<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 6505 bps / non-identical: 800 bps

Full alignment

AC236592.3	26915	GAATTCATTTAGTTTTAACATTTTCTTATGGGAAATCTGAGGTTTTTTCA	26964
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1	GAATTCATTTAGTTTTAACATTTTCTTATGGGAAATCTGAGGTTTTTTCA	50

AC236592.3	26965	TATGGATCATGTCATCTGCAAATAGAGATAATTTGTTTCTTTTTTTAGTT	27014
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	51	TATGGATCATGTCATCTGCAAATAGAGATAATTTGTTTCTTTTTTTAGTT	100

AC236592.3	27015	GCCTTTTTTTAAATTTGTCCAATTGCTCTTGCTAGTACTTCCAGTACTAT	27064
			||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
AC106795.3	101	GCCTTTTTTTAAATTTGTCTAATTGCTCTTGCTAGTACTTCCAGTACCAT	150

AC236592.3	27065	GTTGAATAAAAGTGACAAGGCTAGGCATCCCTGTCTTGAACTCAATCTTA	27114
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	151	GTTGAATAAAAGTGACAAGGCTAGGCATCCCTGTCTTGAACTCAATCTTA	200

AC236592.3	27115	GTGGAAAGACTTTCAATTGTTCCCCATTGATTATGATGTTAGCTGTGGGT	27164
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	201	GTGGAAAGACTTTCAATTGTTCCCCATTGATTATGATGTTAGCTGTGGGT	250

AC236592.3	27165	TTTTTAGAGGCGGCCTTTATTATTTAGAGGAGCTTTCTTTTCCATCCGTC	27214
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	251	TTTTTAGAGGCGGCCTTTATTATTTAGAGGAGCTTTCTTTTCCATCCGTC	300

AC236592.3	27215	TCAGCTCAGCCTGGGGACTTCCCATCAAGTGAGGCACTTGTTCAGCTCTT	27264
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	301	TCAGCTCAGCCTGGGGACTTCCCATCAAGTGAGGCACTTGTTCAGCTCTT	350

AC236592.3	27265	GCATTAGGGACTGTGATTTCTCTGGCTGACCAAGGCATTGATTCTCTGGA	27314
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	351	GCATTAGGGACTGTGATTTCTCTGGCTGACCAAGGCATTGATTCTCTGGA	400

AC236592.3	27315	AAGCAGGGCACAAATCAGCTCAGGCCCCAACGGCTAGGGTGCCACAGCAA	27364
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	401	AAGCAGGGCACAAATCAGCTCAGGCCCCAACGGCTAGGGTGCCACAGCAA	450

AC236592.3	27365	CTGGGAGGGGCAGGACACAGCAGCATGGCCCCACAGGGTGGGGTGTATGC	27414
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	451	CTGGGAGGGGCAGGACACAGCAGCATGGCCCCACAGGGTGGGGTGTATGC	500

AC236592.3	27415	TACGGTGTGGATGTGGTTTGTCCCCACCAAAACACATGTTGAAATTTGAT	27464
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	501	TACGGTGTGGATGTGGTTTGTCCCCACCAAAACACATGTTGAAATTTGAT	550

AC236592.3	27465	TCCCGATGTGGTGGTGGTGGGAGGTGGGGGCTAGTGGGAGGTATTTGGGT	27514
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	551	TCCCGATGTGGTGGTGGTGGGAGGTGGGGGCTAGTGGGAGGTATTTGGGT	600

AC236592.3	27515	GATGGGCAGACCCTTCATGAATAGATGAACGCTGTCTCGTGGGACTGGAT	27564
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	601	GATGGGCAGACCCTTCATGAATAGATGAACGCTGTCTCGTGGGACTGGAT	650

AC236592.3	27565	GAGTTACCAGGCGTGGGGTGTTATGGAAGTGAGTTTGGCTTCCTGGACCC	27614
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	651	GAGTTACCAGGCGTGGGGTGTTATGGAAGTGAGTTTGGCTTCCTGGACCC	700

AC236592.3	27615	TCTTGCTTCCTCTCTTGCCATGTGCTCTCCTTGCCTGTGCTGGTTTCCCC	27664
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	701	TCTTGCTTCCTCTCTTGCCATGTGCTCTCCTTGCCTGTGCTGGTTTCCCC	750

AC236592.3	27665	TTCCACGTTCTGCCAGGAGTTGGAGCAGCACAAGCCCCTCACCGTGTGCA	27714
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	751	TTCCACGTTCTGCCAGGAGTTGGAGCAGCACAAGCCCCTCACCGTGTGCA	800

AC236592.3	27715	CTGCCCAATCTCAGACTTTCCAGTCACCAGAATATTGAGCCAAAAAAGCC	27764
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	801	CTGCCCAATCTCAGACTTTCCAGTCACCAGAATATTGAGCCAAAAAAGCC	850

AC236592.3	27765	TCTTTTTTAAAAATAAACTACCCAGTCTTGGCCTGGTGCGGTGGCTCACG	27814
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	851	TCTTTTTTAAAAATAAACTACCCAGTCTTGGCCTGGTGCGGTGGCTCACG	900

AC236592.3	27815	CCTCTAATCGCAGCATTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCA	27864
			||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	901	CCTCTAATCGCAGGATTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCA	950

AC236592.3	27865	GGAGATTGAGACCATCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTCTCCGCTAAA	27914
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	951	GGAGATTGAGACCATCCTGGCCAACACAGTGAAACCCTGTCTCCGCTAAA	1000

AC236592.3	27915	AATACACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTA	27964
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1001	AATACACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTA	1050

AC236592.3	27965	CTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCATAGCTTG	28014
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
AC106795.3	1051	CTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGTAGCTTG	1100

AC236592.3	28015	CAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGCGAG	28064
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1101	CAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGCGAG	1150

AC236592.3	28065	ACTCTGTCTCAAAAAAAAAATAAAATTAATAATAATAATAAAATTACCCA	28114
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1151	ACTCTGTCTCAAAAAAAAAATAAAATTAATAATAATAATAAAATTACCCA	1200

AC236592.3	28115	GTCTTAGATATTCTGTTATAGCTGCACTGAACCTTAAGTACATTGAATTT	28164
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1201	GTCTTAGATATTCTGTTATAGCTGCACTGAACCTTAAGTACATTGAATTT	1250

AC236592.3	28165	TATTTGGGTCTCCTTAGTTTTACTTAGTTAATTTCATGGTTTTAAAGTCT	28214
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1251	TATTTGGGTCTCCTTAGTTTTACTTAGTTAATTTCATGGTTTTAAAGTCT	1300

AC236592.3	28215	TGTACATTTTTGCAGTCTTTAATAAGACAAAACGCTGAGATGTTGGACAT	28264
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1301	TGTACATTTTTGCAGTCTTTAATAAGACAAAACGCTGAGATGTTGGACAT	1350

AC236592.3	28265	TTGAATGCCAAAGGTGATATGAGACATTTAGCATTTCATATTTTGGGAAT	28314
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1351	TTGAATGCCAAAGGTGATATGAGACATTTAGCATTTCATATTTTGGGAAT	1400

AC236592.3	28315	AGTACCTTATGATTGAAAACTGGGGCCAGGTGTGGTGGCTTATGCCTGTA	28364
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1401	AGTACCTTATGATTGAAAACTGGGGCCAGGTGTGGTGGCTTATGCCTGTA	1450

AC236592.3	28365	ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGATCTGGAG	28414
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1451	ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGATCTGGAG	1500

AC236592.3	28415	CTGGAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCCGTCTCTGCTAAAAATA	28464
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1501	CTGGAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCCGTCTCTGCTAAAAATA	1550

AC236592.3	28465	CAAAAATTACCTGGGCATCACGTTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGG	28514
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1551	CAAAAATTACCTGGGCATCACGTTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGG	1600

AC236592.3	28515	GAGGTTGAGGAAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGATGCAAAGGTTGCAGTG	28564
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1601	GAGGTTGAGGAAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGATGCAAAGGTTGCAGTG	1650

AC236592.3	28565	AGGCGAGATTAGGCTCCGGCCTGGGTAACAGAGCCAGACTCCATCTT-AA	28613
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
AC106795.3	1651	AGGCGAGATTAGGCTCCGGCCTGGGTAACAGAGCCAGACTCCATCTTAAA	1700

AC236592.3	28614	AAAAAAAAAAAAAAAAGC-GGGGG-GAGAGAGAGAGAGAGAGATGAAAGA	28661
			|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1701	AAAAAAAAAAAAAAAAGCGGGGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGAAAGA	1750

AC236592.3	28662	AGGAAGGGAGGGAGGAAGGAAAAAATTGGGTTTACAAGTATGAGCTACTA	28711
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1751	AGGAAGGGAGGGAGGAAGGAAAAAATTGGGTTTACAAGTATGAGCTACTA	1800

AC236592.3	28712	TGCCTGGCCAAGTGCCCAGAGGCTGTGTGCTGTGGGGAGTGCGGTGCCCC	28761
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1801	TGCCTGGCCAAGTGCCCAGAGGCTGTGTGCTGTGGGGAGTGCGGTGCCCC	1850

AC236592.3	28762	GACTGAGGCAGGCACAGGGTCCCAGCTCCTGTTGTCAGATGTGACAGACT	28811
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1851	GACTGAGGCAGGCACAGGGTCCCAGCTCCTGTTGTCAGATGTGACAGACT	1900

AC236592.3	28812	CTCGGAGAATGGGAAAGCAATGCCACTTTTCCCACAAATCACTTTTGCTT	28861
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1901	CTCGGAGAATGGGAAAGCAATGCCACTTTTCCCACAAATCACTTTTGCTT	1950

AC236592.3	28862	TGGAAAATATTTTTCACAAAAAGATGCTATTTATGTTGCTCTGTAATGGT	28911
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1951	TGGAAAATATTTTTCACAAAAAGATGCTATTTATGTTGCTCTGTAATGGT	2000

AC236592.3	28912	CTTGTTTCTGTTATTTGAAAACAGATTAATAAATATTTTAAATGTGACTC	28961
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	2001	CTTGTTTCTGTTATTTGAAAACAGATTAATAAATATTTTAAATGTGACTC	2050

AC236592.3	28962	AGCTTCCATTTCTTTTCATTGTTGTTAGTCATGGTTCCTTTTATTCTCTT	29011
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	2051	AGCTTCCATTTCTTTTCATTGTTGTTAGTCATGGTTCCTTTTATTCTCTT	2100

AC236592.3	29012	TTCCCTCAGCTCTATTCAGGTATAACTGATCAACATTGTATATGTTTACA	29061
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	2101	TTCCCTCAGCTCTATTCAGGTATAACTGATCAACATTGTATATGTTTACA	2150

AC236592.3	29062	CTTTACAATGTAAATTAAAATTAAATTTCTAAGCCCCTCAATGAACTGAA	29111
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	2151	CTTTACAATGTAAATTAAAATTAAATTTCTAAGCCCCTCAATGAACTGAA	2200

AC236592.3	29112	CGGATCCTCCTCTCAGCCAAGGGGACCCAAATAAACCTGAAAACTTCATT	29161
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	2201	CGGATCCTCCTCTCAGCCAAGGGGACCCAAATAAACCTGAAAACTTCATT	2250

AC236592.3	29162	CAGGCCATGAGGGAGAAGAGGGGTCGGGCACGCCTCAGTATTCCCTCCAC	29211
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	2251	CAGGCCATGAGGGAGAAGAGGGGTCGGGCACGCCTCAGTATTCCCTCCAC	2300

AC236592.3	29212	CCTTTGTGGTTCAGACCCAACTGAGCAGCAGTGACATGAAAATAGAGATC	29261
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	2301	CCTTTGTGGTTCAGACCCAACTGAGCAGCAGTGACATGAAAATAGAGATC	2350

AC236592.3	29262	CTAAGACTGACGGAAGAAACGCCTTGTAGCAATAAGATACCCAACTTCAA	29311
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
AC106795.3	2351	CTAAGACTGACGGAAGAAACGCCTTGTAGCAATAAGATACCCAACTTCCA	2400

AC236592.3	29312	ATGCGCTCTGGTATAGCATCACCTGAAAGCAGGTCCTGAAGGAAGTCTGA	29361
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	2401	ATGCGCTCTGGTATAGCATCACCTGAAAGCAGGTCCTGAAGGAAGTCTGA	2450

AC236592.3	29362	GTATTTTACCCCGAGACAGATTTCTCTGACATTTTTTGGAATGGCCCAAC	29411
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	2451	GTATTTTACCCCGAGACAGATTTCTCTGACATTTTTTGGAATGGCCCAAC	2500

AC236592.3	29412	ACAGCTGTCTCTTTGTGGGAAATTTGCAATCTGTAGAGCATATGGCTCCA	29461
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	2501	ACAGCTGTCTCTTTGTGGGAAATTTGCAATCTGTAGAGCATATGGCTCCA	2550

AC236592.3	29462	TCACTAGGTCTTTCCAGAAAGTCTGTTACCTTTTAAGTCCAATAAGAGAC	29511
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	2551	TCACTAGGTCTTTCCAGAAAGTCTGTTACCTTTTAAGTCCAATAAGAGAC	2600

AC236592.3	29512	GTTTACGTCTATCCTCTCTGAAGCCCTCTGCCTGGAAGTGTCATTTACGT	29561
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	2601	GTTTACGTCTATCCTCTCTGAAGCCCTCTGCCTGGAAGTGTCATTTACGT	2650

AC236592.3	29562	GACAAGAACCTTGGCTCCCACAACTTCCCAAACTCCCACCCCCGACCACA	29611
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	2651	GACAAGAACCTTGGCTCCCACAACTTCCCAAACTCCCACCCCCGACCACA	2700

AC236592.3	29612	CCATGTTACCTAATTGAAGCTGATTTCAACTTTTAAGACAGAGTTTAACC	29661
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	2701	CCATGTTACCTAATTGAAGCTGATTTCAACTTTTAAGACAGAGTTTAACC	2750

AC236592.3	29662	CTTTCAACCAACTGCCAATCAAGAAACCTTTGAATCCAACTGTGACCTGG	29711
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	2751	CTTTCAACCAACTGCCAATCAAGAAACCTTTGAATCCAACTGTGACCTGG	2800

AC236592.3	29712	AACCCACCCCCAGCACGCCACCCGATTCCCCAGACAGAAGGCATGGAAGC	29761
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	2801	AACCCACCCCCAGCACGCCACCCGATTCCCCAGACAGAAGGCATGGAAGC	2850

AC236592.3	29762	CATGCATCCAGGACCCCCCAGCCCCATACGCCTTGCTCTATGCAGATCAT	29811
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	2851	CATGCATCCAGGACCCCCCAGCCCCATACGCCTTGCTCTATGCAGATCAT	2900

AC236592.3	29812	TTCTAATCAAATTGTAAATATAGCCCTTTTCTGAATTCTCTGAGTCATTT	29861
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	2901	TTCTAATCAAATTGTAAATATAGCCCTTTTCTGAATTCTCTGAGTCATTT	2950

AC236592.3	29862	CTAGTGAAGTTTTGAACCTGAGGAAGTCATGGTAATCCTTGAATTTATAG	29911
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	2951	CTAGTGAAGTTTTGAACCTGAGGAAGTCATGGTAATCCTTGAATTTATAG	3000

AC236592.3	29912	CCAGTTTGTCAGAAGTGCAGGTGGCTTGGGGACTCCCAAAGTTCAGCTGG	29961
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	3001	CCAGTTTGTCAGAAGTGCAGGTGGCTTGGGGACTCCCAAAGTTCAGCTGG	3050

AC236592.3	29962	TGTCTGAAGTAAGGGCAGTTTTGTGGGACTCAGCTCTGGAGTTGTGGAAT	30011
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	3051	TGTCTGAAGTAAGGGCAGTTTTGTGGGACTCAGCTCTGGAGTTGTGGAAT	3100

AC236592.3	30012	CTGGTGCTAACCCTGAGTGGTGAGGGTCGGAACTGCCTTGCAGTCCACCC	30061
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	3101	CTGGTGCTAACCCTGAGTGGTGAGGGTCGGAACTGCCTTGCAGTCCACCC	3150

AC236592.3	30062	GGTTAGGCTCCACATATACGCTGTGGAGTAATGGGGACGGCATTCCTTGT	30111
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	3151	GGTTAGGCTCCACATATACGCTGTGGAGTAATGGGGACGGCATTCCTTGT	3200

AC236592.3	30112	TGAGAAAGCTTACACCTGCAACTCTGCTGTCTAGGCGGAGTATAACACCA	30161
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	3201	TGAGAAAGCTTACACCTGCAACTCTGCTGTCTAGGCGGAGTATAACACCA	3250

AC236592.3	30162	GCGGAAACAGACGTGGGCACAGACACACGGCCGCCCCACACAAATCCCAC	30211
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	3251	GCGGAAACAGACGTGGGCACAGACACACGGCCGCCCCACACAAATCCCAC	3300

AC236592.3	30212	CCCACACAGACACACCCCACCGCCCACGCGCACAAACTCATACCAGCTAA	30261
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	3301	CCCACACAGACACACCCCACCGCCCACGCGCACAAACTCATACCAGCTAA	3350

AC236592.3	30262	AGGAAACGCAACTGCTTGTGGAAACACGGTCACAGTGCTTTACCTGGAAA	30311
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	3351	AGGAAACGCAACTGCTTGTGGAAACACGGTCACAGTGCTTTACCTGGAAA	3400

AC236592.3	30312	ATAATGTTCCTTCATCACCACCAATCCTCATTCTAACCAGAAAGCTGGAG	30361
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	3401	ATAATGTTCCTTCATCACCACCAATCCTCATTCTAACCAGAAAGCTGGAG	3450

AC236592.3	30362	TCAGGGTGGCTCCCCAGACGAAAGCCAGCAAGGAAGACTCACCTTCCCTA	30411
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	3451	TCAGGGTGGCTCCCCAGACGAAAGCCAGCAAGGAAGACTCACCTTCCCTA	3500

AC236592.3	30412	TCATCTAGATTTCTCCTTCACAAGTGGCACATGCAGAATATGCATGAATT	30461
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	3501	TCATCTAGATTTCTCCTTCACAAGTGGCACATGCAGAATATGCATGAATT	3550

AC236592.3	30462	TTCCCCTCTGAGGCCACCTACAGTGACAGAAAAGAAGGCACTACAGTACC	30511
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	3551	TTCCCCTCTGAGGCCACCTACAGTGACAGAAAAGAAGGCACTACAGTACC	3600

AC236592.3	30512	ATAGGTTCCGATGTGTTCTCTAAGCACAGGTGGGTTTTTTTTTT-GTTGT	30560
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
AC106795.3	3601	ATAGGTTCCGATGTGTTCTCTAAGCACAGGTGGGTTTTTTTTTTTGTTGT	3650

AC236592.3	30561	TTGTTTGTTTGTTTCTTCCTGTTGACTTTATAAAACAAGAGGATAAATAG	30610
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	3651	TTGTTTGTTTGTTTCTTCCTGTTGACTTTATAAAACAAGAGGATAAATAG	3700

AC236592.3	30611	GGGTCAAGTCAAAGGAATCTATTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTT	30660
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	3701	GGGTCAAGTCAAAGGAATCTATTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTT	3750

AC236592.3	30661	TTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGAT	30710
			| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	3751	T-GAGACAGAGTCTTGCTCTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGAT	3799

AC236592.3	30711	CTTGGCTCACTGCAACCTACGCCTCCCAGGTTCAAGCGAATTCTCTGCCT	30760
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	3800	CTTGGCTCACTGCAACCTACGCCTCCCAGGTTCAAGCGAATTCTCTGCCT	3849

AC236592.3	30761	CAGCCTCCTGCATAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCACGCCTAGCTA	30810
			|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
AC106795.3	3850	CAGCCTCCTGCATAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCTAGCTA	3899

AC236592.3	30811	ATTTTTTGTATTTTAGCAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGATGG	30860
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	3900	ATTTTTTGTATTTTAGCAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGATGG	3949

AC236592.3	30861	TCTCTATCTCCTGGCCTCATGATCTGCCCACCTTGGCCTCTCAAAGTGCT	30910
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	3950	TCTCTATCTCCTGGCCTCATGATCTGCCCACCTTGGCCTCTCAAAGTGCT	3999

AC236592.3	30911	GGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAAGTCAAAGGAATCTAAA	30960
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4000	GGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAAGTCAAAGGAATCTAAA	4049

AC236592.3	30961	AGCAAGGGTAGAGAAAACCTACTCCTGTCATAGGGCAGACTTTTGCTGGA	31010
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4050	AGCAAGGGTAGAGAAAACCTACTCCTGTCATAGGGCAGACTTTTGCTGGA	4099

AC236592.3	31011	GAATGTGTCTGTCATGTCTATTGTTTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTT	31060
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4100	GAATGTGTCTGTCATGTCTATTGTTTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTT	4149

AC236592.3	31061	GTTTTTTGAGGTGGAGTCTCCGTCAACCAGACTGGAGTGCAGTGGTGCAA	31110
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4150	GTTTTTTGAGGTGGAGTCTCCGTCAACCAGACTGGAGTGCAGTGGTGCAA	4199

AC236592.3	31111	TCTCGGCTCACTACAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGAAGTTCTCTTGCC	31160
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4200	TCTCGGCTCACTACAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGAAGTTCTCTTGCC	4249

AC236592.3	31161	TCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACGACGCCTGGCT	31210
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4250	TCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACGACGCCTGGCT	4299

AC236592.3	31211	AATTTTGGCATTTTTAGTAGAGATGGGATTTCGCCATATTGACGAGGCTG	31260
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4300	AATTTTGGCATTTTTAGTAGAGATGGGATTTCGCCATATTGACGAGGCTG	4349

AC236592.3	31261	GTCATGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACTCGCCTAGGCCTCCCAAGTG	31310
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4350	GTCATGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACTCGCCTAGGCCTCCCAAGTG	4399

AC236592.3	31311	CTGGGATTATAGGCCACCACGCCCGGCCTGTCATGTTTATTTCAATCAGC	31360
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4400	CTGGGATTATAGGCCACCACGCCCGGCCTGTCATGTTTATTTCAATCAGC	4449

AC236592.3	31361	AGTTGCAAAATTATTAACCCACGGAGGAAATAATTGCTACTGAGGAAAAG	31410
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4450	AGTTGCAAAATTATTAACCCACGGAGGAAATAATTGCTACTGAGGAAAAG	4499

AC236592.3	31411	GCTCTCTATGCACAGTGAAGAACCTGACACAACCCGGCTTATGTGCCCTC	31460
			||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
AC106795.3	4500	GCTCTCTATGCACAGTGAAGAACCTGACACAACCCAGCTTATGTGCCCTC	4549

AC236592.3	31461	CTGAATCAGGCCTCGTTTGGTAAGAGACTTCTTTCCCAAGCCCTTGAGGA	31510
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4550	CTGAATCAGGCCTCGTTTGGTAAGAGACTTCTTTCCCAAGCCCTTGAGGA	4599

AC236592.3	31511	AACAGCCGCTAACCTCTGTAATGTATGTGGCCACGTTTCCATAACTGAAC	31560
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4600	AACAGCCGCTAACCTCTGTAATGTATGTGGCCACGTTTCCATAACTGAAC	4649

AC236592.3	31561	TCAATTGATAAAACAGCAAAGCACCGCTTCTACCTCAGAAAAAGAAAGAC	31610
			||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4650	TCAATTGATAAAACAGCAAAGCACCACTTCTACCTCAGAAAAAGAAAGAC	4699

AC236592.3	31611	AATCTTAACCTGGCATTAGATGGGACCCCTCATCTGTCCTGCCACTAGGA	31660
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4700	AATCTTAACCTGGCATTAGATGGGACCCCTCATCTGTCCTGCCACTAGGA	4749

AC236592.3	31661	AGCCACTGTAATTCATCCTCTGGAGGAGCTGGGTGGACGGGGCGGTGGTG	31710
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4750	AGCCACTGTAATTCATCCTCTGGAGGAGCTGGGTGGACGGGGCGGTGGTG	4799

AC236592.3	31711	GGACATCGGGATGCTGCCCGTGCATGGCCCCACCCCAGCTGGACATGAGA	31760
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4800	GGACATCGGGATGCTGCCCGTGCATGGCCCCACCCCAGCTGGACATGAGA	4849

AC236592.3	31761	GTTGCAAAAACAAGGTGCTAGACGCAAGCTATAACCGACCATGCCGAGTT	31810
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4850	GTTGCAAAAACAAGGTGCTAGACGCAAGCTATAACCGACCATGCCGAGTT	4899

AC236592.3	31811	CACGTTTGTCCCGTCCCTAGGTTGTGTATGTGCCAGGATTTGAGCACTTC	31860
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4900	CACGTTTGTCCCGTCCCTAGGTTGTGTATGTGCCAGGATTTGAGCACTTC	4949

AC236592.3	31861	TAGGGCATATGCTGACAACGTTATCGAATACCACAAACCATCGCCTCAGT	31910
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4950	TAGGGCATATGCTGACAACGTTATCGAATACCACAAACCATCGCCTCAGT	4999

AC236592.3	31911	TCCTAGTTTTGGGTCAGATACTGAGAATCAGTCCTAGCACTGACAGAGAT	31960
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	5000	TCCTAGTTTTGGGTCAGATACTGAGAATCAGTCCTAGCACTGACAGAGAT	5049

AC236592.3	31961	TGACAGTTGTCCTTGTCTCCCAACATTCAGAATCTGTGAGCTGCCCAGAG	32010
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	5050	TGACAGTTGTCCTTGTCTCCCAACATTCAGAATCTGTGAGCTGCCCAGAG	5099

AC236592.3	32011	GCATCTGGACTTTCTATGTGCTTTTAATGCATCCCTCAGCATGGCCAGAA	32060
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	5100	GCATCTGGACTTTCTATGTGCTTTTAATGCATCCCTCAGCATGGCCAGAA	5149

AC236592.3	32061	TGAAGACATCAGAAAATACCAATTGTTGGAGAGGCTGGGGAGCAACCAAA	32110
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	5150	TGAAGACATCAGAAAATACCAATTGTTGGAGAGGCTGGGGAGCAACCAAA	5199

AC236592.3	32111	CTGTCTTCCTCAGCTGGCGTGATATCCGTTGCACGTTCCACCTGGGAAAC	32160
			||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
AC106795.3	5200	CTGTCTTCCTCAGCTGGCGTGATATCCGTTGCACGCTCCACCTGGGAAAC	5249

AC236592.3	32161	TCTGTCAGTAGCTGCTGAAAGTGGACAAGCACATGTGCGATGACCGGCGA	32210
			|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
AC106795.3	5250	TCTGTCAGTAGCTGCTGAAAGTGGACAAGCACATCTGCGATGACCGGCGA	5299

AC236592.3	32211	CCCCTTGGGTGGAGAATATCCGGCAGAAAAGAGCGTGTGTGCTCCCCAAA	32260
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	5300	CCCCTTGGGTGGAGAATATCCGGCAGAAAAGAGCGTGTGTGCTCCCCAAA	5349

AC236592.3	32261	GACACTCACAGGAAAGCAGCACTTTCATCACCTCCCAAAGCCATAACCAC	32310
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	5350	GACACTCACAGGAAAGCAGCACTTTCATCACCTCCCAAAGCCATAACCAC	5399

AC236592.3	32311	CCAAACCCTCACTGACAGTAGAACCTGTGAACAGATTCTAGGACATTTCA	32360
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	5400	CCAAACCCTCACTGACAGTAGAACCTGTGAACAGATTCTAGGACATTTCA	5449

AC236592.3	32361	GCCCTGGCACGCTATGTCCCCGCGGGAAGGACAGATCCTTAAACACATGC	32410
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	5450	GCCCTGGCACGCTATGTCCCCGCGGGAAGGACAGATCCTTAAACACATGC	5499

AC236592.3	32411	GACAACGTGGGCCAATCTCGCAAAACAGAGTAAATGAAGCTCACACAAAA	32460
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	5500	GACAACGTGGGCCAATCTCGCAAAACAGAGTAAATGAAGCTCACACAAAA	5549

AC236592.3	32461	GGAGTCCTGATCTCCTTTATTTCCAAGGAGGCTGCAGTTACCCTTGATGG	32510
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	5550	GGAGTCCTGATCTCCTTTATTTCCAAGGAGGCTGCAGTTACCCTTGATGG	5599

AC236592.3	32511	GGAGGCTCACCACAGGAAGCTGGCCGCAGAAGGCTTATCGGGGATGGCTT	32560
			|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
AC106795.3	5600	GGAGGCTCACCACAGGAAGCTGGCCGCAGAAGACTTATCGGGGATGGCTT	5649

AC236592.3	32561	CCAGTCATGGGTTTTGTTGTGGTTTTCATTTCAATCTGGTTAATGATTAA	32610
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	5650	CCAGTCATGGGTTTTGTTGTGGTTTTCATTTCAATCTGGTTAATGATTAA	5699

AC236592.3	32611	ATTTCATGAAAATTCATTGAGCTGTACATTTATGATAGGAATGACTTTTT	32660
			||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
AC106795.3	5700	ATTTCATGAAAATTCATTGAGCTGTACATTTATGACAGGAATGACTTTTT	5749

AC236592.3	32661	GCTATGTATACAATATTTCAATTAAAAGTAAAAAAAAAAGAAGAAATAAA	32710
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	5750	GCTATGTATACAATATTTCAATTAAAAGTAAAAAAAAAAGAAGAAATAAA	5799

AC236592.3	32711	CAGCATGTCTCAAACACATTATGAAAATCTCAGCCGGGCGCGGTGGCTCA	32760
			|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
AC106795.3	5800	CAGCATGTCTCAAACACATTATGAAAATCTCAGCTGGGCGCGGTGGCTCA	5849

AC236592.3	32761	CACCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCATGAGGT	32810
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	5850	CACCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCATGAGGT	5899

AC236592.3	32811	GAAGAGATCGAGACCCATCCTGGCCAACGTGGTGAAACCCTGTGTCTACT	32860
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	5900	GAAGAGATCGAGACCCATCCTGGCCAACGTGGTGAAACCCTGTGTCTACT	5949

AC236592.3	32861	AAAAATACAAAAATTAGCTAGATGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGC	32910
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	5950	AAAAATACAAAAATTAGCTAGATGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGC	5999

AC236592.3	32911	TACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCTGGAGACAGAGGT	32960
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	6000	TACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCTGGAGACAGAGGT	6049

AC236592.3	32961	TATAGTGAGCTGAGATCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGCGA	33010
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	6050	TATAGTGAGCTGAGATCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGCGA	6099

AC236592.3	33011	GATTCCGTCCCAAAACAAAAACAAAAACAAAAGAAGAAAGAAAGAAAATC	33060
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	6100	GATTCCGTCCCAAAACAAAAACAAAAACAAAAGAAGAAAGAAAGAAAATC	6149

AC236592.3	33061	TCAGCAGATATGGAGTGGCAGGTAGGGTAGCTGAAGGATCTGTCATAAAC	33110
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	6150	TCAGCAGATATGGAGTGGCAGGTAGGGTAGCTGAAGGATCTGTCATAAAC	6199

AC236592.3	33111	CCAGAGTCACACGACTGTACCCAAGTGCAGAGATGGCATCAGGACTTTTA	33160
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	6200	CCAGAGTCACACGACTGTACCCAAGTGCAGAGATGGCATCAGGACTTTTA	6249

AC236592.3	33161	GAGTAACTGTCTTCACAGCACCAGAAAGCCCCAGATTGCTGCAGGACTCT	33210
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	6250	GAGTAACTGTCTTCACAGCACCAGAAAGCCCCAGATTGCTGCAGGACTCT	6299

AC236592.3	33211	CCAGCACTCACACCTATTTAACCACAGGGCAGAATACTCCCAAAACAGCA	33260
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	6300	CCAGCACTCACACCTATTTAACCACAGGGCAGAATACTCCCAAAACAGCA	6349

AC236592.3	33261	CTGACAAGCGCTTATCTGGTTCAACGGAGGGTGGAAGAGGAGAGGGTTGG	33310
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	6350	CTGACAAGCGCTTATCTGGTTCAACGGAGGGTGGAAGAGGAGAGGGTTGG	6399

AC236592.3	33311	GATCAACAGGTACCTGACTACCTCACACATCCAGGTGCCAGCAATGGTCC	33360
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	6400	GATCAACAGGTACCTGACTACCTCACACATCCAGGTGCCAGCAATGGTCC	6449

AC236592.3	33361	CAGGAGGCTGGGACCTTCTTTCTCCTTGGTCAGATCACAATGCTCCTATA	33410
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	6450	CAGGAGGCTGGGACCTTCTTTCTCCTTGGTCAGATCACAATGCTCCTATA	6499

AC236592.3	33411	AATCTTTAA	33419
			|||||||||
AC106795.3	6500	AATCTTTAA	6508

Compact alignment

skip 100 bps 100% identity alignment

AC236592.3	27015	GCCTTTTTTTAAATTTGTCCAATTGCTCTTGCTAGTACTTCCAGTACTAT	27064
			||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
AC106795.3	101	GCCTTTTTTTAAATTTGTCTAATTGCTCTTGCTAGTACTTCCAGTACCAT	150

skip 750 bps 100% identity alignment

AC236592.3	27815	CCTCTAATCGCAGCATTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCA	27864
			||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	901	CCTCTAATCGCAGGATTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCA	950

skip 100 bps 100% identity alignment

AC236592.3	27965	CTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCATAGCTTG	28014
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
AC106795.3	1051	CTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGTAGCTTG	1100

skip 550 bps 100% identity alignment

AC236592.3	28565	AGGCGAGATTAGGCTCCGGCCTGGGTAACAGAGCCAGACTCCATCTT-AA	28613
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
AC106795.3	1651	AGGCGAGATTAGGCTCCGGCCTGGGTAACAGAGCCAGACTCCATCTTAAA	1700

AC236592.3	28614	AAAAAAAAAAAAAAAAGC-GGGGG-GAGAGAGAGAGAGAGAGATGAAAGA	28661
			|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	1701	AAAAAAAAAAAAAAAAGCGGGGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGAAAGA	1750

skip 600 bps 100% identity alignment

AC236592.3	29262	CTAAGACTGACGGAAGAAACGCCTTGTAGCAATAAGATACCCAACTTCAA	29311
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
AC106795.3	2351	CTAAGACTGACGGAAGAAACGCCTTGTAGCAATAAGATACCCAACTTCCA	2400

skip 1200 bps 100% identity alignment

AC236592.3	30512	ATAGGTTCCGATGTGTTCTCTAAGCACAGGTGGGTTTTTTTTTT-GTTGT	30560
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
AC106795.3	3601	ATAGGTTCCGATGTGTTCTCTAAGCACAGGTGGGTTTTTTTTTTTGTTGT	3650

skip 100 bps 100% identity alignment

AC236592.3	30661	TTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGAT	30710
			| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	3751	T-GAGACAGAGTCTTGCTCTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGAT	3799

skip 50 bps 100% identity alignment

AC236592.3	30761	CAGCCTCCTGCATAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCACGCCTAGCTA	30810
			|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
AC106795.3	3850	CAGCCTCCTGCATAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCTAGCTA	3899

skip 600 bps 100% identity alignment

AC236592.3	31411	GCTCTCTATGCACAGTGAAGAACCTGACACAACCCGGCTTATGTGCCCTC	31460
			||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
AC106795.3	4500	GCTCTCTATGCACAGTGAAGAACCTGACACAACCCAGCTTATGTGCCCTC	4549

skip 100 bps 100% identity alignment

AC236592.3	31561	TCAATTGATAAAACAGCAAAGCACCGCTTCTACCTCAGAAAAAGAAAGAC	31610
			||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
AC106795.3	4650	TCAATTGATAAAACAGCAAAGCACCACTTCTACCTCAGAAAAAGAAAGAC	4699

skip 500 bps 100% identity alignment

AC236592.3	32111	CTGTCTTCCTCAGCTGGCGTGATATCCGTTGCACGTTCCACCTGGGAAAC	32160
			||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
AC106795.3	5200	CTGTCTTCCTCAGCTGGCGTGATATCCGTTGCACGCTCCACCTGGGAAAC	5249

AC236592.3	32161	TCTGTCAGTAGCTGCTGAAAGTGGACAAGCACATGTGCGATGACCGGCGA	32210
			|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
AC106795.3	5250	TCTGTCAGTAGCTGCTGAAAGTGGACAAGCACATCTGCGATGACCGGCGA	5299

skip 300 bps 100% identity alignment

AC236592.3	32511	GGAGGCTCACCACAGGAAGCTGGCCGCAGAAGGCTTATCGGGGATGGCTT	32560
			|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
AC106795.3	5600	GGAGGCTCACCACAGGAAGCTGGCCGCAGAAGACTTATCGGGGATGGCTT	5649

skip 50 bps 100% identity alignment

AC236592.3	32611	ATTTCATGAAAATTCATTGAGCTGTACATTTATGATAGGAATGACTTTTT	32660
			||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
AC106795.3	5700	ATTTCATGAAAATTCATTGAGCTGTACATTTATGACAGGAATGACTTTTT	5749

skip 50 bps 100% identity alignment

AC236592.3	32711	CAGCATGTCTCAAACACATTATGAAAATCTCAGCCGGGCGCGGTGGCTCA	32760
			|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
AC106795.3	5800	CAGCATGTCTCAAACACATTATGAAAATCTCAGCTGGGCGCGGTGGCTCA	5849

skip 659 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AC236592.3 - 33419 bps
Hit
AC106795.3 - 177116 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 6505 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.80010650526915334191165081
Short-link