<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AC011903.4	1	TCATGTTACCTCAATCAGACATGCACTTGTATGTGGTAGTTAGCATAGGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	179722	TCATGTTACCTCAATCAGACATGCACTTGTATGTGGTAGTTAGCATAGGC	179771

AC011903.4	51	AACCACACCCAACCAGATGTGCACTTGGGCCTCTAAGTAGTAATTGCTCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	179772	AACCACACCCAACCAGATGTGCACTTGGGCCTCTAAGTAGTAATTGCTCA	179821

AC011903.4	101	TGCTGCCTAAGTGGTGGTCAGCATAGACAGCCACACCCCTGAGCCCTGCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	179822	TGCTGCCTAAGTGGTGGTCAGCATAGACAGCCACACCCCTGAGCCCTGCC	179871

AC011903.4	151	AGAGCACCTGAGGCTCACTCAATGCAATTCCCTGATGCTAATGCAAGAGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	179872	AGAGCACCTGAGGCTCACTCAATGCAATTCCCTGATGCTAATGCAAGAGG	179921

AC011903.4	201	GAGGCTCTCTGCAGTATCAGATGAAACTTCAAAGAGAAGTCCACAGGAAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	179922	GAGGCTCTCTGCAGTATCAGATGAAACTTCAAAGAGAAGTCCACAGGAAT	179971

AC011903.4	251	TTGTGGCAATTGGTTCTGGAAGCTGGATCACCAATTCTTGGCTGTGGCCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	179972	TTGTGGCAATTGGTTCTGGAAGCTGGATCACCAATTCTTGGCTGTGGCCT	180021

AC011903.4	301	AAAAGGAGAAAGCAGGAAAATCTGCAGAACAGATCCAGCCCTCTGTTACC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180022	AAAAGGAGAAAGCAGGAAAATCTGCAGAACAGATCCAGCCCTCTGTTACC	180071

AC011903.4	351	TGGCCAGGTACAAATGAATATTCATAATAGCCATCTCAGTCATCAACACA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180072	TGGCCAGGTACAAATGAATATTCATAATAGCCATCTCAGTCATCAACACA	180121

AC011903.4	401	GCATTGTGATATGTTCTGTGTCATTGGTAGGCTTCAGAATGGCACCACAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180122	GCATTGTGATATGTTCTGTGTCATTGGTAGGCTTCAGAATGGCACCACAC	180171

AC011903.4	451	TGACTGGACCATTTACATCTGAAGTACTCAAAATCTTAATGGAATTTTTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180172	TGACTGGACCATTTACATCTGAAGTACTCAAAATCTTAATGGAATTTTTC	180221

AC011903.4	501	TTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180222	TTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCA	180271

AC011903.4	551	CTCAGGCAGGAGTGCAGCATCATGATCTTCACTCATGTCAACCTCTGTCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180272	CTCAGGCAGGAGTGCAGCATCATGATCTTCACTCATGTCAACCTCTGTCT	180321

AC011903.4	601	CCCAGTTTTAAAATGATTGTCCTGCGTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGCTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180322	CCCAGTTTTAAAATGATTGTCCTGCGTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGCTT	180371

AC011903.4	651	ACAGGTGACCATCACCATGCCCAGCTAATTTTTCTATTTTTAGTAGAGAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180372	ACAGGTGACCATCACCATGCCCAGCTAATTTTTCTATTTTTAGTAGAGAT	180421

AC011903.4	701	GGTTTTTTACCATATTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTTCTTGACCTGATGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180422	GGTTTTTTACCATATTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTTCTTGACCTGATGT	180471

AC011903.4	751	GATCCGCCTGCCTCAGCCTCTGGAATTGTTATTTATTAAAGTTATCAGCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180472	GATCCGCCTGCCTCAGCCTCTGGAATTGTTATTTATTAAAGTTATCAGCT	180521

AC011903.4	801	GGGTAAGGTGGCTCATGCCTGTTATCCCAGCAGTTTGGGAAGCTGAGTGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180522	GGGTAAGGTGGCTCATGCCTGTTATCCCAGCAGTTTGGGAAGCTGAGTGG	180571

AC011903.4	851	GGAGTATGGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGCCCAGCCTGTGCAACTTAGTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180572	GGAGTATGGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGCCCAGCCTGTGCAACTTAGTG	180621

AC011903.4	901	AGACCACATTTATACAAAAATAAATAAATAAAAACAAGCCAGGGCTGGTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180622	AGACCACATTTATACAAAAATAAATAAATAAAAACAAGCCAGGGCTGGTG	180671

AC011903.4	951	GTGGACGCCTGTGGTCTCAGTTGCTTGGGAGGCTGAGGAGGGAGGATCAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180672	GTGGACGCCTGTGGTCTCAGTTGCTTGGGAGGCTGAGGAGGGAGGATCAC	180721

AC011903.4	1001	TTGAGCCAGGGAGGTCAAGTCTTCAGTGAGCTCTGAAGGTGTCACTGCAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180722	TTGAGCCAGGGAGGTCAAGTCTTCAGTGAGCTCTGAAGGTGTCACTGCAC	180771

AC011903.4	1051	TTCACCCTGGGTGGCAGAGAGAGACCCTGTCTAAACATAAAGAAATAAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180772	TTCACCCTGGGTGGCAGAGAGAGACCCTGTCTAAACATAAAGAAATAAAA	180821

AC011903.4	1101	TTAAAAAAATACCTTTCTTTAAAGTAACTGCAGGACTTTCTTCACTTCCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180822	TTAAAAAAATACCTTTCTTTAAAGTAACTGCAGGACTTTCTTCACTTCCT	180871

AC011903.4	1151	GCACCATCTGAACAAGTTTCTAGATCACTATGCTCCTCAGTGTCTTCTTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180872	GCACCATCTGAACAAGTTTCTAGATCACTATGCTCCTCAGTGTCTTCTTT	180921

AC011903.4	1201	AGCAAGATAGGACAGATGAGGATTTCCTAAAATCCTCCAAACTCTGAATT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180922	AGCAAGATAGGACAGATGAGGATTTCCTAAAATCCTCCAAACTCTGAATT	180971

AC011903.4	1251	CCTTGAGTTCGTAGTTCATAATGTTTTGCCCAGGAGACCAAATGACTTTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	180972	CCTTGAGTTCGTAGTTCATAATGTTTTGCCCAGGAGACCAAATGACTTTT	181021

AC011903.4	1301	GACCTCAAACTAGTGCTAATAACAGGGAAGAGGAAAGGCTCATATTTGTA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	181022	GACCTCAAACTAGTGCTAATAACAGGGAAGAGGAAAGGCTCATATTTGTA	181071

AC011903.4	1351	GTAACTTTATTTTAAAAACAGGAACAATGAATAATCTGATGAACCATTTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	181072	GTAACTTTATTTTAAAAACAGGAACAATGAATAATCTGATGAACCATTTG	181121

AC011903.4	1401	GCATAGAGATTTCTATGGCATTTTTGAAAATACATAGATATTCACATTTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	181122	GCATAGAGATTTCTATGGCATTTTTGAAAATACATAGATATTCACATTTC	181171

AC011903.4	1451	TCAGTTGATATGACAGTTGTAGATTTAGAAAGCAGTCAGAACCAACTTCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	181172	TCAGTTGATATGACAGTTGTAGATTTAGAAAGCAGTCAGAACCAACTTCA	181221

AC011903.4	1501	GGAGTAATGAAACACATGTAAGCCACACTAATTAGAGGAAAGTGTTAATT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	181222	GGAGTAATGAAACACATGTAAGCCACACTAATTAGAGGAAAGTGTTAATT	181271

AC011903.4	1551	ATTTAAGTCAGCAGGTTGGAAGTTATTATTTGCTGCAAAAATACCTTTTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	181272	ATTTAAGTCAGCAGGTTGGAAGTTATTATTTGCTGCAAAAATACCTTTTT	181321

AC011903.4	1601	GTTGGTCATTTATGCAAGGCAGTGCTTCTAAACAGCCCATCAGTATTATC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	181322	GTTGGTCATTTATGCAAGGCAGTGCTTCTAAACAGCCCATCAGTATTATC	181371

AC011903.4	1651	AAGAATTTTGAAAAATATGAGCCCGGCACTGTGGCTCCTGCCTATCCTCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	181372	AAGAATTTTGAAAAATATGAGCCCGGCACTGTGGCTCCTGCCTATCCTCC	181421

AC011903.4	1701	CAGTACTTTGGGAGGCTGAGGTGTGAGGATTGCTTGAGTCCAGGAATTCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	181422	CAGTACTTTGGGAGGCTGAGGTGTGAGGATTGCTTGAGTCCAGGAATTCA	181471

AC011903.4	1751	AGAACAACCTGGGCAACAAAGCAAAACCTTATCTCTGCAAAACATTACAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	181472	AGAACAACCTGGGCAACAAAGCAAAACCTTATCTCTGCAAAACATTACAA	181521

AC011903.4	1801	AAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	181522	AAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAT	181571

AC011903.4	1851	GTTGAAGTGGGAGGATCAGTTGGGCCTGGATGGCAGAGGCTGCAGCAAGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	181572	GTTGAAGTGGGAGGATCAGTTGGGCCTGGATGGCAGAGGCTGCAGCAAGC	181621

AC011903.4	1901	CAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTAGCAGAGAGACACTCTGTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	181622	CAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTAGCAGAGAGACACTCTGTC	181671

AC011903.4	1951	TGAAATAAAGATAAAGATAAAAATACCCAAATTGTTGGCCTTAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010879.2	181672	TGAAATAAAGATAAAGATAAAAATACCCAAATTGTTGGCCTTAGGAATTC	181721

Overview

Query
AC011903.4 - 67475 bps
Hit
AC010879.2 - 181721 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link