTCCCTTTTTATTTTGAATTATTGTTAA	175231
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	5583	CTAGATTTAAAACTATGTATTTCTCCCTTTTTATTTTGAATTATTGTTAA	5632

AC023449.11	175232	TGGTATTGTATTTTTAAATTTGGTTTCCACGTGTCCATTGTTAGTATACA	175281
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	5633	TGGTATTGTATTTTTAAATTTGGTTTCCACGTGTCCATTGTTAGTATACA	5682

AC023449.11	175282	GAAATACAATTGATCGCTGCATGTTGATTTTGTAGCCTGTAACTCTATGG	175331
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	5683	GAAATACAATTGATCGCTGCATGTTGATTTTGTAGCCTGTAACTCTATGG	5732

AC023449.11	175332	AATTC	175336
			|||||
AC124305.3	5733	AATTC	5737

Compact alignment

skip 600 bps 100% identity alignment

AC023449.11	170183	AGCCTCCCGCCAGACCACCACGGGCACAGACTCAGAAGGCCCCAGGCAGG	170232
			||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	601	AGCCTCCCGCCAGACCACCACAGGCACAGACTCAGAAGGCCCCAGGCAGG	650

skip 1500 bps 100% identity alignment

AC023449.11	171733	GCATGAGTTTCCTGTGCTGCCATAACGAATCACCACAAACCTGTTGTCTT	171782
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
AC124305.3	2151	GCATGAGTTTCCTGTGCTGCCATAACGAATCACCACAAACCTCTTGTCTT	2200

skip 350 bps 100% identity alignment

AC023449.11	172133	TCCCACCTTTTTTTGGCGACAGGGTCTTACTCTGTCACCAGGCTGGAGTG	172182
			|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2551	TCCCACCTTTTTTTGGTGACAGGGTCTTACTCTGTCACCAGGCTGGAGTG	2600

skip 100 bps 100% identity alignment

AC023449.11	172283	AAAGACCCTTTG-TTTTTTTTTTCATATAAGGTAATGTCCACAGGTTCCA	172331
			|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	2701	AAAGACCCTTTGTTTTTTTTTTTCATATAAGGTAATGTCCACAGGTTCCA	2750

skip 350 bps 100% identity alignment

AC023449.11	172682	ACAAACTCCCACCAAGACTGTTTCATGACTCCTAAGTCTTAGCCAAGGAT	172731
			|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3101	ACAAACTCTCACCAAGACTGTTTCATGACTCCTAAGTCTTAGCCAAGGAT	3150

skip 150 bps 100% identity alignment

AC023449.11	172882	ATAGGAACAACACATTGGGCAGTGAGCCTAGTGCTTCTCAAACTTTTTTT	172931
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
AC124305.3	3301	ATAGGAACAACACATTGGGCAGTGAGCCTAGTGCTTCTCAAAC-------	3343

AC023449.11	172932	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCCCTCT	172981
			          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3344	----------TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCCCTCT	3383

skip 150 bps 100% identity alignment

AC023449.11	173132	AGACGGGGTTTCATCCTGTTAGCCAGGACGGTCTCGATCTCCTGACCTCG	173181
			|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3534	AGACAGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGACGGTCTCGATCTCCTGACCTCG	3583

skip 50 bps 100% identity alignment

AC023449.11	173232	ACCGCCCGGCCGCTTCTCAAACTTTAAAATGGAATCACCTGAAGCTCTTC	173281
			||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	3634	ACCGCCCGGCCACTTCTCAAACTTTAAAATGGAATCACCTGAAGCTCTTC	3683

skip 550 bps 100% identity alignment

AC023449.11	173832	CAGGAATTTGACACTGATACAATGTGAGTGCATAGTTCTGTGTCGTTTTA	173881
			||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4234	CAGGAATTTGACATTGATACAATGTGAGTGCATAGTTCTGTGTCGTTTTA	4283

skip 450 bps 100% identity alignment

AC023449.11	174332	TATGTATATATATATACATATTTTTTTTTTTTTGAGATAGGGTCTCACTG	174381
			|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
AC124305.3	4734	TATGTATATATATATACATA-TTTTTTTTTTTTGAGATAGGGTCTCACTG	4782

skip 955 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AC023449.11 - 175336 bps
Hit
AC124305.3 - 28143 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 5754 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.8605057541695831753361157371
Short-link