<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1224 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AC006293.1	1	GATCCGCCTGTATCAGACTGCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	4655	GATCCGCCTGTATCAGACTGCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCA	4704

AC006293.1	51	CCACACCCAGCCTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	4705	CCACACCCAGCCTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTG	4754

AC006293.1	101	GTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCATCCACCTCGGCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	4755	GTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCATCCACCTCGGCC	4804

AC006293.1	151	ACCCAAAGTGCTGGGAGTACAGATGTTAGCCACCGTACCCAGTGAGAGTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	4805	ACCCAAAGTGCTGGGAGTACAGATGTTAGCCACCGTACCCAGTGAGAGTT	4854

AC006293.1	201	TCAGTGCTCTATCGGATTCCCTGCCTACTCCATGTTGCATGTAATGTTCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	4855	TCAGTGCTCTATCGGATTCCCTGCCTACTCCATGTTGCATGTAATGTTCC	4904

AC006293.1	251	ACCTCAGGGATGTTTCTCTCCTTTCTGTCTCCTTCCTCTTCTCCTTTTCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	4905	ACCTCAGGGATGTTTCTCTCCTTTCTGTCTCCTTCCTCTTCTCCTTTTCC	4954

AC006293.1	301	TTTTTTCTTTCTAATTTTTATTTTTTTGAGACAGAGCCTTGCTCTGTTAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	4955	TTTTTTCTTTCTAATTTTTATTTTTTTGAGACAGAGCCTTGCTCTGTTAC	5004

AC006293.1	351	CCAGGCTAGAGTACAGTGGCACGATCCCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	5005	CCAGGCTAGAGTACAGTGGCACGATCCCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTC	5054

AC006293.1	401	CTGGGTTCAAGAGATTCTCCTGACTCAGCCTCTCGAGTAGCTGGGATTAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	5055	CTGGGTTCAAGAGATTCTCCTGACTCAGCCTCTCGAGTAGCTGGGATTAC	5104

AC006293.1	451	AGGCACCCGCCATCACACCCAGCTAGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	5105	AGGCACCCGCCATCACACCCAGCTAGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGA	5154

AC006293.1	501	GGTTTCACCATGTTGGCCAGACTGGTCTTGAACTCCTGCCCTCAGGTAAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	5155	GGTTTCACCATGTTGGCCAGACTGGTCTTGAACTCCTGCCCTCAGGTAAT	5204

AC006293.1	551	CCACCCGCCTGTGGCCCCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	5205	CCACCCGCCTGTGGCCCCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACC	5254

AC006293.1	601	ACTCCCAGCCCTGAATGATCTTTCCTCTTTAGTGTGTTCTCACAACCACC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	5255	ACTCCCAGCCCTGAATGATCTTTCCTCTTTAGTGTGTTCTCACAACCACC	5304

AC006293.1	651	TCTCACTGAGCTTTCTTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	5305	TCTCACTGAGCTTTCTTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGT	5354

AC006293.1	701	TTTTGTTTTTGGCAGAGTCTGGCTTTGTTGCCTATGCTGGAGTGCAGTGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	5355	TTTTGTTTTTGGCAGAGTCTGGCTTTGTTGCCTATGCTGGAGTGCAGTGG	5404

AC006293.1	751	TGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	5405	TGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTC	5454

AC006293.1	801	CCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCACCACCACACC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	5455	CCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCACCACCACACC	5504

AC006293.1	851	CAGCTAATTTTTGCATTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	5505	CAGCTAATTTTTGCATTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCA	5554

AC006293.1	901	GGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCTGCCAGCCTCAGCCTCCCAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	5555	GGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCTGCCAGCCTCAGCCTCCCAA	5604

AC006293.1	951	AGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACCACTCCCAGCCCTGGATTATCTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	5605	AGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCACCACTCCCAGCCCTGGATTATCTT	5654

AC006293.1	1001	TCCTCTTTAGTGTGTTCTCACAACTACCTCTCACTGCTGGGTTTTCTCTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	5655	TCCTCTTTAGTGTGTTCTCACAACTACCTCTCACTGCTGGGTTTTCTCTC	5704

AC006293.1	1051	TTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGTCCGGCTTTGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	5705	TTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGTCCGGCTTTGT	5754

AC006293.1	1101	TGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	5755	TGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCAC	5804

AC006293.1	1151	CTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCCACCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	5805	CTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCCACCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGAT	5854

AC006293.1	1201	TACAGGCGCATGCCAGCACACCCA	1224
			||||||||||||||||||||||||
AC098784.2	5855	TACAGGCGCATGCCAGCACACCCA	5878

Overview

Query
AC006293.1 - 43527 bps
Hit
AC098784.2 - 5878 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1224 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link