<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1117 bps / non-identical: 50 bps

Full alignment

AC098789.2	1	TGATCTGAGTTTTACTCATGGTTAGGATTGCAGAGAAGCTCTTTTTTTGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	79311	TGATCTGAGTTTTACTCATGGTTAGGATTGCAGAGAAGCTCTTTTTTTGG	79360

AC098789.2	51	AGTGGGGGAGGGAGGGGGAGGGATGGAGTTTCGCTTTTGTTGCCCAGGCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	79361	AGTGGGGGAGGGAGGGGGAGGGATGGAGTTTCGCTTTTGTTGCCCAGGCT	79410

AC098789.2	101	GGAGTGCAATGGCGTGTTCTTGGCTCACTACAACCTCTGCCTCCTGGGTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	79411	GGAGTGCAATGGCGTGTTCTTGGCTCACTACAACCTCTGCCTCCTGGGTT	79460

AC098789.2	151	CAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACGGGCATG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	79461	CAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACGGGCATG	79510

AC098789.2	201	TGCCACCATGCCCAGCTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAGAGGGTTTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	79511	TGCCACCATGCCCAGCTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAGAGGGTTTC	79560

AC098789.2	251	ACTATGTTTTCCAGGCTCGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCCACCC	300
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
AC010492.9	79561	ACTATGTTTTCCAGGCTCGTCTCAAACTCCTGACCTTAGGCAATCCACCC	79610

AC098789.2	301	ACCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCACCCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	79611	ACCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCACCCA	79660

AC098789.2	351	GCTAGTGAAACTCTTTCCAGCTCCCCAAACCCTGGGCAGAAGCCGGGATA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	79661	GCTAGTGAAACTCTTTCCAGCTCCCCAAACCCTGGGCAGAAGCCGGGATA	79710

AC098789.2	401	TGAATTATTTATTTACTTACTGAGTTATGTGACATAACTCACACCATATG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	79711	TGAATTATTTATTTACTTACTGAGTTATGTGACATAACTCACACCATATG	79760

AC098789.2	451	AAATGCACCATTTTTTAGTGTACAAATAAATGGATTTTAGTGTCTTCACT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	79761	AAATGCACCATTTTTTAGTGTACAAATAAATGGATTTTAGTGTCTTCACT	79810

AC098789.2	501	ATGCTGTGCAATCACCATCCCTACCTCATCCCACAGCATTTCCATCACCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	79811	ATGCTGTGCAATCACCATCCCTACCTCATCCCACAGCATTTCCATCACCT	79860

AC098789.2	551	CAGAAAGAACCCCCAAGTAGTCAGTCCTAGTTCTTCCCTTCCCTCAGCCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	79861	CAGAAAGAACCCCCAAGTAGTCAGTCCTAGTTCTTCCCTTCCCTCAGCCT	79910

AC098789.2	601	TAAGAAATCACTAGTCTACTCTCAGTTTCTATGGCTTTGTCTATTCTGGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	79911	TAAGAAATCACTAGTCTACTCTCAGTTTCTATGGCTTTGTCTATTCTGGA	79960

AC098789.2	651	TATTTCATGTGCATAAAATCACACCAAATACACGTCCTTTTGTAGCTGTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	79961	TATTTCATGTGCATAAAATCACACCAAATACACGTCCTTTTGTAGCTGTT	80010

AC098789.2	701	GATGGAAAAGAAGTGGTTACCATGAAGGAACTGAAGTTTTCCAAAGACAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	80011	GATGGAAAAGAAGTGGTTACCATGAAGGAACTGAAGTTTTCCAAAGACAA	80060

AC098789.2	751	AATTATAATGTGGCCTGACAGAAGAAGTACAGAAATTGATAACAAAAACA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	80061	AATTATAATGTGGCCTGACAGAAGAAGTACAGAAATTGATAACAAAAACA	80110

AC098789.2	801	AATCCATCACAACTTATCATGAATCTGGTCATGCCATTATTGCATATTAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	80111	AATCCATCACAACTTATCATGAATCTGGTCATGCCATTATTGCATATTAC	80160

AC098789.2	851	ACAAAAGATGAAATGTCTATCAACAAAGCTACAATCATGCCACAGGGGCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	80161	ACAAAAGATGAAATGTCTATCAACAAAGCTACAATCATGCCACAGGGGCC	80210

AC098789.2	901	AACATTTGGACCTGTGTCCCCATTACCTGGTGATGACAGATGGAATGAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	80211	AACATTTGGACCTGTGTCCCCATTACCTGGTGATGACAGATGGAATGAAA	80260

AC098789.2	951	CCAGAGCCCAGCTGCTTGCACAAATGGACATTAGTATGGGAGCAAGAGTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	80261	CCAGAGCCCAGCTGCTTGCACAAATGGACATTAGTATGGGAGCAAGAGTG	80310

AC098789.2	1001	GCAGAGGAGCTTATATTTGGAATTGACCATATTACAACAGGTGCTTCCAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	80311	GCAGAGGAGCTTATATTTGGAATTGACCATATTACAACAGGTGCTTCCAG	80360

AC098789.2	1051	TGATTTTGCTAATGCCACTAAAATGGCAAAGCAGATGGTTATCAAATTTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC010492.9	80361	TGATTTTGCTAATGCCACTAAAATGGCAAAGCAGATGGTTATCAAATTTG	80410

AC098789.2	1101	GAATTAGCGAAAAGCTT	1117
			|||||||||||||||||
AC010492.9	80411	GAATTAGCGAAAAGCTT	80427

Compact alignment

skip 250 bps 100% identity alignment

AC098789.2	251	ACTATGTTTTCCAGGCTCGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCCACCC	300
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
AC010492.9	79561	ACTATGTTTTCCAGGCTCGTCTCAAACTCCTGACCTTAGGCAATCCACCC	79610

skip 817 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AC098789.2 - 2765 bps
Hit
AC010492.9 - 80427 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1117 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.91050111711117179311804271
Short-link