<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2075 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  AC008984.5	39829	GATCATAGCGTTGGATGATTGATGTGTTCTCTCAAGATCTCATATCTGGG	39780
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	32600	GATCATAGCGTTGGATGATTGATGTGTTCTCTCAAGATCTCATATCTGGG	32649

C  AC008984.5	39779	ATCCCTAATGGAGAAATGTACGTGAAGTATTTCTGAAATATGCAGAACAT	39730
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	32650	ATCCCTAATGGAGAAATGTACGTGAAGTATTTCTGAAATATGCAGAACAT	32699

C  AC008984.5	39729	CAATATCATGAGCAGAAAAAGAGGCGTGGAAGTCTCCAAGTGTAGATGGA	39680
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	32700	CAATATCATGAGCAGAAAAAGAGGCGTGGAAGTCTCCAAGTGTAGATGGA	32749

C  AC008984.5	39679	TCCACATTAAATAACAGAGGCCAGAGGTGAGTCGCCACAGGTGCCTGGGA	39630
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	32750	TCCACATTAAATAACAGAGGCCAGAGGTGAGTCGCCACAGGTGCCTGGGA	32799

C  AC008984.5	39629	CCATCAAGGGGTCATTAGGGTGGAGGTTTCCACCAAAGGTGGCCCAAAGT	39580
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	32800	CCATCAAGGGGTCATTAGGGTGGAGGTTTCCACCAAAGGTGGCCCAAAGT	32849

C  AC008984.5	39579	GATTAGACTCAACATGCCAGACCTGCCTTGGTTTACTACGGAGAAAGAGA	39530
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	32850	GATTAGACTCAACATGCCAGACCTGCCTTGGTTTACTACGGAGAAAGAGA	32899

C  AC008984.5	39529	TTCAAATGTTTAGGAAGGTTAAAATGTTAGAGAGGAGTTGTCATTCAAGA	39480
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	32900	TTCAAATGTTTAGGAAGGTTAAAATGTTAGAGAGGAGTTGTCATTCAAGA	32949

C  AC008984.5	39479	CGGCCTCATCTAAATTGGAAGAGTCTAGAAGATCTATCTTTCTTTTCTTT	39430
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	32950	CGGCCTCATCTAAATTGGAAGAGTCTAGAAGATCTATCTTTCTTTTCTTT	32999

C  AC008984.5	39429	TTTTTTTTTTTTTTGAGATGCAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTG	39380
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33000	TTTTTTTTTTTTTTGAGATGCAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTG	33049

C  AC008984.5	39379	CAGTGGCACCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCACACCCTCCTCCTCCTCC	39330
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33050	CAGTGGCACCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCACACCCTCCTCCTCCTCC	33099

C  AC008984.5	39329	TTCTTCTCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTTCAC	39280
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33100	TTCTTCTCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTTCAC	33149

C  AC008984.5	39279	CTTCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGA	39230
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33150	CTTCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGA	33199

C  AC008984.5	39229	GACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCG	39180
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33200	GACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCG	33249

C  AC008984.5	39179	GTTCACTGCAACCTCCGCCTCCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTATCTCAGC	39130
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33250	GTTCACTGCAACCTCCGCCTCCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTATCTCAGC	33299

C  AC008984.5	39129	CTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCACCATCATGCCAGGCTAATTT	39080
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33300	CTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCACCATCATGCCAGGCTAATTT	33349

C  AC008984.5	39079	TTGTATTTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCATCATGTTGACCAGGCTGGTCTC	39030
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33350	TTGTATTTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCATCATGTTGACCAGGCTGGTCTC	33399

C  AC008984.5	39029	GAACTCCTAACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG	38980
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33400	GAACTCCTAACCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG	33449

C  AC008984.5	38979	GATTACATGCGTGAGCCACCATGCTTTCTTATCCAGCACTGCTAATAAAG	38930
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33450	GATTACATGCGTGAGCCACCATGCTTTCTTATCCAGCACTGCTAATAAAG	33499

C  AC008984.5	38929	ACCACCAGAAACCATTTTCCTTGAGCAGGCACAGCCAGCAATATACATTC	38880
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33500	ACCACCAGAAACCATTTTCCTTGAGCAGGCACAGCCAGCAATATACATTC	33549

C  AC008984.5	38879	ACTGTCCTACCTCAGGCACATACCAACTGTTTAGTTCTATCCCATAGTTT	38830
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33550	ACTGTCCTACCTCAGGCACATACCAACTGTTTAGTTCTATCCCATAGTTT	33599

C  AC008984.5	38829	AGTTCTCACCATAATCATCATTATCATCTCCTTTCATAAAATGTTAGACT	38780
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33600	AGTTCTCACCATAATCATCATTATCATCTCCTTTCATAAAATGTTAGACT	33649

C  AC008984.5	38779	GAATCATTACATTGATAAAATTATGCTGGTTGGAATGCCCATCAATGACA	38730
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33650	GAATCATTACATTGATAAAATTATGCTGGTTGGAATGCCCATCAATGACA	33699

C  AC008984.5	38729	GACTGGATAAAGATACTGTGGTACATATACACCATGGAATACTATGCAGC	38680
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33700	GACTGGATAAAGATACTGTGGTACATATACACCATGGAATACTATGCAGC	33749

C  AC008984.5	38679	CATAAAAAGGAATGAGATCATGTCCTTTGCAGGGACATGGATGGAGCTGG	38630
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33750	CATAAAAAGGAATGAGATCATGTCCTTTGCAGGGACATGGATGGAGCTGG	33799

C  AC008984.5	38629	AAGCCATTATCCTCAGCAAACAAACACAGGAACCAAAAACCAAACACTGC	38580
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33800	AAGCCATTATCCTCAGCAAACAAACACAGGAACCAAAAACCAAACACTGC	33849

C  AC008984.5	38579	ATGTTCTCATTCATAAGTGGGAGCTGAACAATGAGAACACATGGACACAG	38530
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33850	ATGTTCTCATTCATAAGTGGGAGCTGAACAATGAGAACACATGGACACAG	33899

C  AC008984.5	38529	GAATGGAAACAACACACACTTGGGCCTGTTGGGGGGAAAAGGGAGGAAGA	38480
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33900	GAATGGAAACAACACACACTTGGGCCTGTTGGGGGGAAAAGGGAGGAAGA	33949

C  AC008984.5	38479	GCCTCAGGATAAATAACTAATGGGTGCCGGGTTTAATACCTAGGTGATGG	38430
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	33950	GCCTCAGGATAAATAACTAATGGGTGCCGGGTTTAATACCTAGGTGATGG	33999

C  AC008984.5	38429	GCTGATGGGTGCAACAAACCACCACAGCACACGTTTGTTTACTTATGTAA	38380
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	34000	GCTGATGGGTGCAACAAACCACCACAGCACACGTTTGTTTACTTATGTAA	34049

C  AC008984.5	38379	CAAACCTGCAGGTCCTGCACATGTATCCCAGAACATAAAATTAAATTAAA	38330
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	34050	CAAACCTGCAGGTCCTGCACATGTATCCCAGAACATAAAATTAAATTAAA	34099

C  AC008984.5	38329	TTAGATATCAAAAATAAAAATAAAATAAAGTTAAAAAAAGAAATTATGCT	38280
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	34100	TTAGATATCAAAAATAAAAATAAAATAAAGTTAAAAAAAGAAATTATGCT	34149

C  AC008984.5	38279	ATTTGGACCAGGAAAGCAAGAAGTAGCACCTATTCCAAATTTATTAGTAA	38230
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	34150	ATTTGGACCAGGAAAGCAAGAAGTAGCACCTATTCCAAATTTATTAGTAA	34199

C  AC008984.5	38229	CACATTTGCATGACAGAGGGTGAGAAATAAATTCCACAAAAATATTGGAG	38180
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	34200	CACATTTGCATGACAGAGGGTGAGAAATAAATTCCACAAAAATATTGGAG	34249

C  AC008984.5	38179	CCTTCCGCCTCAACACAATTTCTGAGTCCACTGATATGGAAAATGTTGAG	38130
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	34250	CCTTCCGCCTCAACACAATTTCTGAGTCCACTGATATGGAAAATGTTGAG	34299

C  AC008984.5	38129	ATGTAACTTCTAAAGCAAAAGGTAAGTTGTTGCATCTGGCCCTTCCTACA	38080
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	34300	ATGTAACTTCTAAAGCAAAAGGTAAGTTGTTGCATCTGGCCCTTCCTACA	34349

C  AC008984.5	38079	ACCAAAAGAACCATGGTACCTAGTAAGCCTCTTGGGTTTTTTTTTTTTTT	38030
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	34350	ACCAAAAGAACCATGGTACCTAGTAAGCCTCTTGGGTTTTTTTTTTTTTT	34399

C  AC008984.5	38029	TTCCTGAGACAGAATTTTGCTTTTTTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCA	37980
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	34400	TTCCTGAGACAGAATTTTGCTTTTTTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCA	34449

C  AC008984.5	37979	CAATCTGGGCTCACTGCAACCGATTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCT	37930
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	34450	CAATCTGGGCTCACTGCAACCGATTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCT	34499

C  AC008984.5	37929	CTCTAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCGCCCTCACGCCCAGCTAATTTTT	37880
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	34500	CTCTAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCGCCCTCACGCCCAGCTAATTTTT	34549

C  AC008984.5	37879	GTATTTTTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGA	37830
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	34550	GTATTTTTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGA	34599

C  AC008984.5	37829	ACTCCTGACTGCATGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATT	37780
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	34600	ACTCCTGACTGCATGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATT	34649

C  AC008984.5	37779	ACAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGGC	37755
			|||||||||||||||||||||||||
  AC010518.7	34650	ACAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGGC	34674

Overview

Query
AC008984.5 - 39829 bps
Hit
AC010518.7 - 34674 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2075 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100020753775539829-132600346741
Short-link