<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1173 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AC011501.8	1	AAGCTTGTCTGAAACTCCCAACCTCAAGTGATCCGACCGTCTCAGCATGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	42355	AAGCTTGTCTGAAACTCCCAACCTCAAGTGATCCGACCGTCTCAGCATGC	42404

AC011501.8	51	CAAAGTAATGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCAGAATTCAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	42405	CAAAGTAATGGGACTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCAGAATTCAA	42454

AC011501.8	101	AATCAATAATAGATAATGCTGAGTGTATGATTTCAGGTGACAAAGAAGGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	42455	AATCAATAATAGATAATGCTGAGTGTATGATTTCAGGTGACAAAGAAGGT	42504

AC011501.8	151	CTCACTATTCAGATATTTGTGACATTAATGAAAAACACGGATTGAACCCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	42505	CTCACTATTCAGATATTTGTGACATTAATGAAAAACACGGATTGAACCCC	42554

AC011501.8	201	TGAAAGATTGGCGGAAGGATTTTGCACACACAGCTGTCAGCCGTGAAGGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	42555	TGAAAGATTGGCGGAAGGATTTTGCACACACAGCTGTCAGCCGTGAAGGC	42604

AC011501.8	251	ACAAAGGTGAAAACAATCTGATGTGGAAGGAAGAGGCTCTGCCTCAAATG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	42605	ACAAAGGTGAAAACAATCTGATGTGGAAGGAAGAGGCTCTGCCTCAAATG	42654

AC011501.8	301	CTGGGAATGATGTGGGGAGAATGACAAGACGACTGTAGAGAGACGGAGAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	42655	CTGGGAATGATGTGGGGAGAATGACAAGACGACTGTAGAGAGACGGAGAG	42704

AC011501.8	351	CACACTGGGTACACAGGAAACTAAGGAGCAACAAGGAGTGTGTGTTTGAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	42705	CACACTGGGTACACAGGAAACTAAGGAGCAACAAGGAGTGTGTGTTTGAC	42754

AC011501.8	401	ACTCACAGCCATTGGATTCACCTCGGGGTAACCAGGAATCCCTACATGAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	42755	ACTCACAGCCATTGGATTCACCTCGGGGTAACCAGGAATCCCTACATGAT	42804

AC011501.8	451	TAATATGACTGACATGAAAATAAGGGAGGCTCAGTTGCATAACTGGAATC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	42805	TAATATGACTGACATGAAAATAAGGGAGGCTCAGTTGCATAACTGGAATC	42854

AC011501.8	501	TAGGAGACCGTGGAAAAGGCAATTGCCACCCCACTGGTGAAATGTGGTGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	42855	TAGGAGACCGTGGAAAAGGCAATTGCCACCCCACTGGTGAAATGTGGTGC	42904

AC011501.8	551	TGATTTAGACACTAAATGAATGAAGTAGATGGATATAAGATATGTTTGTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	42905	TGATTTAGACACTAAATGAATGAAGTAGATGGATATAAGATATGTTTGTG	42954

AC011501.8	601	AGGTAGAATCATTGACTGGAAACGCTTACTGGGTTTGATTTTCCTACTTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	42955	AGGTAGAATCATTGACTGGAAACGCTTACTGGGTTTGATTTTCCTACTTG	43004

AC011501.8	651	TTTAATCCTCGCTTAATTAATTTCTTTCTGAGATTTATTCATCCTACACA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	43005	TTTAATCCTCGCTTAATTAATTTCTTTCTGAGATTTATTCATCCTACACA	43054

AC011501.8	701	TAAATCAATACCTGGCAAAGGAGTGACAGATATATGAGTGGTGGTGGAAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	43055	TAAATCAATACCTGGCAAAGGAGTGACAGATATATGAGTGGTGGTGGAAA	43104

AC011501.8	751	TGAAGAGACTTATTATAGCATAATATACAAGTCTGTGAACAGTGGCTCAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	43105	TGAAGAGACTTATTATAGCATAATATACAAGTCTGTGAACAGTGGCTCAC	43154

AC011501.8	801	GCCTGTAACCTAGCACTGCAGGAGGCCAAGGTGGGTGGATTCCATGAAGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	43155	GCCTGTAACCTAGCACTGCAGGAGGCCAAGGTGGGTGGATTCCATGAAGT	43204

AC011501.8	851	CAGGAGTTCCAGACCAGCCTGGCCAACGTGGTGAAACCCTATCTCTACTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	43205	CAGGAGTTCCAGACCAGCCTGGCCAACGTGGTGAAACCCTATCTCTACTA	43254

AC011501.8	901	AAAATACAAAAATTAGCCGAGCACGATGGTGCATCCCTGTAATCCCAGCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	43255	AAAATACAAAAATTAGCCGAGCACGATGGTGCATCCCTGTAATCCCAGCT	43304

AC011501.8	951	CCTATTCTGGAGGATGAAGCAGGAGAATGACTTCAACCCAGTAGGTGGAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	43305	CCTATTCTGGAGGATGAAGCAGGAGAATGACTTCAACCCAGTAGGTGGAG	43354

AC011501.8	1001	GTTGCAGTGAGTGGAGATTGCATCACTGCACTCCAGCCTGGGGGACACAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	43355	GTTGCAGTGAGTGGAGATTGCATCACTGCACTCCAGCCTGGGGGACACAA	43404

AC011501.8	1051	GGAGACTCTATCTCAAAAAATAAAAATAAGAAATACATAAATATAATAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	43405	GGAGACTCTATCTCAAAAAATAAAAATAAGAAATACATAAATATAATAAA	43454

AC011501.8	1101	ACACACACGAATGACAAAGGCACCTGAATTCCAATCATCGTTTTTCTATT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC006293.1	43455	ACACACACGAATGACAAAGGCACCTGAATTCCAATCATCGTTTTTCTATT	43504

AC011501.8	1151	TCTCTATAATTACTTCTTTGATC	1173
			|||||||||||||||||||||||
AC006293.1	43505	TCTCTATAATTACTTCTTTGATC	43527

Overview

Query
AC011501.8 - 161218 bps
Hit
AC006293.1 - 43527 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1173 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link