<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1278 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AC010518.7	1	GATCCATGAAAGATGTTTAATTATATAATTATTACATTTCGCTAAAAACT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	1488	GATCCATGAAAGATGTTTAATTATATAATTATTACATTTCGCTAAAAACT	1537

AC010518.7	51	TGTTGGTGATGTTGAATGGAAAATCAAGTCAAAAATAAAGAAGAATGATG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	1538	TGTTGGTGATGTTGAATGGAAAATCAAGTCAAAAATAAAGAAGAATGATG	1587

AC010518.7	101	CAAACCTTAAAAAAAATGAGCAAAACTTATCTTGAAAAGTCATGCAGAGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	1588	CAAACCTTAAAAAAAATGAGCAAAACTTATCTTGAAAAGTCATGCAGAGG	1637

AC010518.7	151	AGCATAAGAATCTAGCAGAAGCTTTATTGACCTATGAGACTTTAGGTGCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	1638	AGCATAAGAATCTAGCAGAAGCTTTATTGACCTATGAGACTTTAGGTGCC	1687

AC010518.7	201	AAAGAGATTCAAATTGTTCTTCAGGGGAAAAAGTTGGAAGTGAGATGAGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	1688	AAAGAGATTCAAATTGTTCTTCAGGGGAAAAAGTTGGAAGTGAGATGAGA	1737

AC010518.7	251	ACTCTCTTGATGTGGATGCTTTGCTGGTTTTATTGCAAGAATATAAGTAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	1738	ACTCTCTTGATGTGGATGCTTTGCTGGTTTTATTGCAAGAATATAAGTAG	1787

AC010518.7	301	CATTGCAGTAGTCTCCTTTTGCAATGCTTTCTCCTCATTATTGACGTTGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	1788	CATTGCAGTAGTCTCCTTTTGCAATGCTTTCTCCTCATTATTGACGTTGT	1837

AC010518.7	351	GTAATTTAAGGGTGTGAAACATTTTGTCAATATTTTGTCACGTTTACCCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	1838	GTAATTTAAGGGTGTGAAACATTTTGTCAATATTTTGTCACGTTTACCCA	1887

AC010518.7	401	ATTTTGGTTATTCTCATTATGACACCCATTGCAAATCAGCATCCCATGGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	1888	ATTTTGGTTATTCTCATTATGACACCCATTGCAAATCAGCATCCCATGGC	1937

AC010518.7	451	AAATATATTTTTAAAACTAAAGAACTATCAGGATTAAAGACAGCTCATTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	1938	AAATATATTTTTAAAACTAAAGAACTATCAGGATTAAAGACAGCTCATTT	1987

AC010518.7	501	GGGAAATGTCAATTAGTTATGAAGTTGAAAGTAACTAATGATTTTATGGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	1988	GGGAAATGTCAATTAGTTATGAAGTTGAAAGTAACTAATGATTTTATGGT	2037

AC010518.7	551	TGGTTACTCTACTAGAGGTGAATAAAACTTCAGCCTTTAGCCTTCTATAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	2038	TGGTTACTCTACTAGAGGTGAATAAAACTTCAGCCTTTAGCCTTCTATAT	2087

AC010518.7	601	ACATCAGTGGAAACTTAATTAAGATGCATTAATTATGTTCCAGATTGACC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	2088	ACATCAGTGGAAACTTAATTAAGATGCATTAATTATGTTCCAGATTGACC	2137

AC010518.7	651	ATCAATAAAATGTTTTTAAATCTAAATGTAGAGAATTGTAAGCATACAGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	2138	ATCAATAAAATGTTTTTAAATCTAAATGTAGAGAATTGTAAGCATACAGT	2187

AC010518.7	701	TGCAACCCGAATTTAAATGATTATAACCTTTTGGCATGGTGTGATGGCTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	2188	TGCAACCCGAATTTAAATGATTATAACCTTTTGGCATGGTGTGATGGCTC	2237

AC010518.7	751	ACGCCTCTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGAGTGGAAGGCTTGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	2238	ACGCCTCTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGAGTGGAAGGCTTGA	2287

AC010518.7	801	GTCTAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCTACACGGCGAAACCCTGTCTCTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	2288	GTCTAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCTACACGGCGAAACCCTGTCTCTA	2337

AC010518.7	851	CTAAAATTAAAAAAAATAGCCTCCTGTGGTGGTGCACAACTGTAATCCCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	2338	CTAAAATTAAAAAAAATAGCCTCCTGTGGTGGTGCACAACTGTAATCCCA	2387

AC010518.7	901	GCTACTCAGAAGGCTGAGGCACAAAAATTTGCTTGAACTGGTTGCAGTGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	2388	GCTACTCAGAAGGCTGAGGCACAAAAATTTGCTTGAACTGGTTGCAGTGA	2437

AC010518.7	951	GCCAAGATCTCACAACTCCACTCTAGCCTGGGCGACAGAGTGAAACTTTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	2438	GCCAAGATCTCACAACTCCACTCTAGCCTGGGCGACAGAGTGAAACTTTG	2487

AC010518.7	1001	TCTCAGTAAATAAATAAATAAATAAATAATTGTAACCTTTTAAAAATAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	2488	TCTCAGTAAATAAATAAATAAATAAATAATTGTAACCTTTTAAAAATAAA	2537

AC010518.7	1051	AAAACCCAAACAAATATATGTCCTTTTTTTGTCATTATTCATGATAGCTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	2538	AAAACCCAAACAAATATATGTCCTTTTTTTGTCATTATTCATGATAGCTA	2587

AC010518.7	1101	AATAGTGAAAACAACCCAAATGTCCATCAATTGGTGAATGCATAAACCAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	2588	AATAGTGAAAACAACCCAAATGTCCATCAATTGGTGAATGCATAAACCAA	2637

AC010518.7	1151	ATGTGATATAGGCATAGAATGGAATATTCTTCAACAGTAGAAAGGAACAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	2638	ATGTGATATAGGCATAGAATGGAATATTCTTCAACAGTAGAAAGGAACAA	2687

AC010518.7	1201	AGACCAATTACATGCTCTAGCGTGCAGAGACCACGAAAACATTTTGCTAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	2688	AGACCAATTACATGCTCTAGCGTGCAGAGACCACGAAAACATTTTGCTAT	2737

AC010518.7	1251	GTGCAATTGGATTTTTGCCATTTTGTTG	1278
			||||||||||||||||||||||||||||
AC098789.2	2738	GTGCAATTGGATTTTTGCCATTTTGTTG	2765

Overview

Query
AC010518.7 - 34674 bps
Hit
AC098789.2 - 2765 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1278 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link