<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2004 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AC134349.2	36931	AATTCAGCTTTCACTTCAACATCAATATGGAAAATTTTACCTTACAGCAA	36980
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1	AATTCAGCTTTCACTTCAACATCAATATGGAAAATTTTACCTTACAGCAA	50

AC134349.2	36981	GGATGTTGTGTTTGAATAGGAGTTAATTTGAGCTGTTTTGGAAATTATCA	37030
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	51	GGATGTTGTGTTTGAATAGGAGTTAATTTGAGCTGTTTTGGAAATTATCA	100

AC134349.2	37031	TGTTTTCCATAAAGACAGCATTGATTTCATCCATTAGCATATTGAGATGA	37080
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	101	TGTTTTCCATAAAGACAGCATTGATTTCATCCATTAGCATATTGAGATGA	150

AC134349.2	37081	TTTCCTCTTTGACGTTGGTCACAGAATTTAAAAGGAACAAGAACATTACT	37130
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	151	TTTCCTCTTTGACGTTGGTCACAGAATTTAAAAGGAACAAGAACATTACT	200

AC134349.2	37131	GCACATTCAGGAATCAGTTACACATAGAAGTTAAGGTCAGGACCTTAAAG	37180
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	201	GCACATTCAGGAATCAGTTACACATAGAAGTTAAGGTCAGGACCTTAAAG	250

AC134349.2	37181	GGAATCTTGACCAGTGATATTAGGCCTACTTTTTAAAACATTCAGACATG	37230
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	251	GGAATCTTGACCAGTGATATTAGGCCTACTTTTTAAAACATTCAGACATG	300

AC134349.2	37231	ATAAATTTACTACCATTCATTTTTTCAATAACAGCAATGATATATTTATT	37280
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	301	ATAAATTTACTACCATTCATTTTTTCAATAACAGCAATGATATATTTATT	350

AC134349.2	37281	TTTCCCATGGACACCTACATTAAGCTTGTTGTCTATTTTTATATTTCAAC	37330
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	351	TTTCCCATGGACACCTACATTAAGCTTGTTGTCTATTTTTATATTTCAAC	400

AC134349.2	37331	ATTTTTGTCTTTGAGTCCTTTTAGGAGTTGTTAAACAATCCTGAAATTTC	37380
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	401	ATTTTTGTCTTTGAGTCCTTTTAGGAGTTGTTAAACAATCCTGAAATTTC	450

AC134349.2	37381	CCTTACAGTGCTGTTAACAATTATATTTTTTCAAAGTCCTTTGGCATAAT	37430
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	451	CCTTACAGTGCTGTTAACAATTATATTTTTTCAAAGTCCTTTGGCATAAT	500

AC134349.2	37431	GATTGATTAAAGGAAATATCTCCAGTATAATTACACTTGCTTATAAGAAA	37480
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	501	GATTGATTAAAGGAAATATCTCCAGTATAATTACACTTGCTTATAAGAAA	550

AC134349.2	37481	AGAGTATTTGAAACTTGAAGAAAAAAAGGTTAGACAAATTTATAATGAAA	37530
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	551	AGAGTATTTGAAACTTGAAGAAAAAAAGGTTAGACAAATTTATAATGAAA	600

AC134349.2	37531	TATAAATAAATATGTATAATATATAAGGCATTATTAATAAATGTATATGA	37580
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	601	TATAAATAAATATGTATAATATATAAGGCATTATTAATAAATGTATATGA	650

AC134349.2	37581	AATAACTATCATAGAATGAAATTTATTGAAGTAAAAATACATTCTAAATT	37630
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	651	AATAACTATCATAGAATGAAATTTATTGAAGTAAAAATACATTCTAAATT	700

AC134349.2	37631	AGAATAGGAAAGAACTTGGAAACTATTGTTTAATAATATGTTATATAAAT	37680
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	701	AGAATAGGAAAGAACTTGGAAACTATTGTTTAATAATATGTTATATAAAT	750

AC134349.2	37681	ACAAAACTGTAAATATTACTCTTACGTTACTTATTTTGGAAAGGATATGA	37730
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	751	ACAAAACTGTAAATATTACTCTTACGTTACTTATTTTGGAAAGGATATGA	800

AC134349.2	37731	AACAATGGGAATTTTCATATTCTACTCCTAGGATGATAAATCTGTACCAT	37780
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	801	AACAATGGGAATTTTCATATTCTACTCCTAGGATGATAAATCTGTACCAT	850

AC134349.2	37781	CATTTTGGCTGAGTATGGCATTATCTGATTAAGATGAAGGATCACATCCT	37830
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	851	CATTTTGGCTGAGTATGGCATTATCTGATTAAGATGAAGGATCACATCCT	900

AC134349.2	37831	AAACCCAGTATTTACACTCTTATCCGAATACATATACATGCACATGCGTA	37880
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	901	AAACCCAGTATTTACACTCTTATCCGAATACATATACATGCACATGCGTA	950

AC134349.2	37881	TCACTGAGTTTCAGTAGCTAAAGTTGAGAAGTACTTGGAATGTCTGTCAG	37930
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	951	TCACTGAGTTTCAGTAGCTAAAGTTGAGAAGTACTTGGAATGTCTGTCAG	1000

AC134349.2	37931	TCCTCCAAATGGATAAACAAATTATGGCATACTTATACAATGGAATACTA	37980
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1001	TCCTCCAAATGGATAAACAAATTATGGCATACTTATACAATGGAATACTA	1050

AC134349.2	37981	TACAGTGATCAAAATTAACAAAGAAGACTGACATGTTTACAACAGTATAA	38030
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1051	TACAGTGATCAAAATTAACAAAGAAGACTGACATGTTTACAACAGTATAA	1100

AC134349.2	38031	TACAACAAAGGAAATGAACAAATTTGAGCTACATAGATAATAATACTCAC	38080
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1101	TACAACAAAGGAAATGAACAAATTTGAGCTACATAGATAATAATACTCAC	1150

AC134349.2	38081	AGATGTGAAAGGAATTATCAAGATGGAAAAATACATTTGGAATGATCTTT	38130
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1151	AGATGTGAAAGGAATTATCAAGATGGAAAAATACATTTGGAATGATCTTT	1200

AC134349.2	38131	TACATAAAGTTTGGAAAAAAAATTTTTAATACATTGTAATTTGTTACATT	38180
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1201	TACATAAAGTTTGGAAAAAAAATTTTTAATACATTGTAATTTGTTACATT	1250

AC134349.2	38181	GGTGATGAAACTCTACAGTGAAATATATGAATGATCATCATAACAATTGG	38230
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1251	GGTGATGAAACTCTACAGTGAAATATATGAATGATCATCATAACAATTGG	1300

AC134349.2	38231	GATAATCAGGAGGGAGGAAATAAAAGGGAAATATCAACAAGAAGACGTAT	38280
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1301	GATAATCAGGAGGGAGGAAATAAAAGGGAAATATCAACAAGAAGACGTAT	1350

AC134349.2	38281	ATTGGGAGTATCTGGATTGCTGGCAAATTCTATTTTCTGACCAAGGTTTG	38330
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1351	ATTGGGAGTATCTGGATTGCTGGCAAATTCTATTTTCTGACCAAGGTTTG	1400

AC134349.2	38331	GTAACATCAATGTTAATGTTATAATTTTTTCTTACTGTTTTTAGGTTTTA	38380
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1401	GTAACATCAATGTTAATGTTATAATTTTTTCTTACTGTTTTTAGGTTTTA	1450

AC134349.2	38381	TTACTCTCTGTATGTTATATTCCCCAATAAAAAAATGTTAAAAAAGCAAA	38430
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1451	TTACTCTCTGTATGTTATATTCCCCAATAAAAAAATGTTAAAAAAGCAAA	1500

AC134349.2	38431	AACATAAGTACATTTCTACGTATAAATTCAGGGTGATACAGCATATTCTC	38480
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1501	AACATAAGTACATTTCTACGTATAAATTCAGGGTGATACAGCATATTCTC	1550

AC134349.2	38481	ATAGATACCATTGTAATTAGAGTTTTTGCTGAATAAAGGAGAATAGAGCA	38530
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1551	ATAGATACCATTGTAATTAGAGTTTTTGCTGAATAAAGGAGAATAGAGCA	1600

AC134349.2	38531	TTATGGTACTAAGAAATACAAGTTAAAATTTAAAACTTTTTTTATTTTGA	38580
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1601	TTATGGTACTAAGAAATACAAGTTAAAATTTAAAACTTTTTTTATTTTGA	1650

AC134349.2	38581	GACAGGGTCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCACAAGTGCAATCGCG	38630
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1651	GACAGGGTCTTGCTCTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCACAAGTGCAATCGCG	1700

AC134349.2	38631	GCTCAATGCAACCTCTGCCACCCGGGCTGAAGTGATTCTCTCAGTTCAGC	38680
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1701	GCTCAATGCAACCTCTGCCACCCGGGCTGAAGTGATTCTCTCAGTTCAGC	1750

AC134349.2	38681	CTCCAGAGTAGCTAGGACAACAGGCGTGCACCACCACGCCCTGCTAATTT	38730
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1751	CTCCAGAGTAGCTAGGACAACAGGCGTGCACCACCACGCCCTGCTAATTT	1800

AC134349.2	38731	TTTCTATTTTTGGTAGAGATGGGATTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCT	38780
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1801	TTTCTATTTTTGGTAGAGATGGGATTTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCT	1850

AC134349.2	38781	TGAACTCCTGTGCTCAGGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCCTAAAATGGTG	38830
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1851	TGAACTCCTGTGCTCAGGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCCTAAAATGGTG	1900

AC134349.2	38831	GGATTACAGTTATGAGCCACCACACCTGGCCCAAAAGTTTTCTTAAATTA	38880
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1901	GGATTACAGTTATGAGCCACCACACCTGGCCCAAAAGTTTTCTTAAATTA	1950

AC134349.2	38881	ATTAAAAAAGAAGATAAGCAAGAACTGTAAATCCACCTTCTTAATGCTAA	38930
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC018630.40	1951	ATTAAAAAAGAAGATAAGCAAGAACTGTAAATCCACCTTCTTAATGCTAA	2000

AC134349.2	38931	TATG	38934
			||||
AC018630.40	2001	TATG	2004

Overview

Query
AC134349.2 - 38934 bps
Hit
AC018630.40 - 167868 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2004 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link