<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 5791 bps / non-identical: 100 bps

Full alignment

AF111102.2	1	AAGCTTGTTTTCTGCACAGTCCCTCTGCTCTTACACAGAGGAGCTGGTGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	71577	AAGCTTGTTTTCTGCACAGTCCCTCTGCTCTTACACAGAGGAGCTGGTGA	71626

AF111102.2	51	GCACTCACTCCTTCAGGAGAGGCTGCATCCCACACTCCTAGGACACCTAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	71627	GCACTCACTCCTTCAGGAGAGGCTGCATCCCACACTCCTAGGACACCTAG	71676

AF111102.2	101	GGCCCTGCCTGGGGAAATGCAGGCACAGAGGACCACCATGTGAGAGGTGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	71677	GGCCCTGCCTGGGGAAATGCAGGCACAGAGGACCACCATGTGAGAGGTGT	71726

AF111102.2	151	TGGGAAGAAGAGGACTGGCTCCTGAGCTCACACTCACAGCTTACCCAGCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	71727	TGGGAAGAAGAGGACTGGCTCCTGAGCTCACACTCACAGCTTACCCAGCA	71776

AF111102.2	201	CATTCCACAGGAGCTGTGCAAATACACAAGGCTACAGGGCAAAGATCTTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	71777	CATTCCACAGGAGCTGTGCAAATACACAAGGCTACAGGGCAAAGATCTTA	71826

AF111102.2	251	TGGATAAATGTTTGCCTGCTCCAACAGGGACCCATGCATGCAGGGATTGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	71827	TGGATAAATGTTTGCCTGCTCCAACAGGGACCCATGCATGCAGGGATTGA	71876

AF111102.2	301	GATACCTTAGGGTCTCATATTCTGCTTCCAGGGCACCCTGTGTCCACTCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	71877	GATACCTTAGGGTCTCATATTCTGCTTCCAGGGCACCCTGTGTCCACTCC	71926

AF111102.2	351	TGCCAAAGAGACGGATAGAAAATGGCTCAGGCTTTGTCAGAGTAGTCCTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	71927	TGCCAAAGAGACGGATAGAAAATGGCTCAGGCTTTGTCAGAGTAGTCCTG	71976

AF111102.2	401	ATACCTGTTTGCCATCCCTGCCTTCCCAGGAGGATCTGAGGTCACTGAAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	71977	ATACCTGTTTGCCATCCCTGCCTTCCCAGGAGGATCTGAGGTCACTGAAC	72026

AF111102.2	451	ATAAAATGCACCTCCTTCTGTGTACCACAAGATGGGGAGTCCCAAATGAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72027	ATAAAATGCACCTCCTTCTGTGTACCACAAGATGGGGAGTCCCAAATGAG	72076

AF111102.2	501	AGAGAGAAATGGGGTCCCCTCCACAGTCTTACCCCTCAGTCTGGACTGAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72077	AGAGAGAAATGGGGTCCCCTCCACAGTCTTACCCCTCAGTCTGGACTGAT	72126

AF111102.2	551	GGTGGCAGATGCTGCTGCTTAATTCTTGACATTCTGAGGTCTTTGAATAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72127	GGTGGCAGATGCTGCTGCTTAATTCTTGACATTCTGAGGTCTTTGAATAA	72176

AF111102.2	601	AAATGGCACCTGTAGGCTCACATATTTGAAGACAGTGACCAGGGAATGGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72177	AAATGGCACCTGTAGGCTCACATATTTGAAGACAGTGACCAGGGAATGGG	72226

AF111102.2	651	GTACTTTGAAAGGTTTAGGAGAACTGGGGTGTGGCCTTGATATAGGAAGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72227	GTACTTTGAAAGGTTTAGGAGAACTGGGGTGTGGCCTTGATATAGGAAGT	72276

AF111102.2	701	ATTTCACAGGGAACAGTCTTTGAGGTTTTAAAAGGTCATGCCAGCCCAGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72277	ATTTCACAGGGAACAGTCTTTGAGGTTTTAAAAGGTCATGCCAGCCCAGT	72326

AF111102.2	751	CTTGGTCTGTCTGCTGCCCATAGATCAGGATGAGCTCTCAGCTCCTGCTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72327	CTTGGTCTGTCTGCTGCCCATAGATCAGGATGAGCTCTCAGCTCCTGCTC	72376

AF111102.2	801	CAGCCCCATGCCTGCCTGCCTGCTTGCTGCCATGCTCCCCACCATGATGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72377	CAGCCCCATGCCTGCCTGCCTGCTTGCTGCCATGCTCCCCACCATGATGA	72426

AF111102.2	851	GAATGGACTAAGCCACTGAAACTTTAAGTAAGCCCCAATTAAAGGCTGGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72427	GAATGGACTAAGCCACTGAAACTTTAAGTAAGCCCCAATTAAAGGCTGGC	72476

AF111102.2	901	CTTGAACTCATAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCTGAGTGCTGTGATTAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72477	CTTGAACTCATAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCTGAGTGCTGTGATTAAA	72526

AF111102.2	951	GGCATGAGCCACCACGCCCAGCTCATAACAGGTAATCTTAATTTGCTGCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72527	GGCATGAGCCACCACGCCCAGCTCATAACAGGTAATCTTAATTTGCTGCA	72576

AF111102.2	1001	ATGTAGTGTATTTGATTCAACTCTATTTGTAGTTATATGTAACTTGGATT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72577	ATGTAGTGTATTTGATTCAACTCTATTTGTAGTTATATGTAACTTGGATT	72626

AF111102.2	1051	CAACTTTTTCTATTGCCAAAATACCTAGGAGAGGTATAAATGGCCAAAAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72627	CAACTTTTTCTATTGCCAAAATACCTAGGAGAGGTATAAATGGCCAAAAT	72676

AF111102.2	1101	GGGGGAACCCCAAGAATTAGGGTTTGGGCAGGATGTTGCTTCTCCCCTTC	1150
			|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72677	GGGG-AACCCCAAGAATTAGGGTTTGGGCAGGATGTTGCTTCTCCCCTTC	72725

AF111102.2	1151	CAGGTGAATAAAAGCATCGAACAAAGGAATCTGGAGACCACTGGGCAAAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72726	CAGGTGAATAAAAGCATCGAACAAAGGAATCTGGAGACCACTGGGCAAAT	72775

AF111102.2	1201	GAAACAGCTGAAGAAAAAGATGGTTCATCAAGAGAAAATGTCCCAAGAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72776	GAAACAGCTGAAGAAAAAGATGGTTCATCAAGAGAAAATGTCCCAAGAAA	72825

AF111102.2	1251	AGGAGTCAACTGGCCAAGTGGTATCATCCACCTCCCTCTTGTCTCTTCTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72826	AGGAGTCAACTGGCCAAGTGGTATCATCCACCTCCCTCTTGTCTCTTCTG	72875

AF111102.2	1301	CCCTCTACAGACAGAAGTGGCAAATGGTCTTTATTTGATCTCAGTTAAAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72876	CCCTCTACAGACAGAAGTGGCAAATGGTCTTTATTTGATCTCAGTTAAAT	72925

AF111102.2	1351	ATTAATTAACCTGCAATTTGGCCTTAGAGCATGGATCTCTCCTATAAACC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72926	ATTAATTAACCTGCAATTTGGCCTTAGAGCATGGATCTCTCCTATAAACC	72975

AF111102.2	1401	CAAACATGATTATTAAAGGAAAATCCAATATCTCCGTCTCATATCAGAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72976	CAAACATGATTATTAAAGGAAAATCCAATATCTCCGTCTCATATCAGAAG	73025

AF111102.2	1451	AACCACTTGGTATGGGACAGAGAAAAACAGAAAGTAAGGGACTGTTCTAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73026	AACCACTTGGTATGGGACAGAGAAAAACAGAAAGTAAGGGACTGTTCTAT	73075

AF111102.2	1501	TGCCACCCATCTCATGATCTTTTGGTTTTCAGTTACTCTCTAACACTTTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73076	TGCCACCCATCTCATGATCTTTTGGTTTTCAGTTACTCTCTAACACTTTT	73125

AF111102.2	1551	CTTAGGATATGAATATTACAACAACTTCTATAGGAATATTGTGCATACAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73126	CTTAGGATATGAATATTACAACAACTTCTATAGGAATATTGTGCATACAT	73175

AF111102.2	1601	AAATTCTCTATCATCATACCAGCAGTCATACAGGGTAGAAACTAATTCTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73176	AAATTCTCTATCATCATACCAGCAGTCATACAGGGTAGAAACTAATTCTA	73225

AF111102.2	1651	GAAATCATCTTAATCTTGCTTCCTGTGTGTGTTTACAGTTTTCAGTCTCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73226	GAAATCATCTTAATCTTGCTTCCTGTGTGTGTTTACAGTTTTCAGTCTCA	73275

AF111102.2	1701	AGCAAGTAACTAGAAACAAGGTTTATGTATCTTGAATATACTTAAGAGAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73276	AGCAAGTAACTAGAAACAAGGTTTATGTATCTTGAATATACTTAAGAGAT	73325

AF111102.2	1751	AGTGGTTCCGAAACCTTTCTAAGATGTGCTGACTATAGCAATTAAAATGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73326	AGTGGTTCCGAAACCTTTCTAAGATGTGCTGACTATAGCAATTAAAATGA	73375

AF111102.2	1801	ATAGGTTTTTTAGAATTCCTAACAGTAACCTTTTAGGTTTCCAAGAAGAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73376	ATAGGTTTTTTAGAATTCCTAACAGTAACCTTTTAGGTTTCCAAGAAGAA	73425

AF111102.2	1851	GGATGACACAGCCCACTGACTGCAAATTCACCTGGATTGTGTTAACACTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73426	GGATGACACAGCCCACTGACTGCAAATTCACCTGGATTGTGTTAACACTA	73475

AF111102.2	1901	ACTACTGGCATAAACTGCCCCATGCCTCTTCTGCTGCCAGGTCCTGAGCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73476	ACTACTGGCATAAACTGCCCCATGCCTCTTCTGCTGCCAGGTCCTGAGCA	73525

AF111102.2	1951	AACAGCGGACACCTTTGGGTTGACTGCTATGTTCTACATAGACAGGATTG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73526	AACAGCGGACACCTTTGGGTTGACTGCTATGTTCTACATAGACAGGATTG	73575

AF111102.2	2001	ATGCTAAAGTGGCAAACTCCACCCAATGATCAGCTTCAGAATACAAACTC	2050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73576	ATGCTAAAGTGGCAAACTCCACCCAATGATCAGCTTCAGAATACAAACTC	73625

AF111102.2	2051	TCAAGGATATTCAAATTCCGGAGTTCATAGGAAACTGACATGGACATTGT	2100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73626	TCAAGGATATTCAAATTCCGGAGTTCATAGGAAACTGACATGGACATTGT	73675

AF111102.2	2101	GTAGATCTCTGAACTCAAAAATACTGAGTCCAGAGACTGCAAATTCAACC	2150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73676	GTAGATCTCTGAACTCAAAAATACTGAGTCCAGAGACTGCAAATTCAACC	73725

AF111102.2	2151	AAGGTGGACATTGTCGGAAGCTTGGCAGAAATACCTTCATTATTGAAAAC	2200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73726	AAGGTGGACATTGTCGGAAGCTTGGCAGAAATACCTTCATTATTGAAAAC	73775

AF111102.2	2201	AGTTTTACTGTGTTACACTTAAAATCTTTTTTAATATATAGACAAGAAAA	2250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73776	AGTTTTACTGTGTTACACTTAAAATCTTTTTTAATATATAGACAAGAAAA	73825

AF111102.2	2251	GGGAGATATTGGAATAATATATGGATAATAGGAAACAGGGGTAAATTATT	2300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73826	GGGAGATATTGGAATAATATATGGATAATAGGAAACAGGGGTAAATTATT	73875

AF111102.2	2301	CAATCTGTTCTTATATACAACTTTGTATATTGATACACAATTATTGTATA	2350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73876	CAATCTGTTCTTATATACAACTTTGTATATTGATACACAATTATTGTATA	73925

AF111102.2	2351	TTGTTACAAAATTATATTAACTTACAATGGCTTAGATCTTTTTATGTTGA	2400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73926	TTGTTACAAAATTATATTAACTTACAATGGCTTAGATCTTTTTATGTTGA	73975

AF111102.2	2401	GACAAAATTGAGGTTGTATTTGCTTACATTAGTATAGACCTTTGTATATT	2450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	73976	GACAAAATTGAGGTTGTATTTGCTTACATTAGTATAGACCTTTGTATATT	74025

AF111102.2	2451	AATGCAAAACTGAGGTTTATTGATTACACTGGGATAGATCTTTGTATATT	2500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74026	AATGCAAAACTGAGGTTTATTGATTACACTGGGATAGATCTTTGTATATT	74075

AF111102.2	2501	GATACAAAATTAATGTTGTATTTGCTTACATCCATATAGACCCTGTATAT	2550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74076	GATACAAAATTAATGTTGTATTTGCTTACATCCATATAGACCCTGTATAT	74125

AF111102.2	2551	TGATACAAAGTAAGGCTATATTTTGGTTACAACATACCATGTATCAACTA	2600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74126	TGATACAAAGTAAGGCTATATTTTGGTTACAACATACCATGTATCAACTA	74175

AF111102.2	2601	TATAGTATTAAGTTACCTTTGTAATTCTTATACTGCAGGGGGAAGTACTC	2650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74176	TATAGTATTAAGTTACCTTTGTAATTCTTATACTGCAGGGGGAAGTACTC	74225

AF111102.2	2651	ATCACATTTCAAACTGTTTAAGAAAACTTTAAAATGCAAGTTAACACTCA	2700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74226	ATCACATTTCAAACTGTTTAAGAAAACTTTAAAATGCAAGTTAACACTCA	74275

AF111102.2	2701	ATAAAATTTTATTATTTGGGTTTTGTAAGGTACTAGTCTTCAAAAATCTC	2750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74276	ATAAAATTTTATTATTTGGGTTTTGTAAGGTACTAGTCTTCAAAAATCTC	74325

AF111102.2	2751	AGAGATCTACAAAATATAGCAATTAAAGATGTTTTAATTATTTAAGGCTT	2800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74326	AGAGATCTACAAAATATAGCAATTAAAGATGTTTTAATTATTTAAGGCTT	74375

AF111102.2	2801	TTTTTTTTTAGAATGAGATGTGTCAGCTCCTGGCAGCACACCCATACTAC	2850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74376	TTTTTTTTTAGAATGAGATGTGTCAGCTCCTGGCAGCACACCCATACTAC	74425

AF111102.2	2851	TTCAAAGAAGTTGATGAGAATTGAAGAATTTACTTATGGACTTTGCTTCA	2900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74426	TTCAAAGAAGTTGATGAGAATTGAAGAATTTACTTATGGACTTTGCTTCA	74475

AF111102.2	2901	AATATGGCAAGCTGCCACTGGGCAAGAAACTGCCCTTGCTTCAACCGCAG	2950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74476	AATATGGCAAGCTGCCACTGGGCAAGAAACTGCCCTTGCTTCAACCGCAG	74525

AF111102.2	2951	ACAGAACACTGTGCAAACTGGACAAAGAAAGAACAGGAAGTCAAGTGCTG	3000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74526	ACAGAACACTGTGCAAACTGGACAAAGAAAGAACAGGAAGTCAAGTGCTG	74575

AF111102.2	3001	AACTCTGCCAGGACTACATAGAGATGAAGACCCTCATGCTTCCTGCTTTG	3050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74576	AACTCTGCCAGGACTACATAGAGATGAAGACCCTCATGCTTCCTGCTTTG	74625

AF111102.2	3051	AAGAACAATCTGTCAGATGTTCTGGGCCAGCAGCCTGGAAACATGGACGC	3100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74626	AAGAACAATCTGTCAGATGTTCTGGGCCAGCAGCCTGGAAACATGGACGC	74675

AF111102.2	3101	CCCAAACTTCCAGATGAAGCCTGGTGACCGTGCAGCAGCCGCAGTCTCTG	3150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74676	CCCAAACTTCCAGATGAAGCCTGGTGACCGTGCAGCAGCCGCAGTCTCTG	74725

AF111102.2	3151	TGTTTTACAGTCTTACAAGTTGCTTGTTCTGCACTTCCTGTCTGTGTTGA	3200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74726	TGTTTTACAGTCTTACAAGTTGCTTGTTCTGCACTTCCTGTCTGTGTTGA	74775

AF111102.2	3201	TAACATTCGTTCCCCTCAGGTCTCTGATGGGGTTAACTCTCACAGTTAAG	3250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74776	TAACATTCGTTCCCCTCAGGTCTCTGATGGGGTTAACTCTCACAGTTAAG	74825

AF111102.2	3251	CCTAAATTGCTGACGATTTAAGAAAATGTTTTAAGGTTTGAAAAGAGGTT	3300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74826	CCTAAATTGCTGACGATTTAAGAAAATGTTTTAAGGTTTGAAAAGAGGTT	74875

AF111102.2	3301	TTTAGTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTACGCCAGGAACTCATGTCT	3350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74876	TTTAGTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTACGCCAGGAACTCATGTCT	74925

AF111102.2	3351	CTAGCTGCATATGCAGCAGAAGATGGCCTCGTTGGCAATTATTGGGAAGA	3400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74926	CTAGCTGCATATGCAGCAGAAGATGGCCTCGTTGGCAATTATTGGGAAGA	74975

AF111102.2	3401	GAGACCCCTTGGTCTAGCAATCTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAACGCC	3450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	74976	GAGACCCCTTGGTCTAGCAATCTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAACGCC	75025

AF111102.2	3451	AGGGCCAAGAAGTGGGAGTGAGTGGGTAGGGGAGCAGGGTGGGGGGAAGG	3500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
AC087217.1	75026	AGGGCCAAGAAGTGGGAGTGAGTGGGTAGGGGAGCAGGGTGGGGGGAGGG	75075

AF111102.2	3501	TATAGGGGACTTTTGGGGTAGCATTTGAAATGTAAATGAAGAAAATATCT	3550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	75076	TATAGGGGACTTTTGGGGTAGCATTTGAAATGTAAATGAAGAAAATATCT	75125

AF111102.2	3551	AATAAAAATGAAGATTAAAAAACATTAAAAAAAGAGGTTTTTAGGTTGCT	3600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	75126	AATAAAAATGAAGATTAAAAAACATTAAAAAAAGAGGTTTTTAGGTTGCT	75175

AF111102.2	3601	AAATACAAGTTATGACAGGAAGTATTTTGAGTTGCACTCAACAAGATTAG	3650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	75176	AAATACAAGTTATGACAGGAAGTATTTTGAGTTGCACTCAACAAGATTAG	75225

AF111102.2	3651	ATAGATAGTGGAATACTTTCTCCAAACTTGCCAAATACAAGAGGACTTGA	3700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	75226	ATAGATAGTGGAATACTTTCTCCAAACTTGCCAAATACAAGAGGACTTGA	75275

AF111102.2	3701	CATTGTGAATGTAATTCTTAGCAGATAGCAGTATTTAGTTTATTGATATT	3750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	75276	CATTGTGAATGTAATTCTTAGCAGATAGCAGTATTTAGTTTATTGATATT	75325

AF111102.2	3751	AGAGAAATAGTTATTATTCAGACAAAAGGGGAAAATATGGCAGGATATTT	3800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	75326	AGAGAAATAGTTATTATTCAGACAAAAGGGGAAAATATGGCAGGATATTT	75375

AF111102.2	3801	AATTACATTGTGTAGCCCAAGATTCTGAACTTGGAACAAGAAAATCTGTT	3850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	75376	AATTACATTGTGTAGCCCAAGATTCTGAACTTGGAACAAGAAAATCTGTT	75425

AF111102.2	3851	TCTGCTTGTGGACTTGCACAGCCCTAACAGACACCTTTAAGCCAAGAGTT	3900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	75426	TCTGCTTGTGGACTTGCACAGCCCTAACAGACACCTTTAAGCCAAGAGTT	75475

AF111102.2	3901	TTCTGTAAACAATATTAATTAAACTCAACCATAGGTCAAGAGGCACAGCA	3950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	75476	TTCTGTAAACAATATTAATTAAACTCAACCATAGGTCAAGAGGCACAGCA	75525

AF111102.2	3951	TGCAACCAGTTGACAGGGGAGAACATAGGAAACACAGGAAATAGAAGGGA	4000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	75526	TGCAACCAGTTGACAGGGGAGAACATAGGAAACACAGGAAATAGAAGGGA	75575

AF111102.2	4001	GGGAGATTGAGTTGGAGGGAGTTGAAGACAGTATGGAGGAGAAATGCATC	4050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	75576	GGGAGATTGAGTTGGAGGGAGTTGAAGACAGTATGGAGGAGAAATGCATC	75625

AF111102.2	4051	AAGGGAAGGAGATAACTTAGTGTCTCACATACTCCTACCATGCCATCCCC	4100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	75626	AAGGGAAGGAGATAACTTAGTGTCTCACATACTCCTACCATGCCATCCCC	75675

AF111102.2	4101	TGTGTCCACTCTTGCCAAAGAGAAGGCTGGAAAATGGCTCAGGCTTTGTC	4150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	75676	TGTGTCCACTCTTGCCAAAGAGAAGGCTGGAAAATGGCTCAGGCTTTGTC	75725

AF111102.2	4151	AGAGGAGTCCTGACACAAGCTGCCATCACTGCCTTTCTAGGGAGATCTGA	4200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	75726	AGAGGAGTCCTGACACAAGCTGCCATCACTGCCTTTCTAGGGAGATCTGA	75775

AF111102.2	4201	GGTCACTGAGCAAGAAGAGCACTTCCTTCTGTGTACCACAAGATGGGGAG	4250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	75776	GGTCACTGAGCAAGAAGAGCACTTCCTTCTGTGTACCACAAGATGGGGAG	75825

AF111102.2	4251	TCCCAAAGGAGAGAGACATGGGGTCCCCTCCACACTCTTATCCCTCAGTC	4300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	75826	TCCCAAAGGAGAGAGACATGGGGTCCCCTCCACACTCTTATCCCTCAGTC	75875

AF111102.2	4301	TGGACTGATGGTGGCAGATGCTGCTGCTTGATTCTTGACATTCTGAGGTC	4350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	75876	TGGACTGATGGTGGCAGATGCTGCTGCTTGATTCTTGACATTCTGAGGTC	75925

AF111102.2	4351	TTTGAATAAAAATGGCACCTGTAGGCTCACATATTTGAAGACAGTGACCA	4400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	75926	TTTGAATAAAAATGGCACCTGTAGGCTCACATATTTGAAGACAGTGACCA	75975

AF111102.2	4401	AGGAATGGGGCATTTTGAAAGGATTAGAAAAATTGGGGTGTGGCCTTGAT	4450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	75976	AGGAATGGGGCATTTTGAAAGGATTAGAAAAATTGGGGTGTGGCCTTGAT	76025

AF111102.2	4451	ACAAAAAGTATAAGCCTGGGAATAGTCTTTGAGGTTTCAAAAGCCCATGC	4500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76026	ACAAAAAGTATAAGCCTGGGAATAGTCTTTGAGGTTTCAAAAGCCCATGC	76075

AF111102.2	4501	AAAACCCAATGTTGGTCTGTCTGCTGCCCATAGATCAGGATGAGCTCTCA	4550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76076	AAAACCCAATGTTGGTCTGTCTGCTGCCCATAGATCAGGATGAGCTCTCA	76125

AF111102.2	4551	GCTCCTGCTCCAGCCCCATGCCTGCCTGCCTGCCTGCTTGCTGCCCTGCT	4600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76126	GCTCCTGCTCCAGCCCCATGCCTGCCTGCCTGCCTGCTTGCTGCCCTGCT	76175

AF111102.2	4601	CCCCACCATGATGAGAATGGACTAAGCCACTGAAAATGTAAATAAGCTCC	4650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76176	CCCCACCATGATGAGAATGGACTAAGCCACTGAAAATGTAAATAAGCTCC	76225

AF111102.2	4651	AATTAAAGGCTTTCTATTTCAGAACTGCCTTGATCATGGTGGCCCTGCAC	4700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76226	AATTAAAGGCTTTCTATTTCAGAACTGCCTTGATCATGGTGGCCCTGCAC	76275

AF111102.2	4701	AGCAACATAACAGTGTCTAAGACTCATGCTATCATTTCCAAGTCTCTGCC	4750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76276	AGCAACATAACAGTGTCTAAGACTCATGCTATCATTTCCAAGTCTCTGCC	76325

AF111102.2	4751	ATCTATGTCCCCATCCATCCAGCAGTAACCTCACCTAGAAGCAAAATGGA	4800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76326	ATCTATGTCCCCATCCATCCAGCAGTAACCTCACCTAGAAGCAAAATGGA	76375

AF111102.2	4801	CCCTAATGCTCATTAAGACCAGACCAAAGGCACCATCCCTGTCCCTCTGC	4850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76376	CCCTAATGCTCATTAAGACCAGACCAAAGGCACCATCCCTGTCCCTCTGC	76425

AF111102.2	4851	TGATGTCACTCTCCAGCTCAGCTCTGACTCCTCAGAGCAGACCAGCCTTG	4900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76426	TGATGTCACTCTCCAGCTCAGCTCTGACTCCTCAGAGCAGACCAGCCTTG	76475

AF111102.2	4901	TGATAAACCTAAAACCACCCACATTCCAGAAACAGGGGACTCCTAGCCTG	4950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76476	TGATAAACCTAAAACCACCCACATTCCAGAAACAGGGGACTCCTAGCCTG	76525

AF111102.2	4951	CACTCAGACACTCAGCACCAACAGCTTAGTTTTCAACAGCCAAAAATGGG	5000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76526	CACTCAGACACTCAGCACCAACAGCTTAGTTTTCAACAGCCAAAAATGGG	76575

AF111102.2	5001	ACATATTATCACTGTTGCCTGCACCCACTTTCTCTTCCATTCTTGCTCAG	5050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76576	ACATATTATCACTGTTGCCTGCACCCACTTTCTCTTCCATTCTTGCTCAG	76625

AF111102.2	5051	AGGCAGCCTTTTTTATAGGAATCTCCATACATAAATCTTACTCCTGACGT	5100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76626	AGGCAGCCTTTTTTATAGGAATCTCCATACATAAATCTTACTCCTGACGT	76675

AF111102.2	5101	CTGTTGGGAGGTGTTACCTTTGAGGCATCCCTTGGTTCTCTGATTGACAC	5150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76676	CTGTTGGGAGGTGTTACCTTTGAGGCATCCCTTGGTTCTCTGATTGACAC	76725

AF111102.2	5151	AAAAACCCCAAAGCCTAACACTGGAGCTGTGGTTTGGTAGACTGGCCTTG	5200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76726	AAAAACCCCAAAGCCTAACACTGGAGCTGTGGTTTGGTAGACTGGCCTTG	76775

AF111102.2	5201	GGCTTGTGCACACTTTTGAGGCCCAAGCTACATGGGAACCTATCCCTTAT	5250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76776	GGCTTGTGCACACTTTTGAGGCCCAAGCTACATGGGAACCTATCCCTTAT	76825

AF111102.2	5251	CTCCAGTCCACCCACAGCAGACCCACCTTCTGGCCCTCCATCCATCACCA	5300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76826	CTCCAGTCCACCCACAGCAGACCCACCTTCTGGCCCTCCATCCATCACCA	76875

AF111102.2	5301	GCACCTGGTGAGTGGTCCCTCTCAGTTGTCCCCAGTGCTTCCCTGAGTCT	5350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76876	GCACCTGGTGAGTGGTCCCTCTCAGTTGTCCCCAGTGCTTCCCTGAGTCT	76925

AF111102.2	5351	TGGTACTCTATATGGTGGAGGTACCCATCCCTGCTTTGGACCTTTGCCCC	5400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76926	TGGTACTCTATATGGTGGAGGTACCCATCCCTGCTTTGGACCTTTGCCCC	76975

AF111102.2	5401	TGGGTTGGGTTTTATTTTGAGCTATATTTTTTTCTGCTACCTGCTGTCTC	5450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	76976	TGGGTTGGGTTTTATTTTGAGCTATATTTTTTTCTGCTACCTGCTGTCTC	77025

AF111102.2	5451	TCTTTGTTCTCCCTGAGCCTGTACATTGTGAGTTTCTTTGCCTCTCACCC	5500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	77026	TCTTTGTTCTCCCTGAGCCTGTACATTGTGAGTTTCTTTGCCTCTCACCC	77075

AF111102.2	5501	ATAGAGTGGAATGTGGGTGGTTCTAGGATTACCAACAAGGCTGGTCTGCT	5550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	77076	ATAGAGTGGAATGTGGGTGGTTCTAGGATTACCAACAAGGCTGGTCTGCT	77125

AF111102.2	5551	CTGAGGAGTCAGAACATACTGGAGAGTGACATCATAGAAGTATAGAAATT	5600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	77126	CTGAGGAGTCAGAACATACTGGAGAGTGACATCATAGAAGTATAGAAATT	77175

AF111102.2	5601	CCCTCTACTGGAATTTGGTTTTACAACCCTGTCTCTCTATACCTCCAAGA	5650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	77176	CCCTCTACTGGAATTTGGTTTTACAACCCTGTCTCTCTATACCTCCAAGA	77225

AF111102.2	5651	AATCAGGTTTTATTACAACGTCTTGGCCTCAGTACAAATCAATAGTCAAA	5700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	77226	AATCAGGTTTTATTACAACGTCTTGGCCTCAGTACAAATCAATAGTCAAA	77275

AF111102.2	5701	AGTTGGGTACAATTGATTTCCAACTTTTCCCAAATCATAACAGCTCTCTC	5750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	77276	AGTTGGGTACAATTGATTTCCAACTTTTCCCAAATCATAACAGCTCTCTC	77325

AF111102.2	5751	TGCACAGGCAAGTGATCCCCAAATATCTTATGTCTAAGCTT	5791
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	77326	TGCACAGGCAAGTGATCCCCAAATATCTTATGTCTAAGCTT	77366

Compact alignment

skip 1100 bps 100% identity alignment

AF111102.2	1101	GGGGGAACCCCAAGAATTAGGGTTTGGGCAGGATGTTGCTTCTCCCCTTC	1150
			|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC087217.1	72677	GGGG-AACCCCAAGAATTAGGGTTTGGGCAGGATGTTGCTTCTCCCCTTC	72725

skip 2300 bps 100% identity alignment

AF111102.2	3451	AGGGCCAAGAAGTGGGAGTGAGTGGGTAGGGGAGCAGGGTGGGGGGAAGG	3500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
AC087217.1	75026	AGGGCCAAGAAGTGGGAGTGAGTGGGTAGGGGAGCAGGGTGGGGGGAGGG	75075

skip 2291 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AF111102.2 - 158443 bps
Hit
AC087217.1 - 77366 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 5791 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.98270579115791171577773661
Short-link