<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 3154 bps / non-identical: 350 bps

Full alignment

C  AC004099.1	3154	TTTGGGAGGCTGAGGCAGATGGATCATGAGGTTAGGAATTCAAAACCACC	3105
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1	TTTGGGAGGCTGAGGCAGATGGATCATGAGGTTAGGAATTCAAAACCACC	50

C  AC004099.1	3104	CTGACCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATCAGCT	3055
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	51	CTGACCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATCAGCT	100

C  AC004099.1	3054	GGGCATAATGGTGTGTGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCA	3005
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	101	GGGCATAATGGTGTGTGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCA	150

C  AC004099.1	3004	GGAGAATCGCTTGAACCTAAGAGGTGGAGATTGCAGTTAGCAGAGATGAC	2955
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	151	GGAGAATCGCTTGAACCTAAGAGGTGGAGATTGCAGTTAGCAGAGATGAC	200

C  AC004099.1	2954	ACCACTGTACTCCAGCCTGGGCGACTGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAA	2905
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	201	ACCACTGTACTCCAGCCTGGGCGACTGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAA	250

C  AC004099.1	2904	AAAAAAAAGAAAGAAAAAGAAAAATTGGAAGGAATAGATTTAATAAGACA	2855
			||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
  AC068447.16	251	AAAAAAA-GAAAGAAAAAGAAAAATTGGAAGGAATAGATTTAATAAGATA	299

C  AC004099.1	2854	TAGATCTCCTTAGCAGTTGACAGTAATCTCCGAAATATTACATCATAAAA	2805
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	300	TAGATCTCCTTAGCAGTTGACAGTAATCTCCGAAATATTACATCATAAAA	349

C  AC004099.1	2804	AATAGCATAAAACTAGGCTAGGAGAAGCCAGCATTAGTGAGTTACCTGCA	2755
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	350	AATAGCATAAAACTAGGCTAGGAGAAGCCAGCATTAGTGAGTTACCTGCA	399

C  AC004099.1	2754	AGCAGAGGAAAAAAGGAGGTGGCCCACATTCAGCACACTTGATATAAGGC	2705
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	400	AGCAGAGGAAAAAAGGAGGTGGCCCACATTCAGCACACTTGATATAAGGC	449

C  AC004099.1	2704	TCCATGAGGTAGGAGGAGCAGCCTCGGCAAGGTGGCTTATCAGAGGGATC	2655
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	450	TCCATGAGGTAGGAGGAGCAGCCTCGGCAAGGTGGCTTATCAGAGGGATC	499

C  AC004099.1	2654	ATCTAGAACAAACAGAAAACAAATGCACATTTCAGACCACCTTACGGTTA	2605
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	500	ATCTAGAACAAACAGAAAACAAATGCACATTTCAGACCACCTTACGGTTA	549

C  AC004099.1	2604	TCTTAAGTGCAAAAAGGTGAAAATCCCCAAATGACCACACAAGTAGTGAG	2555
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	550	TCTTAAGTGCAAAAAGGTGAAAATCCCCAAATGACCACACAAGTAGTGAG	599

C  AC004099.1	2554	CTAAGCTGAAAAGTTCATGGAGACAAGATGAGCTCATTACAAATAAAAAA	2505
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	600	CTAAGCTGAAAAGTTCATGGAGACAAGATGAGCTCATTACAAATAAAAAA	649

C  AC004099.1	2504	AAGCAAAAATTATGATCCTTTTAACTTCAGGGCAGCATTGTTCCCTTTCA	2455
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
  AC068447.16	650	AAGCAAAAATTATGATCCTTTTAACTTCAGGGCAGCATTGTTCCTTTTCA	699

C  AC004099.1	2454	CACAGCATTTACGTAGATATGAACCCTGCAGAGAAATTTACAAGCATATG	2405
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	700	CACAGCATTTACGTAGATATGAACCCTGCAGAGAAATTTACAAGCATATG	749

C  AC004099.1	2404	TTTGTTTGTTGATTTATTTATATATTTTTAGAGACAGGGTCTTGCTCTGC	2355
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	750	TTTGTTTGTTGATTTATTTATATATTTTTAGAGACAGGGTCTTGCTCTGC	799

C  AC004099.1	2354	CACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTGACAATAGCTCACTGTAACCTGAAA	2305
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	800	CACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTGACAATAGCTCACTGTAACCTGAAA	849

C  AC004099.1	2304	CTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGTTAGGAC	2255
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	850	CTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGTTAGGAC	899

C  AC004099.1	2254	TACAGGCACATGCCACCACACCTGGTTAATTTTTTGTAGAGACGATGTCT	2205
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	900	TACAGGCACATGCCACCACACCTGGTTAATTTTTTGTAGAGACGATGTCT	949

C  AC004099.1	2204	CACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTTTTAGGTTCAAAGAATGTTCC	2155
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	950	CACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTTTTAGGTTCAAAGAATGTTCC	999

C  AC004099.1	2154	TGCCTTGGCCTCTCAAAGCTCTGGAATTACAGGTATGAGCTACCATGCCC	2105
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1000	TGCCTTGGCCTCTCAAAGCTCTGGAATTACAGGTATGAGCTACCATGCCC	1049

C  AC004099.1	2104	AGTCACAAACACATTTTTAACTGGAAGTTTCATAATATCCCAAACTTATT	2055
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1050	AGTCACAAACACATTTTTAACTGGAAGTTTCATAATATCCCAAACTTATT	1099

C  AC004099.1	2054	TTTCCAGGAGCATAAAATGGACACATACCTGCACATACAATATAAAGAAA	2005
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1100	TTTCCAGGAGCATAAAATGGACACATACCTGCACATACAATATAAAGAAA	1149

C  AC004099.1	2004	ATCTGACAAAATGTTAACAATTGCTGAATCTAGGTAGCAAGCATATAAAT	1955
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1150	ATCTGACAAAATGTTAACAATTGCTGAATCTAGGTAGCAAGCATATAAAT	1199

C  AC004099.1	1954	AATCACTGTAGGCCGGCCACATTAGCTTACCCTGTAATTCCAGCACTTTG	1905
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1200	AATCACTGTAGGCCGGCCACATTAGCTTACCCTGTAATTCCAGCACTTTG	1249

C  AC004099.1	1904	GGAGGCCAAGGTGGGTGCATTACCTGAGGCCAGAAGTTTGAGACCAGCCT	1855
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1250	GGAGGCCAAGGTGGGTGCATTACCTGAGGCCAGAAGTTTGAGACCAGCCT	1299

C  AC004099.1	1854	TGCCAACCTGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAACAGCCAGGGA	1805
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1300	TGCCAACCTGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAACAGCCAGGGA	1349

C  AC004099.1	1804	TGGGGGCGCAGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAAGTTGAGGCACAGAAT	1755
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1350	TGGGGGCGCAGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAAGTTGAGGCACAGAAT	1399

C  AC004099.1	1754	CACTTGAACCCGGAAGGCAAAGGTTGCCGTGAGCCAAGATTGTGCCACTG	1705
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1400	CACTTGAACCCGGAAGGCAAAGGTTGCCGTGAGCCAAGATTGTGCCACTG	1449

C  AC004099.1	1704	CACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCTAGACCCTGCCTCAAATAATAATAATA	1655
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||
  AC068447.16	1450	CACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCTAGACCCTGCCTCA------AATAATA	1493

C  AC004099.1	1654	ATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCAGCTGGGCATGGTGGCTCAC	1605
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1494	ATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCAGCTGGGCATGGTGGCTCAC	1543

C  AC004099.1	1604	GCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATTGCCTGCTC	1555
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1544	GCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATTGCCTGCTC	1593

C  AC004099.1	1554	TTAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACACAGTGAAACCCTGTCTCTACT	1505
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1594	TTAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACACAGTGAAACCCTGTCTCTACT	1643

C  AC004099.1	1504	AAAACTACAAAAAAATTGGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCA	1455
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1644	AAAACTACAAAAAAATTGGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCA	1693

C  AC004099.1	1454	GCACTTTGGGGGGCCGAGGCGGGTGGATCATGAGGTGAGGAGTTCAAGAC	1405
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1694	GCACTTTGGGGGGCCGAGGCGGGTGGATCATGAGGTGAGGAGTTCAAGAC	1743

C  AC004099.1	1404	CAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAACACAAAAATT	1355
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1744	CAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAACACAAAAATT	1793

C  AC004099.1	1354	AGCCAGGTGTGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGA	1305
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1794	AGCCAGGTGTGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGA	1843

C  AC004099.1	1304	GGCAGAGGAATCACTTGAACCCAGAAGGCACAGGTTGCAGTGAGCCGAGA	1255
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1844	GGCAGAGGAATCACTTGAACCCAGAAGGCACAGGTTGCAGTGAGCCGAGA	1893

C  AC004099.1	1254	TCGCGCCGCTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTCTTACTCTGTCTCAAA	1205
			||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||
  AC068447.16	1894	TCGCGCCGCTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTAAGACTCTGTCTCAAA	1943

C  AC004099.1	1204	AAAAAAACAAAAAAATTAGCCAAGCATGGCGGTATGCATCTGTAGTCCCA	1155
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1944	AAAAAAACAAAAAAATTAGCCAAGCATGGCGGTATGCATCTGTAGTCCCA	1993

C  AC004099.1	1154	GCTACACAGGAGGCTGAGGCAGAAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGCGGAG	1105
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	1994	GCTACACAGGAGGCTGAGGCAGAAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGCGGAG	2043

C  AC004099.1	1104	GTTGCAGTGATCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGTCTGGGCAACAGAG	1055
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2044	GTTGCAGTGATCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGTCTGGGCAACAGAG	2093

C  AC004099.1	1054	AGAGACTCCGTCTCCAAAAAAAAATAAAAAAATAAAAAAACACATCATCA	1005
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2094	AGAGACTCCGTCTCCAAAAAAAAATAAAAAAATAAAAAAACACATCATCA	2143

C  AC004099.1	1004	TCATTGTACTGTTCTTTTGACTTTTCT-----------------------	978
			|||||||||||||||||||||||||||                       
  AC068447.16	2144	TCATTGTACTGTTCTTTTGACTTTTCTATTTAAGTTTAAAACTTTTCATA	2193

C  AC004099.1	977	ATAAAAAGTTGGGGCAAATAAGAGAAAACTCCTTTTTTTTTTGAGATAGG	928
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2194	ATAAAAAGTTGGGGCAAATAAGAGAAAACTCCTTTTTTTTTTGAGATAGG	2243

C  AC004099.1	927	GTCTCACTCTGTCACCTAGGCTGAAGTGTGGTTGCACGATCATGCCTCAA	878
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2244	GTCTCACTCTGTCACCTAGGCTGAAGTGTGGTTGCACGATCATGCCTCAA	2293

C  AC004099.1	877	TGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAATGAGCCTCCCACCTCAGCCTCCTA	828
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2294	TGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAATGAGCCTCCCACCTCAGCCTCCTA	2343

C  AC004099.1	827	ACTAGCAGGGACTACAGGCACAAGCCACCACACCCGGGTACTTTTTTAAA	778
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2344	ACTAGCAGGGACTACAGGCACAAGCCACCACACCCGGGTACTTTTTTAAA	2393

C  AC004099.1	777	ATTTATTTTCTGTAGAGACAAGAGTTTCACTATGTTGCCTAGGCTGGTCT	728
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2394	ATTTATTTTCTGTAGAGACAAGAGTTTCACTATGTTGCCTAGGCTGGTCT	2443

C  AC004099.1	727	TGAATTCCTGGGCTCAAACGGTTCCAGGAATTTGAGCTGCCTCAGCTTCC	678
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2444	TGAATTCCTGGGCTCAAACGGTTCCAGGAATTTGAGCTGCCTCAGCTTCC	2493

C  AC004099.1	677	TAAAGTGTTGGGATTACAGGTATGAGCCATCACACTCAGCTAGCCTCTAA	628
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2494	TAAAGTGTTGGGATTACAGGTATGAGCCATCACACTCAGCTAGCCTCTAA	2543

C  AC004099.1	627	ATACATGTCTCTTCTAAATACATATTTTGGAATATACTATTTTATATTTG	578
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2544	ATACATGTCTCTTCTAAATACATATTTTGGAATATACTATTTTATATTTG	2593

C  AC004099.1	577	AGTTCGGATTTTTCTTTTTTTTCTTGAGACAGGGTCTTCTTGAGACAGAG	528
			 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2594	GGTTCGGATTTTTCTTTTTTTTCTTGAGACAGGGTCTTCTTGAGACAGAG	2643

C  AC004099.1	527	TCTTCTTGAGACAGGGTCTTAGACTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGT	478
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2644	TCTTCTTGAGACAGGGTCTTAGACTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGT	2693

C  AC004099.1	477	GAGATCATGGCTCACTGTGGCTTCAATCTCCCCAGGCTCAGGTGTTCCTC	428
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2694	GAGATCATGGCTCACTGTGGCTTCAATCTCCCCAGGCTCAGGTGTTCCTC	2743

C  AC004099.1	427	CCACCTCAGCCTCCCAAGAGGAGGGACAGACTTGCACCACTGCGCCTGGC	378
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2744	CCACCTCAGCCTCCCAAGAGGAGGGACAGACTTGCACCACTGCGCCTGGC	2793

C  AC004099.1	377	TAAATTTTTACTTTTTGTAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGCCCACACTG	328
			|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2794	TAAATTTTTAATTTTTGTAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGCCCACACTG	2843

C  AC004099.1	327	GTCTTAAGAAGTCCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAAGTGGTGGAATTATAGG	278
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2844	GTCTTAAGAAGTCCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAAGTGGTGGAATTATAGG	2893

C  AC004099.1	277	CATGAGCCACCACACCTGGCTCTGAGTGGGAATTGAAACCCAGGAAGCTT	228
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2894	CATGAGCCACCACACCTGGCTCTGAGTGGGAATTGAAACCCAGGAAGCTT	2943

C  AC004099.1	227	CCTCCCTTTCTCCCATGGTAAGTACATAACACAGCAGATCTTCTACTCCA	178
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2944	CCTCCCTTTCTCCCATGGTAAGTACATAACACAGCAGATCTTCTACTCCA	2993

C  AC004099.1	177	ATGACAGTGGTATGTCTCCAAACTATGAAGACAAGGAGTACAATCCAAAC	128
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2994	ATGACAGTGGTATGTCTCCAAACTATGAAGACAAGGAGTACAATCCAAAC	3043

C  AC004099.1	127	TCTCAAAACTCATAAAAATGCAGATATATGTGTCCCTGGTTGCCCCAAAT	78
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	3044	TCTCAAAACTCATAAAAATGCAGATATATGTGTCCCTGGTTGCCCCAAAT	3093

C  AC004099.1	77	TCGGCCTCTGGAGTCACGGCAACCTAGCAAAATTGTTCTCTATGATCAAT	28
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	3094	TCGGCCTCTGGAGTCACGGCAACCTAGCAAAATTGTTCTCTATGATCAAT	3143

C  AC004099.1	27	CACAAGAATCTAAGAGAAGAAAAGCTT	1
			|||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	3144	CACAAGAATCTAAGAGAAGAAAAGCTT	3170

Compact alignment

skip 250 bps 100% identity alignment

C  AC004099.1	2904	AAAAAAAAGAAAGAAAAAGAAAAATTGGAAGGAATAGATTTAATAAGACA	2855
			||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
  AC068447.16	251	AAAAAAA-GAAAGAAAAAGAAAAATTGGAAGGAATAGATTTAATAAGATA	299

skip 350 bps 100% identity alignment

C  AC004099.1	2504	AAGCAAAAATTATGATCCTTTTAACTTCAGGGCAGCATTGTTCCCTTTCA	2455
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
  AC068447.16	650	AAGCAAAAATTATGATCCTTTTAACTTCAGGGCAGCATTGTTCCTTTTCA	699

skip 750 bps 100% identity alignment

C  AC004099.1	1704	CACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCTAGACCCTGCCTCAAATAATAATAATA	1655
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||
  AC068447.16	1450	CACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCTAGACCCTGCCTCA------AATAATA	1493

skip 400 bps 100% identity alignment

C  AC004099.1	1254	TCGCGCCGCTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTCTTACTCTGTCTCAAA	1205
			||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||
  AC068447.16	1894	TCGCGCCGCTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTAAGACTCTGTCTCAAA	1943

skip 200 bps 100% identity alignment

C  AC004099.1	1004	TCATTGTACTGTTCTTTTGACTTTTCT-----------------------	978
			|||||||||||||||||||||||||||                       
  AC068447.16	2144	TCATTGTACTGTTCTTTTGACTTTTCTATTTAAGTTTAAAACTTTTCATA	2193

skip 400 bps 100% identity alignment

C  AC004099.1	577	AGTTCGGATTTTTCTTTTTTTTCTTGAGACAGGGTCTTCTTGAGACAGAG	528
			 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2594	GGTTCGGATTTTTCTTTTTTTTCTTGAGACAGGGTCTTCTTGAGACAGAG	2643

skip 150 bps 100% identity alignment

C  AC004099.1	377	TAAATTTTTACTTTTTGTAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGCCCACACTG	328
			|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC068447.16	2794	TAAATTTTTAATTTTTGTAGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGCCCACACTG	2843

skip 327 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AC004099.1 - 136222 bps
Hit
AC068447.16 - 103056 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 3154 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link