<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2003 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  AC068799.14	170249	GAATTCTGGCAAATGAAAGAAACACATCAGATCGCTCTCCTGCCTTCTAG	170200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38009	GAATTCTGGCAAATGAAAGAAACACATCAGATCGCTCTCCTGCCTTCTAG	38058

C  AC068799.14	170199	CCTGGAGTTGTGAAGCAGCTTGTGTTGGGGATTGAAAGGTGTTTACTTAA	170150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38059	CCTGGAGTTGTGAAGCAGCTTGTGTTGGGGATTGAAAGGTGTTTACTTAA	38108

C  AC068799.14	170149	AAAAAAATCTTTCTGGAGAAGAAGGATGAATCCTGGTTTTATAATCATTT	170100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38109	AAAAAAATCTTTCTGGAGAAGAAGGATGAATCCTGGTTTTATAATCATTT	38158

C  AC068799.14	170099	CTTTGGACTCCTTGACAAAATGAGACAATGTTTCCATCTGTCTGCTACTA	170050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38159	CTTTGGACTCCTTGACAAAATGAGACAATGTTTCCATCTGTCTGCTACTA	38208

C  AC068799.14	170049	GAAAGGCAGGCACATGCAGAAAGGAGGTGCCTGGCACCTTGTAAGCGCTT	170000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38209	GAAAGGCAGGCACATGCAGAAAGGAGGTGCCTGGCACCTTGTAAGCGCTT	38258

C  AC068799.14	169999	CTAAGTATTTATTCCCTGATGGAAAAGCATTCCTGCATAAAGCTTGACTT	169950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38259	CTAAGTATTTATTCCCTGATGGAAAAGCATTCCTGCATAAAGCTTGACTT	38308

C  AC068799.14	169949	GGAGTGGGAAGCACTGATCAATTTGTCTTTAATGGGGATTGGACACAACA	169900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38309	GGAGTGGGAAGCACTGATCAATTTGTCTTTAATGGGGATTGGACACAACA	38358

C  AC068799.14	169899	GTTTCCTTCCCTGGGGAATTGGGGAGGCGTCTCCAAAGCTATAAAGGATT	169850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38359	GTTTCCTTCCCTGGGGAATTGGGGAGGCGTCTCCAAAGCTATAAAGGATT	38408

C  AC068799.14	169849	GGAAAGAAAGCCTTTGGGAGGAAAGCTACTAGGAGCTGGAAATGGGTTTG	169800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38409	GGAAAGAAAGCCTTTGGGAGGAAAGCTACTAGGAGCTGGAAATGGGTTTG	38458

C  AC068799.14	169799	CAGGAAAGGAGTTTAGAATGGGCTTCCCTTCAGGATTAGAAGGGGTGAGT	169750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38459	CAGGAAAGGAGTTTAGAATGGGCTTCCCTTCAGGATTAGAAGGGGTGAGT	38508

C  AC068799.14	169749	GTGGGATGCTAAGTGTTTGTTCTTTATATCTGTGGAAGAGTGAGCAGGGG	169700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38509	GTGGGATGCTAAGTGTTTGTTCTTTATATCTGTGGAAGAGTGAGCAGGGG	38558

C  AC068799.14	169699	AAATTGGGATTAAAGGAAGGCAGGGGAGATTATAGCTGGCATGAAGTCAA	169650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38559	AAATTGGGATTAAAGGAAGGCAGGGGAGATTATAGCTGGCATGAAGTCAA	38608

C  AC068799.14	169649	GCTCCATGTGGCAGGAACAGGACACCGGTGGGGGCTGCCAGGGATGGCAG	169600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38609	GCTCCATGTGGCAGGAACAGGACACCGGTGGGGGCTGCCAGGGATGGCAG	38658

C  AC068799.14	169599	AGCAAGGTGAGTCATAGATTGCCTTTTCACTTTAACAGTCTCCTGGCCTG	169550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38659	AGCAAGGTGAGTCATAGATTGCCTTTTCACTTTAACAGTCTCCTGGCCTG	38708

C  AC068799.14	169549	GGCCCTTTGGGGTCTTGGTGCCCCCACTGTAAAGCCCTTTCAAAGAGGGC	169500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38709	GGCCCTTTGGGGTCTTGGTGCCCCCACTGTAAAGCCCTTTCAAAGAGGGC	38758

C  AC068799.14	169499	CAGTGCACTTCCTCTTTAGCAGACACCCAAACTGAACAACAAGATATGCC	169450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38759	CAGTGCACTTCCTCTTTAGCAGACACCCAAACTGAACAACAAGATATGCC	38808

C  AC068799.14	169449	CACGTACAGTATATAAAAGAAATGTGGTTTTTCTGTATAGCAAGACACAA	169400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38809	CACGTACAGTATATAAAAGAAATGTGGTTTTTCTGTATAGCAAGACACAA	38858

C  AC068799.14	169399	CAAACAGGGTAGAACCAGCAGAACATTCCCTTTCCATCCTTGGGGACCCT	169350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38859	CAAACAGGGTAGAACCAGCAGAACATTCCCTTTCCATCCTTGGGGACCCT	38908

C  AC068799.14	169349	GCAGTCTGGGAGGCCACTAGGATTTCTTGTCTCTTTCTGGGAACTGCCTG	169300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38909	GCAGTCTGGGAGGCCACTAGGATTTCTTGTCTCTTTCTGGGAACTGCCTG	38958

C  AC068799.14	169299	ACACTAATTTGTAGTATTTAAAAAAGTATACAAAGGGATCCCTTCCCACC	169250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	38959	ACACTAATTTGTAGTATTTAAAAAAGTATACAAAGGGATCCCTTCCCACC	39008

C  AC068799.14	169249	ATTTACTCTGAGAGAGTAAATTCAACAGGTTGCCTCTTAGGGAGGAATTA	169200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39009	ATTTACTCTGAGAGAGTAAATTCAACAGGTTGCCTCTTAGGGAGGAATTA	39058

C  AC068799.14	169199	CACCGGCTCCAATTCCTACCGAAGACTTGGCTGCCCATTTTTGATCTGAG	169150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39059	CACCGGCTCCAATTCCTACCGAAGACTTGGCTGCCCATTTTTGATCTGAG	39108

C  AC068799.14	169149	TTGAGGGTAACTTATTTGTCAAAATTAATTTAACAGGTTTAAAACTTTGG	169100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39109	TTGAGGGTAACTTATTTGTCAAAATTAATTTAACAGGTTTAAAACTTTGG	39158

C  AC068799.14	169099	AGATCAACTGCAGAGGGCAACAAGCCTGAGGGACAAGTTCTTCCCACCCC	169050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39159	AGATCAACTGCAGAGGGCAACAAGCCTGAGGGACAAGTTCTTCCCACCCC	39208

C  AC068799.14	169049	AAGTTGTGGCTCCTATCGAAGAAGCCACGTGGGACCTCATTATGGCAACT	169000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39209	AAGTTGTGGCTCCTATCGAAGAAGCCACGTGGGACCTCATTATGGCAACT	39258

C  AC068799.14	168999	CTTTCCAACCTCATCCACTTTAACCAGCTTCCATTATTTCATCCCCAAGG	168950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39259	CTTTCCAACCTCATCCACTTTAACCAGCTTCCATTATTTCATCCCCAAGG	39308

C  AC068799.14	168949	GTGAAGCAGCAAGCCCGCTTTGGGGGAATAAAAAAATAATAATCATATTG	168900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39309	GTGAAGCAGCAAGCCCGCTTTGGGGGAATAAAAAAATAATAATCATATTG	39358

C  AC068799.14	168899	TTACTTGATATTGTTTCCAGGCACCAAAGCTTTAACATTTAATCCATTCA	168850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39359	TTACTTGATATTGTTTCCAGGCACCAAAGCTTTAACATTTAATCCATTCA	39408

C  AC068799.14	168849	TATTCTTTAGGTTCGTATGACATTATGACTAGGAAAAACTGAGGACAAGT	168800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39409	TATTCTTTAGGTTCGTATGACATTATGACTAGGAAAAACTGAGGACAAGT	39458

C  AC068799.14	168799	GACCCATCCAAAGTCATCCAGTGGCAAAGTGGGAAGATCCTTATTGCCAC	168750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39459	GACCCATCCAAAGTCATCCAGTGGCAAAGTGGGAAGATCCTTATTGCCAC	39508

C  AC068799.14	168749	CAGGCTTCTTTGAACAACATAACTTCCAGGCCCCTTGGATGCTATTGCTG	168700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39509	CAGGCTTCTTTGAACAACATAACTTCCAGGCCCCTTGGATGCTATTGCTG	39558

C  AC068799.14	168699	GAGGAGGGGGTCAGTCAATGGATGTGGCAAAGTCAAGTGATTCTAGCTGG	168650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39559	GAGGAGGGGGTCAGTCAATGGATGTGGCAAAGTCAAGTGATTCTAGCTGG	39608

C  AC068799.14	168649	TATGGGTGGGTTTGGGGAGGGGATTTGCACAATCCATTGGATGGGTTCAT	168600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39609	TATGGGTGGGTTTGGGGAGGGGATTTGCACAATCCATTGGATGGGTTCAT	39658

C  AC068799.14	168599	GTCACATGAGGGCTCTGCTCACTGGTATCAAAATCTAAATGCAGCAAATT	168550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39659	GTCACATGAGGGCTCTGCTCACTGGTATCAAAATCTAAATGCAGCAAATT	39708

C  AC068799.14	168549	CTGGGAATGCCTCTTTCATTGGGAGACAGCCCCTTTAATCAATTTCCCAC	168500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39709	CTGGGAATGCCTCTTTCATTGGGAGACAGCCCCTTTAATCAATTTCCCAC	39758

C  AC068799.14	168499	TCCTCTCCCCATGCCCTGAACCCTTTCTAACTAGAACAATTATGGGGCTT	168450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39759	TCCTCTCCCCATGCCCTGAACCCTTTCTAACTAGAACAATTATGGGGCTT	39808

C  AC068799.14	168449	CCAAATGTTTCAGGTACATGGGCGTGGACCCTAATTATGGACACACGAGG	168400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39809	CCAAATGTTTCAGGTACATGGGCGTGGACCCTAATTATGGACACACGAGG	39858

C  AC068799.14	168399	GATTAATATGGGCCAGGGACACGTTTCTTGGCATTGAGGGTCTTCAATGA	168350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39859	GATTAATATGGGCCAGGGACACGTTTCTTGGCATTGAGGGTCTTCAATGA	39908

C  AC068799.14	168349	AAGCAGTGGCAATCTAAGATCGACACACTTGTGCAGGGAAGAGGACGGAC	168300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39909	AAGCAGTGGCAATCTAAGATCGACACACTTGTGCAGGGAAGAGGACGGAC	39958

C  AC068799.14	168299	AGAGACCTGGCCCATCACACACACACACACACACACACACACACACACAG	168250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC026364.36	39959	AGAGACCTGGCCCATCACACACACACACACACACACACACACACACACAG	40008

C  AC068799.14	168249	GCA	168247
			|||
  AC026364.36	40009	GCA	40011

Overview

Query
AC068799.14 - 170249 bps
Hit
AC026364.36 - 40011 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2003 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
110002003168247170249-138009400111
Short-link