<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 5168 bps / non-identical: 468 bps

Full alignment

C  AC226496.2	5168	GAATTCCTTCCTGTGTGGAATCCAAGAACCTTCACTTCATGTCTGTATCA	5119
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1	GAATTCCTTCCTGTGTGGAATCCAAGAACCTTCACTTCATGTCTGTATCA	50

C  AC226496.2	5118	AGACCCCTTTTTCCAGTAACACTTCCAAGGAGACATTTCTGGCTTTCACC	5069
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	51	AGACCCCTTTTTCCAGTAACACTTCCAAGGAGACATTTCTGGCTTTCACC	100

C  AC226496.2	5068	GTTTGCCTTAATTTGATGGTTATTAGTCCTCACTCTTCTATTATTTTCTC	5019
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	101	GTTTGCCTTAATTTGATGGTTATTAGTCCTCACTCTTCTATTATTTTCTC	150

C  AC226496.2	5018	CCAAGCCTTAACTCTGTGGAAAAAAACATTTGCCTGTATTGTGATCATAA	4969
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	151	CCAAGCCTTAACTCTGTGGAAAAAAACATTTGCCTGTATTGTGATCATAA	200

C  AC226496.2	4968	TTTCTACTGTTCCCATATTGATAAATATGTGATATATCCTAATAACTAAT	4919
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	201	TTTCTACTGTTCCCATATTGATAAATATGTGATATATCCTAATAACTAAT	250

C  AC226496.2	4918	GTTTTCCCCTCAAAAGATTTCCATCATAATTTACCATTACTGAATGTATG	4869
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	251	GTTTTCCCCTCAAAAGATTTCCATCATAATTTACCATTACTGAATGTATG	300

C  AC226496.2	4868	AAAAATTTAAATTGTCACATTCCAGGGGCTATTTGTGTTCTCTGTACCAA	4819
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	301	AAAAATTTAAATTGTCACATTCCAGGGGCTATTTGTGTTCTCTGTACCAA	350

C  AC226496.2	4818	TAGTGATAGGGTTCTCATTACACTTGGTAGTGAATAATCCAACTCTACAA	4769
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	351	TAGTGATAGGGTTCTCATTACACTTGGTAGTGAATAATCCAACTCTACAA	400

C  AC226496.2	4768	TCTCATTTTCTTGTCTGTTCTTTTTTTCTGACCTCTCTTGGTACATATTA	4719
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	401	TCTCATTTTCTTGTCTGTTCTTTTTTTCTGACCTCTCTTGGTACATATTA	450

C  AC226496.2	4718	TCAAATGCTCAGTGCCTTGAAGAAGTAGATTCTAAGCTGAATATTTTTTG	4669
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	451	TCAAATGCTCAGTGCCTTGAAGAAGTAGATTCTAAGCTGAATATTTTTTG	500

C  AC226496.2	4668	AGGGAGATAATTAGGGAGTTTTCCTGGAAATAACATCTGTGAAAAAGTAG	4619
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	501	AGGGAGATAATTAGGGAGTTTTCCTGGAAATAACATCTGTGAAAAAGTAG	550

C  AC226496.2	4618	GAAGCAGGATTGGACAGTGGAACAAATTAGGACATAATTCAGTGCAATGG	4569
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	551	GAAGCAGGATTGGACAGTGGAACAAATTAGGACATAATTCAGTGCAATGG	600

C  AC226496.2	4568	TCTGAATGTCTGAATGCCCCCAAAATTCATAAGTTATAATTCTAATAACC	4519
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	601	TCTGAATGTCTGAATGCCCCCAAAATTCATAAGTTATAATTCTAATAACC	650

C  AC226496.2	4518	AAAATTACTGTATTAGCTGATAGAACCATTTAGGAGGTGTTTAGGTCATG	4469
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	651	AAAATTACTGTATTAGCTGATAGAACCATTTAGGAGGTGTTTAGGTCATG	700

C  AC226496.2	4468	AAGGCAGAGTCCTCATTAATGGAATTAATTCTTTTGAAAAATATGCTCAC	4419
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	701	AAGGCAGAGTCCTCATTAATGGAATTAATTCTTTTGAAAAATATGCTCAC	750

C  AC226496.2	4418	AATAACTCATTCATCTCTTTCCCCCATTAAGACATGGTGACGAGTTGCCA	4369
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	751	AATAACTCATTCATCTCTTTCCCCCATTAAGACATGGTGACGAGTTGCCA	800

C  AC226496.2	4368	TCTTGGAGGAATGCCCAATACCAGCATCTTGATGGTGAATCTTTCAGCCT	4319
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	801	TCTTGGAGGAATGCCCAATACCAGCATCTTGATGGTGAATCTTTCAGCCT	850

C  AC226496.2	4318	CAAGAACTGTGACAAATAAATGTTTGTTGTCTGTAAGCTAGCCAATGTAT	4269
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	851	CAAGAACTGTGACAAATAAATGTTTGTTGTCTGTAAGCTAGCCAATGTAT	900

C  AC226496.2	4268	GGTATTTTTCTATATAGCACCCTGAGCATGCTAAGACATGCAGTCTCAGC	4219
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	901	GGTATTTTTCTATATAGCACCCTGAGCATGCTAAGACATGCAGTCTCAGC	950

C  AC226496.2	4218	ATAGGTTTTGTCTCACCCACTGGGAGCTCTGAAGCTGTTAGGCCTTCAGA	4169
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	951	ATAGGTTTTGTCTCACCCACTGGGAGCTCTGAAGCTGTTAGGCCTTCAGA	1000

C  AC226496.2	4168	GTTGGTCCAAACTGAAAAGGGGAGAATGGGCCTTTAGAGTCCTACATGTG	4119
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1001	GTTGGTCCAAACTGAAAAGGGGAGAATGGGCCTTTAGAGTCCTACATGTG	1050

C  AC226496.2	4118	ACCAGGCATTGGATATGGGCTGTCTTGGAAAGGTCACTATATGCTAGATA	4069
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1051	ACCAGGCATTGGATATGGGCTGTCTTGGAAAGGTCACTATATGCTAGATA	1100

C  AC226496.2	4068	GCTTTCAGCAGGGTTGTACTGAGAGAGAGAGCTTATAGGTGAGGTATGTC	4019
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1101	GCTTTCAGCAGGGTTGTACTGAGAGAGAGAGCTTATAGGTGAGGTATGTC	1150

C  AC226496.2	4018	AGTTGTTCATCACTTCATCAGCTGGAAAGTAATTTCTATATACCCAAAAG	3969
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1151	AGTTGTTCATCACTTCATCAGCTGGAAAGTAATTTCTATATACCCAAAAG	1200

C  AC226496.2	3968	GGGAATCTCGGTGACACGTAATGCATGCACTCAAGGACAATAAAAACATT	3919
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1201	GGGAATCTCGGTGACACGTAATGCATGCACTCAAGGACAATAAAAACATT	1250

C  AC226496.2	3918	GAACAATATTGACACTCTGCAGGCAATATTTTCTCAGAAACTGGGTTTGA	3869
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1251	GAACAATATTGACACTCTGCAGGCAATATTTTCTCAGAAACTGGGTTTGA	1300

C  AC226496.2	3868	ATATCCTTTTAAGAAAGATTTACCTCATTGCAGGTTAACAGACCATTAAT	3819
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1301	ATATCCTTTTAAGAAAGATTTACCTCATTGCAGGTTAACAGACCATTAAT	1350

C  AC226496.2	3818	AGAATAAAAACATGTTTGTCTATTTTGTCACATGCATCTTTTCCTTCTTA	3769
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1351	AGAATAAAAACATGTTTGTCTATTTTGTCACATGCATCTTTTCCTTCTTA	1400

C  AC226496.2	3768	ATTCTACTTTGATGGAAATTTCTGGTGAGATTTTTTTCAAAATACAACTT	3719
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1401	ATTCTACTTTGATGGAAATTTCTGGTGAGATTTTTTTCAAAATACAACTT	1450

C  AC226496.2	3718	GCCTGAATTACAAGGCAATCTGCAAAACAAGTTCAGGAGTAGGCACTTAG	3669
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1451	GCCTGAATTACAAGGCAATCTGCAAAACAAGTTCAGGAGTAGGCACTTAG	1500

C  AC226496.2	3668	AAGATAAATACTTTCTAAAAGTGAGAAATATAAGGAATGTTGCAAATATT	3619
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1501	AAGATAAATACTTTCTAAAAGTGAGAAATATAAGGAATGTTGCAAATATT	1550

C  AC226496.2	3618	CAGGAAGGGATAAGATTTTGATTTAGGGAAAATATTTTCAAATAAAGCAA	3569
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1551	CAGGAAGGGATAAGATTTTGATTTAGGGAAAATATTTTCAAATAAAGCAA	1600

C  AC226496.2	3568	AGTAACTGAAATTGTACTTTGTCAGATGCATAACTGGGAAAAATATTCTC	3519
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1601	AGTAACTGAAATTGTACTTTGTCAGATGCATAACTGGGAAAAATATTCTC	1650

C  AC226496.2	3518	TCCTTCTATATGTTGTCTGTTCACTCTGATGATAGTTTATTTTGCTGTGC	3469
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1651	TCCTTCTATATGTTGTCTGTTCACTCTGATGATAGTTTATTTTGCTGTGC	1700

C  AC226496.2	3468	AGGAGACCTTTAATTAGATCCCATTTGCCCATTTTTCTTTTGTTGTAATT	3419
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1701	AGGAGACCTTTAATTAGATCCCATTTGCCCATTTTTCTTTTGTTGTAATT	1750

C  AC226496.2	3418	GCTTTTGGTGTTTTCATCATAAAATCTTTGCTTGTTCCTAAGCCTTGAAT	3369
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1751	GCTTTTGGTGTTTTCATCATAAAATCTTTGCTTGTTCCTAAGCCTTGAAT	1800

C  AC226496.2	3368	GGTATTACCTAGATTTTCTTTTAGGGTTTTTAAAGTTTTTGTTGTTACAT	3319
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1801	GGTATTACCTAGATTTTCTTTTAGGGTTTTTAAAGTTTTTGTTGTTACAT	1850

C  AC226496.2	3318	TACATTTAATTCTTTAATCCACCTTGAGTTAGTTTTCATATAAAGTATTA	3269
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1851	TACATTTAATTCTTTAATCCACCTTGAGTTAGTTTTCATATAAAGTATTA	1900

C  AC226496.2	3268	GGAAGTGGTCCAGTTTTAATTTTCTGCATACAACTAGCCAGTTCTCCCAG	3219
			|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1901	GGAAGTGGTCTAGTTTTAATTTTCTGCATACAACTAGCCAGTTCTCCCAG	1950

C  AC226496.2	3218	TGCTATGTATTAAATAGTAAACCCTTTTCTGATTGTTTTTACAAGGTTTG	3169
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1951	TGCTATGTATTAAATAGTAAACCCTTTTCTGATTGTTTTTACAAGGTTTG	2000

C  AC226496.2	3168	TCAAAGATCAGATGGTTGTAGATGTGTGGTGTAATTTCTGAGGTCTCTGT	3119
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2001	TCAAAGATCAGATGGTTGTAGATGTGTGGTGTAATTTCTGAGGTCTCTGT	2050

C  AC226496.2	3118	TCTACTCCATTGGACTACCTGTCTGTTTTTGTACAAGTATTATGCTGTTT	3069
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2051	TCTACTCCATTGGACTACCTGTCTGTTTTTGTACAAGTATTATGCTGTTT	2100

C  AC226496.2	3068	TGGTTACTATAGCTTTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAGCATGATACCT	3019
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2101	TGGTTACTATAGCTTTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAGCATGATACCT	2150

C  AC226496.2	3018	CCAGCTTTATTCTATTTGCTTAGGATTGTCTTGGCTCTACTGACTTTTTA	2969
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2151	CCAGCTTTATTCTATTTGCTTAGGATTGTCTTGGCTCTACTGACTTTTTA	2200

C  AC226496.2	2968	GTTCCTTATACATTTTAAAATAGTTTTTTTTTTTCTAATTCTGTAAAGAA	2919
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2201	GTTCCTTATACATTTTAAAATAGTTTTTTTTTTTCTAATTCTGTAAAGAA	2250

C  AC226496.2	2918	TGTCAATGGTAGTTCAATGAGAACAGCATTGAATCTATAAATTACTTTGG	2869
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2251	TGTCAATGGTAGTTCAATGAGAACAGCATTGAATCTATAAATTACTTTGG	2300

C  AC226496.2	2868	GCAGTGTGGCCATTTTTATGATATTGATTCTTCCTACCCATGATCAAGGA	2819
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2301	GCAGTGTGGCCATTTTTATGATATTGATTCTTCCTACCCATGATCAAGGA	2350

C  AC226496.2	2818	ATGTTTTTCCATTTGTTGGTGTCCTCTCTGATTTCCTTGAGCAGTGGTTT	2769
			|||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2351	ATGTTTTTCCATTTGTTGGTGTTCTCTGTGATTTCCTTGAGCAGTGGTTT	2400

C  AC226496.2	2768	GTAGTTCTTGAAGAAGTCCTTCACTTCCCTTGCTAGTAGAATTCTTAGAT	2719
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2401	GTAGTTCTTGAAGAAGTCCTTCACTTCCCTTGCTAGTAGAATTCTTAGAT	2450

C  AC226496.2	2718	ATTTTATTTTCATGGTAGCTATTGTGAATGGAAGTTTATTTACTATTTGG	2669
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2451	ATTTTATTTTCATGGTAGCTATTGTGAATGGAAGTTTATTTACTATTTGG	2500

C  AC226496.2	2668	CTCTTTGCTTGCCTGTTGTTGGTGTACAGGAAAGCTACCAATTTTTGAAC	2619
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2501	CTCTTTGCTTGCCTGTTGTTGGTGTACAGGAAAGCTACCAATTTTTGAAC	2550

C  AC226496.2	2618	ATTGATTTTGTATTCTGAGAATAATGAAGTTGCTTCTCAGTTTAAGAAGC	2569
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2551	ATTGATTTTGTATTCTGAGAATAATGAAGTTGCTTCTCAGTTTAAGAAGC	2600

C  AC226496.2	2568	TTTTGGACTGAAACAATGGGATTTCTAGATAAAGAATCATGTTATCTGCA	2519
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2601	TTTTGGACTGAAACAATGGGATTTCTAGATAAAGAATCATGTTATCTGCA	2650

C  AC226496.2	2518	AACAAAGATAATTTTACTTCCACTCTTCTGATTGAATAACTTTTATTTAT	2469
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2651	AACAAAGATAATTTTACTTCCACTCTTCTGATTGAATAACTTTTATTTAT	2700

C  AC226496.2	2468	TTCTCACAACTGATTGACCTGACCAAAACTTTCAATAAAATGTTGAATAG	2419
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2701	TTCTCACAACTGATTGACCTGACCAAAACTTTCAATAAAATGTTGAATAG	2750

C  AC226496.2	2418	GAGTGGTGAGAGATGGCACTGTGGTCTTGGGCTGTTTTTCAAGGGAAATG	2369
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2751	GAGTGGTGAGAGATGGCACTGTGGTCTTGGGCTGTTTTTCAAGGGAAATG	2800

C  AC226496.2	2368	CTTCCAGCTTTTGCCCATTCAGTATGATATTGGTTGTGTACTTATCATAA	2319
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
  AC019173.4	2801	CTTCCAGCTTTTGCCCATTCAGTATGATATTGGTTGTGTATTTATCATAA	2850

C  AC226496.2	2318	ATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTTAATGCCTAGTTAATTTAG	2269
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2851	ATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTTAATGCCTAGTTAATTTAG	2900

C  AC226496.2	2268	AGTTTTTAATGTGAAGAAATGCTGAATTTTATGAAAGGCCTTTTCTGCAT	2219
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2901	AGTTTTTAATGTGAAGAAATGCTGAATTTTATGAAAGGCCTTTTCTGCAT	2950

C  AC226496.2	2218	CTATTGAGATAATCATGTGTTTTTTGTCTTTAGATCTGTTTATGTGATGA	2169
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2951	CTATTGAGATAATCATGTGTTTTTTGTCTTTAGATCTGTTTATGTGATGA	3000

C  AC226496.2	2168	ATAACATTTATTGATTTTTGTACATTGAACCAAACTTGTATTCTGAGGAT	2119
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3001	ATAACATTTATTGATTTTTGTACATTGAACCAAACTTGTATTCTGAGGAT	3050

C  AC226496.2	2118	GAAGTCATCTTGATTGTGATAGATAAACTTATTGATGTGTTGCTGGATTT	2069
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3051	GAAGTCATCTTGATTGTGATAGATAAACTTATTGATGTGTTGCTGGATTT	3100

C  AC226496.2	2068	GGTTTGTCAGTATTTTAGAGGATTTTTGCTTTGATATTCATCAGGGATAT	2019
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3101	GGTTTGTCAGTATTTTAGAGGATTTTTGCTTTGATATTCATCAGGGATAT	3150

C  AC226496.2	2018	TGGCCTGAAGTTTTGTCGTTGTTGTTGTTGTTGATGTTGGAGTCCCTCCT	1969
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3151	TGGCCTGAAGTTTTGTCGTTGTTGTTGTTGTTGATGTTGGAGTCCCTCCT	3200

C  AC226496.2	1968	TTACAATCATTTGGAATAGTTTCAGAAGAAATAGTATCTCTGTTAGAATT	1919
			|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3201	TTACGATCATTTGGAATAGTTTCAGAAGAAATAGTATCTCTGTTAGAATT	3250

C  AC226496.2	1918	CAGCTGTAAATCTATCTGATCCTGGGATTTTTGTTGTTGTTGGTGGTGGT	1869
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3251	CAGCTGTAAATCTATCTGATCCTGGGATTTTTGTTGTTGTTGGTGGTGGT	3300

C  AC226496.2	1868	AGGCTATTTATTACTGCCTCAATTTTTGAACTTATTATTGGTTTATTCAG	1819
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3301	AGGCTATTTATTACTGCCTCAATTTTTGAACTTATTATTGGTTTATTCAG	3350

C  AC226496.2	1818	GGATTTAATGTTTTCCTGGTTCAGACTTGGGAGGGTGTGTGCATCCAGGA	1769
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3351	GGATTTAATGTTTTCCTGGTTCAGACTTGGGAGGGTGTGTGCATCCAGGA	3400

C  AC226496.2	1768	ATGTATCCATTTCTTCTAGATTTTCTAGTTTATGTGCTAAAGATTTTTAA	1719
			|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3401	ATGTATCCATTTCTTCTAGATTTTCTAGCTTATGTGCTAAAGATTTTTAA	3450

C  AC226496.2	1718	AGTATTCTCTGATGGTTGTTTGTATATTTGTGGGGTCAGTGGTGATATCC	1669
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3451	AGTATTCTCTGATGGTTGTTTGTATATTTGTGGGGTCAGTGGTGATATCC	3500

C  AC226496.2	1668	CCCTTATCATTTCTGACTGTGTCTATTTAATTCTTTTAAGTTTTCTTCTT	1619
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3501	CCCTTATCATTTCTGACTGTGTCTATTTAATTCTTTTAAGTTTTCTTCTT	3550

C  AC226496.2	1618	TATTAGTGCAGATGCGGTCTATTTTGTTAACTTTTATTCAAAAAAAAAAA	1569
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||
  AC019173.4	3551	TATTAGTGCAGATGCGGTCTATTTTGTTAACTTTTATTC---AAAAAAAA	3597

C  AC226496.2	1568	AAAATACAGCTCCTGAATCCCTTGAGTTTTTTGAAGGATTTTGTGTGTCT	1519
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3598	AAAATACAGCTCCTGAATCCCTTGAGTTTTTTGAAGGATTTTGTGTGTCT	3647

C  AC226496.2	1518	CTATCTCATTCAGTTCTGCTCTGATCTTGGTTATTTCTTGTCTTCTGCTA	1469
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3648	CTATCTCATTCAGTTCTGCTCTGATCTTGGTTATTTCTTGTCTTCTGCTA	3697

C  AC226496.2	1468	GCTTTGGGAAGTTTTCCTCTTGGTCCTCTAGTTCTTTTACTTGTGATATT	1419
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
  AC019173.4	3698	GCTTTGGGAAGTTTTCCTCTTGGTCCTCTAGTTCTTTTACTTGTGATGTT	3747

C  AC226496.2	1418	AGGTCATTGACTTGAGATATTTGTAGCTTTTTGATATGGGGCATTTAGTG	1369
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3748	AGGTCATTGACTTGAGATATTTGTAGCTTTTTGATATGGGGCATTTAGTG	3797

C  AC226496.2	1368	CTCTAACTTTTCCTCTTACCACTGCTTAAGCTGCATCTGAGAGATTCTGG	1319
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3798	CTCTAACTTTTCCTCTTACCACTGCTTAAGCTGCATCTGAGAGATTCTGG	3847

C  AC226496.2	1318	TATGTTGTCTCGTTGTTCTCATTAGTTTCAGAGAACTTCCTAATTTCTGC	1269
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3848	TATGTTGTCTCGTTGTTCTCATTAGTTTCAGAGAACTTCCTAATTTCTGC	3897

C  AC226496.2	1268	CCTAATTTTATTATTTACCCAGGAGTCATTCAGGAGCATGTTGTACAAGT	1219
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3898	CCTAATTTTATTATTTACCCAGGAGTCATTCAGGAGCATGTTGTACAAGT	3947

C  AC226496.2	1218	TCCACATAGTCTTGTGATTTTGATTGAGTTTCTTAATGTTGAGTTATAAT	1169
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3948	TCCACATAGTCTTGTGATTTTGATTGAGTTTCTTAATGTTGAGTTATAAT	3997

C  AC226496.2	1168	TTATTTGCATTGTGGTCTGGGAGACTGTTTGTTATGATTTCAGTTCTTTT	1119
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3998	TTATTTGCATTGTGGTCTGGGAGACTGTTTGTTATGATTTCAGTTCTTTT	4047

C  AC226496.2	1118	GCATTTGATGAGGAGTGTTTTATTTCCAATAATGTGATCAATTTTAGACT	1069
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4048	GCATTTGATGAGGAGTGTTTTATTTCCAATAATGTGATCAATTTTAGACT	4097

C  AC226496.2	1068	AAGTGCCGTGCAGCCATGAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTCAGTTGG	1019
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4098	AAGTGCCGTGCAGCCATGAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTCAGTTGG	4147

C  AC226496.2	1018	AGAGTTCTCTAGATATCTATTAGGTCTACTTGATCCAGAGCTGAGTTCAG	969
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4148	AGAGTTCTCTAGATATCTATTAGGTCTACTTGATCCAGAGCTGAGTTCAG	4197

C  AC226496.2	968	GTCCTGAAAATCTTTGTTAATTTTCTGTCTCAATGATCTGTCTAATATTG	919
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4198	GTCCTGAAAATCTTTGTTAATTTTCTGTCTCAATGATCTGTCTAATATTG	4247

C  AC226496.2	918	TCAGTGGAGTGTTAAAATCTTCCACTATTATTGTGTGGGAGTCTAAGTCA	869
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4248	TCAGTGGAGTGTTAAAATCTTCCACTATTATTGTGTGGGAGTCTAAGTCA	4297

C  AC226496.2	868	TTTTGGAGGTCTCTAAGAACTGGCTTTATGAATCTGGATGCTTCTTTATT	819
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4298	TTTTGGAGGTCTCTAAGAACTGGCTTTATGAATCTGGATGCTTCTTTATT	4347

C  AC226496.2	818	GGGTACACATATATTTAGAATAATTAGCTTTTTTGTTGAATTGAAAACTC	769
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4348	GGGTACACATATATTTAGAATAATTAGCTTTTTTGTTGAATTGAAAACTC	4397

C  AC226496.2	768	ATCATCATGTAATGTCTTTTTTTTAATATTTGTTGGTTTAAAATCTGTTT	719
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4398	ATCATCATGTAATGTCTTTTTTTTAATATTTGTTGGTTTAAAATCTGTTT	4447

C  AC226496.2	718	TGTCAGGAACAAAAATTGTAACTACTGCTTTTTTTCTGTTTTCCTCTGCT	669
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4448	TGTCAGGAACAAAAATTGTAACTACTGCTTTTTTTCTGTTTTCCTCTGCT	4497

C  AC226496.2	668	TGGTAAATTTTCCTCCATCCCTTTATTTTGAGTCTATGTGTGTCTTTTCA	619
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4498	TGGTAAATTTTCCTCCATCCCTTTATTTTGAGTCTATGTGTGTCTTTTCA	4547

C  AC226496.2	618	TGTGAAATAGGTCTCTTGAAGACAACATACTGATGGAGCTTGACTCTTTA	569
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4548	TGTGAAATAGGTCTCTTGAAGACAACATACTGATGGAGCTTGACTCTTTA	4597

C  AC226496.2	568	TCCAGCTTGCCATTCTGTGTTTTTAATTGAGGCGTTAAGTCCATTTACAT	519
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4598	TCCAGCTTGCCATTCTGTGTTTTTAATTGAGGCGTTAAGTCCATTTACAT	4647

C  AC226496.2	518	TTATGGTTAATATTGTGTCAATTTCATCCTGTCATCATGATGGCTATTTT	469
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4648	TTATGGTTAATATTGTGTCAATTTCATCCTGTCATCATGATGGCTATTTT	4697

C  AC226496.2	468	GCAGACTTGTTTACATGGTTGTTTTATAGTGTTACTAGTCTGTGTACCTT	419
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4698	GCAGACTTGTTTACATGGTTGTTTTATAGTGTTACTAGTCTGTGTACCTT	4747

C  AC226496.2	418	GGTGTGGTTTTTGTAGTCACTGGTAACGGTATTTCCTTTCAATAGTTAGT	369
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4748	GGTGTGGTTTTTGTAGTCACTGGTAACGGTATTTCCTTTCAATAGTTAGT	4797

C  AC226496.2	368	AGTTCCCTCAGGAGTTCTTGAAAGGCAAGCTTGGTGGTGATGAATTTCCT	319
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4798	AGTTCCCTCAGGAGTTCTTGAAAGGCAAGCTTGGTGGTGATGAATTTCCT	4847

C  AC226496.2	318	CAGCATTTGCTTGTCTGAAAGGAATATGATTTCCCTTTCACTTATACAGC	269
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4848	CAGCATTTGCTTGTCTGAAAGGAATATGATTTCCCTTTCACTTATACAGC	4897

C  AC226496.2	268	TTAGTGTGTCTGGTTATGAAATTCTGGGTTACAAATTCTTTTCTTTAAGA	219
			||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
  AC019173.4	4898	TTAGTGTGTCTGGTTATGAAATTCTGGGTTACAAAATCTTTTCTTTAAGA	4947

C  AC226496.2	218	ATGTTGAATATTGGTCCCAAATATCTTGTGGTTTGTAGGGTTTCCAATGA	169
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4948	ATGTTGAATATTGGTCCCAAATATCTTGTGGTTTGTAGGGTTTCCAATGA	4997

C  AC226496.2	168	CAGGTTGTTAGTCTGATGGGCTTTCCATTGTAGGTGACCTGGCCTTTCTC	119
			|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4998	CAGGTTGTTAGTCTGATGGGCTTTCCTTTGTAGGTGACCTGGCCTTTCTC	5047

C  AC226496.2	118	TCTGGCTGCTCTTAACACTTTTCTTTCATTGTGACCTTGGAGAATCTGAT	69
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	5048	TCTGGCTGCTCTTAACACTTTTCTTTCATTGTGACCTTGGAGAATCTGAT	5097

C  AC226496.2	68	GATTATGTGTCTTGAGGTTGATTTTCTCATGGAGCATCCTGCTGGGGTTC	19
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	5098	GATTATGTGTCTTGAGGTTGATTTTCTCATGGAGCATCCTGCTGGGGTTC	5147

C  AC226496.2	18	TCTGGATTTTCTGAATTC	1
			||||||| ||||||||||
  AC019173.4	5148	TCTGGATATTCTGAATTC	5165

Compact alignment

skip 1900 bps 100% identity alignment

C  AC226496.2	3268	GGAAGTGGTCCAGTTTTAATTTTCTGCATACAACTAGCCAGTTCTCCCAG	3219
			|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	1901	GGAAGTGGTCTAGTTTTAATTTTCTGCATACAACTAGCCAGTTCTCCCAG	1950

skip 400 bps 100% identity alignment

C  AC226496.2	2818	ATGTTTTTCCATTTGTTGGTGTCCTCTCTGATTTCCTTGAGCAGTGGTTT	2769
			|||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	2351	ATGTTTTTCCATTTGTTGGTGTTCTCTGTGATTTCCTTGAGCAGTGGTTT	2400

skip 400 bps 100% identity alignment

C  AC226496.2	2368	CTTCCAGCTTTTGCCCATTCAGTATGATATTGGTTGTGTACTTATCATAA	2319
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
  AC019173.4	2801	CTTCCAGCTTTTGCCCATTCAGTATGATATTGGTTGTGTATTTATCATAA	2850

skip 350 bps 100% identity alignment

C  AC226496.2	1968	TTACAATCATTTGGAATAGTTTCAGAAGAAATAGTATCTCTGTTAGAATT	1919
			|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3201	TTACGATCATTTGGAATAGTTTCAGAAGAAATAGTATCTCTGTTAGAATT	3250

skip 150 bps 100% identity alignment

C  AC226496.2	1768	ATGTATCCATTTCTTCTAGATTTTCTAGTTTATGTGCTAAAGATTTTTAA	1719
			|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
  AC019173.4	3401	ATGTATCCATTTCTTCTAGATTTTCTAGCTTATGTGCTAAAGATTTTTAA	3450

skip 100 bps 100% identity alignment

C  AC226496.2	1618	TATTAGTGCAGATGCGGTCTATTTTGTTAACTTTTATTCAAAAAAAAAAA	1569
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||
  AC019173.4	3551	TATTAGTGCAGATGCGGTCTATTTTGTTAACTTTTATTC---AAAAAAAA	3597

skip 100 bps 100% identity alignment

C  AC226496.2	1468	GCTTTGGGAAGTTTTCCTCTTGGTCCTCTAGTTCTTTTACTTGTGATATT	1419
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
  AC019173.4	3698	GCTTTGGGAAGTTTTCCTCTTGGTCCTCTAGTTCTTTTACTTGTGATGTT	3747

skip 1150 bps 100% identity alignment

C  AC226496.2	268	TTAGTGTGTCTGGTTATGAAATTCTGGGTTACAAATTCTTTTCTTTAAGA	219
			||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
  AC019173.4	4898	TTAGTGTGTCTGGTTATGAAATTCTGGGTTACAAAATCTTTTCTTTAAGA	4947

skip 50 bps 100% identity alignment

C  AC226496.2	168	CAGGTTGTTAGTCTGATGGGCTTTCCATTGTAGGTGACCTGGCCTTTCTC	119
			|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
  AC019173.4	4998	CAGGTTGTTAGTCTGATGGGCTTTCCTTTGTAGGTGACCTGGCCTTTCTC	5047

skip 100 bps 100% identity alignment

C  AC226496.2	18	TCTGGATTTTCTGAATTC	1
			||||||| ||||||||||
  AC019173.4	5148	TCTGGATATTCTGAATTC	5165

Overview

Query
AC226496.2 - 177776 bps
Hit
AC019173.4 - 181117 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 5168 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link